MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42f

Total Repeats: 1684

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007766	GTTC	2	8	40	47	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_007766	CCGG	2	8	367	374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_007766	CGGC	2	8	596	603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_007766	TCAA	2	8	614	621	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007766	GCCG	2	8	688	695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_007766	GTCG	2	8	1482	1489	0 %	25 %	50 %	25 %	86360735
7	NC_007766	CGGG	2	8	2767	2774	0 %	0 %	75 %	25 %	86360737
8	NC_007766	CAGA	2	8	3529	3536	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_007766	CCGG	2	8	4564	4571	0 %	0 %	50 %	50 %	86360738
10	NC_007766	GGCG	2	8	4583	4590	0 %	0 %	75 %	25 %	86360738
11	NC_007766	TCGC	2	8	5134	5141	0 %	25 %	25 %	50 %	86360738
12	NC_007766	CATT	2	8	5263	5270	25 %	50 %	0 %	25 %	86360738
13	NC_007766	ACGA	2	8	5479	5486	50 %	0 %	25 %	25 %	86360738
14	NC_007766	AAGG	2	8	5539	5546	50 %	0 %	50 %	0 %	86360738
15	NC_007766	CGAC	2	8	6006	6013	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_007766	CGGC	2	8	6195	6202	0 %	0 %	50 %	50 %	86360739
17	NC_007766	GGTC	2	8	6285	6292	0 %	25 %	50 %	25 %	86360739
18	NC_007766	GGCG	2	8	6663	6670	0 %	0 %	75 %	25 %	86360739
19	NC_007766	CGGC	2	8	7506	7513	0 %	0 %	50 %	50 %	86360740
20	NC_007766	CTCG	2	8	8592	8599	0 %	25 %	25 %	50 %	86360742
21	NC_007766	AGAA	2	8	9261	9268	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007766	CCCG	2	8	9750	9757	0 %	0 %	25 %	75 %	86360743
23	NC_007766	GACG	2	8	10558	10565	25 %	0 %	50 %	25 %	86360744
24	NC_007766	GCCG	2	8	11047	11054	0 %	0 %	50 %	50 %	86360745
25	NC_007766	CGGC	2	8	11623	11630	0 %	0 %	50 %	50 %	86360745
26	NC_007766	CCCA	2	8	12876	12883	25 %	0 %	0 %	75 %	86360747
27	NC_007766	GGGC	2	8	12907	12914	0 %	0 %	75 %	25 %	86360747
28	NC_007766	CGAT	2	8	13087	13094	25 %	25 %	25 %	25 %	86360747
29	NC_007766	TCGG	2	8	13312	13319	0 %	25 %	50 %	25 %	86360747
30	NC_007766	GACG	2	8	13475	13482	25 %	0 %	50 %	25 %	86360747
31	NC_007766	CGGC	2	8	13845	13852	0 %	0 %	50 %	50 %	86360748
32	NC_007766	GGCA	2	8	14352	14359	25 %	0 %	50 %	25 %	86360748
33	NC_007766	GCCT	2	8	14383	14390	0 %	25 %	25 %	50 %	86360748
34	NC_007766	GCCG	2	8	15048	15055	0 %	0 %	50 %	50 %	86360749
35	NC_007766	GCGA	2	8	15064	15071	25 %	0 %	50 %	25 %	86360749
36	NC_007766	TCGC	2	8	15098	15105	0 %	25 %	25 %	50 %	86360749
37	NC_007766	CGAT	2	8	15376	15383	25 %	25 %	25 %	25 %	86360749
38	NC_007766	GATC	2	8	15441	15448	25 %	25 %	25 %	25 %	86360749
39	NC_007766	GGAA	2	8	15934	15941	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007766	TGGA	2	8	15984	15991	25 %	25 %	50 %	0 %	86360750
41	NC_007766	GCCG	2	8	16061	16068	0 %	0 %	50 %	50 %	86360750
42	NC_007766	CATC	2	8	16088	16095	25 %	25 %	0 %	50 %	86360750
43	NC_007766	GATC	2	8	16180	16187	25 %	25 %	25 %	25 %	86360750
44	NC_007766	CCTT	2	8	17043	17050	0 %	50 %	0 %	50 %	86360751
45	NC_007766	CGGC	2	8	17116	17123	0 %	0 %	50 %	50 %	86360751
46	NC_007766	CGCC	2	8	17320	17327	0 %	0 %	25 %	75 %	86360751
47	NC_007766	CACC	2	8	17860	17867	25 %	0 %	0 %	75 %	86360752
48	NC_007766	CGGC	2	8	18249	18256	0 %	0 %	50 %	50 %	86360753
49	NC_007766	TCCG	2	8	19127	19134	0 %	25 %	25 %	50 %	86360753
50	NC_007766	CATC	2	8	21037	21044	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_007766	TCAA	2	8	24043	24050	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_007766	AGAC	2	8	24609	24616	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_007766	ATTC	2	8	24627	24634	25 %	50 %	0 %	25 %	86360758
54	NC_007766	AAGC	2	8	25136	25143	50 %	0 %	25 %	25 %	86360758
55	NC_007766	CCGC	2	8	25292	25299	0 %	0 %	25 %	75 %	86360759
56	NC_007766	CAGC	2	8	25569	25576	25 %	0 %	25 %	50 %	86360759
57	NC_007766	GCTT	2	8	26004	26011	0 %	50 %	25 %	25 %	86360759
58	NC_007766	CCGA	2	8	26318	26325	25 %	0 %	25 %	50 %	86360760
59	NC_007766	CGAT	2	8	26882	26889	25 %	25 %	25 %	25 %	86360760
60	NC_007766	CTCG	2	8	27240	27247	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_007766	AACT	2	8	27286	27293	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_007766	GAGC	2	8	27842	27849	25 %	0 %	50 %	25 %	86360761
63	NC_007766	GCCC	2	8	27971	27978	0 %	0 %	25 %	75 %	86360761
64	NC_007766	CGAG	2	8	28529	28536	25 %	0 %	50 %	25 %	86360762
65	NC_007766	ATTG	2	8	28592	28599	25 %	50 %	25 %	0 %	86360762
66	NC_007766	GCCT	2	8	28759	28766	0 %	25 %	25 %	50 %	86360762
67	NC_007766	TTGC	2	8	28881	28888	0 %	50 %	25 %	25 %	86360762
68	NC_007766	TGCT	2	8	28985	28992	0 %	50 %	25 %	25 %	86360762
69	NC_007766	GAAG	2	8	29277	29284	50 %	0 %	50 %	0 %	86360762
70	NC_007766	TCCG	2	8	30384	30391	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_007766	AGCG	2	8	30796	30803	25 %	0 %	50 %	25 %	86360764
72	NC_007766	CGCC	2	8	31317	31324	0 %	0 %	25 %	75 %	86360765
73	NC_007766	CGAG	2	8	31329	31336	25 %	0 %	50 %	25 %	86360765
74	NC_007766	GCAG	2	8	31735	31742	25 %	0 %	50 %	25 %	86360765
75	NC_007766	CGGG	2	8	32272	32279	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76	NC_007766	CGGA	2	8	32798	32805	25 %	0 %	50 %	25 %	86360766
77	NC_007766	CGCC	2	8	33135	33142	0 %	0 %	25 %	75 %	86360766
78	NC_007766	AGCG	2	8	33505	33512	25 %	0 %	50 %	25 %	86360766
79	NC_007766	ATCG	2	8	34149	34156	25 %	25 %	25 %	25 %	86360767
80	NC_007766	CATC	2	8	34343	34350	25 %	25 %	0 %	50 %	86360767
81	NC_007766	GGAA	2	8	34703	34710	50 %	0 %	50 %	0 %	86360767
82	NC_007766	GCAT	2	8	35101	35108	25 %	25 %	25 %	25 %	86360767
83	NC_007766	CGCC	2	8	35360	35367	0 %	0 %	25 %	75 %	86360768
84	NC_007766	CCGG	2	8	35712	35719	0 %	0 %	50 %	50 %	86360768
85	NC_007766	TGCC	2	8	36787	36794	0 %	25 %	25 %	50 %	86360769
86	NC_007766	GCCT	2	8	36897	36904	0 %	25 %	25 %	50 %	86360769
87	NC_007766	CGAC	2	8	37460	37467	25 %	0 %	25 %	50 %	86360769
88	NC_007766	CTTC	2	8	38564	38571	0 %	50 %	0 %	50 %	86360771
89	NC_007766	CGAC	2	8	38873	38880	25 %	0 %	25 %	50 %	86360771
90	NC_007766	AGGA	2	8	39091	39098	50 %	0 %	50 %	0 %	86360771
91	NC_007766	GCCG	2	8	40122	40129	0 %	0 %	50 %	50 %	86360772
92	NC_007766	CGAT	2	8	40459	40466	25 %	25 %	25 %	25 %	86360773
93	NC_007766	GCCG	2	8	40479	40486	0 %	0 %	50 %	50 %	86360773
94	NC_007766	GCCC	2	8	41732	41739	0 %	0 %	25 %	75 %	86360775
95	NC_007766	CCTT	2	8	42043	42050	0 %	50 %	0 %	50 %	86360775
96	NC_007766	GCGG	2	8	42330	42337	0 %	0 %	75 %	25 %	86360775
97	NC_007766	CATC	2	8	42530	42537	25 %	25 %	0 %	50 %	86360775
98	NC_007766	CGAT	2	8	42665	42672	25 %	25 %	25 %	25 %	86360775
99	NC_007766	TCCA	2	8	43005	43012	25 %	25 %	0 %	50 %	86360775
100	NC_007766	GCCC	2	8	43240	43247	0 %	0 %	25 %	75 %	86360776
101	NC_007766	GAAG	2	8	43316	43323	50 %	0 %	50 %	0 %	86360776
102	NC_007766	CAAT	2	8	43765	43772	50 %	25 %	0 %	25 %	86360776
103	NC_007766	GCGG	2	8	44113	44120	0 %	0 %	75 %	25 %	86360776
104	NC_007766	CGGC	2	8	44280	44287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_007766	CGGC	3	12	44598	44609	0 %	0 %	50 %	50 %	86360777
106	NC_007766	TCGC	2	8	44629	44636	0 %	25 %	25 %	50 %	86360777
107	NC_007766	CTCG	2	8	44757	44764	0 %	25 %	25 %	50 %	86360777
108	NC_007766	CTCG	2	8	44880	44887	0 %	25 %	25 %	50 %	86360777
109	NC_007766	GCCG	2	8	46274	46281	0 %	0 %	50 %	50 %	86360779
110	NC_007766	GGCG	2	8	46664	46671	0 %	0 %	75 %	25 %	86360779
111	NC_007766	ACCG	2	8	46971	46978	25 %	0 %	25 %	50 %	86360779
112	NC_007766	TCGG	2	8	47283	47290	0 %	25 %	50 %	25 %	86360779
113	NC_007766	CGGC	2	8	47306	47313	0 %	0 %	50 %	50 %	86360779
114	NC_007766	ACAG	2	8	47385	47392	50 %	0 %	25 %	25 %	86360779
115	NC_007766	TCGC	2	8	47473	47480	0 %	25 %	25 %	50 %	86360779
116	NC_007766	GGCC	2	8	47679	47686	0 %	0 %	50 %	50 %	86360779
117	NC_007766	GCCG	2	8	48378	48385	0 %	0 %	50 %	50 %	86360780
118	NC_007766	CCTG	2	8	48497	48504	0 %	25 %	25 %	50 %	86360780
119	NC_007766	GCAG	2	8	48956	48963	25 %	0 %	50 %	25 %	86360781
120	NC_007766	ACCT	2	8	49413	49420	25 %	25 %	0 %	50 %	86360781
121	NC_007766	CGGC	2	8	49528	49535	0 %	0 %	50 %	50 %	86360781
122	NC_007766	AACC	2	8	49661	49668	50 %	0 %	0 %	50 %	86360781
123	NC_007766	CGCC	3	12	50018	50029	0 %	0 %	25 %	75 %	86360781
124	NC_007766	TCCG	2	8	50293	50300	0 %	25 %	25 %	50 %	86360782
125	NC_007766	GCCG	2	8	50361	50368	0 %	0 %	50 %	50 %	86360782
126	NC_007766	ACCA	2	8	50428	50435	50 %	0 %	0 %	50 %	86360782
127	NC_007766	GGGC	2	8	51036	51043	0 %	0 %	75 %	25 %	86360782
128	NC_007766	GCCC	2	8	51832	51839	0 %	0 %	25 %	75 %	86360783
129	NC_007766	TCCG	2	8	52111	52118	0 %	25 %	25 %	50 %	86360784
130	NC_007766	GGCG	3	12	52124	52135	0 %	0 %	75 %	25 %	86360784
131	NC_007766	CCGC	2	8	52456	52463	0 %	0 %	25 %	75 %	86360784
132	NC_007766	TCTT	2	8	52617	52624	0 %	75 %	0 %	25 %	86360784
133	NC_007766	GGGC	2	8	53703	53710	0 %	0 %	75 %	25 %	86360784
134	NC_007766	GCCG	2	8	53849	53856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_007766	CCTC	2	8	54869	54876	0 %	25 %	0 %	75 %	86360786
136	NC_007766	GGCC	2	8	55533	55540	0 %	0 %	50 %	50 %	86360787
137	NC_007766	GGCC	2	8	55845	55852	0 %	0 %	50 %	50 %	86360787
138	NC_007766	GCCG	2	8	56440	56447	0 %	0 %	50 %	50 %	86360787
139	NC_007766	CCTG	2	8	56587	56594	0 %	25 %	25 %	50 %	86360787
140	NC_007766	CTCG	2	8	57375	57382	0 %	25 %	25 %	50 %	86360789
141	NC_007766	GTCT	2	8	57711	57718	0 %	50 %	25 %	25 %	86360789
142	NC_007766	GATG	2	8	57766	57773	25 %	25 %	50 %	0 %	86360790
143	NC_007766	GCGG	2	8	57908	57915	0 %	0 %	75 %	25 %	86360790
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