MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Anaplasma phagocytophilum HZ

Total Repeats: 6064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_007797	AGC	2	6	1459080	1459085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_007797	CAC	2	6	1459129	1459134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6003	NC_007797	GTC	2	6	1459154	1459159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_007797	TTA	2	6	1459176	1459181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_007797	CTT	2	6	1459247	1459252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_007797	AGC	2	6	1459343	1459348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_007797	AAC	2	6	1459373	1459378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_007797	TAG	2	6	1459400	1459405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_007797	TAC	2	6	1459432	1459437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_007797	CAC	2	6	1459498	1459503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6011	NC_007797	TGT	2	6	1459543	1459548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_007797	ATA	2	6	1459658	1459663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_007797	CAA	2	6	1459870	1459875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_007797	TAC	2	6	1460016	1460021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_007797	CTA	2	6	1462429	1462434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_007797	TCC	2	6	1463483	1463488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6017	NC_007797	AAC	2	6	1463496	1463501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_007797	CTA	2	6	1464829	1464834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_007797	CAT	2	6	1466448	1466453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_007797	CTA	2	6	1466460	1466465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_007797	TAT	2	6	1466642	1466647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_007797	CAA	2	6	1466660	1466665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_007797	ATG	2	6	1466818	1466823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_007797	ACT	2	6	1466848	1466853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_007797	AGA	2	6	1466954	1466959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_007797	ATA	2	6	1467008	1467013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_007797	AGA	2	6	1467186	1467191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_007797	CAA	2	6	1467206	1467211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_007797	CGC	2	6	1467215	1467220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6030	NC_007797	CTA	2	6	1467248	1467253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_007797	CTA	2	6	1467278	1467283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_007797	TGT	2	6	1467325	1467330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_007797	TCG	2	6	1467455	1467460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_007797	CAC	2	6	1467470	1467475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6035	NC_007797	TTC	2	6	1467519	1467524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_007797	AGC	3	9	1467660	1467668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_007797	AAC	2	6	1467690	1467695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_007797	TAG	2	6	1467717	1467722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_007797	TAC	2	6	1467749	1467754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_007797	CAC	2	6	1467815	1467820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6041	NC_007797	TGT	2	6	1467860	1467865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_007797	ATA	2	6	1468003	1468008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_007797	TAA	2	6	1468015	1468020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_007797	GGC	2	6	1468172	1468177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_007797	CAT	2	6	1468218	1468223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_007797	TAC	2	6	1468226	1468231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_007797	GAA	2	6	1468283	1468288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_007797	ATA	2	6	1469679	1469684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_007797	CTG	2	6	1469705	1469710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_007797	ATT	2	6	1469723	1469728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_007797	ATA	2	6	1469763	1469768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_007797	ACT	2	6	1469892	1469897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_007797	ATC	2	6	1469976	1469981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_007797	ACT	2	6	1469994	1469999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_007797	TGT	2	6	1470055	1470060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_007797	CAG	2	6	1470071	1470076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_007797	ATA	2	6	1470107	1470112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_007797	CAT	2	6	1470175	1470180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_007797	ACA	2	6	1470198	1470203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_007797	GCA	2	6	1470413	1470418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_007797	CAC	2	6	1470455	1470460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6062	NC_007797	AAT	2	6	1470575	1470580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_007797	TAA	2	6	1470666	1470671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_007797	TTA	3	9	1471259	1471267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.