MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus NCTC 8325 chromosome

Total Repeats: 630

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007795	TGAAC	2	10	6975	6984	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_007795	AGGAA	2	10	14342	14351	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007795	GTAGG	2	10	14402	14411	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007795	TCGAT	2	10	23816	23825	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_007795	ATATT	2	10	24354	24363	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007795	TTTTA	2	10	36460	36469	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007795	GTGTT	2	10	42090	42099	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007795	AGAAA	2	10	49127	49136	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007795	TAAAG	2	10	49168	49177	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007795	ATTCA	2	10	49440	49449	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_007795	GTAAT	2	10	70707	70716	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007795	AGATG	2	10	77477	77486	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007795	GGGGC	2	10	115394	115403	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
14	NC_007795	CAAAA	2	10	138838	138847	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_007795	AAAGC	2	10	139188	139197	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_007795	CGTTT	2	10	140407	140416	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_007795	TATCA	2	10	148983	148992	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_007795	ATCAT	2	10	157115	157124	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_007795	GCTTT	2	10	173758	173767	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_007795	TGATT	2	10	174104	174113	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007795	TAACA	2	10	180330	180339	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_007795	TAATG	2	10	188628	188637	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007795	AATAT	2	10	199510	199519	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007795	TATTT	2	10	205501	205510	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007795	AACAT	2	10	213792	213801	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_007795	GATAA	2	10	217746	217755	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007795	ATAAC	2	10	222393	222402	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_007795	TGAAT	2	10	222504	222513	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007795	ATTAA	2	10	222645	222654	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007795	TTCAT	2	10	225706	225715	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_007795	AAAGT	2	10	226389	226398	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007795	TAAAA	2	10	228102	228111	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007795	AAATT	2	10	229418	229427	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007795	TAAAA	2	10	243565	243574	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007795	GAAAA	2	10	251356	251365	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007795	ATAAA	2	10	251474	251483	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007795	TCATA	2	10	259882	259891	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_007795	ATTTA	2	10	275707	275716	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007795	TAAAT	2	10	307022	307031	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007795	AAATT	2	10	310715	310724	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007795	ATTTT	2	10	312580	312589	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007795	ATAGA	2	10	318817	318826	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007795	TGACA	2	10	319009	319018	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_007795	GATAA	2	10	331312	331321	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007795	GTAAT	2	10	366064	366073	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007795	AGAAT	2	10	367290	367299	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007795	TAAGG	2	10	367354	367363	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007795	TAAAT	2	10	374799	374808	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007795	ACAGT	2	10	377372	377381	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_007795	CATAA	2	10	387849	387858	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_007795	TAAAA	2	10	388073	388082	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007795	AATAT	2	10	390218	390227	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007795	AAAGT	2	10	402187	402196	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007795	AAATT	2	10	405377	405386	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007795	CTCAC	2	10	412492	412501	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
56	NC_007795	CAAAG	2	10	412517	412526	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_007795	TTGTA	2	10	420518	420527	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007795	ATTAT	2	10	420685	420694	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007795	CTTAA	2	10	430226	430235	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_007795	TGGTG	2	10	448043	448052	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007795	CAACT	2	10	448608	448617	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_007795	GGTAA	2	10	449080	449089	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007795	TCGTG	2	10	449900	449909	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_007795	GATTG	2	10	452234	452243	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007795	GATTT	2	10	457144	457153	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007795	ATATA	2	10	459562	459571	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007795	CAAAG	2	10	466110	466119	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_007795	TTGAT	2	10	469271	469280	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007795	AGACA	2	10	483232	483241	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_007795	AAGTA	2	10	485667	485676	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007795	TTAAA	2	10	487791	487800	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007795	GATAA	2	10	487830	487839	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007795	GGTAA	2	10	493360	493369	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007795	TCGTG	2	10	494179	494188	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_007795	GATTG	2	10	496513	496522	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007795	ATATA	2	10	503129	503138	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007795	AAAAT	2	10	507904	507913	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007795	TTTAT	2	10	508013	508022	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007795	TTATG	2	10	511019	511028	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007795	ATTTA	2	10	511164	511173	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007795	ACAAT	2	10	512969	512978	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_007795	TGAAT	2	10	517436	517445	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007795	GTATA	2	10	517493	517502	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007795	TATAA	2	10	521210	521219	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007795	GTTTA	2	10	537376	537385	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007795	TAAAG	2	10	541570	541579	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007795	TTAAC	2	10	550744	550753	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_007795	AATTT	2	10	550829	550838	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007795	ATAAA	2	10	555224	555233	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007795	TTATA	2	10	569601	569610	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007795	CACAT	2	10	569997	570006	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_007795	ATGAT	2	10	579021	579030	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007795	TAATT	2	10	582508	582517	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007795	TAAGT	2	10	587493	587502	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007795	TATTG	2	10	588953	588962	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007795	AGTTC	2	10	591502	591511	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_007795	TTTAA	2	10	592050	592059	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007795	AAATT	2	10	595294	595303	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007795	TAAAT	2	10	597887	597896	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007795	AAATT	2	10	599891	599900	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007795	TAAAA	2	10	607030	607039	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007795	ATTAA	2	10	609218	609227	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007795	TTATT	2	10	609267	609276	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007795	CAATA	2	10	609333	609342	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_007795	TTAAT	2	10	611958	611967	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007795	ATTTT	2	10	614245	614254	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007795	ATATA	2	10	614301	614310	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007795	ATAAA	2	10	620937	620946	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007795	TTTTA	2	10	623203	623212	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007795	AAAGG	2	10	623524	623533	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007795	ATATA	2	10	627169	627178	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007795	AAACT	2	10	630694	630703	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_007795	TTCAC	2	10	635907	635916	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
114	NC_007795	GGTTG	2	10	646890	646899	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007795	AGTAG	2	10	656598	656607	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007795	AAGTT	2	10	657047	657056	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007795	AATTG	2	10	657079	657088	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007795	AAACT	2	10	658954	658963	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_007795	ATTTA	2	10	659345	659354	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007795	AAAGT	2	10	661593	661602	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007795	AATTT	2	10	664202	664211	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007795	CATGA	2	10	666362	666371	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_007795	ATCAT	2	10	670815	670824	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_007795	AATTT	2	10	675707	675716	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007795	AATTA	2	10	682509	682518	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007795	ATTTA	2	10	686690	686699	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007795	AAAGT	2	10	686783	686792	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007795	TAAAG	2	10	688618	688627	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007795	ATTTT	2	10	699170	699179	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007795	TAAGT	2	10	702192	702201	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007795	TAAAA	2	10	705007	705016	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007795	GAATA	2	10	705166	705175	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007795	AAAGT	2	10	707946	707955	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007795	TAATA	2	10	721527	721536	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007795	CATCC	2	10	724259	724268	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
136	NC_007795	AATTA	2	10	730338	730347	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007795	TTCGT	2	10	730379	730388	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_007795	ATATT	2	10	733825	733834	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007795	TTAAT	2	10	737105	737114	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007795	TTTTA	2	10	738657	738666	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007795	AGTTA	2	10	738683	738692	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007795	TCATG	2	10	738862	738871	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_007795	ATGAT	2	10	744190	744199	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007795	ATGAC	2	10	746309	746318	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_007795	GTTAA	2	10	749671	749680	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_007795	TTGAA	2	10	752755	752764	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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