MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444 chromosome

Total Repeats: 336

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007794	CACGC	2	10	3136	3145	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_007794	GTACT	2	10	3908	3917	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_007794	GCTCC	2	10	10597	10606	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_007794	TTCAA	2	10	12535	12544	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_007794	AACCG	2	10	85227	85236	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_007794	CCCCG	2	10	93056	93065	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
7	NC_007794	TGCGG	2	10	113764	113773	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_007794	AAAGG	2	10	115179	115188	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007794	TTGGA	2	10	119829	119838	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007794	CCCTT	2	10	134760	134769	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
11	NC_007794	GCCCG	2	10	150579	150588	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
12	NC_007794	GCCCT	2	10	150679	150688	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
13	NC_007794	AGTCA	2	10	160839	160848	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_007794	AAAAG	2	10	166648	166657	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007794	TGTCC	2	10	169935	169944	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_007794	GATCG	2	10	208769	208778	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_007794	CGCCC	2	10	208866	208875	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
18	NC_007794	CGGGC	2	10	230868	230877	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19	NC_007794	GCTTG	2	10	231864	231873	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_007794	AGGGC	2	10	244840	244849	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_007794	GGCCG	2	10	250347	250356	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
22	NC_007794	CAAGG	2	10	288310	288319	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_007794	TCCGG	2	10	288369	288378	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_007794	TGCAG	2	10	293442	293451	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_007794	GAGAA	2	10	299189	299198	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007794	TTCGG	2	10	299206	299215	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_007794	GAAGC	2	10	299806	299815	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_007794	CGGGA	2	10	308493	308502	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
29	NC_007794	GGGGC	2	10	314748	314757	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
30	NC_007794	CGGAT	2	10	318606	318615	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_007794	CTGCC	2	10	346610	346619	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_007794	CCGTG	2	10	368042	368051	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_007794	CCGCA	2	10	368244	368253	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
34	NC_007794	CCGCA	2	10	371901	371910	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
35	NC_007794	GCCCT	2	10	401345	401354	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
36	NC_007794	GGCGC	2	10	403848	403857	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
37	NC_007794	CCGAT	2	10	404413	404422	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_007794	GATGC	2	10	409991	410000	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_007794	CAGCG	2	10	419637	419646	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_007794	CTTGT	2	10	426054	426063	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_007794	GGCTA	2	10	434424	434433	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_007794	GCCCG	2	10	440326	440335	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
43	NC_007794	GGGAT	2	10	447781	447790	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007794	ATCGA	2	10	454518	454527	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_007794	GCCAC	2	10	457470	457479	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
46	NC_007794	GTGCG	2	10	465074	465083	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
47	NC_007794	GGCGC	2	10	466126	466135	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
48	NC_007794	GCCGG	2	10	467857	467866	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
49	NC_007794	GTCCC	2	10	468493	468502	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
50	NC_007794	CGCAT	2	10	468533	468542	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_007794	GCCCC	2	10	502349	502358	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
52	NC_007794	GAGCC	2	10	503952	503961	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_007794	CGGTC	2	10	518582	518591	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
54	NC_007794	GGACG	2	10	528827	528836	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
55	NC_007794	CAGGG	2	10	538827	538836	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
56	NC_007794	CGGAC	2	10	540035	540044	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
57	NC_007794	ATCGT	2	10	549859	549868	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_007794	GCAGC	2	10	549930	549939	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_007794	AGGTT	2	10	552451	552460	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007794	GGTGC	2	10	559792	559801	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
61	NC_007794	CTGGG	2	10	572177	572186	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
62	NC_007794	GGGGC	2	10	575293	575302	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
63	NC_007794	TACGA	2	10	580249	580258	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_007794	GGATC	2	10	587394	587403	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_007794	CTTGC	2	10	611774	611783	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_007794	TCCTG	2	10	614196	614205	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_007794	CTGCG	2	10	618951	618960	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
68	NC_007794	CGAAC	2	10	618977	618986	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_007794	CCCGG	2	10	621683	621692	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
70	NC_007794	CCGAA	2	10	624077	624086	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_007794	GTTCA	2	10	638815	638824	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_007794	CGATC	2	10	643965	643974	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_007794	TTTCC	2	10	647984	647993	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_007794	GGCGC	2	10	658329	658338	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
75	NC_007794	TGAAA	2	10	708141	708150	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007794	AGGGC	2	10	708747	708756	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
77	NC_007794	GCCGG	2	10	723968	723977	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
78	NC_007794	TTGCC	2	10	734545	734554	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_007794	ATCAT	2	10	746736	746745	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_007794	GGTGA	2	10	746782	746791	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007794	GCCGG	2	10	774440	774449	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
82	NC_007794	TTGCG	2	10	774506	774515	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_007794	TGCGG	2	10	782288	782297	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
84	NC_007794	AATAA	2	10	789360	789369	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007794	AAGTT	2	10	789399	789408	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007794	TCCGA	2	10	800358	800367	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_007794	CGGGG	2	10	802532	802541	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
88	NC_007794	GTGCA	2	10	826258	826267	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_007794	GTTTG	2	10	832168	832177	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007794	CGGAT	2	10	839186	839195	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_007794	GGGCA	2	10	853871	853880	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
92	NC_007794	GCCTT	2	10	866696	866705	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_007794	GAAAC	2	10	875070	875079	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_007794	GGGCA	2	10	880078	880087	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
95	NC_007794	TTTCA	2	10	882857	882866	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_007794	AACCG	2	10	889438	889447	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_007794	GGCTT	2	10	893898	893907	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_007794	TCCGG	2	10	902380	902389	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
99	NC_007794	GCGCA	2	10	917024	917033	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
100	NC_007794	GTCCG	2	10	956719	956728	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
101	NC_007794	CGGGC	2	10	969225	969234	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
102	NC_007794	CTGCA	2	10	969282	969291	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_007794	GCGGA	2	10	1004902	1004911	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
104	NC_007794	GGCTT	2	10	1004979	1004988	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
105	NC_007794	GTTGC	2	10	1005383	1005392	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_007794	TGAAA	2	10	1013280	1013289	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007794	GGGGC	2	10	1013291	1013300	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
108	NC_007794	GCGCC	2	10	1025533	1025542	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
109	NC_007794	CGGGC	2	10	1036879	1036888	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
110	NC_007794	AGGGT	2	10	1053944	1053953	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007794	TTGGC	2	10	1058586	1058595	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_007794	TGGAG	2	10	1072435	1072444	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007794	TGCCG	2	10	1092993	1093002	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
114	NC_007794	CCCGC	2	10	1112459	1112468	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
115	NC_007794	GGGGC	2	10	1115495	1115504	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
116	NC_007794	AGCGC	2	10	1118726	1118735	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
117	NC_007794	AAAGG	2	10	1155518	1155527	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007794	TCGCG	2	10	1164573	1164582	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
119	NC_007794	TTGTT	2	10	1208817	1208826	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007794	GCGCC	2	10	1210543	1210552	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
121	NC_007794	TCGGC	2	10	1213203	1213212	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_007794	ACCCA	2	10	1213268	1213277	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
123	NC_007794	ATGTG	2	10	1225641	1225650	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007794	GCACC	2	10	1235744	1235753	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
125	NC_007794	TGCGC	2	10	1242089	1242098	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
126	NC_007794	CGCGC	2	10	1243733	1243742	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
127	NC_007794	GATAT	2	10	1248876	1248885	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007794	CGCCA	2	10	1266614	1266623	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
129	NC_007794	ACGGC	2	10	1267139	1267148	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
130	NC_007794	AATGA	2	10	1284890	1284899	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007794	GACCG	2	10	1292194	1292203	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
132	NC_007794	GACCG	2	10	1293253	1293262	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
133	NC_007794	GCTGA	2	10	1293314	1293323	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_007794	TCCGG	2	10	1293960	1293969	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
135	NC_007794	TGGGG	2	10	1298000	1298009	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007794	TTTTG	2	10	1298033	1298042	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007794	GGTCG	2	10	1298417	1298426	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
138	NC_007794	CCTTC	2	10	1298471	1298480	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
139	NC_007794	GCGCC	2	10	1298553	1298562	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
140	NC_007794	CGGAA	2	10	1314171	1314180	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
141	NC_007794	AGGGG	2	10	1323941	1323950	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007794	GGCCG	2	10	1350803	1350812	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
143	NC_007794	GTCCC	2	10	1355752	1355761	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
144	NC_007794	GCAAA	2	10	1365581	1365590	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_007794	AGGGC	2	10	1370382	1370391	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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147	NC_007794	GCACG	2	10	1371161	1371170	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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149	NC_007794	GCCGG	2	10	1403495	1403504	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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151	NC_007794	GGAAA	2	10	1416513	1416522	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
152	NC_007794	AGGGC	2	10	1417315	1417324	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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161	NC_007794	GGCGG	2	10	1489095	1489104	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
162	NC_007794	GGCCG	2	10	1507580	1507589	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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164	NC_007794	TTCAG	2	10	1553005	1553014	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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262	NC_007794	CACGA	2	10	2862959	2862968	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
263	NC_007794	CACTC	2	10	2864487	2864496	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
264	NC_007794	GGCGC	2	10	2868130	2868139	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
265	NC_007794	GCGCA	2	10	2870017	2870026	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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267	NC_007794	TGACC	2	10	2924448	2924457	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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270	NC_007794	CACCC	2	10	2949702	2949711	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
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273	NC_007794	CCCTC	2	10	2960709	2960718	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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277	NC_007794	CCCGG	2	10	3026437	3026446	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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279	NC_007794	AAGCC	2	10	3031835	3031844	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
280	NC_007794	GCCCG	2	10	3035380	3035389	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
281	NC_007794	ATTCA	2	10	3035410	3035419	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
282	NC_007794	ATTCC	2	10	3044265	3044274	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
283	NC_007794	ACAAA	2	10	3048193	3048202	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
284	NC_007794	GCGCC	2	10	3048630	3048639	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
285	NC_007794	GGCGA	2	10	3070448	3070457	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
286	NC_007794	GGGAG	2	10	3074106	3074115	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
287	NC_007794	ATGCT	2	10	3092246	3092255	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
288	NC_007794	CCCCG	2	10	3100862	3100871	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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291	NC_007794	CGTTT	2	10	3126666	3126675	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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294	NC_007794	TTCTA	2	10	3133156	3133165	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
295	NC_007794	GCCGG	2	10	3165908	3165917	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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299	NC_007794	GCGCC	2	10	3177289	3177298	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
300	NC_007794	TGCAG	2	10	3188341	3188350	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
301	NC_007794	CTTCG	2	10	3192748	3192757	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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321	NC_007794	GCAAC	2	10	3403833	3403842	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
322	NC_007794	AGGCG	2	10	3403893	3403902	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
323	NC_007794	CTTGA	2	10	3405766	3405775	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
324	NC_007794	GGCGC	2	10	3415275	3415284	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
325	NC_007794	CCCTG	2	10	3421280	3421289	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
326	NC_007794	CTAGG	2	10	3429297	3429306	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
327	NC_007794	GCAGC	2	10	3429368	3429377	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
328	NC_007794	GCAGC	2	10	3455351	3455360	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
329	NC_007794	TTGCG	2	10	3467223	3467232	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
330	NC_007794	GCCGC	2	10	3489698	3489707	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
331	NC_007794	GACCG	2	10	3512490	3512499	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
332	NC_007794	CGGAA	2	10	3519954	3519963	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
333	NC_007794	CCGGC	2	10	3525952	3525961	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
334	NC_007794	GCGCC	2	10	3529618	3529627	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
335	NC_007794	GACCG	2	10	3538576	3538585	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
336	NC_007794	CCCTT	2	10	3542224	3542233	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.