MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Anaplasma phagocytophilum HZ

Total Repeats: 341

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007797	TAAGT	2	10	9148	9157	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007797	CATAG	2	10	10976	10985	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_007797	TGGGA	2	10	12163	12172	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007797	TATCT	2	10	12392	12401	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_007797	AAAAT	2	10	20879	20888	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007797	CTTTT	2	10	44687	44696	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_007797	TAGGA	2	10	46805	46814	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007797	AAGTG	2	10	47898	47907	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007797	TATGA	2	10	48372	48381	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007797	AAATT	2	10	56213	56222	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007797	GGAAA	2	10	73452	73461	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007797	CTACA	2	10	73969	73978	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_007797	TTGTA	2	10	77451	77460	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007797	GCAAG	2	10	78916	78925	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_007797	CCCTA	2	10	80880	80889	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
16	NC_007797	ATCTT	2	10	83807	83816	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_007797	ACATA	2	10	85837	85846	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_007797	TTTTG	2	10	87341	87350	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007797	CCGTA	2	10	91415	91424	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_007797	AGATT	2	10	92568	92577	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007797	ATTTT	2	10	92873	92882	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007797	TGGTA	2	10	93418	93427	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007797	TTCTA	2	10	93932	93941	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_007797	GAGAG	2	10	99716	99725	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007797	TGTCA	2	10	107670	107679	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_007797	TTTTC	2	10	108359	108368	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_007797	TGTGT	2	10	117597	117606	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007797	ATTGC	2	10	119063	119072	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_007797	GTAGG	2	10	121176	121185	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007797	TGTTT	2	10	121402	121411	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007797	ATTGC	2	10	121840	121849	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_007797	CAATC	2	10	122676	122685	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_007797	GTCTA	2	10	123199	123208	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_007797	CTCAA	2	10	126882	126891	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_007797	CTCAT	2	10	137594	137603	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_007797	CACAG	2	10	137764	137773	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_007797	ATTCT	2	10	150002	150011	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_007797	TTGTT	2	10	159628	159637	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007797	AGTTA	2	10	159787	159796	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007797	ATGTT	2	10	166162	166171	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007797	GTTGC	2	10	167701	167710	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_007797	AAGAT	2	10	168740	168749	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007797	TAGAA	2	10	172200	172209	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007797	ATTGT	2	10	172609	172618	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007797	TTCTG	2	10	197542	197551	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_007797	CCTTA	2	10	203166	203175	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_007797	GGTAT	2	10	207775	207784	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007797	GTTTT	2	10	209362	209371	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007797	TAATA	2	10	213031	213040	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007797	TATAG	2	10	216320	216329	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007797	TGTGA	2	10	220894	220903	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007797	ATTCT	2	10	225422	225431	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_007797	TAGAT	2	10	226414	226423	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007797	GATTG	2	10	226496	226505	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007797	TCTAC	2	10	238277	238286	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_007797	TACTA	2	10	242280	242289	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_007797	CCTAT	2	10	250398	250407	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
58	NC_007797	GTGCT	2	10	259685	259694	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_007797	TTTTG	2	10	260564	260573	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007797	ATAGG	2	10	275232	275241	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007797	CTACA	2	10	296182	296191	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_007797	GTTAT	2	10	298433	298442	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007797	CAAAA	2	10	304288	304297	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_007797	CCATT	2	10	310496	310505	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_007797	TTTAT	2	10	311364	311373	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007797	CAAGT	2	10	322696	322705	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_007797	TGCGC	2	10	339596	339605	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
68	NC_007797	ACACG	2	10	339955	339964	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_007797	ATAGA	2	10	340015	340024	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007797	ATTCT	2	10	340247	340256	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_007797	GCTAC	2	10	341024	341033	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_007797	TGTGT	2	10	344069	344078	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007797	TAGAA	2	10	349885	349894	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007797	ATAGT	2	10	364256	364265	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007797	CAAAA	2	10	392550	392559	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_007797	ATATG	2	10	392987	392996	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007797	CTGCA	2	10	394099	394108	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_007797	GCATT	2	10	404415	404424	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_007797	TGTGG	2	10	416273	416282	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007797	GGTGG	2	10	420544	420553	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007797	TTATG	2	10	431957	431966	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007797	AATAC	2	10	450272	450281	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_007797	AATAC	2	10	450664	450673	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_007797	GGCTT	2	10	458702	458711	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_007797	TTCTA	2	10	476955	476964	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_007797	TGATA	2	10	479580	479589	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007797	CAAAA	2	10	481514	481523	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_007797	ATATG	2	10	481951	481960	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007797	CTATC	2	10	492569	492578	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
90	NC_007797	CCTGA	2	10	493073	493082	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_007797	CTATC	2	10	505898	505907	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_007797	AAGTG	2	10	514867	514876	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007797	ACCTT	2	10	522824	522833	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
94	NC_007797	AGGGA	2	10	524679	524688	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007797	ATCTT	2	10	524755	524764	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_007797	TAAGG	2	10	525301	525310	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007797	GCGTA	2	10	525817	525826	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_007797	CCGTA	2	10	526239	526248	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_007797	AATTA	2	10	528495	528504	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007797	TAAAA	2	10	544428	544437	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007797	TTCTC	2	10	545909	545918	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_007797	ATCTG	2	10	554489	554498	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_007797	ATAGA	2	10	554873	554882	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007797	AGCTA	2	10	561206	561215	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_007797	AGTAT	2	10	561272	561281	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007797	ATTAG	2	10	583251	583260	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007797	CATAG	2	10	583447	583456	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_007797	CAAAA	2	10	583738	583747	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_007797	ATATG	2	10	584112	584121	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007797	TATGT	2	10	587993	588002	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007797	CATGT	2	10	590625	590634	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_007797	TAGAA	2	10	591784	591793	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007797	GTTAT	2	10	596527	596536	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007797	GTTTT	2	10	607387	607396	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007797	ATATT	2	10	608580	608589	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007797	TCGCT	2	10	614432	614441	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_007797	GTACA	2	10	614875	614884	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_007797	GGGAA	2	10	617886	617895	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007797	AGTTT	2	10	618169	618178	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007797	ATTCA	2	10	619613	619622	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_007797	TTATA	2	10	623154	623163	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007797	GTGTT	2	10	624319	624328	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007797	TGCCG	2	10	625081	625090	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
124	NC_007797	ATTCT	2	10	630767	630776	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_007797	GTTTT	2	10	632234	632243	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007797	ACCTA	2	10	632496	632505	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_007797	ATATC	2	10	635127	635136	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_007797	CTGTA	2	10	637669	637678	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_007797	AGGGA	2	10	642648	642657	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007797	CAATG	2	10	645674	645683	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_007797	GATAG	2	10	646919	646928	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007797	TAGCA	2	10	648254	648263	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_007797	GATAT	2	10	655874	655883	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007797	CAAAA	2	10	655888	655897	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_007797	AAGCA	2	10	658137	658146	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_007797	CCGGG	2	10	661354	661363	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
137	NC_007797	CAATG	2	10	662161	662170	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_007797	ATCTT	2	10	662193	662202	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_007797	CTCTT	2	10	662687	662696	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
140	NC_007797	CAATG	2	10	665834	665843	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_007797	TACAA	2	10	668804	668813	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_007797	TATAT	2	10	673073	673082	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007797	ATTCA	2	10	679832	679841	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_007797	TAAAC	2	10	680245	680254	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_007797	ATAAA	2	10	686356	686365	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007797	TCACT	2	10	691803	691812	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
147	NC_007797	TTTCT	2	10	691852	691861	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.