MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_FPR3757 plasmid pUSA03

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007792	ACAAG	2	10	499	508	60 %	0 %	20 %	20 %	87159870
2	NC_007792	ATAGT	2	10	1921	1930	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007792	ACTTT	2	10	2041	2050	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_007792	GTTTT	2	10	2262	2271	0 %	80 %	20 %	0 %	87159883
5	NC_007792	TAATT	2	10	2977	2986	40 %	60 %	0 %	0 %	87159883
6	NC_007792	GTTTG	2	10	3692	3701	0 %	60 %	40 %	0 %	87159883
7	NC_007792	CAATA	2	10	4273	4282	60 %	20 %	0 %	20 %	87159883
8	NC_007792	ACAAT	2	10	6895	6904	60 %	20 %	0 %	20 %	87159864
9	NC_007792	AGCGA	2	10	8705	8714	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_007792	ACATG	2	10	9932	9941	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_007792	ACATG	3	15	9976	9990	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_007792	ATAAC	2	10	10043	10052	60 %	20 %	0 %	20 %	87159868
13	NC_007792	AGAAA	2	10	10995	11004	80 %	0 %	20 %	0 %	87159868
14	NC_007792	TTTTC	2	10	12267	12276	0 %	80 %	0 %	20 %	87159853
15	NC_007792	AAACA	2	10	12819	12828	80 %	0 %	0 %	20 %	87159848
16	NC_007792	AAAGC	2	10	14761	14770	60 %	0 %	20 %	20 %	87159857
17	NC_007792	TGAAT	2	10	15089	15098	40 %	40 %	20 %	0 %	87159857
18	NC_007792	AAGTA	2	10	15290	15299	60 %	20 %	20 %	0 %	87159857
19	NC_007792	AATTG	2	10	15419	15428	40 %	40 %	20 %	0 %	87159857
20	NC_007792	AATAA	2	10	15483	15492	80 %	20 %	0 %	0 %	87159857
21	NC_007792	AGAAA	2	10	15536	15545	80 %	0 %	20 %	0 %	87159857
22	NC_007792	GATTT	2	10	16506	16515	20 %	60 %	20 %	0 %	87159855
23	NC_007792	AGAAA	2	10	16604	16613	80 %	0 %	20 %	0 %	87159855
24	NC_007792	TTATT	2	10	16935	16944	20 %	80 %	0 %	0 %	87159856
25	NC_007792	AGGGC	2	10	17910	17919	20 %	0 %	60 %	20 %	87159878
26	NC_007792	AATGA	2	10	19163	19172	60 %	20 %	20 %	0 %	87159878
27	NC_007792	ACATG	3	15	21651	21665	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_007792	TGGAT	2	10	21712	21721	20 %	40 %	40 %	0 %	87159873
29	NC_007792	TATAA	2	10	23265	23274	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007792	ATTAT	2	10	24567	24576	40 %	60 %	0 %	0 %	87159850
31	NC_007792	AAAAG	2	10	24666	24675	80 %	0 %	20 %	0 %	87159850
32	NC_007792	TTATT	2	10	24760	24769	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007792	ACAAT	2	10	25040	25049	60 %	20 %	0 %	20 %	87159862
34	NC_007792	ATTCA	2	10	25363	25372	40 %	40 %	0 %	20 %	87159862
35	NC_007792	GTAAA	2	10	26925	26934	60 %	20 %	20 %	0 %	87159861
36	NC_007792	GAACT	2	10	26937	26946	40 %	20 %	20 %	20 %	87159861
37	NC_007792	ATATA	2	10	27399	27408	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007792	AAGAA	2	10	27412	27421	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007792	AAATT	2	10	28192	28201	60 %	40 %	0 %	0 %	87159877
40	NC_007792	TAACT	2	10	28816	28825	40 %	40 %	0 %	20 %	87159865
41	NC_007792	TAACT	2	10	29191	29200	40 %	40 %	0 %	20 %	87159865
42	NC_007792	ATATG	2	10	31013	31022	40 %	40 %	20 %	0 %	87159876
43	NC_007792	AACGT	2	10	34229	34238	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_007792	AATTA	2	10	34314	34323	60 %	40 %	0 %	0 %	87159866
45	NC_007792	ACATG	3	15	34978	34992	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_007792	TCAAA	2	10	36751	36760	60 %	20 %	0 %	20 %	87159867

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.