MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42f

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007766	A	6	6	4694	4699	100 %	0 %	0 %	0 %	86360738
2	NC_007766	T	6	6	5488	5493	0 %	100 %	0 %	0 %	86360738
3	NC_007766	T	6	6	28194	28199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007766	G	6	6	57328	57333	0 %	0 %	100 %	0 %	86360789
5	NC_007766	A	6	6	57447	57452	100 %	0 %	0 %	0 %	86360789
6	NC_007766	T	6	6	58459	58464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007766	C	6	6	71101	71106	0 %	0 %	0 %	100 %	86360804
8	NC_007766	G	6	6	74888	74893	0 %	0 %	100 %	0 %	86360808
9	NC_007766	C	6	6	76595	76600	0 %	0 %	0 %	100 %	86360809
10	NC_007766	A	6	6	84450	84455	100 %	0 %	0 %	0 %	86360814
11	NC_007766	C	6	6	86953	86958	0 %	0 %	0 %	100 %	86360818
12	NC_007766	T	6	6	87810	87815	0 %	100 %	0 %	0 %	86360820
13	NC_007766	A	7	7	88834	88840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007766	G	6	6	90369	90374	0 %	0 %	100 %	0 %	86360822
15	NC_007766	G	7	7	94412	94418	0 %	0 %	100 %	0 %	86360825
16	NC_007766	A	6	6	108096	108101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007766	A	6	6	108510	108515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007766	T	8	8	108519	108526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007766	A	6	6	108838	108843	100 %	0 %	0 %	0 %	86360836
20	NC_007766	C	6	6	111856	111861	0 %	0 %	0 %	100 %	86360838
21	NC_007766	C	6	6	112767	112772	0 %	0 %	0 %	100 %	86360838
22	NC_007766	C	7	7	113049	113055	0 %	0 %	0 %	100 %	86360839
23	NC_007766	T	6	6	113078	113083	0 %	100 %	0 %	0 %	86360839
24	NC_007766	A	6	6	115293	115298	100 %	0 %	0 %	0 %	86360839
25	NC_007766	C	6	6	115766	115771	0 %	0 %	0 %	100 %	86360840
26	NC_007766	C	6	6	116235	116240	0 %	0 %	0 %	100 %	86360840
27	NC_007766	G	6	6	123723	123728	0 %	0 %	100 %	0 %	86360848
28	NC_007766	T	6	6	124702	124707	0 %	100 %	0 %	0 %	86360850
29	NC_007766	A	6	6	126780	126785	100 %	0 %	0 %	0 %	86360852
30	NC_007766	G	6	6	132988	132993	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007766	T	7	7	133165	133171	0 %	100 %	0 %	0 %	86360857
32	NC_007766	A	6	6	135182	135187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007766	T	6	6	136503	136508	0 %	100 %	0 %	0 %	86360859
34	NC_007766	G	6	6	136774	136779	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007766	A	6	6	137191	137196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007766	G	6	6	141984	141989	0 %	0 %	100 %	0 %	86360865
37	NC_007766	T	6	6	145207	145212	0 %	100 %	0 %	0 %	86360869
38	NC_007766	A	6	6	146069	146074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007766	T	6	6	153944	153949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007766	A	6	6	155271	155276	100 %	0 %	0 %	0 %	86360877
41	NC_007766	C	6	6	155399	155404	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
42	NC_007766	T	6	6	155420	155425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007766	G	6	6	156262	156267	0 %	0 %	100 %	0 %	86360878
44	NC_007766	A	6	6	158404	158409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007766	T	6	6	161704	161709	0 %	100 %	0 %	0 %	86360883
46	NC_007766	A	6	6	164685	164690	100 %	0 %	0 %	0 %	86360885
47	NC_007766	C	7	7	165688	165694	0 %	0 %	0 %	100 %	86360887
48	NC_007766	G	6	6	169927	169932	0 %	0 %	100 %	0 %	86360891
49	NC_007766	A	7	7	175986	175992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007766	T	6	6	176015	176020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007766	T	6	6	179345	179350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007766	A	6	6	179537	179542	100 %	0 %	0 %	0 %	86360901
53	NC_007766	T	6	6	188484	188489	0 %	100 %	0 %	0 %	86360909
54	NC_007766	A	6	6	196964	196969	100 %	0 %	0 %	0 %	86360917
55	NC_007766	C	7	7	213556	213562	0 %	0 %	0 %	100 %	86360933
56	NC_007766	G	6	6	225760	225765	0 %	0 %	100 %	0 %	86360944
57	NC_007766	T	6	6	227978	227983	0 %	100 %	0 %	0 %	86360946
58	NC_007766	T	6	6	230571	230576	0 %	100 %	0 %	0 %	86360948
59	NC_007766	C	6	6	234625	234630	0 %	0 %	0 %	100 %	86360952
60	NC_007766	A	6	6	240014	240019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007766	T	6	6	259551	259556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007766	T	6	6	260943	260948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007766	A	7	7	276556	276562	100 %	0 %	0 %	0 %	86360988
64	NC_007766	G	7	7	278414	278420	0 %	0 %	100 %	0 %	86360990
65	NC_007766	C	6	6	290988	290993	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
66	NC_007766	G	6	6	306678	306683	0 %	0 %	100 %	0 %	86361007
67	NC_007766	C	6	6	310008	310013	0 %	0 %	0 %	100 %	86361010
68	NC_007766	A	6	6	311474	311479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007766	T	7	7	322015	322021	0 %	100 %	0 %	0 %	86361019
70	NC_007766	A	6	6	322419	322424	100 %	0 %	0 %	0 %	86361019
71	NC_007766	C	6	6	322644	322649	0 %	0 %	0 %	100 %	86361019
72	NC_007766	G	6	6	325672	325677	0 %	0 %	100 %	0 %	86361022
73	NC_007766	G	6	6	344243	344248	0 %	0 %	100 %	0 %	86361035
74	NC_007766	G	9	9	344608	344616	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007766	A	6	6	362016	362021	100 %	0 %	0 %	0 %	86361052
76	NC_007766	G	6	6	362424	362429	0 %	0 %	100 %	0 %	86361052
77	NC_007766	A	6	6	364976	364981	100 %	0 %	0 %	0 %	86361054
78	NC_007766	A	6	6	369723	369728	100 %	0 %	0 %	0 %	86361060
79	NC_007766	A	8	8	374042	374049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007766	A	6	6	380205	380210	100 %	0 %	0 %	0 %	86361069
81	NC_007766	C	8	8	383085	383092	0 %	0 %	0 %	100 %	86361071
82	NC_007766	C	6	6	384934	384939	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
83	NC_007766	T	7	7	386744	386750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007766	A	6	6	390803	390808	100 %	0 %	0 %	0 %	86361078
85	NC_007766	T	6	6	397928	397933	0 %	100 %	0 %	0 %	86361084
86	NC_007766	T	8	8	399285	399292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007766	C	6	6	400509	400514	0 %	0 %	0 %	100 %	86361086
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89	NC_007766	A	6	6	407625	407630	100 %	0 %	0 %	0 %	86361091
90	NC_007766	A	7	7	410596	410602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007766	A	6	6	410714	410719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007766	T	6	6	410995	411000	0 %	100 %	0 %	0 %	86361093
93	NC_007766	G	6	6	430591	430596	0 %	0 %	100 %	0 %	86361112
94	NC_007766	A	6	6	431702	431707	100 %	0 %	0 %	0 %	86361113
95	NC_007766	T	8	8	432673	432680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007766	T	6	6	440027	440032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007766	A	7	7	452667	452673	100 %	0 %	0 %	0 %	86361129
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100	NC_007766	A	6	6	482582	482587	100 %	0 %	0 %	0 %	86361159
101	NC_007766	A	6	6	483410	483415	100 %	0 %	0 %	0 %	86361160
102	NC_007766	A	6	6	492586	492591	100 %	0 %	0 %	0 %	86361169
103	NC_007766	C	6	6	501239	501244	0 %	0 %	0 %	100 %	86361177
104	NC_007766	A	6	6	501911	501916	100 %	0 %	0 %	0 %	86361178
105	NC_007766	A	6	6	504922	504927	100 %	0 %	0 %	0 %	86361180
106	NC_007766	C	6	6	507492	507497	0 %	0 %	0 %	100 %	86361181
107	NC_007766	T	7	7	508620	508626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007766	T	7	7	518159	518165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007766	A	7	7	519026	519032	100 %	0 %	0 %	0 %	86361189
110	NC_007766	T	6	6	522435	522440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007766	A	6	6	522583	522588	100 %	0 %	0 %	0 %	86361193
112	NC_007766	A	7	7	530640	530646	100 %	0 %	0 %	0 %	86361199
113	NC_007766	A	6	6	530987	530992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007766	T	6	6	532497	532502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007766	G	6	6	533018	533023	0 %	0 %	100 %	0 %	86361202
116	NC_007766	C	7	7	549752	549758	0 %	0 %	0 %	100 %	86361217
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118	NC_007766	A	6	6	551290	551295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007766	A	6	6	556442	556447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007766	C	7	7	557415	557421	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
121	NC_007766	C	6	6	557805	557810	0 %	0 %	0 %	100 %	86361221
122	NC_007766	T	6	6	559597	559602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007766	C	6	6	566601	566606	0 %	0 %	0 %	100 %	86361231
124	NC_007766	T	6	6	575324	575329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007766	C	6	6	582074	582079	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
126	NC_007766	A	6	6	598983	598988	100 %	0 %	0 %	0 %	86361262
127	NC_007766	C	6	6	602048	602053	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
128	NC_007766	T	6	6	607530	607535	0 %	100 %	0 %	0 %	86361271
129	NC_007766	T	6	6	612336	612341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007766	T	6	6	622592	622597	0 %	100 %	0 %	0 %	86361284
131	NC_007766	A	6	6	629315	629320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.