MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli str. K-12 substr. W3110

Total Repeats: 171

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007779	GAAAAT	2	12	10613	10624	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007779	TAAAAA	2	12	58377	58388	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007779	ACGCGT	2	12	75580	75591	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007779	AAGGGA	2	12	84331	84342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007779	TCTCCC	2	12	164544	164555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_007779	TCACCC	2	12	164595	164606	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_007779	GTAGTG	2	12	200380	200391	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007779	TCCGCC	2	12	249457	249468	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_007779	TGCGCC	2	12	249922	249933	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_007779	TGGAGA	2	12	250337	250348	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007779	TCTCCC	2	12	288467	288478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_007779	GCAGAA	2	12	289683	289694	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_007779	GTGCAG	2	12	296589	296600	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_007779	TAAGGG	2	12	310938	310949	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007779	TGTGGA	2	12	312085	312096	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007779	TTTTCT	2	12	319331	319342	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_007779	CTATTT	2	12	320367	320378	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_007779	TAAATT	2	12	343265	343276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007779	TTTATT	2	12	343374	343385	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007779	TATTGA	2	12	384218	384229	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007779	AACAAT	2	12	406491	406502	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_007779	TATTGA	2	12	409337	409348	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007779	TTTTCA	2	12	471702	471713	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_007779	CAGGCG	2	12	490545	490556	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_007779	TTATAT	2	12	567908	567919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007779	GATTTT	2	12	571503	571514	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007779	AATAAA	2	12	576225	576236	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007779	CTGTCA	2	12	579367	579378	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007779	GCAGAA	2	12	581087	581098	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_007779	TGCAAA	2	12	611876	611887	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_007779	ATTTTT	2	12	708694	708705	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007779	TTTTCT	2	12	795372	795383	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_007779	AATATT	2	12	821181	821192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007779	CAGAAA	2	12	833412	833423	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_007779	TAACCG	2	12	923307	923318	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007779	AAATAA	2	12	955034	955045	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007779	CTGGAA	2	12	964598	964609	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_007779	AAAGAT	2	12	987565	987576	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007779	TGTCCA	2	12	1008198	1008209	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007779	TAAGGA	2	12	1030466	1030477	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007779	ATAATG	2	12	1031880	1031891	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007779	TTTTGT	2	12	1221083	1221094	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007779	AGCGAT	2	12	1221484	1221495	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_007779	CACAGG	2	12	1223435	1223446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007779	ACGCTT	2	12	1241703	1241714	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007779	ACTCGA	2	12	1241723	1241734	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007779	CAGGCT	2	12	1241855	1241866	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_007779	CTTATT	2	12	1294002	1294013	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_007779	CAAAAG	2	12	1300898	1300909	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_007779	GGGGGT	2	12	1310454	1310465	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007779	CTGATC	2	12	1312712	1312723	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007779	CTATAA	2	12	1358979	1358990	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_007779	ATTTAA	2	12	1420218	1420229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007779	TGCCTT	2	12	1427872	1427883	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_007779	GGCACC	2	12	1468039	1468050	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
56	NC_007779	TATCAA	2	12	1472955	1472966	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_007779	GATGGT	2	12	1475053	1475064	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007779	AGCGCT	2	12	1475473	1475484	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_007779	GCAGGC	2	12	1475542	1475553	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007779	AAAAAC	2	12	1557475	1557486	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_007779	TTCATA	2	12	1569066	1569077	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_007779	ACCGTT	2	12	1572339	1572350	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_007779	TGGTTA	2	12	1581169	1581180	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007779	CAAAAA	2	12	1630839	1630850	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_007779	TAAATA	2	12	1632638	1632649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007779	TTTTTC	2	12	1634360	1634371	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_007779	AAAAAC	2	12	1646738	1646749	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_007779	ATACTT	2	12	1742848	1742859	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_007779	AAAATA	2	12	1756504	1756515	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007779	TGTTTT	2	12	1757137	1757148	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007779	AAGACT	2	12	1757397	1757408	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_007779	GAACAG	2	12	1805177	1805188	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_007779	TATTAC	2	12	1873625	1873636	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_007779	TTTCTT	2	12	1891640	1891651	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_007779	ATAAAC	2	12	1895583	1895594	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_007779	ACTGTC	2	12	1939241	1939252	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_007779	TTAATG	2	12	1981655	1981666	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007779	AATTCA	2	12	1988780	1988791	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_007779	TCTTAT	2	12	2002598	2002609	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_007779	ATATTT	2	12	2035992	2036003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007779	CGACTT	2	12	2036814	2036825	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_007779	ATTTTT	2	12	2060110	2060121	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007779	CTGATA	2	12	2070399	2070410	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_007779	GCACAG	2	12	2072992	2073003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_007779	TCCCCC	2	12	2155466	2155477	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
86	NC_007779	GAAAAA	2	12	2201352	2201363	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007779	ATACCG	2	12	2201729	2201740	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007779	TCTTCC	2	12	2267171	2267182	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_007779	CCAGAC	2	12	2322572	2322583	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_007779	CGCAGG	2	12	2335092	2335103	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_007779	CCATGC	2	12	2335662	2335673	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_007779	CAGCGT	2	12	2336154	2336165	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_007779	GCAGTT	2	12	2337659	2337670	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_007779	CCACTA	2	12	2354296	2354307	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_007779	TAAATG	2	12	2412347	2412358	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007779	TGTCAC	2	12	2425981	2425992	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_007779	AGAAAA	2	12	2436261	2436272	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007779	CTGATG	2	12	2500451	2500462	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_007779	GTTATG	2	12	2518291	2518302	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007779	CAAGTG	2	12	2536753	2536764	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_007779	TCCTTC	2	12	2637944	2637955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_007779	TGGACA	2	12	2688214	2688225	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_007779	CAGTTT	2	12	2702801	2702812	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_007779	GGTTTT	2	12	2764027	2764038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007779	TTTTAC	2	12	2781750	2781761	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_007779	ATTAAC	2	12	2786688	2786699	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_007779	TCAGCC	2	12	2808030	2808041	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
108	NC_007779	ATCTTA	2	12	2855498	2855509	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_007779	GGTTTT	2	12	2916684	2916695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007779	ACAAGA	2	12	2921015	2921026	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_007779	TTTGTT	2	12	2945951	2945962	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007779	ATCGCG	2	12	3039810	3039821	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_007779	GTAAGG	2	12	3055505	3055516	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007779	ACTGAG	2	12	3080494	3080505	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_007779	GCCAGC	2	12	3110466	3110477	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
116	NC_007779	ACGCAG	2	12	3120108	3120119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_007779	TTTTCG	2	12	3126754	3126765	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_007779	AGTTGT	2	12	3209685	3209696	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007779	CTTTTT	2	12	3214362	3214373	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_007779	AATGAT	2	12	3215197	3215208	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007779	TCTCCC	2	12	3238252	3238263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_007779	GTAACC	2	12	3265917	3265928	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_007779	AGACAA	2	12	3267537	3267548	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_007779	TGCATT	2	12	3276788	3276799	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_007779	TTTTAT	2	12	3278685	3278696	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.