MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Anaplasma phagocytophilum HZ

Total Repeats: 20171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007797	ATG	2	6	14	19	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007797	TGT	2	6	46	51	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007797	TAA	2	6	55	60	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007797	TTC	2	6	61	66	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007797	TCG	2	6	147	152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88607943
6	NC_007797	TAT	2	6	179	184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88607943
7	NC_007797	AGG	2	6	223	228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88607943
8	NC_007797	ATT	2	6	282	287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88607943
9	NC_007797	GAA	2	6	434	439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88607943
10	NC_007797	GAC	2	6	458	463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88607943
11	NC_007797	CAG	2	6	522	527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88607943
12	NC_007797	TAC	2	6	537	542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88607943
13	NC_007797	TCA	2	6	629	634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88607943
14	NC_007797	ATA	2	6	678	683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88607943
15	NC_007797	CTG	2	6	714	719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88607943
16	NC_007797	ATG	2	6	858	863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88607943
17	NC_007797	TGC	2	6	991	996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88607943
18	NC_007797	AGT	2	6	1015	1020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88607943
19	NC_007797	GGA	2	6	1054	1059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88607943
20	NC_007797	TGC	2	6	1138	1143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88607943
21	NC_007797	CAG	2	6	1171	1176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88607943
22	NC_007797	GGC	2	6	1201	1206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	88607943
23	NC_007797	GTT	2	6	1244	1249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88607943
24	NC_007797	ATG	2	6	1251	1256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88607943
25	NC_007797	ATG	2	6	1265	1270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88607943
26	NC_007797	TCA	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88607943
27	NC_007797	ATT	2	6	1444	1449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88607943
28	NC_007797	TGA	2	6	1564	1569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88607943
29	NC_007797	GAA	3	9	1595	1603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88607943
30	NC_007797	CAG	2	6	1646	1651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88607943
31	NC_007797	AGC	2	6	2005	2010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88607943
32	NC_007797	ATT	2	6	2013	2018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88607943
33	NC_007797	CGT	2	6	2101	2106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88607943
34	NC_007797	TAT	2	6	2132	2137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88607943
35	NC_007797	AGA	2	6	2156	2161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88607943
36	NC_007797	ACA	2	6	2306	2311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88607943
37	NC_007797	GGA	2	6	2355	2360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88607943
38	NC_007797	AGT	2	6	2402	2407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88607943
39	NC_007797	ATT	2	6	2533	2538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88607943
40	NC_007797	AGA	2	6	2551	2556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88607943
41	NC_007797	TGA	2	6	2580	2585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88607943
42	NC_007797	AAG	2	6	2586	2591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88607943
43	NC_007797	CTG	2	6	2887	2892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88607073
44	NC_007797	TGT	2	6	2923	2928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88607073
45	NC_007797	AGC	2	6	2960	2965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88607073
46	NC_007797	TGA	2	6	3097	3102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88607073
47	NC_007797	ATC	2	6	3118	3123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88607073
48	NC_007797	TAA	2	6	3196	3201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88607073
49	NC_007797	CAC	2	6	3255	3260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	88607073
50	NC_007797	GGA	2	6	3327	3332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88607073
51	NC_007797	GAT	2	6	3380	3385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88607073
52	NC_007797	TCA	2	6	3396	3401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88607073
53	NC_007797	TGG	2	6	3422	3427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88607073
54	NC_007797	GTT	2	6	3480	3485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88607073
55	NC_007797	TGC	2	6	3500	3505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88607073
56	NC_007797	GCT	2	6	3603	3608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_007797	TAG	2	6	3757	3762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88607911
58	NC_007797	GCG	2	6	3933	3938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	88607911
59	NC_007797	TGT	2	6	4097	4102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88607911
60	NC_007797	GAG	2	6	4144	4149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88607911
61	NC_007797	ACA	2	6	4284	4289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88607911
62	NC_007797	AGC	2	6	4301	4306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88607911
63	NC_007797	CAA	3	9	4403	4411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88607015
64	NC_007797	GTA	2	6	4650	4655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88607015
65	NC_007797	AGG	2	6	4668	4673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88607015
66	NC_007797	TAT	2	6	4811	4816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88607015
67	NC_007797	TAT	2	6	4928	4933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88607015
68	NC_007797	GGT	2	6	4995	5000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88607015
69	NC_007797	ATG	2	6	5101	5106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007797	GCA	2	6	5207	5212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_007797	ACG	2	6	5226	5231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_007797	TTA	2	6	5341	5346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007797	TAT	2	6	5359	5364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007797	ATG	2	6	5376	5381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007797	ATG	2	6	5407	5412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007797	ATG	2	6	5422	5427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007797	TTC	2	6	5500	5505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_007797	GAA	2	6	5664	5669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007797	AAG	2	6	5702	5707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007797	GTA	2	6	5758	5763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007797	TTG	2	6	6039	6044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007797	AAG	2	6	6090	6095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007797	AGA	2	6	6124	6129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007797	TGT	2	6	6133	6138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007797	TGA	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88607386
86	NC_007797	GGA	2	6	6220	6225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88607386
87	NC_007797	TGT	2	6	6275	6280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88607386
88	NC_007797	GTG	2	6	6377	6382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88607386
89	NC_007797	TCA	2	6	6538	6543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88607386
90	NC_007797	TAT	2	6	6642	6647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88607386
91	NC_007797	TCC	2	6	6682	6687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	88607386
92	NC_007797	CTA	2	6	6779	6784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88607386
93	NC_007797	GGA	2	6	6799	6804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	88607386
94	NC_007797	ATA	2	6	6841	6846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88607386
95	NC_007797	TGA	2	6	6897	6902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88607386
96	NC_007797	TGA	2	6	6936	6941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88607386
97	NC_007797	GAG	2	6	7038	7043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007797	TGT	2	6	7183	7188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88606844
99	NC_007797	GAA	3	9	7214	7222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88606844
100	NC_007797	TGG	2	6	7318	7323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88606844
101	NC_007797	ATT	2	6	7341	7346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	88606844
102	NC_007797	AAG	2	6	7424	7429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88606844
103	NC_007797	TGC	2	6	7465	7470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88606844
104	NC_007797	TAG	2	6	7477	7482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88606844
105	NC_007797	GCG	2	6	7539	7544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	88606844
106	NC_007797	TGG	2	6	7677	7682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88606844
107	NC_007797	GTT	2	6	7770	7775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007797	CAA	2	6	7843	7848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_007797	TAC	2	6	8198	8203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88607550
110	NC_007797	CCG	2	6	8280	8285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	88607550
111	NC_007797	CCT	2	6	8355	8360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	88607550
112	NC_007797	TCT	2	6	8397	8402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88607550
113	NC_007797	GAT	2	6	8427	8432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88607550
114	NC_007797	TTG	2	6	8465	8470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88607550
115	NC_007797	TCA	2	6	8481	8486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88607550
116	NC_007797	TGC	2	6	8487	8492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88607550
117	NC_007797	CTT	2	6	8711	8716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88607550
118	NC_007797	ACT	2	6	8841	8846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88607550
119	NC_007797	TCC	2	6	8859	8864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	88607550
120	NC_007797	CTA	2	6	8866	8871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88607550
121	NC_007797	AGT	2	6	8962	8967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88607550
122	NC_007797	ATC	2	6	8975	8980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88607550
123	NC_007797	TAA	2	6	9034	9039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	88607550
124	NC_007797	TGT	2	6	9046	9051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88607550
125	NC_007797	ATT	2	6	9085	9090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007797	ATA	2	6	9095	9100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007797	ATA	2	6	9105	9110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007797	ATA	2	6	9119	9124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007797	TGT	2	6	9229	9234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007797	TAC	2	6	9342	9347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88606947
131	NC_007797	TGT	2	6	9350	9355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88606947
132	NC_007797	GGT	2	6	9363	9368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88606947
133	NC_007797	TAG	2	6	9424	9429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88606947
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135	NC_007797	ATG	2	6	9526	9531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88606947
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