MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Methanospirillum hungatei JF-1 chromosome

Total Repeats: 1126

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007796	GCATTT	2	12	402	413	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_007796	GAGAGT	2	12	459	470	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007796	AAAACA	2	12	1173	1184	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_007796	AACGGA	2	12	4478	4489	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	88601326
5	NC_007796	CACAAA	2	12	13314	13325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007796	CGAAAA	2	12	14700	14711	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	88601331
7	NC_007796	AAAAGA	2	12	22832	22843	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007796	GGTGTC	2	12	28783	28794	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	88601337
9	NC_007796	ATCGGC	2	12	29727	29738	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	88601337
10	NC_007796	TATCTG	2	12	35511	35522	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	88601344
11	NC_007796	CCTGTA	2	12	43079	43090	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_007796	GAAGGC	2	12	43280	43291	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_007796	TTCTTT	2	12	53011	53022	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_007796	CCTCTT	2	12	54536	54547	0 %	50 %	0 %	50 %	88601356
15	NC_007796	GACCAT	2	12	74285	74296	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	88601372
16	NC_007796	TTTGAG	2	12	74523	74534	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	88601372
17	NC_007796	ACCAGG	2	12	74748	74759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88601372
18	NC_007796	GGAGCA	2	12	90669	90680	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	88601390
19	NC_007796	TTTTCG	2	12	91747	91758	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	88601391
20	NC_007796	TGATGC	2	12	99366	99377	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	88601396
21	NC_007796	ACCGGG	2	12	103818	103829	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	88601402
22	NC_007796	TGAACC	2	12	105996	106007	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	88601404
23	NC_007796	CAGATC	2	12	108378	108389	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	88601406
24	NC_007796	ATCTGA	2	12	113351	113362	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	88601413
25	NC_007796	GAACGT	2	12	114063	114074	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	88601414
26	NC_007796	CTCCCA	2	12	118315	118326	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	88601419
27	NC_007796	TGTCAG	2	12	118396	118407	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	88601419
28	NC_007796	AATATT	2	12	119868	119879	50 %	50 %	0 %	0 %	88601421
29	NC_007796	AAATTA	2	12	120002	120013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007796	AAAGGA	2	12	122081	122092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	88601423
31	NC_007796	AGGTGA	2	12	122095	122106	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	88601423
32	NC_007796	ATGCAA	2	12	123057	123068	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	88601424
33	NC_007796	TTCTGC	2	12	123447	123458	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	88601424
34	NC_007796	AAGATA	2	12	124604	124615	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	88601425
35	NC_007796	AAATTT	2	12	131258	131269	50 %	50 %	0 %	0 %	88601430
36	NC_007796	TTGATG	2	12	137052	137063	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	88601434
37	NC_007796	CTTCAT	2	12	154382	154393	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	88601450
38	NC_007796	TGCAGA	2	12	160932	160943	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	88601456
39	NC_007796	TCCTGT	2	12	161509	161520	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	88601457
40	NC_007796	GATATT	2	12	162828	162839	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	88601459
41	NC_007796	GTTCAA	2	12	164852	164863	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	88601462
42	NC_007796	ATATGT	2	12	175468	175479	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007796	GTGAAA	2	12	175544	175555	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007796	TGGTAC	2	12	175966	175977	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	88601474
45	NC_007796	TATGCA	2	12	182159	182170	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	88601481
46	NC_007796	ATAAGA	2	12	183653	183664	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007796	TTTAAA	2	12	185127	185138	50 %	50 %	0 %	0 %	88601484
48	NC_007796	CAGATC	2	12	191941	191952	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	88601489
49	NC_007796	GATTGA	2	12	194129	194140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	88601490
50	NC_007796	TCTTCA	2	12	194887	194898	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	88601491
51	NC_007796	TTTTCG	2	12	204032	204043	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	88601498
52	NC_007796	TTTACT	2	12	207864	207875	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	88601500
53	NC_007796	TCAGTT	2	12	209436	209447	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	88601502
54	NC_007796	TGCTCC	2	12	210501	210512	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	88601503
55	NC_007796	TTGCAT	2	12	210753	210764	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	88601503
56	NC_007796	GATTCT	2	12	211786	211797	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	88601503
57	NC_007796	CTGAAC	2	12	213038	213049	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	88601504
58	NC_007796	GATGTT	2	12	213121	213132	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	88601504
59	NC_007796	CATGAT	2	12	218445	218456	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	88601507
60	NC_007796	ATTCTG	2	12	219249	219260	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	88601508
61	NC_007796	CTGGGG	2	12	223614	223625	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	88601512
62	NC_007796	TCCAGA	2	12	236430	236441	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	88601523
63	NC_007796	TTATTC	2	12	236764	236775	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	88601524
64	NC_007796	TTGTTT	2	12	237616	237627	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	88601524
65	NC_007796	AGATCA	2	12	239663	239674	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	88601527
66	NC_007796	CAGAGC	2	12	240759	240770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88601528
67	NC_007796	TCTGTC	2	12	247914	247925	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	88601534
68	NC_007796	TCCTGG	2	12	249799	249810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88601536
69	NC_007796	ACCAGG	2	12	255445	255456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88601543
70	NC_007796	GAAGAG	2	12	258425	258436	50 %	0 %	50 %	0 %	88601545
71	NC_007796	GCAAGA	2	12	261411	261422	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	88601548
72	NC_007796	GGTGAA	2	12	264657	264668	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	88601552
73	NC_007796	GAACCA	2	12	268181	268192	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_007796	TCCTTT	2	12	274962	274973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	88601562
75	NC_007796	CGATGT	2	12	275144	275155	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	88601562
76	NC_007796	GCTTAT	2	12	277021	277032	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	88601564
77	NC_007796	CCAGAG	2	12	279911	279922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	88601567
78	NC_007796	ACTGGG	2	12	282918	282929	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	88601569
79	NC_007796	AAGGAG	2	12	284929	284940	50 %	0 %	50 %	0 %	88601572
80	NC_007796	GATTAA	2	12	294675	294686	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007796	GGATCC	2	12	297477	297488	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	88601580
82	NC_007796	TCCATA	2	12	297659	297670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601580
83	NC_007796	TTTTCG	2	12	298625	298636	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	88601581
84	NC_007796	TTTTCG	2	12	303191	303202	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	88601585
85	NC_007796	CTTTCC	2	12	305103	305114	0 %	50 %	0 %	50 %	88601586
86	NC_007796	GGATCA	2	12	309262	309273	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	88601589
87	NC_007796	ACGAAT	2	12	309527	309538	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	88601589
88	NC_007796	GGTTTT	2	12	310984	310995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	88601590
89	NC_007796	TATACC	2	12	312865	312876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	88601592
90	NC_007796	TGATCA	2	12	323602	323613	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	88601599
91	NC_007796	TACCCG	2	12	329740	329751	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	88601604
92	NC_007796	ATGACA	2	12	333623	333634	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	88601605
93	NC_007796	ATCTGC	2	12	333947	333958	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	88601605
94	NC_007796	TAATTT	2	12	338739	338750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007796	ACGATA	2	12	339388	339399	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	88601612
96	NC_007796	ACGATA	2	12	341216	341227	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	88601615
97	NC_007796	GACACC	2	12	341317	341328	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	88601615
98	NC_007796	TTATCT	2	12	345477	345488	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	88601617
99	NC_007796	AATGAT	2	12	351811	351822	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	88601624
100	NC_007796	AAGATC	2	12	352207	352218	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	88601624
101	NC_007796	GTTTCT	2	12	354478	354489	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	88601625
102	NC_007796	TATTAA	2	12	355583	355594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007796	ATATTA	2	12	356529	356540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007796	ATTTTT	2	12	357533	357544	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	88601628
105	NC_007796	GAACCT	2	12	357710	357721	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	88601628
106	NC_007796	TTTTAT	2	12	357904	357915	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	88601628
107	NC_007796	TTTACC	2	12	360859	360870	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	88601631
108	NC_007796	GTATCA	2	12	360985	360996	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	88601631
109	NC_007796	CCTCTC	2	12	361964	361975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	88601632
110	NC_007796	CGTCTC	2	12	362130	362141	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	88601632
111	NC_007796	ACTTGC	2	12	369289	369300	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	88601639
112	NC_007796	ATAAAA	2	12	373286	373297	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	88601642
113	NC_007796	GGGAAT	2	12	374333	374344	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	88601643
114	NC_007796	GTCCTT	2	12	377556	377567	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	88601646
115	NC_007796	GTGGGT	2	12	380513	380524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	88601649
116	NC_007796	GGGCAT	2	12	381092	381103	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	88601650
117	NC_007796	CAAAAC	2	12	381989	382000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	88601651
118	NC_007796	TCATCG	2	12	388111	388122	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	88601655
119	NC_007796	TGATTG	2	12	394682	394693	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	88601660
120	NC_007796	TTTTCG	2	12	395154	395165	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	88601661
121	NC_007796	CGTCCT	2	12	398063	398074	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	88601663
122	NC_007796	TCAGAT	2	12	400028	400039	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_007796	CTGGTC	2	12	402269	402280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	88601665
124	NC_007796	GCACTT	2	12	403358	403369	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	88601665
125	NC_007796	GGATTA	2	12	411033	411044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007796	CTGTAT	2	12	416315	416326	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	88601680
127	NC_007796	GAAGTC	2	12	416682	416693	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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131	NC_007796	TGATAT	2	12	423007	423018	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	88601689
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140	NC_007796	AATACT	2	12	441376	441387	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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220	NC_007796	CGAAAA	2	12	676178	676189	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	88601890
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229	NC_007796	TTGGTG	2	12	699175	699186	0 %	50 %	50 %	0 %	88601904
230	NC_007796	CATCCT	2	12	708371	708382	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	88601910
231	NC_007796	ATCAGG	2	12	712008	712019	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	88601913
232	NC_007796	CCCACA	2	12	712467	712478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	88601913
233	NC_007796	TGAGCG	2	12	714154	714165	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	88601914
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235	NC_007796	CTGGAA	2	12	719374	719385	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	88601919
236	NC_007796	CCACCG	2	12	725449	725460	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	88601924
237	NC_007796	CACAAA	2	12	725810	725821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
238	NC_007796	CGAAAA	2	12	727196	727207	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	88601925
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240	NC_007796	TTCTCT	2	12	728531	728542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
241	NC_007796	GGATTT	2	12	731043	731054	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	88601927
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340	NC_007796	ATCCGC	2	12	1008174	1008185	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	88602193
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348	NC_007796	TCATTT	2	12	1047039	1047050	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
349	NC_007796	GATGGT	2	12	1049544	1049555	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	88602237
350	NC_007796	TATTGG	2	12	1051457	1051468	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	88602238
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352	NC_007796	GAAGAG	2	12	1053413	1053424	50 %	0 %	50 %	0 %	88602239
353	NC_007796	AATATA	2	12	1057875	1057886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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462	NC_007796	TATCTT	2	12	1350541	1350552	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	88602476
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