MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_FPR3757 plasmid pUSA03

Total Repeats: 481

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007792	AGA	2	6	124	129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87159870
2	NC_007792	AAT	2	6	653	658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159870
3	NC_007792	TAA	2	6	775	780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159870
4	NC_007792	GAA	2	6	791	796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87159870
5	NC_007792	TAA	2	6	841	846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159870
6	NC_007792	AGA	2	6	871	876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87159870
7	NC_007792	GAA	2	6	884	889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87159870
8	NC_007792	GAA	2	6	992	997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87159870
9	NC_007792	TAT	2	6	1009	1014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159870
10	NC_007792	GAA	2	6	1017	1022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87159870
11	NC_007792	CTA	2	6	1235	1240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87159858
12	NC_007792	GTG	2	6	1291	1296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	87159858
13	NC_007792	TCA	2	6	1304	1309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87159858
14	NC_007792	GAA	2	6	1364	1369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87159858
15	NC_007792	TTA	2	6	1385	1390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159858
16	NC_007792	TGA	2	6	1403	1408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87159858
17	NC_007792	GCA	2	6	1596	1601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	87159858
18	NC_007792	AAT	2	6	1610	1615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159858
19	NC_007792	CAT	2	6	1835	1840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87159858
20	NC_007792	AAT	2	6	2600	2605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159883
21	NC_007792	TAT	2	6	2655	2660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159883
22	NC_007792	TGT	2	6	2761	2766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	87159883
23	NC_007792	ATT	2	6	2871	2876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159883
24	NC_007792	TAT	2	6	2900	2905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159883
25	NC_007792	TAA	2	6	2934	2939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159883
26	NC_007792	ATT	2	6	2954	2959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159883
27	NC_007792	TCC	2	6	3001	3006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	87159883
28	NC_007792	GTT	2	6	3041	3046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	87159883
29	NC_007792	TAA	2	6	3208	3213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159883
30	NC_007792	ATT	2	6	3244	3249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159883
31	NC_007792	TTG	2	6	3304	3309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	87159883
32	NC_007792	AAC	2	6	3361	3366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	87159883
33	NC_007792	ATT	2	6	3383	3388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159883
34	NC_007792	AAT	4	12	3392	3403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159883
35	NC_007792	AGT	2	6	3551	3556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87159883
36	NC_007792	AAT	2	6	3572	3577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159883
37	NC_007792	TGA	2	6	3592	3597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87159883
38	NC_007792	ATA	2	6	3627	3632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159883
39	NC_007792	AGA	2	6	3676	3681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87159883
40	NC_007792	CAT	2	6	3728	3733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87159883
41	NC_007792	CTA	2	6	3840	3845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87159883
42	NC_007792	TCT	2	6	3860	3865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	87159883
43	NC_007792	TTA	2	6	3939	3944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159883
44	NC_007792	TAG	2	6	4044	4049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87159883
45	NC_007792	ATA	2	6	4083	4088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159883
46	NC_007792	TAA	2	6	4111	4116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159883
47	NC_007792	TAA	2	6	4135	4140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159883
48	NC_007792	TAA	2	6	4200	4205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159883
49	NC_007792	AAT	2	6	4226	4231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159883
50	NC_007792	AAC	2	6	4378	4383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	87159883
51	NC_007792	TTA	2	6	4494	4499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159883
52	NC_007792	AAT	2	6	4660	4665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159883
53	NC_007792	ATA	2	6	4704	4709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159883
54	NC_007792	TCT	2	6	4748	4753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	87159883
55	NC_007792	TAA	2	6	4843	4848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159883
56	NC_007792	TCT	2	6	4862	4867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	87159883
57	NC_007792	GAT	2	6	4886	4891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87159883
58	NC_007792	TAT	2	6	4953	4958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159883
59	NC_007792	CAA	2	6	5024	5029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	87159883
60	NC_007792	ATT	2	6	5095	5100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159883
61	NC_007792	TAA	3	9	5200	5208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159883
62	NC_007792	TTA	2	6	5225	5230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159883
63	NC_007792	ATT	2	6	5319	5324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159880
64	NC_007792	CAA	2	6	5407	5412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	87159880
65	NC_007792	ATT	2	6	5516	5521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159880
66	NC_007792	AAT	2	6	5540	5545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159880
67	NC_007792	CTA	2	6	5790	5795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87159860
68	NC_007792	GTG	2	6	5846	5851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	87159860
69	NC_007792	TCA	2	6	5859	5864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87159860
70	NC_007792	GAA	2	6	5919	5924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87159860
71	NC_007792	TTA	2	6	5940	5945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159860
72	NC_007792	TGA	2	6	5958	5963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87159860
73	NC_007792	TTA	2	6	6080	6085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159860
74	NC_007792	CAT	2	6	6390	6395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87159860
75	NC_007792	GAA	2	6	6732	6737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87159864
76	NC_007792	TAA	2	6	6817	6822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159864
77	NC_007792	ACA	2	6	6912	6917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	87159864
78	NC_007792	TAA	2	6	6958	6963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159864
79	NC_007792	AGA	2	6	6980	6985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87159864
80	NC_007792	ACT	2	6	7034	7039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87159864
81	NC_007792	CGA	2	6	7049	7054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	87159864
82	NC_007792	ATT	3	9	7135	7143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159864
83	NC_007792	TTA	2	6	7899	7904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159879
84	NC_007792	ATA	2	6	7914	7919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159879
85	NC_007792	AAT	2	6	7927	7932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159879
86	NC_007792	ATA	2	6	7959	7964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159879
87	NC_007792	TTG	2	6	8079	8084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	87159879
88	NC_007792	ATA	2	6	8192	8197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159879
89	NC_007792	TGA	2	6	8224	8229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87159879
90	NC_007792	ATT	2	6	8266	8271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159879
91	NC_007792	ATT	2	6	8293	8298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159879
92	NC_007792	ATT	2	6	8439	8444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159879
93	NC_007792	ATT	2	6	8584	8589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159879
94	NC_007792	TAA	2	6	8590	8595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159879
95	NC_007792	CTA	2	6	8952	8957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87159872
96	NC_007792	GTG	2	6	9008	9013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	87159872
97	NC_007792	TCA	2	6	9021	9026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87159872
98	NC_007792	GAA	2	6	9081	9086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87159872
99	NC_007792	TTA	2	6	9102	9107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159872
100	NC_007792	TGA	2	6	9120	9125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87159872
101	NC_007792	TTA	2	6	9242	9247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159872
102	NC_007792	CAT	2	6	9552	9557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	87159872
103	NC_007792	ATT	2	6	9678	9683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159859
104	NC_007792	ATT	3	9	9856	9864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159859
105	NC_007792	GAA	2	6	10069	10074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87159868
106	NC_007792	GAT	2	6	10147	10152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87159868
107	NC_007792	TAT	2	6	10276	10281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159868
108	NC_007792	GAT	2	6	10354	10359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87159868
109	NC_007792	ATT	2	6	10362	10367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159868
110	NC_007792	TGA	2	6	10413	10418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87159868
111	NC_007792	AGA	2	6	10518	10523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87159868
112	NC_007792	GAA	2	6	10735	10740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87159868
113	NC_007792	GAG	2	6	10915	10920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	87159868
114	NC_007792	AAC	2	6	11050	11055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	87159875
115	NC_007792	ACA	2	6	11140	11145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	87159875
116	NC_007792	TTG	2	6	11172	11177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	87159875
117	NC_007792	TGA	2	6	11230	11235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87159875
118	NC_007792	GCA	2	6	11300	11305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	87159875
119	NC_007792	AAG	2	6	11420	11425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87159849
120	NC_007792	GAA	2	6	11455	11460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87159849
121	NC_007792	ATA	2	6	11479	11484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159849
122	NC_007792	TAA	2	6	11618	11623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159849
123	NC_007792	TAG	2	6	11642	11647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87159849
124	NC_007792	AAG	2	6	11786	11791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87159849
125	NC_007792	TGA	3	9	11799	11807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	87159849
126	NC_007792	AAC	2	6	11844	11849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	87159853
127	NC_007792	AAG	2	6	11904	11909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87159853
128	NC_007792	GTT	2	6	11942	11947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	87159853
129	NC_007792	TTA	2	6	12002	12007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	87159853
130	NC_007792	AGA	2	6	12034	12039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	87159853
131	NC_007792	ACG	2	6	12069	12074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	87159853
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133	NC_007792	TAA	4	12	12163	12174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	87159853
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