MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_FPR3757 plasmid pUSA03

Total Repeats: 122

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007792	GATA	2	8	265	272	50 %	25 %	25 %	0 %	87159870
2	NC_007792	AAAC	2	8	406	413	75 %	0 %	0 %	25 %	87159870
3	NC_007792	TTTA	2	8	423	430	25 %	75 %	0 %	0 %	87159870
4	NC_007792	ATGA	2	8	659	666	50 %	25 %	25 %	0 %	87159870
5	NC_007792	AATT	2	8	756	763	50 %	50 %	0 %	0 %	87159870
6	NC_007792	ACAT	2	8	1469	1476	50 %	25 %	0 %	25 %	87159858
7	NC_007792	AAGA	2	8	1703	1710	75 %	0 %	25 %	0 %	87159858
8	NC_007792	AGAA	2	8	2380	2387	75 %	0 %	25 %	0 %	87159883
9	NC_007792	TAAA	2	8	2856	2863	75 %	25 %	0 %	0 %	87159883
10	NC_007792	TAAT	2	8	2922	2929	50 %	50 %	0 %	0 %	87159883
11	NC_007792	GGTT	2	8	3347	3354	0 %	50 %	50 %	0 %	87159883
12	NC_007792	AAGG	2	8	3428	3435	50 %	0 %	50 %	0 %	87159883
13	NC_007792	AATT	2	8	3954	3961	50 %	50 %	0 %	0 %	87159883
14	NC_007792	ATTA	2	8	4255	4262	50 %	50 %	0 %	0 %	87159883
15	NC_007792	AAAG	2	8	4484	4491	75 %	0 %	25 %	0 %	87159883
16	NC_007792	AATT	2	8	4980	4987	50 %	50 %	0 %	0 %	87159883
17	NC_007792	AAAC	2	8	5235	5242	75 %	0 %	0 %	25 %	87159883
18	NC_007792	ATCT	2	8	5382	5389	25 %	50 %	0 %	25 %	87159880
19	NC_007792	ACAT	2	8	6024	6031	50 %	25 %	0 %	25 %	87159860
20	NC_007792	AAGA	2	8	6258	6265	75 %	0 %	25 %	0 %	87159860
21	NC_007792	GAAA	2	8	6683	6690	75 %	0 %	25 %	0 %	87159864
22	NC_007792	AAAC	2	8	6774	6781	75 %	0 %	0 %	25 %	87159864
23	NC_007792	ATTT	2	8	8231	8238	25 %	75 %	0 %	0 %	87159879
24	NC_007792	ACAT	2	8	9186	9193	50 %	25 %	0 %	25 %	87159872
25	NC_007792	AAGA	2	8	9420	9427	75 %	0 %	25 %	0 %	87159872
26	NC_007792	ATCA	2	8	10124	10131	50 %	25 %	0 %	25 %	87159868
27	NC_007792	AAGG	2	8	11012	11019	50 %	0 %	50 %	0 %	87159868
28	NC_007792	ATTA	2	8	11023	11030	50 %	50 %	0 %	0 %	87159875
29	NC_007792	TGGT	2	8	11312	11319	0 %	50 %	50 %	0 %	87159875
30	NC_007792	CTTA	2	8	11607	11614	25 %	50 %	0 %	25 %	87159849
31	NC_007792	TGAT	2	8	11720	11727	25 %	50 %	25 %	0 %	87159849
32	NC_007792	GACG	2	8	11882	11889	25 %	0 %	50 %	25 %	87159853
33	NC_007792	AGAA	2	8	12783	12790	75 %	0 %	25 %	0 %	87159848
34	NC_007792	TCAA	2	8	12811	12818	50 %	25 %	0 %	25 %	87159848
35	NC_007792	TAAA	2	8	13271	13278	75 %	25 %	0 %	0 %	87159848
36	NC_007792	GTTC	2	8	13579	13586	0 %	50 %	25 %	25 %	87159848
37	NC_007792	TGAC	2	8	14021	14028	25 %	25 %	25 %	25 %	87159848
38	NC_007792	TAGA	2	8	14354	14361	50 %	25 %	25 %	0 %	87159848
39	NC_007792	TTCC	2	8	14738	14745	0 %	50 %	0 %	50 %	87159857
40	NC_007792	AATA	2	8	14918	14925	75 %	25 %	0 %	0 %	87159857
41	NC_007792	ACAG	2	8	15104	15111	50 %	0 %	25 %	25 %	87159857
42	NC_007792	TGAA	2	8	15121	15128	50 %	25 %	25 %	0 %	87159857
43	NC_007792	ACAA	2	8	15274	15281	75 %	0 %	0 %	25 %	87159857
44	NC_007792	ATAA	2	8	15702	15709	75 %	25 %	0 %	0 %	87159857
45	NC_007792	CTAT	2	8	16232	16239	25 %	50 %	0 %	25 %	87159855
46	NC_007792	GTAG	2	8	16688	16695	25 %	25 %	50 %	0 %	87159855
47	NC_007792	TAGT	2	8	16806	16813	25 %	50 %	25 %	0 %	87159855
48	NC_007792	ATTT	2	8	16885	16892	25 %	75 %	0 %	0 %	87159855
49	NC_007792	CTGG	2	8	16955	16962	0 %	25 %	50 %	25 %	87159856
50	NC_007792	AGCA	2	8	17136	17143	50 %	0 %	25 %	25 %	87159856
51	NC_007792	ATCA	2	8	17154	17161	50 %	25 %	0 %	25 %	87159856
52	NC_007792	ACAA	2	8	17261	17268	75 %	0 %	0 %	25 %	87159856
53	NC_007792	AGAT	2	8	17340	17347	50 %	25 %	25 %	0 %	87159856
54	NC_007792	AGTA	2	8	17377	17384	50 %	25 %	25 %	0 %	87159856
55	NC_007792	TTTG	2	8	18184	18191	0 %	75 %	25 %	0 %	87159878
56	NC_007792	GTTA	2	8	18223	18230	25 %	50 %	25 %	0 %	87159878
57	NC_007792	ATGA	2	8	18302	18309	50 %	25 %	25 %	0 %	87159878
58	NC_007792	TAAA	2	8	18738	18745	75 %	25 %	0 %	0 %	87159878
59	NC_007792	AAAT	2	8	18985	18992	75 %	25 %	0 %	0 %	87159878
60	NC_007792	AAAG	2	8	19205	19212	75 %	0 %	25 %	0 %	87159878
61	NC_007792	ATAG	2	8	19289	19296	50 %	25 %	25 %	0 %	87159878
62	NC_007792	AAAC	2	8	19489	19496	75 %	0 %	0 %	25 %	87159878
63	NC_007792	GAAA	2	8	19918	19925	75 %	0 %	25 %	0 %	87159852
64	NC_007792	TAAA	2	8	20036	20043	75 %	25 %	0 %	0 %	87159851
65	NC_007792	AATT	2	8	20339	20346	50 %	50 %	0 %	0 %	87159851
66	NC_007792	ATAA	2	8	20371	20378	75 %	25 %	0 %	0 %	87159851
67	NC_007792	GAAG	2	8	20605	20612	50 %	0 %	50 %	0 %	87159851
68	NC_007792	TGAT	2	8	21371	21378	25 %	50 %	25 %	0 %	87159851
69	NC_007792	AGAA	2	8	21479	21486	75 %	0 %	25 %	0 %	87159851
70	NC_007792	AAAG	2	8	21523	21530	75 %	0 %	25 %	0 %	87159851
71	NC_007792	AAGA	2	8	21556	21563	75 %	0 %	25 %	0 %	87159851
72	NC_007792	TAAA	2	8	21627	21634	75 %	25 %	0 %	0 %	87159851
73	NC_007792	TATT	2	8	22231	22238	25 %	75 %	0 %	0 %	87159873
74	NC_007792	CTTT	2	8	22426	22433	0 %	75 %	0 %	25 %	87159873
75	NC_007792	CCTT	2	8	22521	22528	0 %	50 %	0 %	50 %	87159873
76	NC_007792	TAAA	2	8	22622	22629	75 %	25 %	0 %	0 %	87159873
77	NC_007792	ATCT	2	8	23007	23014	25 %	50 %	0 %	25 %	87159881
78	NC_007792	ACAT	2	8	23589	23596	50 %	25 %	0 %	25 %	87159874
79	NC_007792	AAGA	2	8	23823	23830	75 %	0 %	25 %	0 %	87159874
80	NC_007792	CATT	2	8	24460	24467	25 %	50 %	0 %	25 %	87159850
81	NC_007792	CTTT	2	8	25168	25175	0 %	75 %	0 %	25 %	87159862
82	NC_007792	AATA	2	8	25643	25650	75 %	25 %	0 %	0 %	87159862
83	NC_007792	AAAG	2	8	25802	25809	75 %	0 %	25 %	0 %	87159862
84	NC_007792	ATTT	2	8	26327	26334	25 %	75 %	0 %	0 %	87159882
85	NC_007792	AATT	2	8	26740	26747	50 %	50 %	0 %	0 %	87159861
86	NC_007792	TAGA	2	8	27000	27007	50 %	25 %	25 %	0 %	87159861
87	NC_007792	TAAG	2	8	28025	28032	50 %	25 %	25 %	0 %	87159877
88	NC_007792	AAAT	2	8	28152	28159	75 %	25 %	0 %	0 %	87159877
89	NC_007792	AAAT	2	8	28259	28266	75 %	25 %	0 %	0 %	87159877
90	NC_007792	AACA	2	8	28309	28316	75 %	0 %	0 %	25 %	87159877
91	NC_007792	ACTA	2	8	28332	28339	50 %	25 %	0 %	25 %	87159877
92	NC_007792	ATGA	2	8	28649	28656	50 %	25 %	25 %	0 %	87159865
93	NC_007792	AGAT	2	8	29371	29378	50 %	25 %	25 %	0 %	87159865
94	NC_007792	ATTT	2	8	29394	29401	25 %	75 %	0 %	0 %	87159865
95	NC_007792	ACGA	2	8	29403	29410	50 %	0 %	25 %	25 %	87159865
96	NC_007792	AAAG	2	8	29867	29874	75 %	0 %	25 %	0 %	87159865
97	NC_007792	AAAG	2	8	29942	29949	75 %	0 %	25 %	0 %	87159865
98	NC_007792	AACT	2	8	30064	30071	50 %	25 %	0 %	25 %	87159865
99	NC_007792	AAGA	2	8	30153	30160	75 %	0 %	25 %	0 %	87159865
100	NC_007792	AAAT	2	8	30596	30603	75 %	25 %	0 %	0 %	87159876
101	NC_007792	TTCG	2	8	31259	31266	0 %	50 %	25 %	25 %	87159876
102	NC_007792	GATA	2	8	31376	31383	50 %	25 %	25 %	0 %	87159876
103	NC_007792	TTAA	2	8	31554	31561	50 %	50 %	0 %	0 %	87159876
104	NC_007792	TAAT	2	8	31621	31628	50 %	50 %	0 %	0 %	87159876
105	NC_007792	TAAA	2	8	31774	31781	75 %	25 %	0 %	0 %	87159876
106	NC_007792	GTAA	2	8	31824	31831	50 %	25 %	25 %	0 %	87159876
107	NC_007792	ACTT	2	8	31887	31894	25 %	50 %	0 %	25 %	87159876
108	NC_007792	ACAA	2	8	32077	32084	75 %	0 %	0 %	25 %	87159876
109	NC_007792	CATT	2	8	33639	33646	25 %	50 %	0 %	25 %	87159854
110	NC_007792	ATTT	2	8	33767	33774	25 %	75 %	0 %	0 %	87159854
111	NC_007792	ATTC	2	8	33862	33869	25 %	50 %	0 %	25 %	87159854
112	NC_007792	TTTA	2	8	34341	34348	25 %	75 %	0 %	0 %	87159866
113	NC_007792	TAAA	2	8	34493	34500	75 %	25 %	0 %	0 %	87159866
114	NC_007792	AGAA	2	8	34539	34546	75 %	0 %	25 %	0 %	87159866
115	NC_007792	AAAT	2	8	34592	34599	75 %	25 %	0 %	0 %	87159866
116	NC_007792	CAAT	2	8	35333	35340	50 %	25 %	0 %	25 %	87159871
117	NC_007792	GATA	2	8	35472	35479	50 %	25 %	25 %	0 %	87159871
118	NC_007792	TAAA	2	8	35629	35636	75 %	25 %	0 %	0 %	87159871
119	NC_007792	CATT	2	8	36125	36132	25 %	50 %	0 %	25 %	87159871
120	NC_007792	AAGA	2	8	36269	36276	75 %	0 %	25 %	0 %	87159869
121	NC_007792	ATGT	2	8	36685	36692	25 %	50 %	25 %	0 %	87159867
122	NC_007792	ATTC	2	8	36847	36854	25 %	50 %	0 %	25 %	87159867

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.