MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Anaplasma phagocytophilum HZ

Total Repeats: 264

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007797	ATTATG	2	12	1304	1315	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	88607943
2	NC_007797	GGCTTT	2	12	4700	4711	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	88607015
3	NC_007797	TGATAT	2	12	7582	7593	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	88606844
4	NC_007797	GTTGAT	2	12	14804	14815	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	88606787
5	NC_007797	GTAGTG	2	12	15902	15913	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	88606746
6	NC_007797	TGGAAG	2	12	16065	16076	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	88606746
7	NC_007797	TACGTT	2	12	16195	16206	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	88606746
8	NC_007797	TACAGA	2	12	18409	18420	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	88607636
9	NC_007797	CAAGAC	2	12	18889	18900	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	88607040
10	NC_007797	ACTTTC	2	12	28918	28929	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	88607403
11	NC_007797	ACTTTC	2	12	29425	29436	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	88607403
12	NC_007797	CTCTGC	2	12	33058	33069	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	88607566
13	NC_007797	TGTTAT	2	12	40839	40850	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	88607511
14	NC_007797	AGCCTA	2	12	44330	44341	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	88606722
15	NC_007797	GTTTGA	2	12	45855	45866	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	88607852
16	NC_007797	TTTTGG	2	12	48793	48804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88606966
17	NC_007797	GCTGTT	2	12	51500	51511	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	88606817
18	NC_007797	GACGTG	2	12	53818	53829	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	88606817
19	NC_007797	AGATGT	2	12	59536	59547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88607541
20	NC_007797	TGGGTG	2	12	64103	64114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88606858
21	NC_007797	ATTTTG	2	12	68181	68192	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	88607026
22	NC_007797	ATAAGC	2	12	69153	69164	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	88606750
23	NC_007797	GAAAGG	2	12	70421	70432	50 %	0 %	50 %	0 %	88606901
24	NC_007797	TCTTTT	2	12	75094	75105	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	88606778
25	NC_007797	TAGCTA	2	12	84301	84312	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	88607780
26	NC_007797	ATACAG	2	12	84553	84564	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	88607780
27	NC_007797	ACTCCG	2	12	95011	95022	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	88607628
28	NC_007797	TATTTC	2	12	99143	99154	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	88607927
29	NC_007797	TTAATG	2	12	100593	100604	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	88607674
30	NC_007797	GAGTTC	2	12	110803	110814	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	88607738
31	NC_007797	CCTGGC	2	12	114071	114082	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	88607880
32	NC_007797	AGTGGT	2	12	117094	117105	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	88606992
33	NC_007797	TACGTT	2	12	122794	122805	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	88607223
34	NC_007797	CAGTAT	2	12	127235	127246	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	88607609
35	NC_007797	GGGTTA	2	12	141414	141425	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	88607475
36	NC_007797	ACATCT	2	12	145002	145013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88607392
37	NC_007797	TGGCTT	2	12	152809	152820	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	88607214
38	NC_007797	TTCTGA	2	12	158261	158272	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	88607286
39	NC_007797	CAAAGG	2	12	160664	160675	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	88607253
40	NC_007797	GACTTT	2	12	161849	161860	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	88606897
41	NC_007797	CAAAGG	2	12	163442	163453	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	88607039
42	NC_007797	GACTTT	2	12	164627	164638	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	88607770
43	NC_007797	CGGCAT	2	12	167499	167510	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	88607041
44	NC_007797	TCAGTA	2	12	170229	170240	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	88607371
45	NC_007797	GCGTTG	2	12	174798	174809	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	88606879
46	NC_007797	CTGAAC	2	12	186150	186161	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	88607802
47	NC_007797	GCTATG	2	12	201065	201076	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	88607575
48	NC_007797	TCTCTA	2	12	201099	201110	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	88607575
49	NC_007797	TTAGCA	2	12	203381	203392	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	88606809
50	NC_007797	TCACTG	2	12	207696	207707	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	88607777
51	NC_007797	TCACTG	2	12	212039	212050	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	88606986
52	NC_007797	GCAATG	2	12	221622	221633	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	88607384
53	NC_007797	ATGCGT	2	12	223433	223444	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	88607005
54	NC_007797	TTCTAC	2	12	228905	228916	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	88607014
55	NC_007797	CTTTTC	2	12	234572	234583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88607892
56	NC_007797	CCAGCA	2	12	238439	238450	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	88606723
57	NC_007797	GCCTAT	2	12	246844	246855	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	88606862
58	NC_007797	TCGTAT	2	12	258590	258601	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	88607848
59	NC_007797	CTATCC	2	12	269744	269755	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	88607225
60	NC_007797	TGAAGA	2	12	274128	274139	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	88607530
61	NC_007797	GGGTAA	2	12	279197	279208	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	88607804
62	NC_007797	CGTTAT	2	12	280192	280203	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	88607479
63	NC_007797	TATTCC	2	12	283792	283803	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	88607078
64	NC_007797	CTAAGG	2	12	287714	287725	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	88606692
65	NC_007797	CAAGAG	2	12	289423	289434	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	88607372
66	NC_007797	GATATA	3	18	294028	294045	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	88607182
67	NC_007797	GCTTTG	2	12	306748	306759	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	88607307
68	NC_007797	TAGTGG	2	12	328511	328522	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	88606792
69	NC_007797	GAAGAG	2	12	328833	328844	50 %	0 %	50 %	0 %	88606792
70	NC_007797	GGCAAG	2	12	328956	328967	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	88606792
71	NC_007797	TGTAGG	2	12	334203	334214	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	88607670
72	NC_007797	GGTACT	2	12	347286	347297	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	88607600
73	NC_007797	TTGCTA	2	12	350191	350202	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	88607418
74	NC_007797	CTATTA	2	12	351738	351749	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	88607282
75	NC_007797	ACCGTA	2	12	351827	351838	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	88607282
76	NC_007797	AATTTA	2	12	370692	370703	50 %	50 %	0 %	0 %	88607745
77	NC_007797	GAAAAG	2	12	371144	371155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88607745
78	NC_007797	AGGCTA	2	12	371478	371489	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	88607745
79	NC_007797	CAGCAT	2	12	373007	373018	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	88607745
80	NC_007797	AGGTTC	2	12	373284	373295	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	88607035
81	NC_007797	GTAGAT	2	12	375323	375334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88607035
82	NC_007797	ATTATA	2	12	378943	378954	50 %	50 %	0 %	0 %	88607561
83	NC_007797	TGAGGT	2	12	383400	383411	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	88607561
84	NC_007797	TGAGGT	2	12	383646	383657	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	88607561
85	NC_007797	TGAGGT	2	12	383892	383903	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	88607561
86	NC_007797	TGAGGT	2	12	384054	384065	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	88607561
87	NC_007797	GATACT	2	12	384280	384291	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	88607561
88	NC_007797	ACGTGA	2	12	389869	389880	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	88607953
89	NC_007797	AGGAGA	2	12	391694	391705	50 %	0 %	50 %	0 %	88607816
90	NC_007797	TATGGT	2	12	410795	410806	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	88607503
91	NC_007797	TGGATG	2	12	417253	417264	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	88607267
92	NC_007797	GAAGGT	2	12	418326	418337	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	88607267
93	NC_007797	GGTTAT	2	12	419012	419023	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	88607654
94	NC_007797	TACGAG	2	12	419753	419764	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	88607654
95	NC_007797	ATATGC	2	12	431220	431231	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	88607086
96	NC_007797	GGTGGC	2	12	436779	436790	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	88607423
97	NC_007797	AAGACT	2	12	446284	446295	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	88606708
98	NC_007797	CGGTGG	2	12	447286	447297	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	88607304
99	NC_007797	TTACAT	2	12	449314	449325	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	88607132
100	NC_007797	CGATTG	2	12	459348	459359	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	88607378
101	NC_007797	ATTTGG	2	12	462543	462554	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	88607734
102	NC_007797	AGATAT	2	12	464571	464582	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	88607009
103	NC_007797	AAAGGA	2	12	464790	464801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88607009
104	NC_007797	AGGTTG	2	12	466714	466725	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	88607683
105	NC_007797	ATTGAT	2	12	466755	466766	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	88607683
106	NC_007797	AAGGAA	2	12	468503	468514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88607319
107	NC_007797	TGTTTG	2	12	470239	470250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88607319
108	NC_007797	TCATGC	2	12	472289	472300	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	88607130
109	NC_007797	GATGCT	2	12	472479	472490	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	88607130
110	NC_007797	GCGCTT	2	12	497709	497720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88606922
111	NC_007797	GGATAG	2	12	501809	501820	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	88606838
112	NC_007797	AGGAAG	2	12	502365	502376	50 %	0 %	50 %	0 %	88606838
113	NC_007797	GATAAG	2	12	514378	514389	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	88607631
114	NC_007797	GCCTTC	2	12	521137	521148	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	88607774
115	NC_007797	TGATCT	2	12	530936	530947	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	88606902
116	NC_007797	ATCTGC	2	12	558366	558377	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	88607519
117	NC_007797	GATTCC	2	12	561020	561031	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	88607700
118	NC_007797	TCTTCC	2	12	563179	563190	0 %	50 %	0 %	50 %	88606831
119	NC_007797	AAAATC	2	12	565479	565490	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	88606932
120	NC_007797	TTTTAC	2	12	569832	569843	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	88607383
121	NC_007797	TTTTAC	2	12	570009	570020	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	88607383
122	NC_007797	TTTTAC	2	12	570186	570197	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	88607383
123	NC_007797	TTTTAC	2	12	570363	570374	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	88607383
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219	NC_007797	CCAGCT	2	12	1133372	1133383	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	88607498
220	NC_007797	CCCCTA	2	12	1157839	1157850	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	88607554
221	NC_007797	ATTGCT	2	12	1167864	1167875	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	88607206
222	NC_007797	AAACTT	2	12	1168190	1168201	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	88607206
223	NC_007797	TGTAAG	2	12	1172205	1172216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88607517
224	NC_007797	TGTACT	2	12	1187449	1187460	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	88607850
225	NC_007797	GAAGGT	2	12	1204805	1204816	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	88606975
226	NC_007797	CTTGTC	2	12	1217608	1217619	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	88607935
227	NC_007797	TAAACC	2	12	1217743	1217754	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	88607935
228	NC_007797	CTAACG	2	12	1217894	1217905	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	88607935
229	NC_007797	TCCATC	2	12	1225340	1225351	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	88607658
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231	NC_007797	ACGCAA	2	12	1230204	1230215	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	88607079
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.