MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rhodopseudomonas palustris HaA2 chromosome

Total Repeats: 5150

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007778	ACGGC	2	10	307	316	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_007778	CGCGG	2	10	605	614	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3	NC_007778	GCCAC	2	10	1010	1019	20 %	0 %	20 %	60 %	86747128
4	NC_007778	ACCAC	2	10	1988	1997	40 %	0 %	0 %	60 %	86747128
5	NC_007778	CGAAG	2	10	3616	3625	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_007778	CGGGG	2	10	4249	4258	0 %	0 %	80 %	20 %	86747131
7	NC_007778	CGCGG	2	10	4743	4752	0 %	0 %	60 %	40 %	86747131
8	NC_007778	GCCAC	2	10	5667	5676	20 %	0 %	20 %	60 %	86747132
9	NC_007778	GTGCT	2	10	6308	6317	0 %	40 %	40 %	20 %	86747132
10	NC_007778	CCGCG	2	10	6367	6376	0 %	0 %	40 %	60 %	86747132
11	NC_007778	CGCTG	2	10	8035	8044	0 %	20 %	40 %	40 %	86747133
12	NC_007778	GCCGA	2	10	9881	9890	20 %	0 %	40 %	40 %	86747135
13	NC_007778	GCAGC	2	10	12534	12543	20 %	0 %	40 %	40 %	86747138
14	NC_007778	CCGCG	2	10	14899	14908	0 %	0 %	40 %	60 %	86747140
15	NC_007778	GCCGG	2	10	15241	15250	0 %	0 %	60 %	40 %	86747141
16	NC_007778	CGCGG	2	10	16909	16918	0 %	0 %	60 %	40 %	86747144
17	NC_007778	CGAGC	2	10	17665	17674	20 %	0 %	40 %	40 %	86747144
18	NC_007778	GCGAG	2	10	19131	19140	20 %	0 %	60 %	20 %	86747145
19	NC_007778	GTTGC	2	10	20503	20512	0 %	40 %	40 %	20 %	86747146
20	NC_007778	CCGGG	2	10	21398	21407	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
21	NC_007778	GCGAC	2	10	22440	22449	20 %	0 %	40 %	40 %	86747149
22	NC_007778	GCCGC	2	10	25402	25411	0 %	0 %	40 %	60 %	86747153
23	NC_007778	CGCGG	2	10	25564	25573	0 %	0 %	60 %	40 %	86747153
24	NC_007778	GCGCC	2	10	25894	25903	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
25	NC_007778	CGCGC	2	10	25966	25975	0 %	0 %	40 %	60 %	86747154
26	NC_007778	CGCGG	2	10	29231	29240	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
27	NC_007778	GCCAC	2	10	30603	30612	20 %	0 %	20 %	60 %	86747159
28	NC_007778	CGGCT	2	10	31082	31091	0 %	20 %	40 %	40 %	86747159
29	NC_007778	GCGAC	2	10	31259	31268	20 %	0 %	40 %	40 %	86747159
30	NC_007778	GGCGC	2	10	32590	32599	0 %	0 %	60 %	40 %	86747159
31	NC_007778	CGGCG	2	10	34124	34133	0 %	0 %	60 %	40 %	86747162
32	NC_007778	GCGCA	2	10	34242	34251	20 %	0 %	40 %	40 %	86747162
33	NC_007778	TCGCG	2	10	34814	34823	0 %	20 %	40 %	40 %	86747162
34	NC_007778	GGCGC	2	10	35388	35397	0 %	0 %	60 %	40 %	86747162
35	NC_007778	TCCGA	2	10	35470	35479	20 %	20 %	20 %	40 %	86747162
36	NC_007778	GCGCG	2	10	36128	36137	0 %	0 %	60 %	40 %	86747162
37	NC_007778	GTCCG	2	10	36387	36396	0 %	20 %	40 %	40 %	86747162
38	NC_007778	GAAGT	2	10	36523	36532	40 %	20 %	40 %	0 %	86747162
39	NC_007778	TCGAA	2	10	36635	36644	40 %	20 %	20 %	20 %	86747162
40	NC_007778	CGTTG	2	10	37387	37396	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_007778	CAGCG	2	10	37881	37890	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_007778	CCGAC	2	10	38606	38615	20 %	0 %	20 %	60 %	86747165
43	NC_007778	CGCCC	2	10	39670	39679	0 %	0 %	20 %	80 %	86747166
44	NC_007778	CTGGC	2	10	39820	39829	0 %	20 %	40 %	40 %	86747167
45	NC_007778	CGATC	2	10	40693	40702	20 %	20 %	20 %	40 %	86747168
46	NC_007778	GCCGC	2	10	40710	40719	0 %	0 %	40 %	60 %	86747168
47	NC_007778	GCGCC	2	10	46993	47002	0 %	0 %	40 %	60 %	86747174
48	NC_007778	CGATC	2	10	49314	49323	20 %	20 %	20 %	40 %	86747175
49	NC_007778	CGGCC	2	10	49728	49737	0 %	0 %	40 %	60 %	86747175
50	NC_007778	TGTCA	2	10	50176	50185	20 %	40 %	20 %	20 %	86747175
51	NC_007778	GCCGC	2	10	51102	51111	0 %	0 %	40 %	60 %	86747176
52	NC_007778	ACGCG	2	10	51436	51445	20 %	0 %	40 %	40 %	86747177
53	NC_007778	CAGTT	2	10	51573	51582	20 %	40 %	20 %	20 %	86747177
54	NC_007778	CGGCG	2	10	51876	51885	0 %	0 %	60 %	40 %	86747177
55	NC_007778	CCGCG	2	10	52895	52904	0 %	0 %	40 %	60 %	86747177
56	NC_007778	GGCTT	2	10	53590	53599	0 %	40 %	40 %	20 %	86747177
57	NC_007778	CGCGG	2	10	57150	57159	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
58	NC_007778	TGCCC	2	10	57193	57202	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
59	NC_007778	CCGCG	2	10	58286	58295	0 %	0 %	40 %	60 %	86747183
60	NC_007778	CGGCG	2	10	59401	59410	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
61	NC_007778	CACCC	2	10	59457	59466	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
62	NC_007778	CGAGC	2	10	62019	62028	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
63	NC_007778	GCCCG	2	10	63100	63109	0 %	0 %	40 %	60 %	86747187
64	NC_007778	AGATC	2	10	64155	64164	40 %	20 %	20 %	20 %	86747187
65	NC_007778	CTCGC	2	10	64897	64906	0 %	20 %	20 %	60 %	86747188
66	NC_007778	GCATC	2	10	65135	65144	20 %	20 %	20 %	40 %	86747189
67	NC_007778	TCCGA	2	10	67284	67293	20 %	20 %	20 %	40 %	86747190
68	NC_007778	GCCGA	2	10	67445	67454	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
69	NC_007778	CATCG	2	10	68011	68020	20 %	20 %	20 %	40 %	86747191
70	NC_007778	CCCCA	2	10	68503	68512	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
71	NC_007778	GATCA	2	10	69346	69355	40 %	20 %	20 %	20 %	86747193
72	NC_007778	GTCCG	2	10	70743	70752	0 %	20 %	40 %	40 %	86747195
73	NC_007778	CGATG	2	10	70838	70847	20 %	20 %	40 %	20 %	86747195
74	NC_007778	TCGCC	2	10	74825	74834	0 %	20 %	20 %	60 %	86747199
75	NC_007778	CGTTG	2	10	75704	75713	0 %	40 %	40 %	20 %	86747200
76	NC_007778	GTGCC	2	10	79163	79172	0 %	20 %	40 %	40 %	86747203
77	NC_007778	GCGCC	2	10	79967	79976	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
78	NC_007778	CGTGC	2	10	80522	80531	0 %	20 %	40 %	40 %	86747204
79	NC_007778	CCGAG	2	10	80921	80930	20 %	0 %	40 %	40 %	86747204
80	NC_007778	TCGGG	2	10	83346	83355	0 %	20 %	60 %	20 %	86747207
81	NC_007778	GCAGC	2	10	83656	83665	20 %	0 %	40 %	40 %	86747207
82	NC_007778	GCGTC	2	10	85060	85069	0 %	20 %	40 %	40 %	86747209
83	NC_007778	CGGGC	2	10	86017	86026	0 %	0 %	60 %	40 %	86747209
84	NC_007778	CGGGG	2	10	86661	86670	0 %	0 %	80 %	20 %	86747209
85	NC_007778	CGGCG	2	10	86726	86735	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
86	NC_007778	CGCGG	2	10	90046	90055	0 %	0 %	60 %	40 %	86747211
87	NC_007778	CGGCC	2	10	91809	91818	0 %	0 %	40 %	60 %	86747212
88	NC_007778	ATCCG	2	10	93764	93773	20 %	20 %	20 %	40 %	86747214
89	NC_007778	CCGCA	2	10	95306	95315	20 %	0 %	20 %	60 %	86747216
90	NC_007778	GGCGT	2	10	95796	95805	0 %	20 %	60 %	20 %	86747216
91	NC_007778	CGGCG	2	10	98844	98853	0 %	0 %	60 %	40 %	86747218
92	NC_007778	TGACC	2	10	100413	100422	20 %	20 %	20 %	40 %	86747220
93	NC_007778	TGCGC	2	10	100776	100785	0 %	20 %	40 %	40 %	86747220
94	NC_007778	TCGGC	2	10	101592	101601	0 %	20 %	40 %	40 %	86747221
95	NC_007778	CCGCG	2	10	102371	102380	0 %	0 %	40 %	60 %	86747222
96	NC_007778	ACGGC	2	10	102397	102406	20 %	0 %	40 %	40 %	86747222
97	NC_007778	CGCGC	2	10	105462	105471	0 %	0 %	40 %	60 %	86747224
98	NC_007778	CGGCC	2	10	107294	107303	0 %	0 %	40 %	60 %	86747227
99	NC_007778	ACAAT	2	10	108527	108536	60 %	20 %	0 %	20 %	86747228
100	NC_007778	GCCGG	2	10	108951	108960	0 %	0 %	60 %	40 %	86747228
101	NC_007778	GGTGA	2	10	109122	109131	20 %	20 %	60 %	0 %	86747228
102	NC_007778	GCCAA	2	10	110325	110334	40 %	0 %	20 %	40 %	86747229
103	NC_007778	CAGGT	2	10	111300	111309	20 %	20 %	40 %	20 %	86747229
104	NC_007778	CGAGA	2	10	112591	112600	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
105	NC_007778	CGCCA	2	10	115272	115281	20 %	0 %	20 %	60 %	86747231
106	NC_007778	CAAAA	2	10	120147	120156	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_007778	CAGGA	2	10	120776	120785	40 %	0 %	40 %	20 %	86747237
108	NC_007778	CGCGA	2	10	121230	121239	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
109	NC_007778	CGCGC	2	10	121786	121795	0 %	0 %	40 %	60 %	86747238
110	NC_007778	TCCGG	2	10	122152	122161	0 %	20 %	40 %	40 %	86747238
111	NC_007778	CGCGG	2	10	122506	122515	0 %	0 %	60 %	40 %	86747239
112	NC_007778	CGACG	2	10	123677	123686	20 %	0 %	40 %	40 %	86747240
113	NC_007778	CGCGG	2	10	123800	123809	0 %	0 %	60 %	40 %	86747240
114	NC_007778	CGGCG	2	10	126484	126493	0 %	0 %	60 %	40 %	86747243
115	NC_007778	GCCGC	2	10	128145	128154	0 %	0 %	40 %	60 %	86747244
116	NC_007778	GCGCC	2	10	128310	128319	0 %	0 %	40 %	60 %	86747244
117	NC_007778	ACGCC	2	10	128676	128685	20 %	0 %	20 %	60 %	86747244
118	NC_007778	AGCGA	2	10	131332	131341	40 %	0 %	40 %	20 %	86747246
119	NC_007778	GCCGG	2	10	131479	131488	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
120	NC_007778	CGCGC	2	10	131765	131774	0 %	0 %	40 %	60 %	86747247
121	NC_007778	TATCG	2	10	131868	131877	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_007778	CCAGA	2	10	132439	132448	40 %	0 %	20 %	40 %	86747248
123	NC_007778	CGGCG	2	10	136567	136576	0 %	0 %	60 %	40 %	86747253
124	NC_007778	GCGAT	2	10	137523	137532	20 %	20 %	40 %	20 %	86747254
125	NC_007778	CGGCG	2	10	139093	139102	0 %	0 %	60 %	40 %	86747255
126	NC_007778	GGCGC	2	10	139713	139722	0 %	0 %	60 %	40 %	86747256
127	NC_007778	GCCGC	2	10	140828	140837	0 %	0 %	40 %	60 %	86747257
128	NC_007778	ATCGA	2	10	141507	141516	40 %	20 %	20 %	20 %	86747258
129	NC_007778	ACGGC	2	10	142488	142497	20 %	0 %	40 %	40 %	86747259
130	NC_007778	GCGCG	2	10	142782	142791	0 %	0 %	60 %	40 %	86747259
131	NC_007778	ACGGC	2	10	143238	143247	20 %	0 %	40 %	40 %	86747259
132	NC_007778	GCTCG	2	10	144679	144688	0 %	20 %	40 %	40 %	86747260
133	NC_007778	TGCGC	2	10	145358	145367	0 %	20 %	40 %	40 %	86747261
134	NC_007778	GCAGC	2	10	147210	147219	20 %	0 %	40 %	40 %	86747262
135	NC_007778	CGGCT	2	10	148006	148015	0 %	20 %	40 %	40 %	86747262
136	NC_007778	CGGCT	2	10	148378	148387	0 %	20 %	40 %	40 %	86747262
137	NC_007778	CGAGG	2	10	150380	150389	20 %	0 %	60 %	20 %	86747264
138	NC_007778	TTGCC	2	10	150451	150460	0 %	40 %	20 %	40 %	86747264
139	NC_007778	GCACC	2	10	150640	150649	20 %	0 %	20 %	60 %	86747264
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