MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300_FPR3757 plasmid pUSA03

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007792	TA	4	8	5	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007792	TA	3	6	24	29	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007792	GA	3	6	229	234	50 %	0 %	50 %	0 %	87159870
4	NC_007792	AT	3	6	284	289	50 %	50 %	0 %	0 %	87159870
5	NC_007792	AC	3	6	592	597	50 %	0 %	0 %	50 %	87159870
6	NC_007792	AT	3	6	730	735	50 %	50 %	0 %	0 %	87159870
7	NC_007792	AT	3	6	1267	1272	50 %	50 %	0 %	0 %	87159858
8	NC_007792	TA	3	6	1774	1779	50 %	50 %	0 %	0 %	87159858
9	NC_007792	AT	3	6	1869	1874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007792	TA	3	6	1999	2004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007792	AT	3	6	2056	2061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007792	TA	3	6	2585	2590	50 %	50 %	0 %	0 %	87159883
13	NC_007792	AT	3	6	2625	2630	50 %	50 %	0 %	0 %	87159883
14	NC_007792	TA	3	6	3177	3182	50 %	50 %	0 %	0 %	87159883
15	NC_007792	TA	3	6	3267	3272	50 %	50 %	0 %	0 %	87159883
16	NC_007792	AT	3	6	3329	3334	50 %	50 %	0 %	0 %	87159883
17	NC_007792	AG	3	6	5003	5008	50 %	0 %	50 %	0 %	87159883
18	NC_007792	AT	3	6	5822	5827	50 %	50 %	0 %	0 %	87159860
19	NC_007792	TA	3	6	6329	6334	50 %	50 %	0 %	0 %	87159860
20	NC_007792	TA	3	6	6498	6503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007792	AT	3	6	6803	6808	50 %	50 %	0 %	0 %	87159864
22	NC_007792	GT	3	6	7448	7453	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007792	AC	4	8	7522	7529	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_007792	AC	3	6	7615	7620	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_007792	TC	3	6	7729	7734	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_007792	AT	3	6	8115	8120	50 %	50 %	0 %	0 %	87159879
27	NC_007792	CA	3	6	8415	8420	50 %	0 %	0 %	50 %	87159879
28	NC_007792	TA	3	6	8693	8698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007792	AT	3	6	8984	8989	50 %	50 %	0 %	0 %	87159872
30	NC_007792	TA	3	6	9491	9496	50 %	50 %	0 %	0 %	87159872
31	NC_007792	AG	3	6	10225	10230	50 %	0 %	50 %	0 %	87159868
32	NC_007792	AT	3	6	11668	11673	50 %	50 %	0 %	0 %	87159849
33	NC_007792	AT	3	6	11869	11874	50 %	50 %	0 %	0 %	87159853
34	NC_007792	TA	3	6	12119	12124	50 %	50 %	0 %	0 %	87159853
35	NC_007792	TA	3	6	12403	12408	50 %	50 %	0 %	0 %	87159853
36	NC_007792	AT	3	6	13398	13403	50 %	50 %	0 %	0 %	87159848
37	NC_007792	TA	3	6	13757	13762	50 %	50 %	0 %	0 %	87159848
38	NC_007792	AT	3	6	13961	13966	50 %	50 %	0 %	0 %	87159848
39	NC_007792	AT	3	6	14585	14590	50 %	50 %	0 %	0 %	87159857
40	NC_007792	AT	3	6	14611	14616	50 %	50 %	0 %	0 %	87159857
41	NC_007792	AC	3	6	15439	15444	50 %	0 %	0 %	50 %	87159857
42	NC_007792	TA	3	6	15463	15468	50 %	50 %	0 %	0 %	87159857
43	NC_007792	AT	3	6	17112	17117	50 %	50 %	0 %	0 %	87159856
44	NC_007792	AT	3	6	17497	17502	50 %	50 %	0 %	0 %	87159878
45	NC_007792	AT	3	6	17871	17876	50 %	50 %	0 %	0 %	87159878
46	NC_007792	GA	3	6	18054	18059	50 %	0 %	50 %	0 %	87159878
47	NC_007792	AT	3	6	18400	18405	50 %	50 %	0 %	0 %	87159878
48	NC_007792	AT	3	6	18991	18996	50 %	50 %	0 %	0 %	87159878
49	NC_007792	AT	3	6	19580	19585	50 %	50 %	0 %	0 %	87159852
50	NC_007792	AT	3	6	19656	19661	50 %	50 %	0 %	0 %	87159852
51	NC_007792	TA	4	8	19771	19778	50 %	50 %	0 %	0 %	87159852
52	NC_007792	AT	3	6	20090	20095	50 %	50 %	0 %	0 %	87159851
53	NC_007792	AT	3	6	20737	20742	50 %	50 %	0 %	0 %	87159851
54	NC_007792	TC	3	6	20795	20800	0 %	50 %	0 %	50 %	87159851
55	NC_007792	TA	3	6	20816	20821	50 %	50 %	0 %	0 %	87159851
56	NC_007792	AT	3	6	21075	21080	50 %	50 %	0 %	0 %	87159851
57	NC_007792	TA	3	6	21325	21330	50 %	50 %	0 %	0 %	87159851
58	NC_007792	TG	3	6	21930	21935	0 %	50 %	50 %	0 %	87159873
59	NC_007792	TA	3	6	22362	22367	50 %	50 %	0 %	0 %	87159873
60	NC_007792	AT	3	6	22660	22665	50 %	50 %	0 %	0 %	87159881
61	NC_007792	AT	3	6	23387	23392	50 %	50 %	0 %	0 %	87159874
62	NC_007792	TA	3	6	23894	23899	50 %	50 %	0 %	0 %	87159874
63	NC_007792	TA	3	6	24534	24539	50 %	50 %	0 %	0 %	87159850
64	NC_007792	TA	3	6	24635	24640	50 %	50 %	0 %	0 %	87159850
65	NC_007792	AT	3	6	24782	24787	50 %	50 %	0 %	0 %	87159862
66	NC_007792	AT	3	6	25434	25439	50 %	50 %	0 %	0 %	87159862
67	NC_007792	AT	4	8	25817	25824	50 %	50 %	0 %	0 %	87159862
68	NC_007792	AT	4	8	25944	25951	50 %	50 %	0 %	0 %	87159862
69	NC_007792	AT	5	10	26216	26225	50 %	50 %	0 %	0 %	87159882
70	NC_007792	AT	3	6	26254	26259	50 %	50 %	0 %	0 %	87159882
71	NC_007792	TA	3	6	29127	29132	50 %	50 %	0 %	0 %	87159865
72	NC_007792	TA	3	6	30234	30239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007792	TA	3	6	30319	30324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007792	TA	3	6	30865	30870	50 %	50 %	0 %	0 %	87159876
75	NC_007792	AT	3	6	31313	31318	50 %	50 %	0 %	0 %	87159876
76	NC_007792	TA	3	6	31354	31359	50 %	50 %	0 %	0 %	87159876
77	NC_007792	AT	3	6	31711	31716	50 %	50 %	0 %	0 %	87159876
78	NC_007792	TA	3	6	31974	31979	50 %	50 %	0 %	0 %	87159876
79	NC_007792	AT	3	6	32098	32103	50 %	50 %	0 %	0 %	87159876
80	NC_007792	TA	3	6	32221	32226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007792	TA	3	6	32569	32574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007792	GT	3	6	34801	34806	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007792	CA	3	6	35068	35073	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_007792	TA	3	6	35075	35080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007792	TA	3	6	35085	35090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007792	AT	3	6	35106	35111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007792	AT	3	6	35116	35121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007792	AT	3	6	35128	35133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007792	TA	3	6	35147	35152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007792	AG	3	6	36371	36376	50 %	0 %	50 %	0 %	87159869
91	NC_007792	AC	3	6	36433	36438	50 %	0 %	0 %	50 %	87159869
92	NC_007792	TA	3	6	36826	36831	50 %	50 %	0 %	0 %	87159867
93	NC_007792	AT	3	6	36881	36886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007792	AT	3	6	37091	37096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.