MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhodopseudomonas palustris HaA2 chromosome

Total Repeats: 13826

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007778	TCGC	2	8	918	925	0 %	25 %	25 %	50 %	86747128
2	NC_007778	CTCG	2	8	1329	1336	0 %	25 %	25 %	50 %	86747128
3	NC_007778	GCCG	2	8	1450	1457	0 %	0 %	50 %	50 %	86747128
4	NC_007778	GACG	2	8	2107	2114	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007778	CGAC	2	8	2492	2499	25 %	0 %	25 %	50 %	86747129
6	NC_007778	GCCG	2	8	2526	2533	0 %	0 %	50 %	50 %	86747129
7	NC_007778	ATCT	2	8	2830	2837	25 %	50 %	0 %	25 %	86747129
8	NC_007778	CGAC	2	8	2882	2889	25 %	0 %	25 %	50 %	86747129
9	NC_007778	GTCG	2	8	3027	3034	0 %	25 %	50 %	25 %	86747129
10	NC_007778	TTCG	2	8	4032	4039	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_007778	GATC	2	8	4367	4374	25 %	25 %	25 %	25 %	86747131
12	NC_007778	CAGC	2	8	4556	4563	25 %	0 %	25 %	50 %	86747131
13	NC_007778	TGGA	2	8	4791	4798	25 %	25 %	50 %	0 %	86747131
14	NC_007778	GACC	2	8	4913	4920	25 %	0 %	25 %	50 %	86747131
15	NC_007778	CCGG	2	8	5209	5216	0 %	0 %	50 %	50 %	86747131
16	NC_007778	CCCG	2	8	5471	5478	0 %	0 %	25 %	75 %	86747132
17	NC_007778	CCGG	2	8	6541	6548	0 %	0 %	50 %	50 %	86747132
18	NC_007778	CGCT	2	8	7769	7776	0 %	25 %	25 %	50 %	86747132
19	NC_007778	GGTA	2	8	8026	8033	25 %	25 %	50 %	0 %	86747133
20	NC_007778	CCGG	2	8	8402	8409	0 %	0 %	50 %	50 %	86747133
21	NC_007778	GCCG	2	8	8410	8417	0 %	0 %	50 %	50 %	86747133
22	NC_007778	CGAT	2	8	8604	8611	25 %	25 %	25 %	25 %	86747133
23	NC_007778	CTGG	2	8	8852	8859	0 %	25 %	50 %	25 %	86747133
24	NC_007778	ATCC	2	8	8974	8981	25 %	25 %	0 %	50 %	86747133
25	NC_007778	TCGA	2	8	9456	9463	25 %	25 %	25 %	25 %	86747134
26	NC_007778	CACG	2	8	10006	10013	25 %	0 %	25 %	50 %	86747135
27	NC_007778	GGCG	2	8	10151	10158	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_007778	ACGA	2	8	10334	10341	50 %	0 %	25 %	25 %	86747136
29	NC_007778	CAGC	2	8	10366	10373	25 %	0 %	25 %	50 %	86747136
30	NC_007778	CGTC	2	8	10389	10396	0 %	25 %	25 %	50 %	86747136
31	NC_007778	CGGG	2	8	10405	10412	0 %	0 %	75 %	25 %	86747136
32	NC_007778	CGCC	2	8	10543	10550	0 %	0 %	25 %	75 %	86747137
33	NC_007778	CGGC	2	8	11054	11061	0 %	0 %	50 %	50 %	86747138
34	NC_007778	TGAT	2	8	12271	12278	25 %	50 %	25 %	0 %	86747138
35	NC_007778	CGAT	2	8	12625	12632	25 %	25 %	25 %	25 %	86747138
36	NC_007778	GATG	2	8	13883	13890	25 %	25 %	50 %	0 %	86747140
37	NC_007778	GGTC	2	8	14492	14499	0 %	25 %	50 %	25 %	86747140
38	NC_007778	GATC	2	8	14657	14664	25 %	25 %	25 %	25 %	86747140
39	NC_007778	CGGC	2	8	14915	14922	0 %	0 %	50 %	50 %	86747140
40	NC_007778	TCAA	2	8	15095	15102	50 %	25 %	0 %	25 %	86747141
41	NC_007778	CGGT	2	8	15134	15141	0 %	25 %	50 %	25 %	86747141
42	NC_007778	AGCG	2	8	15266	15273	25 %	0 %	50 %	25 %	86747141
43	NC_007778	TCGG	2	8	16131	16138	0 %	25 %	50 %	25 %	86747143
44	NC_007778	CGAG	2	8	16507	16514	25 %	0 %	50 %	25 %	86747143
45	NC_007778	ACGG	2	8	16546	16553	25 %	0 %	50 %	25 %	86747143
46	NC_007778	CGGC	2	8	16602	16609	0 %	0 %	50 %	50 %	86747143
47	NC_007778	TCGG	2	8	16780	16787	0 %	25 %	50 %	25 %	86747143
48	NC_007778	CGAG	2	8	16977	16984	25 %	0 %	50 %	25 %	86747144
49	NC_007778	CGAC	2	8	17283	17290	25 %	0 %	25 %	50 %	86747144
50	NC_007778	GGCC	2	8	17460	17467	0 %	0 %	50 %	50 %	86747144
51	NC_007778	CCGC	2	8	17535	17542	0 %	0 %	25 %	75 %	86747144
52	NC_007778	GCCG	2	8	18066	18073	0 %	0 %	50 %	50 %	86747144
53	NC_007778	CCGA	2	8	18134	18141	25 %	0 %	25 %	50 %	86747144
54	NC_007778	ACGG	2	8	18635	18642	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_007778	ATTC	2	8	18688	18695	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_007778	ATGG	2	8	18702	18709	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007778	GGTG	2	8	18816	18823	0 %	25 %	75 %	0 %	86747145
58	NC_007778	GCCG	2	8	19653	19660	0 %	0 %	50 %	50 %	86747145
59	NC_007778	CCCT	2	8	19715	19722	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
60	NC_007778	CCCG	2	8	20159	20166	0 %	0 %	25 %	75 %	86747146
61	NC_007778	GCCC	2	8	20175	20182	0 %	0 %	25 %	75 %	86747146
62	NC_007778	CGGT	2	8	20215	20222	0 %	25 %	50 %	25 %	86747146
63	NC_007778	GCCG	2	8	20414	20421	0 %	0 %	50 %	50 %	86747146
64	NC_007778	CGGC	2	8	21759	21766	0 %	0 %	50 %	50 %	86747148
65	NC_007778	GAGC	2	8	21984	21991	25 %	0 %	50 %	25 %	86747148
66	NC_007778	TCGC	2	8	22215	22222	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_007778	CTGC	2	8	22231	22238	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_007778	CGGG	2	8	22458	22465	0 %	0 %	75 %	25 %	86747149
69	NC_007778	GTCG	2	8	22972	22979	0 %	25 %	50 %	25 %	86747149
70	NC_007778	CCGC	2	8	23223	23230	0 %	0 %	25 %	75 %	86747149
71	NC_007778	GATC	2	8	23993	24000	25 %	25 %	25 %	25 %	86747151
72	NC_007778	GATC	2	8	24431	24438	25 %	25 %	25 %	25 %	86747151
73	NC_007778	CCGC	2	8	25272	25279	0 %	0 %	25 %	75 %	86747153
74	NC_007778	GCCG	2	8	25350	25357	0 %	0 %	50 %	50 %	86747153
75	NC_007778	GATC	2	8	25500	25507	25 %	25 %	25 %	25 %	86747153
76	NC_007778	GCTC	2	8	26618	26625	0 %	25 %	25 %	50 %	86747155
77	NC_007778	CAGC	2	8	27111	27118	25 %	0 %	25 %	50 %	86747155
78	NC_007778	GATG	2	8	27277	27284	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007778	CGGC	2	8	27467	27474	0 %	0 %	50 %	50 %	86747156
80	NC_007778	TGGC	2	8	27604	27611	0 %	25 %	50 %	25 %	86747156
81	NC_007778	CAGG	2	8	27627	27634	25 %	0 %	50 %	25 %	86747156
82	NC_007778	TGGT	2	8	27941	27948	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007778	CTTC	2	8	28089	28096	0 %	50 %	0 %	50 %	86747157
84	NC_007778	CGGC	2	8	28173	28180	0 %	0 %	50 %	50 %	86747157
85	NC_007778	CCAG	2	8	28749	28756	25 %	0 %	25 %	50 %	86747157
86	NC_007778	CGGC	2	8	28857	28864	0 %	0 %	50 %	50 %	86747157
87	NC_007778	GCCG	2	8	29110	29117	0 %	0 %	50 %	50 %	86747157
88	NC_007778	GGCG	2	8	30054	30061	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
89	NC_007778	GCGG	2	8	30103	30110	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
90	NC_007778	CGGC	2	8	30155	30162	0 %	0 %	50 %	50 %	86747159
91	NC_007778	CGGC	2	8	30331	30338	0 %	0 %	50 %	50 %	86747159
92	NC_007778	CGCT	2	8	31430	31437	0 %	25 %	25 %	50 %	86747159
93	NC_007778	GTCG	2	8	31972	31979	0 %	25 %	50 %	25 %	86747159
94	NC_007778	GGCC	2	8	32293	32300	0 %	0 %	50 %	50 %	86747159
95	NC_007778	CGGC	2	8	32412	32419	0 %	0 %	50 %	50 %	86747159
96	NC_007778	CGGG	2	8	32932	32939	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
97	NC_007778	CGCC	2	8	33312	33319	0 %	0 %	25 %	75 %	86747160
98	NC_007778	GGCC	2	8	33354	33361	0 %	0 %	50 %	50 %	86747160
99	NC_007778	GGCG	2	8	33480	33487	0 %	0 %	75 %	25 %	86747160
100	NC_007778	TCCG	2	8	34158	34165	0 %	25 %	25 %	50 %	86747162
101	NC_007778	GCCG	2	8	34262	34269	0 %	0 %	50 %	50 %	86747162
102	NC_007778	CGCC	2	8	34450	34457	0 %	0 %	25 %	75 %	86747162
103	NC_007778	GCCG	2	8	34779	34786	0 %	0 %	50 %	50 %	86747162
104	NC_007778	GGCG	2	8	35508	35515	0 %	0 %	75 %	25 %	86747162
105	NC_007778	GCGA	2	8	35761	35768	25 %	0 %	50 %	25 %	86747162
106	NC_007778	CTTG	2	8	35981	35988	0 %	50 %	25 %	25 %	86747162
107	NC_007778	CGGC	2	8	36689	36696	0 %	0 %	50 %	50 %	86747162
108	NC_007778	CTGG	2	8	37809	37816	0 %	25 %	50 %	25 %	86747164
109	NC_007778	GGCC	2	8	38547	38554	0 %	0 %	50 %	50 %	86747165
110	NC_007778	CCGA	2	8	39085	39092	25 %	0 %	25 %	50 %	86747165
111	NC_007778	GACA	2	8	39393	39400	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_007778	GCTG	2	8	39645	39652	0 %	25 %	50 %	25 %	86747166
113	NC_007778	TCGG	2	8	40165	40172	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_007778	GATC	2	8	41233	41240	25 %	25 %	25 %	25 %	86747168
115	NC_007778	TCGA	2	8	41261	41268	25 %	25 %	25 %	25 %	86747168
116	NC_007778	CCAG	2	8	42003	42010	25 %	0 %	25 %	50 %	86747168
117	NC_007778	GCAG	2	8	42215	42222	25 %	0 %	50 %	25 %	86747168
118	NC_007778	GGCC	2	8	42250	42257	0 %	0 %	50 %	50 %	86747168
119	NC_007778	GCCC	2	8	42316	42323	0 %	0 %	25 %	75 %	86747168
120	NC_007778	GGCT	2	8	42362	42369	0 %	25 %	50 %	25 %	86747168
121	NC_007778	CCGA	2	8	42640	42647	25 %	0 %	25 %	50 %	86747169
122	NC_007778	CCGG	2	8	42983	42990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_007778	GCCG	2	8	43001	43008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_007778	GGCC	2	8	43766	43773	0 %	0 %	50 %	50 %	86747171
125	NC_007778	CTGT	2	8	44036	44043	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_007778	GACG	2	8	44144	44151	25 %	0 %	50 %	25 %	86747172
127	NC_007778	GACC	2	8	44186	44193	25 %	0 %	25 %	50 %	86747172
128	NC_007778	GCCG	2	8	44496	44503	0 %	0 %	50 %	50 %	86747172
129	NC_007778	CTGG	2	8	45032	45039	0 %	25 %	50 %	25 %	86747172
130	NC_007778	GCTG	2	8	45199	45206	0 %	25 %	50 %	25 %	86747172
131	NC_007778	GGCG	2	8	45245	45252	0 %	0 %	75 %	25 %	86747172
132	NC_007778	CTGT	2	8	45285	45292	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_007778	CGAC	2	8	45603	45610	25 %	0 %	25 %	50 %	86747173
134	NC_007778	TGCC	2	8	45706	45713	0 %	25 %	25 %	50 %	86747173
135	NC_007778	TCGC	2	8	47093	47100	0 %	25 %	25 %	50 %	86747174
136	NC_007778	CGCT	2	8	47224	47231	0 %	25 %	25 %	50 %	86747174
137	NC_007778	CGGC	2	8	47962	47969	0 %	0 %	50 %	50 %	86747174
138	NC_007778	AGCG	2	8	47989	47996	25 %	0 %	50 %	25 %	86747174
139	NC_007778	TCGG	2	8	48389	48396	0 %	25 %	50 %	25 %	86747174
140	NC_007778	GACC	2	8	48487	48494	25 %	0 %	25 %	50 %	86747174
141	NC_007778	CACG	2	8	48609	48616	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_007778	GCCC	2	8	49554	49561	0 %	0 %	25 %	75 %	86747175
143	NC_007778	GCGG	2	8	49738	49745	0 %	0 %	75 %	25 %	86747175
144	NC_007778	GAAG	2	8	50557	50564	50 %	0 %	50 %	0 %	86747176
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