MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris HaA2 chromosome

Total Repeats: 9740

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007778	CGC	2	6	9	14	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_007778	TTC	2	6	98	103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007778	CGG	3	9	144	152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007778	CGG	2	6	264	269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007778	GAC	2	6	345	350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007778	AGG	2	6	374	379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007778	CGA	2	6	395	400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007778	ATT	2	6	442	447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007778	CAT	2	6	464	469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_007778	GCA	2	6	475	480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_007778	GCT	2	6	667	672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_007778	CGG	2	6	2098	2103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007778	CGG	2	6	2140	2145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_007778	CCG	2	6	2200	2205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_007778	GCC	2	6	2285	2290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_007778	CGG	2	6	2309	2314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007778	GCG	2	6	5235	5240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_007778	GCG	2	6	7914	7919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_007778	GAT	2	6	9122	9127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007778	CGA	2	6	9186	9191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_007778	TTC	2	6	9716	9721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007778	GGC	2	6	10133	10138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_007778	TCG	2	6	10139	10144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_007778	TGG	2	6	10243	10248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007778	GCG	2	6	10265	10270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_007778	GCG	2	6	12852	12857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007778	CGG	2	6	14970	14975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_007778	CGG	2	6	14977	14982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007778	CGG	2	6	18455	18460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_007778	CAG	2	6	18534	18539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_007778	CGG	2	6	18548	18553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_007778	AAG	2	6	18674	18679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007778	GCT	2	6	18748	18753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_007778	CGG	2	6	18780	18785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_007778	ATC	2	6	21319	21324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007778	AGC	2	6	21335	21340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_007778	CGG	3	9	21350	21358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007778	GCG	3	9	21478	21486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_007778	TCC	2	6	23306	23311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_007778	CGG	2	6	23372	23377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007778	CGG	2	6	25040	25045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007778	GAC	2	6	26299	26304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_007778	GCG	2	6	26328	26333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007778	GTC	2	6	27229	27234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007778	TCT	2	6	27261	27266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007778	GCT	2	6	27308	27313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007778	TTG	2	6	27316	27321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007778	GAA	2	6	29276	29281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007778	GTC	2	6	29300	29305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007778	CCA	2	6	29358	29363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_007778	GCG	2	6	29385	29390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007778	GAC	2	6	29413	29418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_007778	GCC	2	6	29433	29438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_007778	CCG	2	6	30032	30037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_007778	CGC	2	6	32954	32959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_007778	CGG	2	6	33005	33010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_007778	CGC	2	6	33011	33016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_007778	CCG	2	6	36813	36818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_007778	CGG	2	6	36913	36918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_007778	CTA	2	6	37413	37418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_007778	TGT	2	6	37434	37439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007778	CGA	2	6	37863	37868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_007778	CGG	2	6	37915	37920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_007778	AGA	2	6	37926	37931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007778	CCG	2	6	37932	37937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_007778	CGA	2	6	37957	37962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_007778	GAA	2	6	39206	39211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007778	GCG	2	6	39221	39226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_007778	TCG	3	9	39413	39421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_007778	CAG	2	6	39432	39437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_007778	TCG	2	6	40002	40007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_007778	GGC	2	6	40017	40022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_007778	ACG	2	6	40045	40050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_007778	CGA	2	6	40084	40089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007778	GCG	3	9	42457	42465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_007778	ATC	2	6	42958	42963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_007778	TGC	2	6	43018	43023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_007778	GAT	2	6	43069	43074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007778	CCG	3	9	43120	43128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_007778	TCG	2	6	43204	43209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_007778	CGC	2	6	43564	43569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_007778	GTC	2	6	44005	44010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007778	CGC	2	6	44106	44111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_007778	GAT	2	6	45433	45438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007778	ACG	2	6	45459	45464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_007778	ACG	2	6	46048	46053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_007778	TCG	2	6	48571	48576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007778	CGT	2	6	48737	48742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_007778	CGC	2	6	50336	50341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_007778	GCG	2	6	50420	50425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_007778	ATG	2	6	50460	50465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007778	GAC	2	6	50484	50489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_007778	TGA	2	6	53778	53783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007778	ACC	2	6	53914	53919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_007778	CCT	2	6	54009	54014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_007778	GGC	2	6	54028	54033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_007778	GCC	2	6	55000	55005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_007778	ACA	2	6	57320	57325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_007778	ATC	2	6	57368	57373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_007778	AAT	2	6	57432	57437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007778	GCG	2	6	57461	57466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_007778	ACG	2	6	57513	57518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_007778	TGC	2	6	59375	59380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_007778	GGC	2	6	59506	59511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_007778	GCA	2	6	59532	59537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_007778	GCC	2	6	59647	59652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_007778	TCC	2	6	61077	61082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_007778	TCG	2	6	61943	61948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_007778	CGC	3	9	64188	64196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_007778	CGC	2	6	64254	64259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_007778	GCC	2	6	64273	64278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_007778	TGC	2	6	66001	66006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_007778	GGC	2	6	67366	67371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_007778	GCG	2	6	67372	67377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_007778	TCG	2	6	67404	67409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_007778	CGG	2	6	67473	67478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_007778	CTG	2	6	68475	68480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_007778	CGA	2	6	68654	68659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_007778	TCA	2	6	68660	68665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_007778	TCA	2	6	68684	68689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_007778	TGG	2	6	69308	69313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007778	TGG	2	6	71826	71831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007778	CCG	2	6	71835	71840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_007778	GCA	2	6	71913	71918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_007778	CGC	2	6	71919	71924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_007778	CTT	2	6	73548	73553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_007778	CCG	2	6	73637	73642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_007778	CAA	2	6	73723	73728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_007778	TTC	2	6	73821	73826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_007778	AGC	2	6	73864	73869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_007778	CCG	2	6	73902	73907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_007778	TGG	2	6	77398	77403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007778	CGG	2	6	77409	77414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_007778	ACA	2	6	77420	77425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_007778	GCC	2	6	79730	79735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_007778	GAC	2	6	79779	79784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_007778	GAC	2	6	79953	79958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_007778	GCG	2	6	81339	81344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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140	NC_007778	CGT	2	6	82689	82694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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