MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Synechococcus sp. JA-3-3Ab chromosome

Total Repeats: 6976

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007775	GCTG	2	8	228	235	0 %	25 %	50 %	25 %	86604734
2	NC_007775	GGGC	2	8	539	546	0 %	0 %	75 %	25 %	86604734
3	NC_007775	CAAA	2	8	838	845	75 %	0 %	0 %	25 %	86604734
4	NC_007775	GGCC	2	8	1679	1686	0 %	0 %	50 %	50 %	86604735
5	NC_007775	GCTG	2	8	1805	1812	0 %	25 %	50 %	25 %	86604735
6	NC_007775	CTGC	2	8	2342	2349	0 %	25 %	25 %	50 %	86604736
7	NC_007775	CGCT	2	8	2845	2852	0 %	25 %	25 %	50 %	86604736
8	NC_007775	AATC	2	8	3228	3235	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_007775	GCTT	2	8	3876	3883	0 %	50 %	25 %	25 %	86604737
10	NC_007775	TGGT	2	8	3950	3957	0 %	50 %	50 %	0 %	86604737
11	NC_007775	GGTT	2	8	4203	4210	0 %	50 %	50 %	0 %	86604737
12	NC_007775	CCAT	2	8	4247	4254	25 %	25 %	0 %	50 %	86604737
13	NC_007775	GGCC	2	8	5708	5715	0 %	0 %	50 %	50 %	86604738
14	NC_007775	GATG	2	8	6267	6274	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007775	CTCG	2	8	6380	6387	0 %	25 %	25 %	50 %	86604740
16	NC_007775	CCCG	2	8	7512	7519	0 %	0 %	25 %	75 %	86604741
17	NC_007775	GGGC	2	8	8772	8779	0 %	0 %	75 %	25 %	86604741
18	NC_007775	GCCC	2	8	9464	9471	0 %	0 %	25 %	75 %	86604741
19	NC_007775	GCCA	2	8	10112	10119	25 %	0 %	25 %	50 %	86604742
20	NC_007775	GCTT	2	8	11238	11245	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_007775	TTCG	2	8	11781	11788	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_007775	GCTC	2	8	11845	11852	0 %	25 %	25 %	50 %	86604744
23	NC_007775	TTGC	2	8	12302	12309	0 %	50 %	25 %	25 %	86604744
24	NC_007775	ATGG	2	8	12653	12660	25 %	25 %	50 %	0 %	86604744
25	NC_007775	TGAT	2	8	12996	13003	25 %	50 %	25 %	0 %	86604744
26	NC_007775	CAGC	2	8	14232	14239	25 %	0 %	25 %	50 %	86604746
27	NC_007775	AGCG	2	8	14410	14417	25 %	0 %	50 %	25 %	86604746
28	NC_007775	GGGA	2	8	14701	14708	25 %	0 %	75 %	0 %	86604746
29	NC_007775	GTTG	2	8	15063	15070	0 %	50 %	50 %	0 %	86604747
30	NC_007775	CCAG	2	8	15195	15202	25 %	0 %	25 %	50 %	86604747
31	NC_007775	CAGC	2	8	15310	15317	25 %	0 %	25 %	50 %	86604747
32	NC_007775	TTTC	2	8	15478	15485	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_007775	CGGG	2	8	15521	15528	0 %	0 %	75 %	25 %	86604748
34	NC_007775	GGTA	2	8	15616	15623	25 %	25 %	50 %	0 %	86604748
35	NC_007775	GCCG	2	8	15828	15835	0 %	0 %	50 %	50 %	86604748
36	NC_007775	ACCA	2	8	15958	15965	50 %	0 %	0 %	50 %	86604748
37	NC_007775	GTAA	2	8	16107	16114	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007775	TGAA	2	8	16865	16872	50 %	25 %	25 %	0 %	86604749
39	NC_007775	CTTG	2	8	17465	17472	0 %	50 %	25 %	25 %	86604750
40	NC_007775	GCTC	2	8	17857	17864	0 %	25 %	25 %	50 %	86604751
41	NC_007775	TCCC	2	8	18212	18219	0 %	25 %	0 %	75 %	86604751
42	NC_007775	TGCC	2	8	19356	19363	0 %	25 %	25 %	50 %	86604752
43	NC_007775	CCAG	2	8	19732	19739	25 %	0 %	25 %	50 %	86604753
44	NC_007775	CAGC	2	8	19753	19760	25 %	0 %	25 %	50 %	86604753
45	NC_007775	GAGC	2	8	20100	20107	25 %	0 %	50 %	25 %	86604753
46	NC_007775	TCAA	2	8	20373	20380	50 %	25 %	0 %	25 %	86604754
47	NC_007775	CTGC	2	8	21275	21282	0 %	25 %	25 %	50 %	86604755
48	NC_007775	CAGG	2	8	21407	21414	25 %	0 %	50 %	25 %	86604755
49	NC_007775	GTTT	2	8	21567	21574	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007775	GTTG	2	8	21663	21670	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007775	AGTG	2	8	21671	21678	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007775	TCCT	2	8	22114	22121	0 %	50 %	0 %	50 %	86604757
53	NC_007775	CCCG	2	8	23889	23896	0 %	0 %	25 %	75 %	86604758
54	NC_007775	CGGT	2	8	24232	24239	0 %	25 %	50 %	25 %	86604758
55	NC_007775	GGCC	2	8	24466	24473	0 %	0 %	50 %	50 %	86604758
56	NC_007775	CCCG	2	8	24600	24607	0 %	0 %	25 %	75 %	86604758
57	NC_007775	AAGG	2	8	25416	25423	50 %	0 %	50 %	0 %	86604759
58	NC_007775	CCGC	2	8	25429	25436	0 %	0 %	25 %	75 %	86604759
59	NC_007775	GCCA	2	8	26007	26014	25 %	0 %	25 %	50 %	86604759
60	NC_007775	CAGC	2	8	26132	26139	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_007775	CCAC	2	8	26297	26304	25 %	0 %	0 %	75 %	86604760
62	NC_007775	GGCA	2	8	26499	26506	25 %	0 %	50 %	25 %	86604760
63	NC_007775	GCCT	2	8	27338	27345	0 %	25 %	25 %	50 %	86604762
64	NC_007775	TCCA	2	8	27886	27893	25 %	25 %	0 %	50 %	86604762
65	NC_007775	CTGG	2	8	27939	27946	0 %	25 %	50 %	25 %	86604762
66	NC_007775	AGCC	2	8	29256	29263	25 %	0 %	25 %	50 %	86604762
67	NC_007775	GAGT	2	8	30397	30404	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007775	CTGG	2	8	30541	30548	0 %	25 %	50 %	25 %	86604764
69	NC_007775	TGTT	2	8	30774	30781	0 %	75 %	25 %	0 %	86604764
70	NC_007775	GGGT	2	8	30883	30890	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007775	ACCT	2	8	31062	31069	25 %	25 %	0 %	50 %	86604765
72	NC_007775	ACGG	2	8	31275	31282	25 %	0 %	50 %	25 %	86604765
73	NC_007775	GGCG	2	8	31985	31992	0 %	0 %	75 %	25 %	86604765
74	NC_007775	GCTG	2	8	32131	32138	0 %	25 %	50 %	25 %	86604765
75	NC_007775	TGGC	2	8	33024	33031	0 %	25 %	50 %	25 %	86604766
76	NC_007775	CCCA	2	8	33137	33144	25 %	0 %	0 %	75 %	86604766
77	NC_007775	GTTA	2	8	33260	33267	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007775	ACTA	2	8	33320	33327	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_007775	AAGC	2	8	33489	33496	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_007775	GAAT	2	8	33554	33561	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007775	CCAG	2	8	33571	33578	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_007775	GGGC	2	8	33817	33824	0 %	0 %	75 %	25 %	86604767
83	NC_007775	CTAG	2	8	34261	34268	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_007775	TCCC	2	8	34277	34284	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
85	NC_007775	AGGA	2	8	34540	34547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007775	CAGG	2	8	34605	34612	25 %	0 %	50 %	25 %	86604769
87	NC_007775	GGGA	2	8	35022	35029	25 %	0 %	75 %	0 %	86604770
88	NC_007775	AGGA	2	8	35228	35235	50 %	0 %	50 %	0 %	86604770
89	NC_007775	CCTG	2	8	35302	35309	0 %	25 %	25 %	50 %	86604770
90	NC_007775	ATCC	2	8	35436	35443	25 %	25 %	0 %	50 %	86604770
91	NC_007775	CAGG	2	8	36059	36066	25 %	0 %	50 %	25 %	86604771
92	NC_007775	GGGT	2	8	36233	36240	0 %	25 %	75 %	0 %	86604771
93	NC_007775	GCCA	2	8	36489	36496	25 %	0 %	25 %	50 %	86604771
94	NC_007775	AGGC	2	8	36856	36863	25 %	0 %	50 %	25 %	86604771
95	NC_007775	CTAC	2	8	37848	37855	25 %	25 %	0 %	50 %	86604772
96	NC_007775	CTTT	2	8	38480	38487	0 %	75 %	0 %	25 %	86604772
97	NC_007775	GGGC	2	8	39334	39341	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
98	NC_007775	TGGG	2	8	39349	39356	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007775	TGGC	2	8	39600	39607	0 %	25 %	50 %	25 %	86604774
100	NC_007775	ACCT	2	8	39647	39654	25 %	25 %	0 %	50 %	86604774
101	NC_007775	CTTG	2	8	40017	40024	0 %	50 %	25 %	25 %	86604774
102	NC_007775	CCCG	2	8	40579	40586	0 %	0 %	25 %	75 %	86604774
103	NC_007775	GGCC	2	8	40825	40832	0 %	0 %	50 %	50 %	86604774
104	NC_007775	GGCA	2	8	41161	41168	25 %	0 %	50 %	25 %	86604774
105	NC_007775	TTCC	2	8	42055	42062	0 %	50 %	0 %	50 %	86604775
106	NC_007775	CGCC	2	8	42287	42294	0 %	0 %	25 %	75 %	86604775
107	NC_007775	GGCC	2	8	42377	42384	0 %	0 %	50 %	50 %	86604775
108	NC_007775	GTGG	2	8	42494	42501	0 %	25 %	75 %	0 %	86604775
109	NC_007775	CCCA	2	8	42573	42580	25 %	0 %	0 %	75 %	86604775
110	NC_007775	CACC	2	8	42692	42699	25 %	0 %	0 %	75 %	86604775
111	NC_007775	CCCA	2	8	42915	42922	25 %	0 %	0 %	75 %	86604775
112	NC_007775	TCCC	2	8	44801	44808	0 %	25 %	0 %	75 %	86604778
113	NC_007775	GCGG	2	8	45092	45099	0 %	0 %	75 %	25 %	86604778
114	NC_007775	CCGC	2	8	45422	45429	0 %	0 %	25 %	75 %	86604778
115	NC_007775	GCAC	2	8	46386	46393	25 %	0 %	25 %	50 %	86604779
116	NC_007775	CGTC	2	8	46507	46514	0 %	25 %	25 %	50 %	86604779
117	NC_007775	AGCC	2	8	47250	47257	25 %	0 %	25 %	50 %	86604780
118	NC_007775	GCCT	2	8	47291	47298	0 %	25 %	25 %	50 %	86604780
119	NC_007775	CCCT	2	8	47347	47354	0 %	25 %	0 %	75 %	86604780
120	NC_007775	CGTG	2	8	47466	47473	0 %	25 %	50 %	25 %	86604780
121	NC_007775	TCCT	2	8	48139	48146	0 %	50 %	0 %	50 %	86604781
122	NC_007775	GCTC	2	8	48225	48232	0 %	25 %	25 %	50 %	86604781
123	NC_007775	AAGC	2	8	48806	48813	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_007775	TGGC	2	8	48825	48832	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_007775	TGGC	2	8	49040	49047	0 %	25 %	50 %	25 %	86604782
126	NC_007775	CCAG	2	8	49996	50003	25 %	0 %	25 %	50 %	86604783
127	NC_007775	GCCC	2	8	50282	50289	0 %	0 %	25 %	75 %	86604783
128	NC_007775	TCAG	2	8	50427	50434	25 %	25 %	25 %	25 %	86604783
129	NC_007775	CAAC	2	8	50687	50694	50 %	0 %	0 %	50 %	86604783
130	NC_007775	CAGC	2	8	51374	51381	25 %	0 %	25 %	50 %	86604784
131	NC_007775	CAGG	2	8	51879	51886	25 %	0 %	50 %	25 %	86604786
132	NC_007775	TTCC	2	8	52173	52180	0 %	50 %	0 %	50 %	86604786
133	NC_007775	CCTG	2	8	52592	52599	0 %	25 %	25 %	50 %	86604786
134	NC_007775	TTGA	2	8	53886	53893	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007775	GCAG	2	8	53913	53920	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_007775	AAGA	2	8	53949	53956	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007775	GCCA	2	8	54030	54037	25 %	0 %	25 %	50 %	86604788
138	NC_007775	ATGT	2	8	54177	54184	25 %	50 %	25 %	0 %	86604788
139	NC_007775	GTCG	2	8	55332	55339	0 %	25 %	50 %	25 %	86604788
140	NC_007775	ATCG	2	8	55953	55960	25 %	25 %	25 %	25 %	86604788
141	NC_007775	TTTG	2	8	56474	56481	0 %	75 %	25 %	0 %	86604788
142	NC_007775	AGCC	2	8	56741	56748	25 %	0 %	25 %	50 %	86604788
143	NC_007775	ATTG	2	8	57167	57174	25 %	50 %	25 %	0 %	86604788
144	NC_007775	TTGC	2	8	57273	57280	0 %	50 %	25 %	25 %	86604788
145	NC_007775	CCGC	2	8	57433	57440	0 %	0 %	25 %	75 %	86604788
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