MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus NCTC 8325 chromosome

Total Repeats: 224

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007795	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007795	TTTAAA	2	12	3469	3480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007795	TAAATC	2	12	17162	17173	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_007795	AACAAA	2	12	55423	55434	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_007795	AATATA	2	12	63885	63896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007795	AATGAA	2	12	63897	63908	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007795	TAACAA	2	12	76418	76429	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_007795	ATTAAG	2	12	99247	99258	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007795	AATGTA	2	12	100414	100425	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007795	CTGTAA	2	12	102235	102246	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_007795	GTTTTT	2	12	113462	113473	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007795	TTTATA	2	12	162254	162265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007795	ATTAAT	2	12	162277	162288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007795	ATATGA	2	12	209178	209189	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007795	CTTCAA	2	12	214167	214178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_007795	GGAATA	2	12	223990	224001	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007795	ATATAG	2	12	245218	245229	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007795	ATTTTC	2	12	250534	250545	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_007795	ATAATT	2	12	251485	251496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007795	AACGAT	2	12	258801	258812	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_007795	TAACTT	2	12	267721	267732	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_007795	TTGTAA	2	12	328643	328654	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007795	AATGTA	2	12	366507	366518	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007795	AATTTG	2	12	366614	366625	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007795	TAAAGA	2	12	368587	368598	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007795	TTGAAA	2	12	389981	389992	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007795	TGTATA	2	12	405390	405401	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007795	TTTTTA	2	12	413455	413466	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007795	AAAATG	2	12	418888	418899	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007795	ACGTTG	2	12	439335	439346	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_007795	AAAATA	2	12	440059	440070	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007795	TTATAA	2	12	459372	459383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007795	AAATTT	2	12	466131	466142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007795	AAAGTT	2	12	503688	503699	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007795	TTATAA	2	12	521292	521303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007795	GTTATA	2	12	521963	521974	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007795	CTTAAA	2	12	530395	530406	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_007795	ACATGT	2	12	540365	540376	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_007795	ATTGCG	2	12	565872	565883	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_007795	AATGAT	2	12	569790	569801	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007795	TAGATG	2	12	569863	569874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007795	TAAAAT	2	12	585184	585195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007795	TTTTAA	2	12	597290	597301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007795	CATTAT	2	12	613601	613612	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_007795	CATCAA	2	12	624531	624542	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007795	TAATTT	2	12	628780	628791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007795	TGAATA	2	12	645258	645269	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007795	GGATTC	2	12	656609	656620	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_007795	AAATAT	2	12	659401	659412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007795	TTAAAA	2	12	671335	671346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007795	TAGTTA	2	12	675770	675781	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007795	TTTTTA	2	12	694045	694056	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007795	TGAAAA	2	12	702287	702298	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007795	ACAAAA	2	12	772073	772084	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_007795	TAAAAA	2	12	791215	791226	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007795	TATCAA	2	12	797696	797707	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_007795	TATAAT	2	12	799973	799984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007795	TTTTGA	2	12	801468	801479	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007795	TCATTT	2	12	807461	807472	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_007795	AAATTA	2	12	817573	817584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007795	AAGCAC	2	12	826304	826315	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_007795	ATTTAG	2	12	890197	890208	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007795	ATTCAA	2	12	890362	890373	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_007795	TTTAAT	2	12	906702	906713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007795	ACAATA	2	12	924099	924110	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_007795	AACGGA	2	12	938621	938632	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_007795	AAAAGC	2	12	943220	943231	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_007795	ATTGAA	2	12	947502	947513	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007795	CATTTA	2	12	968552	968563	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_007795	ATCATA	2	12	970447	970458	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_007795	ATTGCA	2	12	978035	978046	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_007795	TTTTCT	2	12	990763	990774	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_007795	TTTATA	2	12	1026776	1026787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007795	ATTTTT	2	12	1050727	1050738	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007795	ATAATT	2	12	1051524	1051535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007795	TAATGA	2	12	1064564	1064575	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007795	ATTTAT	2	12	1083689	1083700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007795	ATTATA	2	12	1087607	1087618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007795	AAATTT	2	12	1088416	1088427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007795	AAGTAA	2	12	1110128	1110139	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007795	TCGTTT	2	12	1113255	1113266	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_007795	TTAATT	2	12	1123971	1123982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007795	AATTAA	2	12	1126707	1126718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007795	GAAATT	2	12	1171615	1171626	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007795	GAAAAA	2	12	1181547	1181558	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007795	AATGAT	2	12	1184391	1184402	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007795	TAAAGA	2	12	1198893	1198904	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007795	TTTCAT	2	12	1214699	1214710	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_007795	TATATT	2	12	1219358	1219369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007795	CATATT	2	12	1244427	1244438	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_007795	ATGTAT	2	12	1245048	1245059	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007795	AAAGAA	2	12	1245280	1245291	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007795	TTAAAG	2	12	1250536	1250547	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007795	AAAGCT	2	12	1282318	1282329	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_007795	AATATT	2	12	1282675	1282686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007795	GAAAAT	2	12	1282735	1282746	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007795	GAAATG	2	12	1283113	1283124	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007795	ATATAA	2	12	1287125	1287136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007795	AAAATA	2	12	1301193	1301204	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007795	GTTTTA	2	12	1316940	1316951	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007795	TAAAAT	2	12	1332515	1332526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007795	TATCTT	2	12	1355350	1355361	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_007795	TTGATT	2	12	1355413	1355424	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007795	AATAAA	2	12	1365605	1365616	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007795	TATTCT	2	12	1410378	1410389	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_007795	TACTTG	2	12	1420625	1420636	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_007795	AAAAAT	2	12	1420641	1420652	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007795	TTAATC	2	12	1434148	1434159	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_007795	TATGAT	2	12	1520109	1520120	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007795	ACAAGA	2	12	1534589	1534600	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_007795	TAAAAA	2	12	1547491	1547502	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007795	TAATAG	2	12	1562912	1562923	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007795	ATATTT	2	12	1562975	1562986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007795	AATTTA	2	12	1564659	1564670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007795	AGCCAA	2	12	1592545	1592556	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_007795	TTGACT	2	12	1592564	1592575	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_007795	TTTAAC	2	12	1597448	1597459	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_007795	TTATAA	2	12	1599930	1599941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007795	ACCTTT	2	12	1609887	1609898	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_007795	TTTTAT	2	12	1612355	1612366	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007795	AGTTTT	2	12	1638011	1638022	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007795	AATTAA	2	12	1639256	1639267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007795	TAAAAC	2	12	1642396	1642407	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_007795	TTAAAT	2	12	1649715	1649726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007795	AATTTA	2	12	1652205	1652216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007795	ATTTTC	2	12	1658240	1658251	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_007795	TTTTAG	2	12	1664378	1664389	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007795	TAAAAA	2	12	1691054	1691065	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007795	GTAAAA	2	12	1707456	1707467	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.