MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42f

Total Repeats: 9682

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007766	CGA	2	6	791	796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360735
2	NC_007766	TCG	2	6	827	832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360735
3	NC_007766	TCG	3	9	857	865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360735
4	NC_007766	GCC	2	6	943	948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360735
5	NC_007766	CGT	2	6	1023	1028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360735
6	NC_007766	CGT	2	6	1098	1103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360735
7	NC_007766	CAG	2	6	1162	1167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360735
8	NC_007766	GTC	2	6	1168	1173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360735
9	NC_007766	TGG	2	6	1187	1192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360735
10	NC_007766	GTC	2	6	1260	1265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360735
11	NC_007766	GGA	2	6	1287	1292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360735
12	NC_007766	GCG	2	6	1293	1298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360735
13	NC_007766	CGA	2	6	1326	1331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360735
14	NC_007766	GTC	2	6	1429	1434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360735
15	NC_007766	ACG	2	6	1450	1455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360735
16	NC_007766	CGG	2	6	1476	1481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360735
17	NC_007766	ACA	2	6	1550	1555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360735
18	NC_007766	CGG	2	6	1563	1568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360735
19	NC_007766	CGC	2	6	1630	1635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360736
20	NC_007766	GGC	2	6	1656	1661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360736
21	NC_007766	CGA	2	6	1712	1717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360736
22	NC_007766	CTG	3	9	1728	1736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360736
23	NC_007766	GAC	2	6	1775	1780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360736
24	NC_007766	ATG	2	6	1800	1805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360736
25	NC_007766	GCG	2	6	1831	1836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360736
26	NC_007766	CGT	3	9	1850	1858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360736
27	NC_007766	GGC	2	6	1959	1964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360736
28	NC_007766	GAG	2	6	1965	1970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360736
29	NC_007766	GCA	2	6	2039	2044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360736
30	NC_007766	CGG	2	6	2057	2062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360736
31	NC_007766	CGG	2	6	2126	2131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360736
32	NC_007766	CGT	2	6	2147	2152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360736
33	NC_007766	CCG	2	6	2230	2235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360736
34	NC_007766	ACG	2	6	2314	2319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360736
35	NC_007766	CGC	2	6	2348	2353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360736
36	NC_007766	CGC	2	6	2505	2510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360737
37	NC_007766	CTG	2	6	2515	2520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360737
38	NC_007766	CCG	2	6	2532	2537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360737
39	NC_007766	CCT	2	6	2559	2564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360737
40	NC_007766	GCG	2	6	2625	2630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360737
41	NC_007766	AGC	4	12	2831	2842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360737
42	NC_007766	CGA	2	6	2967	2972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360737
43	NC_007766	GCA	2	6	3087	3092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360737
44	NC_007766	TCG	2	6	3105	3110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360737
45	NC_007766	GAT	2	6	3112	3117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360737
46	NC_007766	TCG	2	6	3176	3181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360737
47	NC_007766	CGG	2	6	3339	3344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360737
48	NC_007766	CAA	2	6	3606	3611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86360738
49	NC_007766	TGG	2	6	3637	3642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360738
50	NC_007766	TTC	2	6	3665	3670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86360738
51	NC_007766	AAG	2	6	3730	3735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360738
52	NC_007766	TGA	2	6	3773	3778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360738
53	NC_007766	TGG	2	6	3793	3798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360738
54	NC_007766	GGC	2	6	3820	3825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360738
55	NC_007766	GCG	3	9	3881	3889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360738
56	NC_007766	CAG	2	6	3901	3906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360738
57	NC_007766	CCG	2	6	3957	3962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360738
58	NC_007766	CGG	2	6	4077	4082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360738
59	NC_007766	CGA	2	6	4143	4148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360738
60	NC_007766	GCG	2	6	4157	4162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360738
61	NC_007766	ACG	2	6	4298	4303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360738
62	NC_007766	CGG	2	6	4326	4331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360738
63	NC_007766	GGC	2	6	4393	4398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360738
64	NC_007766	CCG	2	6	4466	4471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360738
65	NC_007766	ACT	2	6	4514	4519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360738
66	NC_007766	GAA	2	6	4632	4637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360738
67	NC_007766	CGA	2	6	4646	4651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360738
68	NC_007766	CGC	2	6	4705	4710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360738
69	NC_007766	CCG	2	6	4850	4855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360738
70	NC_007766	TCG	2	6	4868	4873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360738
71	NC_007766	GCG	3	9	4988	4996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360738
72	NC_007766	CGC	2	6	5106	5111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360738
73	NC_007766	AAG	2	6	5125	5130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360738
74	NC_007766	GCC	2	6	5164	5169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360738
75	NC_007766	GGC	3	9	5181	5189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360738
76	NC_007766	CGG	2	6	5193	5198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360738
77	NC_007766	CGC	2	6	5273	5278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360738
78	NC_007766	GAA	2	6	5344	5349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360738
79	NC_007766	TCG	2	6	5354	5359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360738
80	NC_007766	TCG	2	6	5405	5410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360738
81	NC_007766	GCC	2	6	5578	5583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360738
82	NC_007766	TCG	2	6	5693	5698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360738
83	NC_007766	ATC	2	6	6130	6135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360739
84	NC_007766	GCG	2	6	6136	6141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360739
85	NC_007766	CGT	2	6	6150	6155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360739
86	NC_007766	GAT	2	6	6156	6161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86360739
87	NC_007766	GGC	2	6	6174	6179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360739
88	NC_007766	CGG	2	6	6330	6335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360739
89	NC_007766	TGG	2	6	6341	6346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86360739
90	NC_007766	ATC	2	6	6454	6459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360739
91	NC_007766	GCG	2	6	6552	6557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360739
92	NC_007766	CAG	2	6	6609	6614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360739
93	NC_007766	GCT	2	6	6618	6623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360739
94	NC_007766	GGA	2	6	6636	6641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360739
95	NC_007766	GGA	2	6	6827	6832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360740
96	NC_007766	GAA	2	6	6907	6912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360740
97	NC_007766	GCC	2	6	6950	6955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360740
98	NC_007766	GCG	2	6	6959	6964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360740
99	NC_007766	CAG	2	6	7102	7107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360740
100	NC_007766	ATC	2	6	7114	7119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360740
101	NC_007766	GAA	2	6	7195	7200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86360740
102	NC_007766	TCA	2	6	7620	7625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86360740
103	NC_007766	CCG	2	6	7703	7708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360740
104	NC_007766	AGC	2	6	7745	7750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360740
105	NC_007766	CGG	2	6	7752	7757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360740
106	NC_007766	CGG	2	6	7762	7767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360740
107	NC_007766	GGC	2	6	7774	7779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360740
108	NC_007766	CGG	2	6	7791	7796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360740
109	NC_007766	CTG	2	6	7976	7981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360741
110	NC_007766	TCG	2	6	8052	8057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360741
111	NC_007766	CGG	2	6	8105	8110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360741
112	NC_007766	CCG	2	6	8112	8117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360741
113	NC_007766	CCG	2	6	8332	8337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360741
114	NC_007766	ACC	2	6	8346	8351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86360741
115	NC_007766	GCC	2	6	8511	8516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360742
116	NC_007766	AGG	2	6	8563	8568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360742
117	NC_007766	GGC	2	6	8580	8585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360742
118	NC_007766	CGC	2	6	8629	8634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360742
119	NC_007766	TCG	2	6	8635	8640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360742
120	NC_007766	GTT	2	6	8676	8681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86360742
121	NC_007766	CCG	2	6	8753	8758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360742
122	NC_007766	CGC	3	9	8816	8824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360742
123	NC_007766	CGG	2	6	8948	8953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86360742
124	NC_007766	CGA	2	6	8999	9004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360742
125	NC_007766	GTC	2	6	9015	9020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360742
126	NC_007766	TCG	2	6	9061	9066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360742
127	NC_007766	GGA	3	9	9087	9095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86360742
128	NC_007766	CCT	2	6	9129	9134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86360742
129	NC_007766	CGC	2	6	9317	9322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360743
130	NC_007766	GCC	2	6	9328	9333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360743
131	NC_007766	GCC	2	6	9389	9394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86360743
132	NC_007766	GCA	2	6	9427	9432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86360743
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262	NC_007766	TCG	2	6	17823	17828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86360752
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