MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_FPR3757 chromosome

Total Repeats: 1300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007793	GTTGAA	2	12	3218	3229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87160973
2	NC_007793	TGGCGG	2	12	5396	5407	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	87161454
3	NC_007793	GTTATC	2	12	7324	7335	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	87160436
4	NC_007793	CAGATA	2	12	8233	8244	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	87160436
5	NC_007793	CAAGCT	2	12	8292	8303	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	87160436
6	NC_007793	GTAATG	2	12	9280	9291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87160436
7	NC_007793	ACAATT	2	12	11279	11290	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	87161623
8	NC_007793	TAGCAT	2	12	11374	11385	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	87161623
9	NC_007793	GCTTTA	2	12	17467	17478	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	87159904
10	NC_007793	TTTGAA	2	12	18288	18299	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	87159904
11	NC_007793	TAAAGG	2	12	20335	20346	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	87161718
12	NC_007793	TTGAAG	2	12	20532	20543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87161718
13	NC_007793	TGATTG	2	12	21736	21747	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	87160622
14	NC_007793	TGAAAT	2	12	22067	22078	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	87160622
15	NC_007793	AAGGAA	2	12	22505	22516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87160876
16	NC_007793	TGAATT	2	12	25434	25445	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	87160310
17	NC_007793	ATTTCA	2	12	27918	27929	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	87162050
18	NC_007793	CTAAAG	2	12	29052	29063	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	87160298
19	NC_007793	ATCAGC	2	12	31235	31246	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	87161790
20	NC_007793	AAAAGA	2	12	33876	33887	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	87161272
21	NC_007793	ACATCT	2	12	35530	35541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87161823
22	NC_007793	GTTTAA	2	12	36095	36106	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	87160207
23	NC_007793	AATGAA	2	12	39022	39033	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	87160887
24	NC_007793	ACAACT	2	12	41087	41098	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	87161759
25	NC_007793	GCTAAA	2	12	42326	42337	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	87161163
26	NC_007793	GTATGA	2	12	49612	49623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87161581
27	NC_007793	GAAGGT	2	12	54498	54509	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	87161505
28	NC_007793	TATTAA	2	12	57561	57572	50 %	50 %	0 %	0 %	87160457
29	NC_007793	TTATAG	2	12	59736	59747	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	87161965
30	NC_007793	AAAATT	2	12	60307	60318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87161597
31	NC_007793	TAAAAT	2	12	62672	62683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87161681
32	NC_007793	AGACCT	2	12	64269	64280	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	87161898
33	NC_007793	TTTATC	2	12	69187	69198	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	87160434
34	NC_007793	AACTTG	2	12	69481	69492	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	87160434
35	NC_007793	AAAGGA	2	12	69605	69616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87160434
36	NC_007793	ATCTTT	2	12	73746	73757	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	87161307
37	NC_007793	TTAATT	2	12	86502	86513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87161242
38	NC_007793	ATAAAC	2	12	87460	87471	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	87161242
39	NC_007793	ATTAAA	2	12	88103	88114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87161242
40	NC_007793	ACAAAT	2	12	89488	89499	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	87161877
41	NC_007793	AATTAA	2	12	89579	89590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87161877
42	NC_007793	TTAATG	2	12	92347	92358	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	87160645
43	NC_007793	AAGTCA	2	12	93555	93566	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	87162131
44	NC_007793	AAAAAG	2	12	93669	93680	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	87162131
45	NC_007793	GAAAAA	2	12	93982	93993	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	87162131
46	NC_007793	ACCCTT	2	12	98060	98071	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	87161344
47	NC_007793	ATTTCT	2	12	102584	102595	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	87162429
48	NC_007793	ATATTT	2	12	102692	102703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87162429
49	NC_007793	AAGGAA	2	12	103676	103687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87160449
50	NC_007793	TTTAGC	2	12	104725	104736	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	87161497
51	NC_007793	AAATAA	2	12	104776	104787	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	87161497
52	NC_007793	GTTAGA	2	12	106899	106910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87161985
53	NC_007793	AAAAGA	2	12	106953	106964	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	87161985
54	NC_007793	GCTAAA	2	12	109740	109751	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	87162123
55	NC_007793	TAAAGA	2	12	113052	113063	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	87162291
56	NC_007793	AACCAC	2	12	116921	116932	50 %	0 %	0 %	50 %	87161414
57	NC_007793	AACCGA	2	12	120241	120252	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	87159888
58	NC_007793	CATTAC	2	12	121943	121954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87161006
59	NC_007793	ATAGAT	2	12	125142	125153	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	87161855
60	NC_007793	TATCAT	2	12	125909	125920	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	87160686
61	NC_007793	TTTATT	2	12	126317	126328	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	87160277
62	NC_007793	TATTTG	2	12	126403	126414	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	87160277
63	NC_007793	TAAATA	2	12	127836	127847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87160277
64	NC_007793	TTTTTC	2	12	129680	129691	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	87161843
65	NC_007793	TAAGCC	2	12	131541	131552	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	87160394
66	NC_007793	ATCGCA	2	12	132756	132767	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	87160001
67	NC_007793	TTTGAA	2	12	133787	133798	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	87161572
68	NC_007793	GCAATG	2	12	142744	142755	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	87160266
69	NC_007793	TGAAGA	2	12	143579	143590	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	87160851
70	NC_007793	TTTCAT	2	12	144260	144271	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	87160623
71	NC_007793	TGTATA	2	12	148937	148948	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	87162155
72	NC_007793	TCGAAA	2	12	150438	150449	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	87161056
73	NC_007793	CTATTG	2	12	153024	153035	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	87161267
74	NC_007793	CATATG	2	12	154227	154238	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	87161851
75	NC_007793	GGTATG	2	12	157272	157283	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	87159961
76	NC_007793	CAGATT	2	12	159870	159881	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	87161186
77	NC_007793	AGATAT	2	12	167269	167280	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	87161080
78	NC_007793	ATTTGA	2	12	181035	181046	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	87160813
79	NC_007793	GATTTT	2	12	185546	185557	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	87162167
80	NC_007793	ACAAAG	2	12	190066	190077	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	87160148
81	NC_007793	TGTAAT	2	12	191090	191101	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	87161977
82	NC_007793	AAAGAT	2	12	192079	192090	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	87161510
83	NC_007793	CAATAT	2	12	194550	194561	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	87161093
84	NC_007793	TTGGTA	2	12	198405	198416	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	87161514
85	NC_007793	GCGATT	2	12	198425	198436	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	87161514
86	NC_007793	AAATTT	2	12	198523	198534	50 %	50 %	0 %	0 %	87161514
87	NC_007793	ACCTGC	2	12	201425	201436	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	87160024
88	NC_007793	AAGATA	2	12	201571	201582	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	87160024
89	NC_007793	CGTTAA	2	12	204505	204516	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	87161363
90	NC_007793	CTATTA	2	12	206356	206367	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	87161363
91	NC_007793	TATGAT	2	12	207890	207901	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	87161363
92	NC_007793	TTGAAA	2	12	208342	208353	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	87161363
93	NC_007793	AACATT	2	12	210782	210793	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	87161363
94	NC_007793	AGCAAC	2	12	214271	214282	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	87161926
95	NC_007793	TGTTTG	2	12	214319	214330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	87161926
96	NC_007793	CACCTT	2	12	216323	216334	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	87160787
97	NC_007793	ACCTTT	2	12	216828	216839	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	87160787
98	NC_007793	GTAAAT	2	12	220564	220575	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	87160234
99	NC_007793	ATTTTA	2	12	222160	222171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87160101
100	NC_007793	TATCTT	2	12	226775	226786	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	87159952
101	NC_007793	ATTTGG	2	12	227788	227799	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	87160090
102	NC_007793	GAGTTT	2	12	231131	231142	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	87162263
103	NC_007793	CCCTGA	2	12	235708	235719	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	87161253
104	NC_007793	TCCTGA	2	12	236527	236538	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	87161253
105	NC_007793	TCAATT	2	12	238678	238689	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	87160152
106	NC_007793	AATATG	2	12	239978	239989	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	87162264
107	NC_007793	AAAAAT	2	12	243470	243481	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	87161293
108	NC_007793	AGGACA	2	12	245331	245342	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	87161219
109	NC_007793	ACATTT	2	12	245667	245678	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	87161219
110	NC_007793	TTCTTG	2	12	250595	250606	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	87161668
111	NC_007793	GGACGT	2	12	261098	261109	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	87162120
112	NC_007793	TGGTAT	2	12	290160	290171	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	87162056
113	NC_007793	TATAGA	2	12	293514	293525	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	87161765
114	NC_007793	ACGATG	2	12	300143	300154	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	87160847
115	NC_007793	AAGTAA	2	12	311125	311136	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	87160259
116	NC_007793	ATAAAG	2	12	312106	312117	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	87161499
117	NC_007793	GACATT	2	12	313744	313755	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	87160684
118	NC_007793	GATTTC	2	12	315563	315574	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	87161287
119	NC_007793	TTCATA	2	12	316133	316144	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	87160729
120	NC_007793	GATTAT	2	12	321085	321096	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	87161761
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123	NC_007793	TCTTCA	2	12	327184	327195	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	87160126
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234	NC_007793	ACGACT	2	12	594496	594507	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	87161750
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