MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_FPR3757 chromosome

Total Repeats: 9082

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007793	ATTT	2	8	371	378	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007793	AAGA	2	8	524	531	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007793	ATGC	2	8	1039	1046	25 %	25 %	25 %	25 %	87161673
4	NC_007793	TCAT	2	8	1808	1815	25 %	50 %	0 %	25 %	87161673
5	NC_007793	TAAT	2	8	2177	2184	50 %	50 %	0 %	0 %	87160973
6	NC_007793	ATTA	2	8	2497	2504	50 %	50 %	0 %	0 %	87160973
7	NC_007793	CAAA	2	8	2627	2634	75 %	0 %	0 %	25 %	87160973
8	NC_007793	GACT	2	8	2719	2726	25 %	25 %	25 %	25 %	87160973
9	NC_007793	TAAA	2	8	2814	2821	75 %	25 %	0 %	0 %	87160973
10	NC_007793	TTTA	2	8	2875	2882	25 %	75 %	0 %	0 %	87160973
11	NC_007793	TTCA	2	8	3163	3170	25 %	50 %	0 %	25 %	87160973
12	NC_007793	GATG	2	8	3184	3191	25 %	25 %	50 %	0 %	87160973
13	NC_007793	AATT	2	8	3288	3295	50 %	50 %	0 %	0 %	87160973
14	NC_007793	ATTA	2	8	3344	3351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007793	AATT	2	8	3600	3607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007793	ATTA	2	8	3819	3826	50 %	50 %	0 %	0 %	87160250
17	NC_007793	TTCT	2	8	3909	3916	0 %	75 %	0 %	25 %	87160250
18	NC_007793	TCAT	2	8	3920	3927	25 %	50 %	0 %	25 %	87160250
19	NC_007793	GTAT	2	8	5158	5165	25 %	50 %	25 %	0 %	87161454
20	NC_007793	TATC	2	8	6061	6068	25 %	50 %	0 %	25 %	87161454
21	NC_007793	TAGA	2	8	6466	6473	50 %	25 %	25 %	0 %	87161454
22	NC_007793	TGGA	2	8	6592	6599	25 %	25 %	50 %	0 %	87161454
23	NC_007793	AATG	2	8	6815	6822	50 %	25 %	25 %	0 %	87161454
24	NC_007793	TCAA	2	8	7046	7053	50 %	25 %	0 %	25 %	87160436
25	NC_007793	ATGG	2	8	7368	7375	25 %	25 %	50 %	0 %	87160436
26	NC_007793	GGTA	2	8	7559	7566	25 %	25 %	50 %	0 %	87160436
27	NC_007793	TAAG	2	8	7624	7631	50 %	25 %	25 %	0 %	87160436
28	NC_007793	TCGT	2	8	7870	7877	0 %	50 %	25 %	25 %	87160436
29	NC_007793	ACAA	2	8	7996	8003	75 %	0 %	0 %	25 %	87160436
30	NC_007793	AGTT	2	8	8431	8438	25 %	50 %	25 %	0 %	87160436
31	NC_007793	GTCA	2	8	8667	8674	25 %	25 %	25 %	25 %	87160436
32	NC_007793	AATA	2	8	8933	8940	75 %	25 %	0 %	0 %	87160436
33	NC_007793	TGTA	2	8	9293	9300	25 %	50 %	25 %	0 %	87160436
34	NC_007793	TGAT	2	8	9592	9599	25 %	50 %	25 %	0 %	87160436
35	NC_007793	GTCA	2	8	10325	10332	25 %	25 %	25 %	25 %	87160041
36	NC_007793	AATG	2	8	11831	11838	50 %	25 %	25 %	0 %	87161623
37	NC_007793	CCAT	2	8	12339	12346	25 %	25 %	0 %	50 %	87161623
38	NC_007793	CAAT	2	8	12402	12409	50 %	25 %	0 %	25 %	87161623
39	NC_007793	CTAC	2	8	12597	12604	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_007793	ACGT	2	8	12761	12768	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_007793	ATTA	2	8	12932	12939	50 %	50 %	0 %	0 %	87160901
42	NC_007793	ATTT	2	8	13462	13469	25 %	75 %	0 %	0 %	87160901
43	NC_007793	GCAA	2	8	13803	13810	50 %	0 %	25 %	25 %	87160901
44	NC_007793	TAAA	2	8	14093	14100	75 %	25 %	0 %	0 %	87160901
45	NC_007793	TAAA	2	8	14564	14571	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007793	ATTT	2	8	15164	15171	25 %	75 %	0 %	0 %	87160307
47	NC_007793	GCAA	2	8	16537	16544	50 %	0 %	25 %	25 %	87160802
48	NC_007793	AAGG	2	8	16670	16677	50 %	0 %	50 %	0 %	87160802
49	NC_007793	GTAA	2	8	17094	17101	50 %	25 %	25 %	0 %	87160802
50	NC_007793	AAAG	2	8	17677	17684	75 %	0 %	25 %	0 %	87159904
51	NC_007793	AAAG	2	8	17692	17699	75 %	0 %	25 %	0 %	87159904
52	NC_007793	TTAA	2	8	17941	17948	50 %	50 %	0 %	0 %	87159904
53	NC_007793	TAGA	2	8	18724	18731	50 %	25 %	25 %	0 %	87162063
54	NC_007793	ACAA	2	8	18830	18837	75 %	0 %	0 %	25 %	87162063
55	NC_007793	ATGA	2	8	18912	18919	50 %	25 %	25 %	0 %	87162063
56	NC_007793	TAAA	2	8	19636	19643	75 %	25 %	0 %	0 %	87162063
57	NC_007793	CAAC	2	8	19770	19777	50 %	0 %	0 %	50 %	87162063
58	NC_007793	AATT	2	8	19969	19976	50 %	50 %	0 %	0 %	87162063
59	NC_007793	AGTA	2	8	20584	20591	50 %	25 %	25 %	0 %	87161718
60	NC_007793	ATTC	2	8	20669	20676	25 %	50 %	0 %	25 %	87161718
61	NC_007793	GTCT	2	8	20840	20847	0 %	50 %	25 %	25 %	87160622
62	NC_007793	TGAA	2	8	21025	21032	50 %	25 %	25 %	0 %	87160622
63	NC_007793	GCAT	2	8	21119	21126	25 %	25 %	25 %	25 %	87160622
64	NC_007793	GATT	2	8	21136	21143	25 %	50 %	25 %	0 %	87160622
65	NC_007793	GGTA	2	8	21626	21633	25 %	25 %	50 %	0 %	87160622
66	NC_007793	GGTT	2	8	23383	23390	0 %	50 %	50 %	0 %	87160876
67	NC_007793	AACA	2	8	23717	23724	75 %	0 %	0 %	25 %	87160876
68	NC_007793	TGCT	2	8	23823	23830	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_007793	ATCT	2	8	24157	24164	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_007793	GCCT	2	8	24285	24292	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_007793	ATTT	2	8	24617	24624	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007793	GTAC	2	8	25534	25541	25 %	25 %	25 %	25 %	87160310
73	NC_007793	AATC	2	8	26001	26008	50 %	25 %	0 %	25 %	87161483
74	NC_007793	ATCT	2	8	27435	27442	25 %	50 %	0 %	25 %	87161483
75	NC_007793	ACAA	2	8	28094	28101	75 %	0 %	0 %	25 %	87162050
76	NC_007793	AATG	2	8	28198	28205	50 %	25 %	25 %	0 %	87162050
77	NC_007793	TCGT	2	8	28230	28237	0 %	50 %	25 %	25 %	87162050
78	NC_007793	AACA	2	8	28675	28682	75 %	0 %	0 %	25 %	87162050
79	NC_007793	CAAT	2	8	29327	29334	50 %	25 %	0 %	25 %	87160298
80	NC_007793	GATG	2	8	29335	29342	25 %	25 %	50 %	0 %	87160298
81	NC_007793	TGAA	2	8	29481	29488	50 %	25 %	25 %	0 %	87160298
82	NC_007793	TACT	2	8	29557	29564	25 %	50 %	0 %	25 %	87160298
83	NC_007793	GAAA	2	8	30104	30111	75 %	0 %	25 %	0 %	87160913
84	NC_007793	GGCA	2	8	30257	30264	25 %	0 %	50 %	25 %	87160913
85	NC_007793	AAAG	2	8	30270	30277	75 %	0 %	25 %	0 %	87160913
86	NC_007793	GAAC	2	8	30714	30721	50 %	0 %	25 %	25 %	87160913
87	NC_007793	TTGA	2	8	30900	30907	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007793	ATCA	2	8	30960	30967	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_007793	CAAC	2	8	31225	31232	50 %	0 %	0 %	50 %	87161790
90	NC_007793	TACA	2	8	31480	31487	50 %	25 %	0 %	25 %	87161790
91	NC_007793	AATG	2	8	31655	31662	50 %	25 %	25 %	0 %	87161790
92	NC_007793	GACT	2	8	32453	32460	25 %	25 %	25 %	25 %	87161790
93	NC_007793	ATAA	2	8	32706	32713	75 %	25 %	0 %	0 %	87161790
94	NC_007793	TAAA	2	8	32749	32756	75 %	25 %	0 %	0 %	87161790
95	NC_007793	ATGA	2	8	32808	32815	50 %	25 %	25 %	0 %	87161790
96	NC_007793	CAAG	2	8	33175	33182	50 %	0 %	25 %	25 %	87161790
97	NC_007793	AGCT	2	8	33335	33342	25 %	25 %	25 %	25 %	87161790
98	NC_007793	AAGC	2	8	33760	33767	50 %	0 %	25 %	25 %	87161272
99	NC_007793	TTCT	2	8	34412	34419	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_007793	ATAA	2	8	34450	34457	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007793	ATTA	2	8	34542	34549	50 %	50 %	0 %	0 %	87161823
102	NC_007793	GGAT	2	8	34758	34765	25 %	25 %	50 %	0 %	87161823
103	NC_007793	AATA	2	8	34906	34913	75 %	25 %	0 %	0 %	87161823
104	NC_007793	TGAA	2	8	35042	35049	50 %	25 %	25 %	0 %	87161823
105	NC_007793	AAGA	2	8	35404	35411	75 %	0 %	25 %	0 %	87161823
106	NC_007793	TCTT	2	8	36020	36027	0 %	75 %	0 %	25 %	87160207
107	NC_007793	ATGT	2	8	36254	36261	25 %	50 %	25 %	0 %	87160207
108	NC_007793	AAAT	2	8	37026	37033	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007793	TTAA	2	8	37778	37785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007793	TCAT	2	8	37955	37962	25 %	50 %	0 %	25 %	87161628
111	NC_007793	AAAC	2	8	38463	38470	75 %	0 %	0 %	25 %	87161628
112	NC_007793	AAGA	2	8	38636	38643	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007793	GCAT	2	8	38816	38823	25 %	25 %	25 %	25 %	87160887
114	NC_007793	TAGC	2	8	39203	39210	25 %	25 %	25 %	25 %	87161759
115	NC_007793	TTTA	2	8	39391	39398	25 %	75 %	0 %	0 %	87161759
116	NC_007793	TTTG	2	8	39616	39623	0 %	75 %	25 %	0 %	87161759
117	NC_007793	CATA	2	8	40014	40021	50 %	25 %	0 %	25 %	87161759
118	NC_007793	TAGT	2	8	40152	40159	25 %	50 %	25 %	0 %	87161759
119	NC_007793	ATGT	2	8	40197	40204	25 %	50 %	25 %	0 %	87161759
120	NC_007793	GTTT	2	8	40822	40829	0 %	75 %	25 %	0 %	87161759
121	NC_007793	ATGA	2	8	41809	41816	50 %	25 %	25 %	0 %	87162304
122	NC_007793	ATAA	2	8	42067	42074	75 %	25 %	0 %	0 %	87162304
123	NC_007793	TGTA	2	8	42192	42199	25 %	50 %	25 %	0 %	87162304
124	NC_007793	AGCA	2	8	42420	42427	50 %	0 %	25 %	25 %	87161163
125	NC_007793	GACA	2	8	42646	42653	50 %	0 %	25 %	25 %	87160780
126	NC_007793	GTTT	2	8	42808	42815	0 %	75 %	25 %	0 %	87160780
127	NC_007793	TCAT	2	8	43637	43644	25 %	50 %	0 %	25 %	87160780
128	NC_007793	AATA	2	8	43780	43787	75 %	25 %	0 %	0 %	87160780
129	NC_007793	CTTT	2	8	44187	44194	0 %	75 %	0 %	25 %	87161958
130	NC_007793	TGCA	2	8	44502	44509	25 %	25 %	25 %	25 %	87161958
131	NC_007793	CTTT	2	8	44511	44518	0 %	75 %	0 %	25 %	87161958
132	NC_007793	GATT	2	8	44921	44928	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007793	TCCC	2	8	44940	44947	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
134	NC_007793	GATA	2	8	45166	45173	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007793	ACAA	2	8	45544	45551	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_007793	TTAT	3	12	45610	45621	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007793	ATCA	2	8	46057	46064	50 %	25 %	0 %	25 %	87160426
138	NC_007793	GATA	2	8	46067	46074	50 %	25 %	25 %	0 %	87160426
139	NC_007793	GTTG	2	8	46191	46198	0 %	50 %	50 %	0 %	87160426
140	NC_007793	TTAT	2	8	46298	46305	25 %	75 %	0 %	0 %	87160426
141	NC_007793	TTGA	2	8	46384	46391	25 %	50 %	25 %	0 %	87160426
142	NC_007793	TTGC	2	8	46583	46590	0 %	50 %	25 %	25 %	87160426
143	NC_007793	TGAC	2	8	46670	46677	25 %	25 %	25 %	25 %	87160426
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145	NC_007793	TTTG	2	8	47208	47215	0 %	75 %	25 %	0 %	87160426
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