MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rhodopseudomonas palustris HaA2 chromosome

Total Repeats: 16771

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007778	CG	3	6	762	767	0 %	0 %	50 %	50 %	86747128
2	NC_007778	GC	3	6	930	935	0 %	0 %	50 %	50 %	86747128
3	NC_007778	CG	3	6	1595	1600	0 %	0 %	50 %	50 %	86747128
4	NC_007778	GC	5	10	1609	1618	0 %	0 %	50 %	50 %	86747128
5	NC_007778	CG	3	6	1839	1844	0 %	0 %	50 %	50 %	86747128
6	NC_007778	CG	3	6	2374	2379	0 %	0 %	50 %	50 %	86747129
7	NC_007778	GC	3	6	2460	2465	0 %	0 %	50 %	50 %	86747129
8	NC_007778	GC	3	6	2871	2876	0 %	0 %	50 %	50 %	86747129
9	NC_007778	CG	3	6	3875	3880	0 %	0 %	50 %	50 %	86747130
10	NC_007778	GC	3	6	4336	4341	0 %	0 %	50 %	50 %	86747131
11	NC_007778	GC	3	6	4379	4384	0 %	0 %	50 %	50 %	86747131
12	NC_007778	GC	3	6	4801	4806	0 %	0 %	50 %	50 %	86747131
13	NC_007778	CG	3	6	4870	4875	0 %	0 %	50 %	50 %	86747131
14	NC_007778	GC	3	6	4953	4958	0 %	0 %	50 %	50 %	86747131
15	NC_007778	GC	3	6	5093	5098	0 %	0 %	50 %	50 %	86747131
16	NC_007778	GC	3	6	5415	5420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_007778	CG	3	6	6658	6663	0 %	0 %	50 %	50 %	86747132
18	NC_007778	GC	3	6	6668	6673	0 %	0 %	50 %	50 %	86747132
19	NC_007778	GC	3	6	6693	6698	0 %	0 %	50 %	50 %	86747132
20	NC_007778	GC	5	10	6868	6877	0 %	0 %	50 %	50 %	86747132
21	NC_007778	GC	3	6	7014	7019	0 %	0 %	50 %	50 %	86747132
22	NC_007778	CG	3	6	7119	7124	0 %	0 %	50 %	50 %	86747132
23	NC_007778	GC	4	8	7153	7160	0 %	0 %	50 %	50 %	86747132
24	NC_007778	CG	3	6	7402	7407	0 %	0 %	50 %	50 %	86747132
25	NC_007778	CG	4	8	8728	8735	0 %	0 %	50 %	50 %	86747133
26	NC_007778	GA	3	6	9707	9712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007778	CG	3	6	10027	10032	0 %	0 %	50 %	50 %	86747135
28	NC_007778	GT	3	6	10374	10379	0 %	50 %	50 %	0 %	86747136
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30	NC_007778	GC	3	6	11071	11076	0 %	0 %	50 %	50 %	86747138
31	NC_007778	GC	3	6	11351	11356	0 %	0 %	50 %	50 %	86747138
32	NC_007778	CG	3	6	11414	11419	0 %	0 %	50 %	50 %	86747138
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46	NC_007778	GC	3	6	17175	17180	0 %	0 %	50 %	50 %	86747144
47	NC_007778	CG	3	6	18601	18606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_007778	CG	3	6	18740	18745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_007778	GC	3	6	18868	18873	0 %	0 %	50 %	50 %	86747145
50	NC_007778	CG	3	6	18999	19004	0 %	0 %	50 %	50 %	86747145
51	NC_007778	CG	3	6	19102	19107	0 %	0 %	50 %	50 %	86747145
52	NC_007778	CG	3	6	19217	19222	0 %	0 %	50 %	50 %	86747145
53	NC_007778	CG	4	8	19352	19359	0 %	0 %	50 %	50 %	86747145
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66	NC_007778	GC	3	6	22395	22400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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81	NC_007778	GC	3	6	25939	25944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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109	NC_007778	GC	3	6	33429	33434	0 %	0 %	50 %	50 %	86747160
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111	NC_007778	CG	3	6	33797	33802	0 %	0 %	50 %	50 %	86747161
112	NC_007778	GC	3	6	33878	33883	0 %	0 %	50 %	50 %	86747161
113	NC_007778	CG	3	6	34948	34953	0 %	0 %	50 %	50 %	86747162
114	NC_007778	GC	3	6	35007	35012	0 %	0 %	50 %	50 %	86747162
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121	NC_007778	CG	3	6	38454	38459	0 %	0 %	50 %	50 %	86747165
122	NC_007778	GC	3	6	39238	39243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_007778	GC	3	6	39473	39478	0 %	0 %	50 %	50 %	86747166
124	NC_007778	GC	3	6	39699	39704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_007778	CG	3	6	40374	40379	0 %	0 %	50 %	50 %	86747168
126	NC_007778	GC	3	6	40494	40499	0 %	0 %	50 %	50 %	86747168
127	NC_007778	GC	3	6	41065	41070	0 %	0 %	50 %	50 %	86747168
128	NC_007778	GC	3	6	41349	41354	0 %	0 %	50 %	50 %	86747168
129	NC_007778	CG	3	6	42258	42263	0 %	0 %	50 %	50 %	86747168
130	NC_007778	CT	3	6	42466	42471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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132	NC_007778	GC	3	6	42820	42825	0 %	0 %	50 %	50 %	86747169
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134	NC_007778	GC	3	6	43135	43140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_007778	GA	3	6	43260	43265	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007778	CG	3	6	43602	43607	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_007778	CG	3	6	43815	43820	0 %	0 %	50 %	50 %	86747171
138	NC_007778	CG	3	6	44399	44404	0 %	0 %	50 %	50 %	86747172
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143	NC_007778	CG	4	8	45946	45953	0 %	0 %	50 %	50 %	86747173
144	NC_007778	AC	3	6	46126	46131	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_007778	GC	4	8	46409	46416	0 %	0 %	50 %	50 %	86747174
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