MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Frankia sp. CcI3 chromosome

Total Repeats: 95376

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007777	CAG	2	6	161	166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738725
2	NC_007777	CTG	2	6	218	223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738725
3	NC_007777	CTT	2	6	274	279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86738725
4	NC_007777	GCC	2	6	482	487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86738725
5	NC_007777	GCC	2	6	499	504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86738725
6	NC_007777	TCG	2	6	518	523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738725
7	NC_007777	GCC	2	6	559	564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86738725
8	NC_007777	CGG	2	6	570	575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86738725
9	NC_007777	ACC	2	6	622	627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86738725
10	NC_007777	GCG	2	6	659	664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86738725
11	NC_007777	GAG	2	6	911	916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86738725
12	NC_007777	TCA	2	6	930	935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86738725
13	NC_007777	GAC	2	6	947	952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738725
14	NC_007777	CAG	2	6	956	961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738725
15	NC_007777	GCG	2	6	970	975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86738725
16	NC_007777	GAC	2	6	1004	1009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738725
17	NC_007777	AGG	2	6	1041	1046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86738725
18	NC_007777	TTC	2	6	1049	1054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86738725
19	NC_007777	ACG	2	6	1074	1079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738725
20	NC_007777	GGA	2	6	1135	1140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86738725
21	NC_007777	TGA	2	6	1170	1175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86738725
22	NC_007777	GAA	2	6	1222	1227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86738725
23	NC_007777	GGC	2	6	1228	1233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86738725
24	NC_007777	TGC	2	6	1386	1391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738725
25	NC_007777	GCC	3	9	1430	1438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86738725
26	NC_007777	CGG	2	6	1452	1457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86738725
27	NC_007777	GGA	2	6	1477	1482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86738725
28	NC_007777	ACG	2	6	1607	1612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738725
29	NC_007777	ACC	2	6	2563	2568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86738726
30	NC_007777	CTC	2	6	2593	2598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86738726
31	NC_007777	CGC	2	6	2625	2630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86738726
32	NC_007777	GCC	2	6	2647	2652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86738726
33	NC_007777	GGA	2	6	2679	2684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86738726
34	NC_007777	TGC	2	6	2816	2821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738726
35	NC_007777	GAC	2	6	2827	2832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738726
36	NC_007777	CGC	2	6	2889	2894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86738726
37	NC_007777	GAC	2	6	2929	2934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738726
38	NC_007777	CGC	2	6	2991	2996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86738726
39	NC_007777	GGC	2	6	3035	3040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86738726
40	NC_007777	GCC	2	6	3052	3057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86738726
41	NC_007777	GAC	3	9	3249	3257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738726
42	NC_007777	AGG	2	6	3347	3352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86738726
43	NC_007777	CGC	2	6	3375	3380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86738726
44	NC_007777	ACC	2	6	3416	3421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86738726
45	NC_007777	ACG	2	6	3482	3487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738726
46	NC_007777	CGT	2	6	3515	3520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738726
47	NC_007777	CGT	2	6	3555	3560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738726
48	NC_007777	GGA	2	6	3582	3587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86738726
49	NC_007777	CGG	2	6	3590	3595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86738726
50	NC_007777	GGC	2	6	3597	3602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86738726
51	NC_007777	CGA	3	9	3633	3641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738726
52	NC_007777	CTG	2	6	3667	3672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738726
53	NC_007777	TCG	2	6	3720	3725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738727
54	NC_007777	TGG	2	6	3942	3947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86738727
55	NC_007777	TCG	2	6	4020	4025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738727
56	NC_007777	CTG	2	6	4028	4033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738727
57	NC_007777	GGA	2	6	4054	4059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86738727
58	NC_007777	CGT	2	6	4091	4096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738727
59	NC_007777	CGA	2	6	4105	4110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738727
60	NC_007777	GCT	2	6	4111	4116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738727
61	NC_007777	AAC	2	6	4173	4178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86738727
62	NC_007777	CCG	2	6	4197	4202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86738727
63	NC_007777	TCG	2	6	4308	4313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738727
64	NC_007777	AGC	2	6	4455	4460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738727
65	NC_007777	CGG	2	6	4482	4487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86738727
66	NC_007777	GCC	2	6	4535	4540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86738727
67	NC_007777	CGA	2	6	4588	4593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738727
68	NC_007777	CTG	2	6	4691	4696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738727
69	NC_007777	GAC	2	6	4730	4735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738727
70	NC_007777	CGC	3	9	4757	4765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86738727
71	NC_007777	TCG	2	6	4782	4787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738727
72	NC_007777	GGA	2	6	4871	4876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86738727
73	NC_007777	CGG	2	6	5186	5191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86738728
74	NC_007777	GGC	2	6	5235	5240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86738728
75	NC_007777	CGG	2	6	5277	5282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86738728
76	NC_007777	GAC	2	6	5295	5300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738728
77	NC_007777	CCG	2	6	5309	5314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86738728
78	NC_007777	GCT	2	6	5390	5395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738728
79	NC_007777	GGC	2	6	5396	5401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86738728
80	NC_007777	TCG	2	6	5458	5463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738728
81	NC_007777	CTC	2	6	5574	5579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86738728
82	NC_007777	CCG	2	6	5615	5620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86738728
83	NC_007777	TCG	2	6	5623	5628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738728
84	NC_007777	GGC	2	6	5653	5658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86738728
85	NC_007777	CGG	2	6	5675	5680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86738728
86	NC_007777	TGG	2	6	5983	5988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86738729
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88	NC_007777	CAT	2	6	6120	6125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86738729
89	NC_007777	GCT	2	6	6197	6202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738729
90	NC_007777	CGG	2	6	6209	6214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86738729
91	NC_007777	CCG	2	6	6277	6282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86738729
92	NC_007777	ACC	2	6	6297	6302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86738729
93	NC_007777	CGG	2	6	6311	6316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86738729
94	NC_007777	CGG	2	6	6347	6352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86738729
95	NC_007777	ACC	2	6	6486	6491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86738729
96	NC_007777	CGA	2	6	6529	6534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738729
97	NC_007777	ACC	2	6	6543	6548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86738729
98	NC_007777	CGC	2	6	6573	6578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86738729
99	NC_007777	TCG	2	6	6622	6627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738729
100	NC_007777	TCG	2	6	6688	6693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738729
101	NC_007777	CGG	2	6	6791	6796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86738729
102	NC_007777	GGC	2	6	6846	6851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86738729
103	NC_007777	GAG	2	6	6858	6863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86738729
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110	NC_007777	TCG	2	6	7300	7305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738729
111	NC_007777	CGG	2	6	7315	7320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86738729
112	NC_007777	GGT	2	6	7335	7340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86738729
113	NC_007777	TCC	2	6	7363	7368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86738729
114	NC_007777	GAA	2	6	7421	7426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86738729
115	NC_007777	ACG	2	6	7471	7476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738729
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121	NC_007777	CTG	2	6	7824	7829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738729
122	NC_007777	CGA	2	6	7841	7846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738729
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126	NC_007777	CCT	2	6	8170	8175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86738730
127	NC_007777	TCG	2	6	8255	8260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738730
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129	NC_007777	ACG	2	6	8327	8332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738730
130	NC_007777	ACC	2	6	8399	8404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86738730
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132	NC_007777	CGG	2	6	8682	8687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86738730
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