MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444 chromosome

Total Repeats: 98

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007794	CAACCG	2	12	7653	7664	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007794	GCCCGC	2	12	28208	28219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_007794	GGCGCT	2	12	147794	147805	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007794	GGCTGC	2	12	163026	163037	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007794	ATCCCG	2	12	208269	208280	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_007794	GCGCCC	2	12	208884	208895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_007794	GGCGCA	2	12	231470	231481	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007794	AACGGC	2	12	234557	234568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007794	CACCGG	2	12	244747	244758	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_007794	ACCGGC	2	12	289768	289779	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007794	TGCCGG	2	12	316732	316743	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_007794	CTCCTT	2	12	397062	397073	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_007794	TTCCCT	2	12	418219	418230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_007794	TTGCAA	2	12	465111	465122	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_007794	CCGGGC	2	12	485668	485679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_007794	ACGCGA	2	12	491460	491471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007794	ATTTAT	2	12	554133	554144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007794	CCCCTT	2	12	576399	576410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_007794	GCCTGT	2	12	683002	683013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_007794	TTCTCT	2	12	713402	713413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_007794	ACGGAC	2	12	722985	722996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007794	CCTCTC	2	12	734437	734448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_007794	AAGCGA	2	12	752308	752319	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_007794	CGCAGG	2	12	825832	825843	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_007794	CCGCGC	2	12	827147	827158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_007794	AGCAAT	2	12	854361	854372	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_007794	GTCCAT	2	12	902464	902475	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_007794	TTCCTG	2	12	920701	920712	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007794	CAACGA	2	12	935289	935300	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_007794	AGAGGG	2	12	979730	979741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007794	GTTGCC	2	12	994469	994480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_007794	GCCGGC	2	12	1005541	1005552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_007794	TTTACG	2	12	1042758	1042769	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_007794	GCCCTT	2	12	1053920	1053931	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_007794	CGGAAG	2	12	1080005	1080016	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_007794	GCAATA	2	12	1225089	1225100	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_007794	CGGAGG	2	12	1239560	1239571	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_007794	GGGCGC	2	12	1241573	1241584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_007794	TCCACG	2	12	1241797	1241808	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
40	NC_007794	ACGGGA	2	12	1275598	1275609	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_007794	TGGTTC	2	12	1289721	1289732	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_007794	AAAGCG	2	12	1307596	1307607	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_007794	CATCTG	2	12	1342646	1342657	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007794	ACCGGC	2	12	1413223	1413234	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
45	NC_007794	TCGCAG	2	12	1478505	1478516	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007794	GCGCTC	2	12	1539708	1539719	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_007794	ACAAGG	2	12	1557647	1557658	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_007794	GTCGAC	2	12	1559617	1559628	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007794	AAATCA	2	12	1577304	1577315	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_007794	AACATC	2	12	1596447	1596458	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007794	CTTCGG	2	12	1596733	1596744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007794	AACCTC	2	12	1598135	1598146	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_007794	TGGCCG	2	12	1703244	1703255	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007794	GCGGTG	2	12	1746808	1746819	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_007794	TCGTGG	2	12	1860132	1860143	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_007794	CACGTA	2	12	1899853	1899864	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_007794	TGAACC	2	12	1926213	1926224	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_007794	GGGGCA	2	12	1940712	1940723	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_007794	GGCCGG	2	12	1969074	1969085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007794	TTGTCG	2	12	2022900	2022911	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_007794	TGCCGC	2	12	2105753	2105764	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_007794	TTCGAG	2	12	2122563	2122574	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_007794	GCACGC	2	12	2194200	2194211	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
64	NC_007794	CTCGGC	2	12	2220875	2220886	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
65	NC_007794	CCCCGC	2	12	2231033	2231044	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
66	NC_007794	AGCTCA	2	12	2272787	2272798	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_007794	GGCGCT	2	12	2273088	2273099	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_007794	GATGGT	2	12	2322280	2322291	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007794	TCATCT	2	12	2339619	2339630	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_007794	CTGGCG	2	12	2413454	2413465	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_007794	TGCACA	2	12	2495221	2495232	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_007794	TGGAAA	2	12	2571376	2571387	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007794	CGCAAA	2	12	2732914	2732925	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_007794	CGGAAC	2	12	2736628	2736639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007794	TTTGCA	2	12	2753380	2753391	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_007794	GGTGAC	2	12	2759131	2759142	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_007794	AGGGAC	2	12	2805443	2805454	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_007794	CTGGCG	2	12	2872084	2872095	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_007794	GGGGTG	2	12	2979119	2979130	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007794	CCCCGC	2	12	3001828	3001839	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
81	NC_007794	ACGCGC	2	12	3015013	3015024	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
82	NC_007794	GAAAAG	2	12	3026471	3026482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007794	GAACCA	2	12	3051468	3051479	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_007794	ATTGTT	2	12	3100271	3100282	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007794	GCCTTG	2	12	3148761	3148772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_007794	ATTCGC	2	12	3192901	3192912	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_007794	AGGACG	2	12	3201474	3201485	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_007794	AAGTGT	2	12	3224523	3224534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007794	CAACGG	2	12	3275358	3275369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_007794	GAAAAG	2	12	3299371	3299382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007794	GCGGAT	2	12	3356355	3356366	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_007794	GCCCCG	2	12	3358789	3358800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_007794	ATTGCA	2	12	3382825	3382836	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_007794	GCCATC	2	12	3399859	3399870	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_007794	GCGGTT	2	12	3413657	3413668	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_007794	GGTTGC	2	12	3415159	3415170	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_007794	GCCCTT	2	12	3428090	3428101	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
98	NC_007794	GAAGCA	2	12	3532548	3532559	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.