MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Frankia sp. CcI3 chromosome

Total Repeats: 1127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007777	CCGGC	2	10	8032	8041	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2	NC_007777	AGTTC	2	10	18498	18507	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_007777	CGTGG	2	10	22172	22181	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_007777	CGGCG	2	10	39953	39962	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5	NC_007777	TCGGC	2	10	49134	49143	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_007777	CCCGG	2	10	49144	49153	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7	NC_007777	CCGTA	2	10	58664	58673	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_007777	CCGGT	2	10	70400	70409	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_007777	ACCGG	2	10	86755	86764	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_007777	GCCGC	2	10	88635	88644	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11	NC_007777	CCCGG	3	15	88670	88684	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
12	NC_007777	TCGTC	2	10	107351	107360	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_007777	CGCGG	2	10	108686	108695	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14	NC_007777	GGGCA	2	10	118179	118188	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
15	NC_007777	GCCTC	2	10	118884	118893	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
16	NC_007777	GCCTC	2	10	118901	118910	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_007777	GCCTC	2	10	118918	118927	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
18	NC_007777	GCCTC	2	10	118935	118944	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_007777	CCGCG	2	10	120146	120155	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
20	NC_007777	CAGGT	2	10	131724	131733	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_007777	GGCCG	2	10	132209	132218	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
22	NC_007777	GACGC	2	10	132238	132247	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_007777	CCGCG	2	10	139194	139203	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
24	NC_007777	GACGG	2	10	151379	151388	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
25	NC_007777	CGGAC	2	10	161573	161582	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_007777	TGCGG	2	10	164937	164946	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_007777	TCCCT	2	10	165403	165412	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
28	NC_007777	GAGAA	2	10	165953	165962	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007777	GTCCG	2	10	170847	170856	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_007777	GTTGA	2	10	171807	171816	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007777	ATCGA	2	10	173693	173702	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_007777	CCGCG	2	10	175752	175761	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
33	NC_007777	GCCCG	2	10	176988	176997	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
34	NC_007777	AGCCG	2	10	177616	177625	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_007777	GTCTG	2	10	177630	177639	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_007777	GTGCA	2	10	180269	180278	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_007777	CGCGA	2	10	184933	184942	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
38	NC_007777	GTCTC	2	10	192092	192101	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_007777	ACTCC	2	10	195943	195952	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
40	NC_007777	GGACG	2	10	200900	200909	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
41	NC_007777	GGTCC	2	10	212473	212482	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_007777	TAGCG	2	10	216364	216373	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_007777	GCCTG	2	10	225370	225379	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_007777	GGTCG	2	10	239735	239744	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
45	NC_007777	GTAGA	2	10	240515	240524	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007777	GTCGT	2	10	242626	242635	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_007777	CCAGG	2	10	244344	244353	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
48	NC_007777	GACAG	2	10	244556	244565	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_007777	ATCCG	2	10	249059	249068	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_007777	CCGGA	2	10	249070	249079	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
51	NC_007777	GCCGG	2	10	256330	256339	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
52	NC_007777	CCGGC	3	15	256549	256563	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
53	NC_007777	GGTCG	2	10	256598	256607	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
54	NC_007777	TTGCG	2	10	256644	256653	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_007777	CCGGT	2	10	261337	261346	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_007777	GAGCA	2	10	267593	267602	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_007777	CGCTG	2	10	268017	268026	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
58	NC_007777	CCGGC	2	10	268511	268520	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
59	NC_007777	CCCGG	2	10	268584	268593	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
60	NC_007777	GCGGT	2	10	278763	278772	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
61	NC_007777	GGTGA	2	10	278786	278795	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007777	CTGAT	2	10	285485	285494	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_007777	CCGAG	2	10	287317	287326	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_007777	CGCGA	2	10	293429	293438	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
65	NC_007777	CGGGA	2	10	301431	301440	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
66	NC_007777	CCTGT	2	10	306481	306490	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_007777	ACCCG	2	10	323670	323679	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
68	NC_007777	CGGGC	2	10	329877	329886	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
69	NC_007777	GGGCT	2	10	331532	331541	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
70	NC_007777	TCGTG	2	10	335962	335971	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_007777	CGGGG	2	10	339544	339553	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
72	NC_007777	CGGAC	2	10	341003	341012	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
73	NC_007777	GGGCG	2	10	343382	343391	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
74	NC_007777	GCGGA	2	10	371046	371055	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
75	NC_007777	GCCCG	2	10	382821	382830	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
76	NC_007777	CGGGC	2	10	395270	395279	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
77	NC_007777	GGGCC	2	10	395294	395303	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
78	NC_007777	CACGT	2	10	404961	404970	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_007777	GAGCG	2	10	411066	411075	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
80	NC_007777	CAGTG	2	10	415741	415750	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_007777	GTCGG	2	10	420472	420481	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
82	NC_007777	ATCCC	2	10	428700	428709	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
83	NC_007777	CGGCT	2	10	434061	434070	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
84	NC_007777	CGGCC	2	10	434093	434102	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
85	NC_007777	CGGCC	2	10	434137	434146	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
86	NC_007777	CGGCC	2	10	434175	434184	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
87	NC_007777	CGGCC	2	10	434197	434206	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
88	NC_007777	CGGCC	2	10	434241	434250	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
89	NC_007777	GCCGC	2	10	443418	443427	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
90	NC_007777	AGTGG	2	10	458263	458272	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007777	GCGCC	2	10	460193	460202	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
92	NC_007777	ACCCG	2	10	466672	466681	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
93	NC_007777	ACCCG	2	10	466732	466741	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
94	NC_007777	GCTGC	2	10	466822	466831	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
95	NC_007777	GCGCG	2	10	471718	471727	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
96	NC_007777	CGACG	2	10	479920	479929	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_007777	CTGGC	2	10	494716	494725	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
98	NC_007777	GCCGA	2	10	501191	501200	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
99	NC_007777	TGCGC	2	10	505899	505908	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
100	NC_007777	GATCC	2	10	508064	508073	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_007777	GCCGT	2	10	508169	508178	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_007777	AGCAG	2	10	521493	521502	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_007777	CATCC	2	10	523748	523757	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
104	NC_007777	GGGCG	2	10	523814	523823	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
105	NC_007777	GGCGC	2	10	523932	523941	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
106	NC_007777	GACGT	2	10	529219	529228	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_007777	CGCGG	2	10	545092	545101	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
108	NC_007777	GGAAG	2	10	558328	558337	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007777	TCCGG	2	10	560780	560789	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
110	NC_007777	GCTCG	2	10	564021	564030	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
111	NC_007777	CCGGG	2	10	564188	564197	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
112	NC_007777	CCGGA	2	10	565110	565119	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
113	NC_007777	TGATG	2	10	572577	572586	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007777	TGAGT	2	10	595240	595249	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007777	GGGCA	2	10	595287	595296	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
116	NC_007777	ATCCG	2	10	600942	600951	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_007777	GTGCC	2	10	610198	610207	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
118	NC_007777	AGGAG	2	10	624977	624986	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007777	CGGGT	2	10	636210	636219	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
120	NC_007777	GATCA	2	10	644305	644314	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_007777	TTCGT	2	10	650610	650619	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_007777	CAGGG	2	10	654497	654506	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
123	NC_007777	CCGGC	2	10	670496	670505	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
124	NC_007777	GCCGG	2	10	670520	670529	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
125	NC_007777	CCGGT	2	10	708178	708187	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
126	NC_007777	GGGGC	2	10	708298	708307	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
127	NC_007777	GGCGA	2	10	711680	711689	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
128	NC_007777	TCCTC	2	10	713111	713120	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
129	NC_007777	CGGCC	2	10	717358	717367	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
130	NC_007777	TCGCG	2	10	720736	720745	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
131	NC_007777	GTGAT	2	10	723589	723598	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007777	CGTGG	2	10	737237	737246	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
133	NC_007777	GGGCG	2	10	737331	737340	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
134	NC_007777	GCCGG	2	10	753474	753483	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
135	NC_007777	ACGGC	2	10	762889	762898	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
136	NC_007777	CGGGC	2	10	762984	762993	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
137	NC_007777	CCGGG	2	10	764656	764665	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
138	NC_007777	TGGAT	2	10	765207	765216	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007777	GGTGG	2	10	767016	767025	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007777	TGGAT	2	10	768704	768713	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007777	CGAGA	2	10	768748	768757	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_007777	CGATC	2	10	772273	772282	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
143	NC_007777	GACGA	2	10	772321	772330	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
144	NC_007777	CCGGC	2	10	772352	772361	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
145	NC_007777	CGGGC	2	10	778187	778196	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
146	NC_007777	CCCGG	2	10	791097	791106	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
147	NC_007777	GCGGT	2	10	793215	793224	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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281	NC_007777	CCTGG	2	10	1464387	1464396	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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284	NC_007777	CTGGT	2	10	1484553	1484562	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
285	NC_007777	TCCAC	2	10	1491643	1491652	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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423	NC_007777	CCCGG	2	10	2260445	2260454	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
424	NC_007777	GGAAC	2	10	2268829	2268838	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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