MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Frankia sp. CcI3 chromosome

Total Repeats: 4906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007777	ACACC	2	10	405	414	40 %	0 %	0 %	60 %	86738725
2	NC_007777	GACCG	2	10	2604	2613	20 %	0 %	40 %	40 %	86738726
3	NC_007777	CGCCC	2	10	5333	5342	0 %	0 %	20 %	80 %	86738728
4	NC_007777	TACCG	2	10	8878	8887	20 %	20 %	20 %	40 %	86738730
5	NC_007777	CGGTC	2	10	11231	11240	0 %	20 %	40 %	40 %	86738731
6	NC_007777	CGGCC	2	10	11656	11665	0 %	0 %	40 %	60 %	86738731
7	NC_007777	CGCCC	2	10	11885	11894	0 %	0 %	20 %	80 %	86738732
8	NC_007777	CCGGT	2	10	12094	12103	0 %	20 %	40 %	40 %	86738732
9	NC_007777	CGTTC	2	10	14011	14020	0 %	40 %	20 %	40 %	86738733
10	NC_007777	CTGCG	2	10	15752	15761	0 %	20 %	40 %	40 %	86738735
11	NC_007777	CAGCG	2	10	17592	17601	20 %	0 %	40 %	40 %	86738737
12	NC_007777	GTGGC	2	10	18885	18894	0 %	20 %	60 %	20 %	86738738
13	NC_007777	GGCCG	2	10	18947	18956	0 %	0 %	60 %	40 %	86738738
14	NC_007777	CGACC	2	10	19317	19326	20 %	0 %	20 %	60 %	86738738
15	NC_007777	CGGCC	2	10	20860	20869	0 %	0 %	40 %	60 %	86738739
16	NC_007777	CGGCC	2	10	21352	21361	0 %	0 %	40 %	60 %	86738739
17	NC_007777	CCCCG	2	10	22108	22117	0 %	0 %	20 %	80 %	86738739
18	NC_007777	CCCCG	2	10	22123	22132	0 %	0 %	20 %	80 %	86738739
19	NC_007777	TGGGA	2	10	22448	22457	20 %	20 %	60 %	0 %	86738740
20	NC_007777	CCGGC	2	10	24537	24546	0 %	0 %	40 %	60 %	86738740
21	NC_007777	GACGA	2	10	26054	26063	40 %	0 %	40 %	20 %	86738741
22	NC_007777	GCCGG	2	10	26653	26662	0 %	0 %	60 %	40 %	86738741
23	NC_007777	TGGTC	2	10	27792	27801	0 %	40 %	40 %	20 %	86738742
24	NC_007777	CACCG	2	10	28876	28885	20 %	0 %	20 %	60 %	86738743
25	NC_007777	CCCGC	2	10	29219	29228	0 %	0 %	20 %	80 %	86738744
26	NC_007777	ACCGA	2	10	29307	29316	40 %	0 %	20 %	40 %	86738744
27	NC_007777	CACCG	2	10	30484	30493	20 %	0 %	20 %	60 %	86738745
28	NC_007777	GCCCA	2	10	32376	32385	20 %	0 %	20 %	60 %	86738748
29	NC_007777	GGCCC	2	10	33533	33542	0 %	0 %	40 %	60 %	86738750
30	NC_007777	CTTCC	2	10	33585	33594	0 %	40 %	0 %	60 %	86738750
31	NC_007777	CCTGG	2	10	35445	35454	0 %	20 %	40 %	40 %	86738752
32	NC_007777	GCCCT	2	10	36580	36589	0 %	20 %	20 %	60 %	86738753
33	NC_007777	CGATG	2	10	39210	39219	20 %	20 %	40 %	20 %	86738755
34	NC_007777	CGCGG	2	10	39684	39693	0 %	0 %	60 %	40 %	86738756
35	NC_007777	GCCGC	2	10	39771	39780	0 %	0 %	40 %	60 %	86738756
36	NC_007777	GGCCG	2	10	40054	40063	0 %	0 %	60 %	40 %	86738757
37	NC_007777	GCCGA	2	10	44599	44608	20 %	0 %	40 %	40 %	86738759
38	NC_007777	TGTTA	2	10	45242	45251	20 %	60 %	20 %	0 %	86738760
39	NC_007777	TCCGG	2	10	46343	46352	0 %	20 %	40 %	40 %	86738762
40	NC_007777	CGGCG	2	10	46745	46754	0 %	0 %	60 %	40 %	86738762
41	NC_007777	GCCCG	3	15	48323	48337	0 %	0 %	40 %	60 %	86738762
42	NC_007777	CCCGC	2	10	48493	48502	0 %	0 %	20 %	80 %	86738762
43	NC_007777	GGGAG	2	10	48646	48655	20 %	0 %	80 %	0 %	86738762
44	NC_007777	GCCCC	2	10	49535	49544	0 %	0 %	20 %	80 %	86738763
45	NC_007777	CCCGG	2	10	49791	49800	0 %	0 %	40 %	60 %	86738763
46	NC_007777	GCCAC	2	10	51262	51271	20 %	0 %	20 %	60 %	86738765
47	NC_007777	GCGAA	2	10	51728	51737	40 %	0 %	40 %	20 %	86738766
48	NC_007777	TCGGT	2	10	52122	52131	0 %	40 %	40 %	20 %	86738766
49	NC_007777	GGGCT	2	10	52386	52395	0 %	20 %	60 %	20 %	86738766
50	NC_007777	GGCCG	2	10	53734	53743	0 %	0 %	60 %	40 %	86738767
51	NC_007777	GGCCG	2	10	53902	53911	0 %	0 %	60 %	40 %	86738767
52	NC_007777	GGCCG	2	10	54070	54079	0 %	0 %	60 %	40 %	86738767
53	NC_007777	GGCTG	2	10	54133	54142	0 %	20 %	60 %	20 %	86738767
54	NC_007777	GGCCG	2	10	54238	54247	0 %	0 %	60 %	40 %	86738767
55	NC_007777	CGTGC	2	10	54434	54443	0 %	20 %	40 %	40 %	86738767
56	NC_007777	CTCCG	2	10	55399	55408	0 %	20 %	20 %	60 %	86738767
57	NC_007777	TCGTC	2	10	56800	56809	0 %	40 %	20 %	40 %	86738768
58	NC_007777	GACCG	2	10	57299	57308	20 %	0 %	40 %	40 %	86738768
59	NC_007777	CGGGG	2	10	58059	58068	0 %	0 %	80 %	20 %	86738769
60	NC_007777	GCGCC	2	10	60157	60166	0 %	0 %	40 %	60 %	86738771
61	NC_007777	TCGGC	2	10	61324	61333	0 %	20 %	40 %	40 %	86738771
62	NC_007777	GGCAC	2	10	62461	62470	20 %	0 %	40 %	40 %	86738771
63	NC_007777	TTCCC	2	10	62840	62849	0 %	40 %	0 %	60 %	86738772
64	NC_007777	CCGGC	2	10	64229	64238	0 %	0 %	40 %	60 %	86738774
65	NC_007777	CGGTC	2	10	65270	65279	0 %	20 %	40 %	40 %	86738775
66	NC_007777	GGCCG	2	10	66027	66036	0 %	0 %	60 %	40 %	86738775
67	NC_007777	GCGCC	2	10	66811	66820	0 %	0 %	40 %	60 %	86738775
68	NC_007777	GGCCG	2	10	68457	68466	0 %	0 %	60 %	40 %	86738776
69	NC_007777	GCCCG	2	10	69763	69772	0 %	0 %	40 %	60 %	86738776
70	NC_007777	CGTCG	2	10	71490	71499	0 %	20 %	40 %	40 %	86738779
71	NC_007777	ACCGG	2	10	71815	71824	20 %	0 %	40 %	40 %	86738779
72	NC_007777	GACCG	2	10	71832	71841	20 %	0 %	40 %	40 %	86738779
73	NC_007777	GACCG	2	10	71850	71859	20 %	0 %	40 %	40 %	86738779
74	NC_007777	GACCG	2	10	71868	71877	20 %	0 %	40 %	40 %	86738779
75	NC_007777	GACCG	2	10	71886	71895	20 %	0 %	40 %	40 %	86738779
76	NC_007777	GACCG	2	10	71904	71913	20 %	0 %	40 %	40 %	86738779
77	NC_007777	GACCG	2	10	71922	71931	20 %	0 %	40 %	40 %	86738779
78	NC_007777	GACCG	2	10	71940	71949	20 %	0 %	40 %	40 %	86738779
79	NC_007777	GACCG	2	10	71958	71967	20 %	0 %	40 %	40 %	86738779
80	NC_007777	GACCG	2	10	71976	71985	20 %	0 %	40 %	40 %	86738779
81	NC_007777	GACCG	2	10	71994	72003	20 %	0 %	40 %	40 %	86738779
82	NC_007777	CCCGT	2	10	72127	72136	0 %	20 %	20 %	60 %	86738779
83	NC_007777	CCCGT	2	10	72142	72151	0 %	20 %	20 %	60 %	86738779
84	NC_007777	GGATC	2	10	73676	73685	20 %	20 %	40 %	20 %	86738781
85	NC_007777	CCGGC	2	10	74877	74886	0 %	0 %	40 %	60 %	86738782
86	NC_007777	TCCGG	2	10	77311	77320	0 %	20 %	40 %	40 %	86738784
87	NC_007777	CCCGG	2	10	80925	80934	0 %	0 %	40 %	60 %	86738787
88	NC_007777	CCGGC	2	10	82616	82625	0 %	0 %	40 %	60 %	86738788
89	NC_007777	TCACA	2	10	83602	83611	40 %	20 %	0 %	40 %	86738790
90	NC_007777	GGGTG	2	10	85217	85226	0 %	20 %	80 %	0 %	86738791
91	NC_007777	GACCG	2	10	86917	86926	20 %	0 %	40 %	40 %	86738792
92	NC_007777	ACCGT	2	10	87424	87433	20 %	20 %	20 %	40 %	86738792
93	NC_007777	CGGCC	2	10	88227	88236	0 %	0 %	40 %	60 %	86738792
94	NC_007777	TCGGG	2	10	90223	90232	0 %	20 %	60 %	20 %	86738794
95	NC_007777	GCCCA	2	10	90376	90385	20 %	0 %	20 %	60 %	86738794
96	NC_007777	TCCGG	2	10	90686	90695	0 %	20 %	40 %	40 %	86738794
97	NC_007777	GGGCC	2	10	90931	90940	0 %	0 %	60 %	40 %	86738795
98	NC_007777	CCGCC	2	10	91460	91469	0 %	0 %	20 %	80 %	86738795
99	NC_007777	GATCC	2	10	93637	93646	20 %	20 %	20 %	40 %	86738797
100	NC_007777	AGCGG	2	10	95560	95569	20 %	0 %	60 %	20 %	86738800
101	NC_007777	CCTGA	2	10	96789	96798	20 %	20 %	20 %	40 %	86738801
102	NC_007777	GTCCG	2	10	99580	99589	0 %	20 %	40 %	40 %	86738804
103	NC_007777	GTCCG	2	10	100540	100549	0 %	20 %	40 %	40 %	86738805
104	NC_007777	CAGCG	2	10	101297	101306	20 %	0 %	40 %	40 %	86738806
105	NC_007777	CGGGG	3	15	104393	104407	0 %	0 %	80 %	20 %	86738808
106	NC_007777	GGTCG	2	10	104910	104919	0 %	20 %	60 %	20 %	86738808
107	NC_007777	CCACG	2	10	105096	105105	20 %	0 %	20 %	60 %	86738808
108	NC_007777	CCGGC	2	10	106855	106864	0 %	0 %	40 %	60 %	86738810
109	NC_007777	CCAGG	2	10	107012	107021	20 %	0 %	40 %	40 %	86738810
110	NC_007777	CACGT	2	10	107543	107552	20 %	20 %	20 %	40 %	86738811
111	NC_007777	GAGCA	2	10	108239	108248	40 %	0 %	40 %	20 %	86738812
112	NC_007777	GCGGT	2	10	108356	108365	0 %	20 %	60 %	20 %	86738812
113	NC_007777	GGCCG	2	10	109395	109404	0 %	0 %	60 %	40 %	86738813
114	NC_007777	GCCGG	2	10	109470	109479	0 %	0 %	60 %	40 %	86738813
115	NC_007777	GTGCG	2	10	109543	109552	0 %	20 %	60 %	20 %	86738813
116	NC_007777	GTTCC	2	10	110060	110069	0 %	40 %	20 %	40 %	86738813
117	NC_007777	GCCAG	2	10	110670	110679	20 %	0 %	40 %	40 %	86738815
118	NC_007777	CGGTC	2	10	111546	111555	0 %	20 %	40 %	40 %	86738815
119	NC_007777	CCGGG	2	10	113911	113920	0 %	0 %	60 %	40 %	86738815
120	NC_007777	ACCGC	2	10	115730	115739	20 %	0 %	20 %	60 %	86738817
121	NC_007777	GCCCG	2	10	116161	116170	0 %	0 %	40 %	60 %	86738817
122	NC_007777	CGTCC	2	10	117686	117695	0 %	20 %	20 %	60 %	86738818
123	NC_007777	GCCGG	2	10	120420	120429	0 %	0 %	60 %	40 %	86738821
124	NC_007777	CGGGC	2	10	120834	120843	0 %	0 %	60 %	40 %	86738821
125	NC_007777	GCCGG	2	10	122624	122633	0 %	0 %	60 %	40 %	86738823
126	NC_007777	CGCGC	2	10	122712	122721	0 %	0 %	40 %	60 %	86738823
127	NC_007777	GGCTC	2	10	125512	125521	0 %	20 %	40 %	40 %	86738826
128	NC_007777	GCGAG	2	10	126334	126343	20 %	0 %	60 %	20 %	86738827
129	NC_007777	ACCCT	2	10	126912	126921	20 %	20 %	0 %	60 %	86738828
130	NC_007777	GGTCG	2	10	128637	128646	0 %	20 %	60 %	20 %	86738830
131	NC_007777	GGGCG	2	10	129005	129014	0 %	0 %	80 %	20 %	86738830
132	NC_007777	GCCGC	2	10	129155	129164	0 %	0 %	40 %	60 %	86738830
133	NC_007777	CCGGC	2	10	131995	132004	0 %	0 %	40 %	60 %	86738832
134	NC_007777	CTGGC	2	10	132171	132180	0 %	20 %	40 %	40 %	86738832
135	NC_007777	CCGGG	2	10	132966	132975	0 %	0 %	60 %	40 %	86738833
136	NC_007777	CGTGG	2	10	134164	134173	0 %	20 %	60 %	20 %	86738833
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