MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Anaplasma phagocytophilum HZ

Total Repeats: 366

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007797	ATTATG	2	12	1304	1315	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	88607943
2	NC_007797	GGCTTT	2	12	4700	4711	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	88607015
3	NC_007797	TGATAT	2	12	7582	7593	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	88606844
4	NC_007797	GTTGAT	2	12	14804	14815	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	88606787
5	NC_007797	GTAGTG	2	12	15902	15913	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	88606746
6	NC_007797	TGGAAG	2	12	16065	16076	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	88606746
7	NC_007797	TACGTT	2	12	16195	16206	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	88606746
8	NC_007797	TACAGA	2	12	18409	18420	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	88607636
9	NC_007797	CAAGAC	2	12	18889	18900	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	88607040
10	NC_007797	ACTTTC	2	12	28918	28929	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	88607403
11	NC_007797	ACTTTC	2	12	29425	29436	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	88607403
12	NC_007797	CTCTGC	2	12	33058	33069	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	88607566
13	NC_007797	TGTTAT	2	12	40839	40850	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	88607511
14	NC_007797	AGCCTA	2	12	44330	44341	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	88606722
15	NC_007797	GTTTGA	2	12	45855	45866	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	88607852
16	NC_007797	TTTTGG	2	12	48793	48804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88606966
17	NC_007797	GCTGTT	2	12	51500	51511	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	88606817
18	NC_007797	GACGTG	2	12	53818	53829	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	88606817
19	NC_007797	AGATGT	2	12	59536	59547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88607541
20	NC_007797	TGGGTG	2	12	64103	64114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88606858
21	NC_007797	ATTTTG	2	12	68181	68192	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	88607026
22	NC_007797	ATAAGC	2	12	69153	69164	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	88606750
23	NC_007797	GAAAGG	2	12	70421	70432	50 %	0 %	50 %	0 %	88606901
24	NC_007797	GCAGGA	2	12	74006	74017	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_007797	TCTTTT	2	12	75094	75105	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	88606778
26	NC_007797	GCTTTA	2	12	80641	80652	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_007797	TAACTC	2	12	82899	82910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_007797	CAACGC	2	12	83371	83382	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
29	NC_007797	CACCCT	2	12	83525	83536	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_007797	TAGCTA	2	12	84301	84312	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	88607780
31	NC_007797	ATACAG	2	12	84553	84564	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	88607780
32	NC_007797	TGCGTG	2	12	92681	92692	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_007797	ACTCCG	2	12	95011	95022	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	88607628
34	NC_007797	TATTTC	2	12	99143	99154	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	88607927
35	NC_007797	TTAATG	2	12	100593	100604	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	88607674
36	NC_007797	GAGTTC	2	12	110803	110814	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	88607738
37	NC_007797	CCTGGC	2	12	114071	114082	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	88607880
38	NC_007797	AGTGGT	2	12	117094	117105	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	88606992
39	NC_007797	GTAAGT	2	12	119198	119209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007797	TACGTT	2	12	122794	122805	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	88607223
41	NC_007797	CAGTAT	2	12	127235	127246	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	88607609
42	NC_007797	ATACTT	2	12	136714	136725	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_007797	CTATAA	2	12	136773	136784	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_007797	GGGTTA	2	12	141414	141425	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	88607475
45	NC_007797	ACATCT	2	12	145002	145013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88607392
46	NC_007797	TATGGT	2	12	149444	149455	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007797	TGGCTT	2	12	152809	152820	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	88607214
48	NC_007797	TTCTGA	2	12	158261	158272	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	88607286
49	NC_007797	CAAAGG	2	12	160664	160675	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	88607253
50	NC_007797	GACTTT	2	12	161849	161860	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	88606897
51	NC_007797	CAAAGG	2	12	163442	163453	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	88607039
52	NC_007797	GACTTT	2	12	164627	164638	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	88607770
53	NC_007797	CGGCAT	2	12	167499	167510	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	88607041
54	NC_007797	TCAGTA	2	12	170229	170240	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	88607371
55	NC_007797	GCGTTG	2	12	174798	174809	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	88606879
56	NC_007797	CTGAAC	2	12	186150	186161	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	88607802
57	NC_007797	GCTATG	2	12	201065	201076	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	88607575
58	NC_007797	TCTCTA	2	12	201099	201110	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	88607575
59	NC_007797	TTAGCA	2	12	203381	203392	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	88606809
60	NC_007797	TTACCA	2	12	207196	207207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007797	ATGTGG	2	12	207351	207362	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007797	TCACTG	2	12	207696	207707	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	88607777
63	NC_007797	TCACTG	2	12	212039	212050	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	88606986
64	NC_007797	ACAGAA	2	12	221195	221206	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_007797	GCAATG	2	12	221622	221633	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	88607384
66	NC_007797	ATGCGT	2	12	223433	223444	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	88607005
67	NC_007797	GCAGTT	2	12	226861	226872	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_007797	TTCTAC	2	12	228905	228916	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	88607014
69	NC_007797	CTTTTC	2	12	234572	234583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88607892
70	NC_007797	CCAGCA	2	12	238439	238450	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	88606723
71	NC_007797	CGAGGA	2	12	246297	246308	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_007797	GCCTAT	2	12	246844	246855	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	88606862
73	NC_007797	TCGTAT	2	12	258590	258601	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	88607848
74	NC_007797	CTATCC	2	12	269744	269755	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	88607225
75	NC_007797	TGAAGA	2	12	274128	274139	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	88607530
76	NC_007797	GGGTAA	2	12	279197	279208	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	88607804
77	NC_007797	CGTTAT	2	12	280192	280203	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	88607479
78	NC_007797	TATTCC	2	12	283792	283803	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	88607078
79	NC_007797	CTAAGG	2	12	287714	287725	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	88606692
80	NC_007797	CAAGAG	2	12	289423	289434	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	88607372
81	NC_007797	CTATTA	2	12	290530	290541	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_007797	GATATA	3	18	294028	294045	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	88607182
83	NC_007797	TTGAGC	2	12	303832	303843	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_007797	GCTTTG	2	12	306748	306759	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	88607307
85	NC_007797	TACATA	2	12	320121	320132	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_007797	TAATAG	2	12	320748	320759	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007797	TAGTGG	2	12	328511	328522	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	88606792
88	NC_007797	GAAGAG	2	12	328833	328844	50 %	0 %	50 %	0 %	88606792
89	NC_007797	GGCAAG	2	12	328956	328967	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	88606792
90	NC_007797	TGTAGG	2	12	334203	334214	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	88607670
91	NC_007797	GGTACT	2	12	347286	347297	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	88607600
92	NC_007797	TTGCTA	2	12	350191	350202	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	88607418
93	NC_007797	CTATTA	2	12	351738	351749	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	88607282
94	NC_007797	ACCGTA	2	12	351827	351838	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	88607282
95	NC_007797	AATTTA	2	12	370692	370703	50 %	50 %	0 %	0 %	88607745
96	NC_007797	GAAAAG	2	12	371144	371155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88607745
97	NC_007797	AGGCTA	2	12	371478	371489	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	88607745
98	NC_007797	CAGCAT	2	12	373007	373018	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	88607745
99	NC_007797	AGGTTC	2	12	373284	373295	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	88607035
100	NC_007797	GTAGAT	2	12	375323	375334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88607035
101	NC_007797	ATTATA	2	12	378943	378954	50 %	50 %	0 %	0 %	88607561
102	NC_007797	TGAGGT	2	12	383400	383411	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	88607561
103	NC_007797	TGAGGT	2	12	383646	383657	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	88607561
104	NC_007797	TGAGGT	2	12	383892	383903	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	88607561
105	NC_007797	TGAGGT	2	12	384054	384065	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	88607561
106	NC_007797	GATACT	2	12	384280	384291	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	88607561
107	NC_007797	GCCCGT	2	12	387336	387347	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
108	NC_007797	ACGTGA	2	12	389869	389880	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	88607953
109	NC_007797	TTATGG	2	12	390407	390418	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007797	AGGAGA	2	12	391694	391705	50 %	0 %	50 %	0 %	88607816
111	NC_007797	TATGGT	2	12	410795	410806	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	88607503
112	NC_007797	TGGATG	2	12	417253	417264	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	88607267
113	NC_007797	GAAGGT	2	12	418326	418337	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	88607267
114	NC_007797	GGTTAT	2	12	419012	419023	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	88607654
115	NC_007797	TACGAG	2	12	419753	419764	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	88607654
116	NC_007797	CTATAG	2	12	421400	421411	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_007797	TGTACT	2	12	421818	421829	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_007797	TAACGG	2	12	423879	423890	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_007797	TAAATG	2	12	423933	423944	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007797	TCAGAA	2	12	424534	424545	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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229	NC_007797	GAAACA	2	12	848925	848936	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	88607888
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232	NC_007797	GATCCA	2	12	858991	859002	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	88607444
233	NC_007797	ACGAAG	2	12	871437	871448	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	88607726
234	NC_007797	TTCTGA	2	12	880429	880440	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
235	NC_007797	TGCAAT	2	12	883481	883492	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	88607001
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237	NC_007797	TTTGTA	2	12	895643	895654	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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352	NC_007797	TGCAGA	2	12	1386161	1386172	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
353	NC_007797	GAATCG	2	12	1396749	1396760	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
354	NC_007797	CAAACC	2	12	1398942	1398953	50 %	0 %	0 %	50 %	88607875
355	NC_007797	CACAGC	2	12	1404697	1404708	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	88606867
356	NC_007797	AACGTA	2	12	1405939	1405950	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
357	NC_007797	CCACCC	2	12	1410057	1410068	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
358	NC_007797	GCTCTA	2	12	1413515	1413526	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	88606948
359	NC_007797	CAACGC	2	12	1416939	1416950	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
360	NC_007797	TATGTA	2	12	1438667	1438678	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
361	NC_007797	TAGTAT	2	12	1440194	1440205	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
362	NC_007797	TGTTGC	2	12	1442506	1442517	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	88607767
363	NC_007797	TGCGAA	2	12	1448562	1448573	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
364	NC_007797	TATAGA	2	12	1448871	1448882	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	88607748
365	NC_007797	AAGAGG	2	12	1449200	1449211	50 %	0 %	50 %	0 %	88607748
366	NC_007797	GACGAA	2	12	1462765	1462776	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	88607229

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.