MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanospirillum hungatei JF-1 chromosome

Total Repeats: 5919

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007796	TAA	2	6	376	381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007796	GAT	2	6	1007	1012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007796	TCA	2	6	1075	1080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007796	TTA	2	6	2005	2010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007796	TCA	2	6	2027	2032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007796	GGA	2	6	9425	9430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007796	AAT	2	6	9514	9519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007796	GAT	2	6	9565	9570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007796	CAT	2	6	11103	11108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_007796	AAT	2	6	11147	11152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007796	ATT	2	6	13341	13346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007796	TTA	2	6	13365	13370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007796	AAT	2	6	17367	17372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007796	TTA	2	6	17392	17397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007796	TGG	2	6	20484	20489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007796	CAT	2	6	20571	20576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007796	ATC	2	6	20651	20656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_007796	GAT	2	6	20706	20711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007796	ATC	2	6	20961	20966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_007796	TCA	2	6	20984	20989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_007796	CAT	2	6	22579	22584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007796	GAT	2	6	22616	22621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007796	TAA	2	6	22758	22763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007796	TGA	2	6	24984	24989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007796	TCA	2	6	28161	28166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_007796	ATT	2	6	28201	28206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007796	CCG	2	6	28274	28279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_007796	CTG	2	6	28299	28304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007796	GAA	2	6	28344	28349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007796	ATC	2	6	28364	28369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007796	GCT	2	6	28375	28380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_007796	AAG	2	6	28424	28429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007796	AAG	2	6	30400	30405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007796	TGT	2	6	30453	30458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007796	ACG	2	6	30610	30615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007796	AAT	2	6	35181	35186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007796	TCC	2	6	39417	39422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_007796	TGA	2	6	39515	39520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007796	TTC	2	6	39535	39540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007796	CGG	2	6	39613	39618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007796	CGA	2	6	39702	39707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007796	AGG	2	6	39930	39935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007796	GTT	2	6	40041	40046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007796	CAA	2	6	40059	40064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007796	GCA	2	6	40141	40146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007796	CCA	2	6	40215	40220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_007796	GAA	2	6	40236	40241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007796	GCC	2	6	40265	40270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_007796	CGG	2	6	40281	40286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007796	GTG	2	6	40292	40297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007796	CCG	2	6	40355	40360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_007796	ACC	2	6	40460	40465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_007796	CGC	2	6	40626	40631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_007796	CAC	2	6	40681	40686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_007796	GAG	2	6	40788	40793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007796	CGT	2	6	40803	40808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_007796	GTA	2	6	41095	41100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007796	ACC	2	6	41161	41166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_007796	TGA	2	6	41179	41184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007796	CCT	2	6	41274	41279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_007796	GCG	2	6	41373	41378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_007796	GAT	2	6	41492	41497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007796	GAA	2	6	41560	41565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007796	CGA	2	6	41617	41622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_007796	CAT	2	6	41711	41716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_007796	TAG	2	6	41756	41761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007796	GAA	2	6	41770	41775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007796	TAG	2	6	41793	41798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007796	TCA	2	6	41997	42002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_007796	GTA	3	9	42038	42046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007796	TTG	2	6	42178	42183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007796	GAA	2	6	42206	42211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007796	AAG	2	6	42256	42261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007796	CAA	2	6	42274	42279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007796	GAC	2	6	42301	42306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_007796	TAC	2	6	42308	42313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_007796	CAG	2	6	42327	42332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_007796	GGA	2	6	42394	42399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007796	GAA	2	6	42557	42562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007796	TCA	2	6	42598	42603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_007796	CGA	2	6	42605	42610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_007796	AGT	2	6	42709	42714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007796	AGC	2	6	42749	42754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_007796	ATG	2	6	42857	42862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007796	AGT	2	6	42939	42944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007796	TAA	2	6	43406	43411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007796	CGG	2	6	43514	43519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007796	GTA	2	6	43547	43552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007796	TGA	2	6	44013	44018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007796	GTC	2	6	44059	44064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_007796	CGG	2	6	44088	44093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_007796	GCA	3	9	44132	44140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_007796	GTT	2	6	44153	44158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007796	CGT	2	6	44194	44199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_007796	ACG	2	6	44447	44452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_007796	TAA	2	6	44480	44485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007796	CAG	2	6	44599	44604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_007796	CAG	2	6	44655	44660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_007796	ATC	2	6	44747	44752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_007796	GCT	2	6	44756	44761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_007796	CAG	2	6	44850	44855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_007796	ATC	2	6	44942	44947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_007796	GCT	2	6	44951	44956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_007796	CAT	2	6	47988	47993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_007796	AAT	2	6	48055	48060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007796	GTA	2	6	48063	48068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007796	CAA	2	6	48905	48910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007796	CAA	2	6	49037	49042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_007796	ATG	2	6	49917	49922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007796	ATC	2	6	58447	58452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_007796	TTC	2	6	58520	58525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_007796	TAT	2	6	58574	58579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007796	ATT	2	6	58583	58588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007796	GAT	2	6	58650	58655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007796	TAT	2	6	59962	59967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007796	AGT	2	6	59977	59982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007796	AGC	2	6	61306	61311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_007796	CTT	2	6	63210	63215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_007796	TCT	2	6	63236	63241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_007796	AGA	2	6	63331	63336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007796	TAT	2	6	63352	63357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007796	ATA	2	6	63475	63480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007796	TCC	2	6	66439	66444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_007796	ATC	2	6	66476	66481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_007796	ATT	2	6	66485	66490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007796	ATG	2	6	66534	66539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007796	GCA	2	6	66561	66566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_007796	TAT	2	6	66618	66623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007796	GGT	2	6	66747	66752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007796	CCA	2	6	76826	76831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_007796	ATA	2	6	76839	76844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007796	AGA	3	9	78030	78038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007796	GCA	2	6	78049	78054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_007796	TAC	2	6	78105	78110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_007796	CAG	2	6	83317	83322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_007796	GAA	2	6	83332	83337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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138	NC_007796	GTT	2	6	83348	83353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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