MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42f

Total Repeats: 231

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007766	GTTC	2	8	40	47	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_007766	CCGG	2	8	367	374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_007766	CGGC	2	8	596	603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_007766	TCAA	2	8	614	621	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007766	GCCG	2	8	688	695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_007766	CAGA	2	8	3529	3536	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_007766	CGAC	2	8	6006	6013	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_007766	AGAA	2	8	9261	9268	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007766	GGAA	2	8	15934	15941	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007766	CATC	2	8	21037	21044	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007766	TCAA	2	8	24043	24050	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_007766	AGAC	2	8	24609	24616	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_007766	CTCG	2	8	27240	27247	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_007766	AACT	2	8	27286	27293	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_007766	TCCG	2	8	30384	30391	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_007766	CGGG	2	8	32272	32279	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17	NC_007766	CGGC	2	8	44280	44287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_007766	GCCG	2	8	53849	53856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_007766	TCCG	2	8	59227	59234	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_007766	TGCC	2	8	59883	59890	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_007766	CCGG	2	8	62329	62336	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_007766	CCTG	2	8	66528	66535	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_007766	CCCT	2	8	66690	66697	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
24	NC_007766	CTTC	2	8	68870	68877	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_007766	CGAG	2	8	68957	68964	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_007766	GAGC	2	8	68965	68972	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_007766	TCGG	2	8	73425	73432	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_007766	CATG	2	8	80016	80023	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_007766	AAGC	2	8	80266	80273	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_007766	CGGG	2	8	80674	80681	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31	NC_007766	GATC	2	8	80707	80714	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_007766	CCGC	2	8	86213	86220	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_007766	CGCT	2	8	88847	88854	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_007766	TGAT	2	8	89011	89018	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007766	GCCG	2	8	89131	89138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_007766	CGGC	2	8	89192	89199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_007766	GCCG	2	8	95519	95526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_007766	ATCA	2	8	101646	101653	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_007766	ACTA	2	8	101718	101725	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_007766	TGCG	2	8	109646	109653	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_007766	GCTT	2	8	109741	109748	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_007766	GGCA	2	8	117402	117409	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_007766	GTGG	2	8	125440	125447	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007766	GCCG	2	8	125494	125501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_007766	GATC	2	8	125611	125618	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_007766	ATCT	2	8	128130	128137	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_007766	TCGC	2	8	128942	128949	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_007766	TTTC	2	8	129231	129238	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_007766	CTGG	2	8	134966	134973	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_007766	CCCT	2	8	135899	135906	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
51	NC_007766	CGAC	2	8	137215	137222	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_007766	GCTT	2	8	137300	137307	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_007766	GCAA	2	8	137484	137491	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_007766	TACA	2	8	137538	137545	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_007766	CTGG	2	8	137640	137647	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_007766	GCGA	2	8	137812	137819	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_007766	GACT	2	8	137874	137881	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_007766	TTTG	2	8	138305	138312	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007766	TGGC	2	8	138678	138685	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_007766	TTGC	2	8	140845	140852	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_007766	GCCA	2	8	142869	142876	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_007766	CCGC	2	8	143811	143818	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
63	NC_007766	GGTC	2	8	146149	146156	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_007766	CTTT	2	8	147247	147254	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_007766	CCTT	2	8	149848	149855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_007766	TGAC	2	8	150851	150858	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_007766	CGTT	2	8	151018	151025	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_007766	TCGA	2	8	151053	151060	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_007766	GCGG	2	8	151081	151088	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
70	NC_007766	GGGC	2	8	151226	151233	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_007766	CCAG	2	8	151255	151262	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_007766	GGCA	2	8	151371	151378	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_007766	GCAA	2	8	155599	155606	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_007766	TCCA	2	8	156551	156558	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_007766	CTGC	2	8	164886	164893	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_007766	CTTC	2	8	164956	164963	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_007766	AACT	2	8	165495	165502	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_007766	GGCT	2	8	167252	167259	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_007766	GATT	2	8	167553	167560	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007766	GAGC	2	8	167566	167573	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_007766	CCTG	2	8	167609	167616	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_007766	TGAA	2	8	167832	167839	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007766	GCGA	2	8	168656	168663	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_007766	CTGC	2	8	172435	172442	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_007766	GCCC	2	8	172476	172483	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
86	NC_007766	GCCG	2	8	172588	172595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_007766	AAGC	2	8	175011	175018	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_007766	ATGG	2	8	175888	175895	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007766	CGTC	2	8	178417	178424	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_007766	TGAC	2	8	187306	187313	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_007766	GTCC	2	8	187442	187449	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_007766	CGGA	2	8	187601	187608	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_007766	GGCC	2	8	189688	189695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_007766	GCGG	2	8	196085	196092	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
95	NC_007766	TTTC	2	8	199417	199424	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_007766	AAAG	2	8	199426	199433	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007766	CCGC	2	8	201862	201869	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
98	NC_007766	TGCT	2	8	209895	209902	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_007766	CTTC	2	8	209926	209933	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_007766	ATTG	2	8	222217	222224	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007766	CGGC	2	8	231218	231225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_007766	ATTA	2	8	231444	231451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007766	TCGG	2	8	232651	232658	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_007766	AGCC	2	8	234379	234386	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_007766	TGCC	2	8	234579	234586	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_007766	TTGC	2	8	241348	241355	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_007766	GCTG	2	8	242060	242067	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_007766	AGGA	2	8	251500	251507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007766	GCAA	2	8	254215	254222	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_007766	GTCA	2	8	259478	259485	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_007766	TGGC	2	8	259598	259605	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_007766	CTTG	2	8	271379	271386	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_007766	GTTC	2	8	273870	273877	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_007766	GGAA	2	8	273886	273893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007766	CGCT	2	8	275359	275366	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_007766	TGCG	2	8	275862	275869	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_007766	CTGA	2	8	276068	276075	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_007766	GGGC	2	8	277174	277181	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
119	NC_007766	GGCG	2	8	277226	277233	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
120	NC_007766	TGAA	2	8	277775	277782	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007766	TCCT	2	8	278786	278793	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_007766	CAAG	2	8	282627	282634	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_007766	GCGG	2	8	282648	282655	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
124	NC_007766	CGGC	2	8	282802	282809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_007766	CCGG	2	8	291112	291119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_007766	CAGG	2	8	308075	308082	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_007766	AGGC	2	8	308563	308570	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_007766	TGAC	2	8	319766	319773	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_007766	AGCC	2	8	321634	321641	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_007766	CGCA	2	8	333814	333821	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_007766	GGAC	2	8	345467	345474	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_007766	TGCG	2	8	346674	346681	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_007766	TCCC	2	8	355157	355164	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
134	NC_007766	TCAC	2	8	368867	368874	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_007766	CCAG	2	8	369171	369178	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_007766	TTGT	2	8	369196	369203	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007766	CGGG	2	8	371341	371348	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
138	NC_007766	GACG	2	8	371590	371597	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_007766	TGAG	2	8	372910	372917	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007766	CGAT	2	8	374703	374710	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_007766	TTCC	2	8	374776	374783	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_007766	ATGC	2	8	378595	378602	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_007766	GCCG	2	8	386583	386590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_007766	GCAA	2	8	386677	386684	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_007766	AGAA	2	8	386796	386803	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007766	GGTC	2	8	389908	389915	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_007766	ATGC	2	8	399449	399456	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_007766	CGGC	2	8	399553	399560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_007766	CTTC	2	8	405549	405556	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_007766	GCCA	2	8	410506	410513	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_007766	TGGC	2	8	419465	419472	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.