MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_FPR3757 chromosome

Total Repeats: 240

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007793	ATAAAT	2	12	3319	3330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007793	TTTAAA	2	12	3496	3507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007793	TAAATC	2	12	17189	17200	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_007793	AAAAAT	2	12	37786	37797	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007793	AATTAA	2	12	52418	52429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007793	ATAACT	2	12	61482	61493	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_007793	TATAAA	2	12	63633	63644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007793	TTAAAC	2	12	76713	76724	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_007793	TAAAAA	2	12	85480	85491	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007793	ATTTAT	2	12	91825	91836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007793	AATTAT	2	12	96221	96232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007793	AACAAA	2	12	110161	110172	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_007793	AATATA	2	12	118623	118634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007793	AATGAA	2	12	118635	118646	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007793	TAACAA	2	12	131132	131143	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_007793	ATTAAG	2	12	153961	153972	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007793	AATGTA	2	12	155128	155139	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007793	CTGTAA	2	12	156951	156962	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_007793	GTTTTT	2	12	168178	168189	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007793	TAAAGC	2	12	168879	168890	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_007793	TTTTGA	2	12	169065	169076	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007793	GATATG	2	12	177128	177139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007793	TTTATA	2	12	216924	216935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007793	ATTAAT	2	12	216947	216958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007793	ATATGA	2	12	263849	263860	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007793	CTTCAA	2	12	268756	268767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007793	GGAATA	2	12	278579	278590	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007793	ATATAG	2	12	299807	299818	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007793	ATTTTC	2	12	305123	305134	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_007793	ATAATT	2	12	306074	306085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007793	AACGAT	2	12	313391	313402	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_007793	TAACTT	2	12	322311	322322	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_007793	TTGTAA	2	12	386732	386743	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007793	AATGTA	2	12	424650	424661	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007793	AATTTG	2	12	424757	424768	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007793	TAAAGA	2	12	426730	426741	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007793	TTGAAA	2	12	448124	448135	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007793	TGTATA	2	12	463520	463531	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007793	TTTTTA	2	12	477525	477536	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007793	AAAATG	2	12	482958	482969	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007793	ACGTTG	2	12	503405	503416	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_007793	AAAATA	2	12	504129	504140	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007793	TATGGT	2	12	512267	512278	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007793	TTATAA	2	12	523443	523454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007793	AAATTT	2	12	530203	530214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007793	AAAGTT	2	12	567082	567093	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007793	TTATAA	2	12	584686	584697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007793	GTTATA	2	12	585357	585368	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007793	CTTAAA	2	12	593789	593800	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_007793	ACATGT	2	12	603761	603772	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_007793	ATTGCG	2	12	633078	633089	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_007793	AATGAT	2	12	636996	637007	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007793	TAGATG	2	12	637069	637080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007793	TAAAAT	2	12	652390	652401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007793	ATAAAA	2	12	656600	656611	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007793	TTTTAA	2	12	664496	664507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007793	CATTAT	2	12	680806	680817	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_007793	CATCAA	2	12	691470	691481	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_007793	TAATTT	2	12	695710	695721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007793	TGAATA	2	12	712188	712199	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007793	GGATTC	2	12	723539	723550	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_007793	AAATAT	2	12	726331	726342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007793	TTAAAA	2	12	738333	738344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007793	TTTTTA	2	12	761037	761048	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007793	TGAAAA	2	12	769279	769290	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007793	AATGAT	2	12	797993	798004	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007793	TTAATT	2	12	823536	823547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007793	ACAAAA	2	12	838236	838247	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_007793	TAAAAA	2	12	857377	857388	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007793	TATCAA	2	12	863877	863888	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_007793	TTTTGA	2	12	867649	867660	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007793	TCATTT	2	12	873642	873653	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_007793	GAACGA	2	12	885770	885781	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_007793	TATAGA	2	12	894448	894459	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007793	TATAGA	2	12	894477	894488	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007793	CATATA	2	12	895526	895537	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_007793	AAATTA	2	12	897710	897721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007793	AAGCAC	2	12	906441	906452	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_007793	TAAAAT	2	12	914117	914128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007793	TTTAAT	2	12	986840	986851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007793	ACAATA	2	12	1004236	1004247	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_007793	AACGGA	2	12	1018758	1018769	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_007793	AAAAGC	2	12	1023357	1023368	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_007793	CATTTA	2	12	1048678	1048689	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_007793	ATCATA	2	12	1050573	1050584	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_007793	TCAAAA	2	12	1057081	1057092	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_007793	ATTGCA	2	12	1058160	1058171	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_007793	TTTTCT	2	12	1070888	1070899	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_007793	TTTATA	2	12	1106901	1106912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007793	ATTTTT	2	12	1130851	1130862	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007793	ATAATT	2	12	1131648	1131659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007793	TAATGA	2	12	1144687	1144698	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007793	ATTTAT	2	12	1163644	1163655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007793	ATTATA	2	12	1167562	1167573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007793	AAATTT	2	12	1168371	1168382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007793	AAGTAA	2	12	1190075	1190086	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007793	TCGTTT	2	12	1193202	1193213	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_007793	TTAATT	2	12	1203917	1203928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007793	AATTAA	2	12	1206653	1206664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007793	GAAATT	2	12	1251561	1251572	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007793	AATGAT	2	12	1264336	1264347	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007793	TAAAGA	2	12	1278863	1278874	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007793	TTTCAT	2	12	1294669	1294680	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_007793	TATATT	2	12	1299328	1299339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007793	CATATT	2	12	1324397	1324408	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_007793	ATGTAT	2	12	1325018	1325029	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007793	AAAGAA	2	12	1325250	1325261	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007793	AATTCA	2	12	1330294	1330305	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_007793	TTAAAG	2	12	1330506	1330517	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007793	ATTAAA	2	12	1359113	1359124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007793	ATATAA	2	12	1367095	1367106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007793	AAAATA	2	12	1381163	1381174	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007793	GTTTTA	2	12	1396910	1396921	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007793	TAAAAT	2	12	1412491	1412502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007793	TATCTT	2	12	1435327	1435338	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_007793	TTGATT	2	12	1435390	1435401	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007793	ATTCTA	2	12	1442730	1442741	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_007793	AATAAA	2	12	1446325	1446336	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007793	TATTCT	2	12	1493756	1493767	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_007793	TACTTG	2	12	1504003	1504014	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_007793	AAAAAT	2	12	1504019	1504030	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007793	TTAATC	2	12	1517526	1517537	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_007793	ATTTTC	2	12	1592944	1592955	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_007793	TCATTA	2	12	1593682	1593693	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_007793	TATGAT	2	12	1603549	1603560	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007793	ATAAAA	2	12	1612452	1612463	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007793	ACAAGA	2	12	1618029	1618040	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_007793	TAAAAA	2	12	1644288	1644299	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007793	TTATAG	2	12	1653421	1653432	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.