Hexa-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42e

Total Repeats: 249

Go To Repeat Summary Page

Download The Result in

S.No.Genome IDMotifIterationsLengthStartEndA%T%G%C% Protein ID
1NC_007765AGGGGA21252053133.33 %0 %66.67 %0 %86360279
2NC_007765AGAGCG2121492150333.33 %0 %50 %16.67 %86360280
3NC_007765CGGCGA2124901491216.67 %0 %50 %33.33 %86360285
4NC_007765ACGGCG2125431544216.67 %0 %50 %33.33 %86360285
5NC_007765GCTGGC21213878138890 %16.67 %50 %33.33 %86360288
6NC_007765GGCGCC21214173141840 %0 %50 %50 %86360288
7NC_007765GGTCGA212143801439116.67 %16.67 %50 %16.67 %86360288
8NC_007765GGCATG212190631907416.67 %16.67 %50 %16.67 %86360291
9NC_007765GCTGGC21225058250690 %16.67 %50 %33.33 %86360297
10NC_007765GATGGC212262952630616.67 %16.67 %50 %16.67 %86360297
11NC_007765GCCGAT212281172812816.67 %16.67 %33.33 %33.33 %86360298
12NC_007765GCCGTT21229254292650 %33.33 %33.33 %33.33 %86360299
13NC_007765CTCGGC21231603316140 %16.67 %33.33 %50 %86360301
14NC_007765CGGCGC21233628336390 %0 %50 %50 %86360302
15NC_007765CCCGGC21234379343900 %0 %33.33 %66.67 %86360303
16NC_007765GCCGGT21237038370490 %16.67 %50 %33.33 %86360307
17NC_007765CCAGAA212374313744250 %0 %16.67 %33.33 %86360307
18NC_007765CCAGAT212379653797633.33 %16.67 %16.67 %33.33 %86360307
19NC_007765GCGCCG21238903389140 %0 %50 %50 %86360308
20NC_007765TCGGCG21239241392520 %16.67 %50 %33.33 %86360308
21NC_007765TCGATG212422434225416.67 %33.33 %33.33 %16.67 %86360310
22NC_007765GGCCGA212497854979616.67 %0 %50 %33.33 %86360316
23NC_007765TGACGC212500565006716.67 %16.67 %33.33 %33.33 %86360317
24NC_007765AGGCCG212501155012616.67 %0 %50 %33.33 %86360317
25NC_007765ATCGAG212507685077933.33 %16.67 %33.33 %16.67 %86360317
26NC_007765GTGAAG212536695368033.33 %16.67 %50 %0 %86360319
27NC_007765GCGCTG21254504545150 %16.67 %50 %33.33 %86360320
28NC_007765CTTGCG21254591546020 %33.33 %33.33 %33.33 %86360320
29NC_007765CCAGAC212548635487433.33 %0 %16.67 %50 %86360320
30NC_007765CCGGGG21256204562150 %0 %66.67 %33.33 %86360321
31NC_007765GCCTGG21256518565290 %16.67 %50 %33.33 %86360321
32NC_007765TCGCCG21256773567840 %16.67 %33.33 %50 %86360321
33NC_007765CCACCT212580295804016.67 %16.67 %0 %66.67 %86360322
34NC_007765GTGCTG21259021590320 %33.33 %50 %16.67 %86360322
35NC_007765CTGCCG21261075610860 %16.67 %33.33 %50 %86360324
36NC_007765CCGGGC21264049640600 %0 %50 %50 %86360327
37NC_007765CGCCAG212642656427616.67 %0 %33.33 %50 %86360327
38NC_007765GAAAAT212647246473566.67 %16.67 %16.67 %0 %86360327
39NC_007765GAGGTC212651046511516.67 %16.67 %50 %16.67 %86360328
40NC_007765CGCCGG21265516655270 %0 %50 %50 %86360328
41NC_007765AGTGGC212687896880016.67 %16.67 %50 %16.67 %86360332
42NC_007765CGGTGA212710207103116.67 %16.67 %50 %16.67 %86360334
43NC_007765AGGAGC212744287443933.33 %0 %50 %16.67 %86360339
44NC_007765GTCGCC21281110811210 %16.67 %33.33 %50 %86360347
45NC_007765TCGATT212812488125916.67 %50 %16.67 %16.67 %86360347
46NC_007765GCAGGC212816538166416.67 %0 %50 %33.33 %86360348
47NC_007765GGCGGT21282049820600 %16.67 %66.67 %16.67 %86360348
48NC_007765GAAGGC212822848229533.33 %0 %50 %16.67 %86360348
49NC_007765GGGCGA212910609107116.67 %0 %66.67 %16.67 %86360355
50NC_007765CTCCGG21292902929130 %16.67 %33.33 %50 %86360358
51NC_007765GGCGCA212948759488616.67 %0 %50 %33.33 %86360359
52NC_007765GCCGAC212966359664616.67 %0 %33.33 %50 %86360362
53NC_007765GCAGGC212970369704716.67 %0 %50 %33.33 %86360362
54NC_007765GCTTCT21299932999430 %50 %16.67 %33.33 %86360364
55NC_007765GTCTCG2121000061000170 %33.33 %33.33 %33.33 %86360365
56NC_007765ATGCCG21210280510281616.67 %16.67 %33.33 %33.33 %86360367
57NC_007765TCCTGA21210649510650616.67 %33.33 %16.67 %33.33 %86360370
58NC_007765CCATCG21210766310767416.67 %16.67 %16.67 %50 %86360371
59NC_007765TCCGGC2121076831076940 %16.67 %33.33 %50 %86360371
60NC_007765CCAGCG21210803310804416.67 %0 %33.33 %50 %86360371
61NC_007765CTATGT21210822810823916.67 %50 %16.67 %16.67 %86360371
62NC_007765TCCGGC2121085171085280 %16.67 %33.33 %50 %86360371
63NC_007765CCAGCG21210884610885716.67 %0 %33.33 %50 %86360371
64NC_007765CGTCAT21210904410905516.67 %33.33 %16.67 %33.33 %86360371
65NC_007765TCGGCG2121095291095400 %16.67 %50 %33.33 %86360372
66NC_007765CGACCA21211115211116333.33 %0 %16.67 %50 %86360373
67NC_007765GAAGAT21212073412074550 %16.67 %33.33 %0 %86360382
68NC_007765GGCATC21212222412223516.67 %16.67 %33.33 %33.33 %86360383
69NC_007765AGGGAT21213172113173233.33 %16.67 %50 %0 %86360389
70NC_007765GATGCC21213278313279416.67 %16.67 %33.33 %33.33 %86360390
71NC_007765CATGGC21213356813357916.67 %16.67 %33.33 %33.33 %86360391
72NC_007765AGCCCG21213379713380816.67 %0 %33.33 %50 %86360391
73NC_007765TGCCGA21213649613650716.67 %16.67 %33.33 %33.33 %86360394
74NC_007765GCCGAG21213892713893816.67 %0 %50 %33.33 %86360395
75NC_007765CCGGCA21214014914016016.67 %0 %33.33 %50 %86360395
76NC_007765TCGGCA21214119914121016.67 %16.67 %33.33 %33.33 %86360395
77NC_007765TGCCGA21214213214214316.67 %16.67 %33.33 %33.33 %86360396
78NC_007765CGGGAT21214251114252216.67 %16.67 %50 %16.67 %86360397
79NC_007765GGCAAG21214476014477133.33 %0 %50 %16.67 %86360399
80NC_007765TGCCGA21214774914776016.67 %16.67 %33.33 %33.33 %86360401
81NC_007765CGGCAG21215124915126016.67 %0 %50 %33.33 %86360403
82NC_007765GGGCTC2121528341528450 %16.67 %50 %33.33 %86360405
83NC_007765CAGCGG21215359415360516.67 %0 %50 %33.33 %86360406
84NC_007765GACGCT21215369315370416.67 %16.67 %33.33 %33.33 %86360406
85NC_007765CCGAAG21215383515384633.33 %0 %33.33 %33.33 %86360406
86NC_007765AGCTGC21215399815400916.67 %16.67 %33.33 %33.33 %86360406
87NC_007765ACCGCC21215506515507616.67 %0 %16.67 %66.67 %86360406
88NC_007765GCCGAG21215758715759816.67 %0 %50 %33.33 %86360408
89NC_007765TGGCGC2121593751593860 %16.67 %50 %33.33 %86360409
90NC_007765AGGCCA21216211016212133.33 %0 %33.33 %33.33 %86360410
91NC_007765TGAGAT21216853116854233.33 %33.33 %33.33 %0 %86360418
92NC_007765GCTGAT21217136217137316.67 %33.33 %33.33 %16.67 %86360421
93NC_007765CATCGC21217520317521416.67 %16.67 %16.67 %50 %86360423
94NC_007765CGCCTG2121762141762250 %16.67 %33.33 %50 %86360424
95NC_007765GACGGC21217718517719616.67 %0 %50 %33.33 %86360425
96NC_007765GGCGAA21217853917855033.33 %0 %50 %16.67 %86360426
97NC_007765TCGCCG2121809551809660 %16.67 %33.33 %50 %86360428
98NC_007765GTCATC21218642318643416.67 %33.33 %16.67 %33.33 %86360433
99NC_007765CCGGAT21218723618724716.67 %16.67 %33.33 %33.33 %86360434
100NC_007765CCGCGC2121896761896870 %0 %33.33 %66.67 %86360436
101NC_007765TCCTTC2121921451921560 %50 %0 %50 %86360437
102NC_007765TTGCCG2121937201937310 %33.33 %33.33 %33.33 %86360440
103NC_007765ATATCG21220313820314933.33 %33.33 %16.67 %16.67 %86360451
104NC_007765CTCGAT21220391720392816.67 %33.33 %16.67 %33.33 %86360451
105NC_007765CCAGGC21220528520529616.67 %0 %33.33 %50 %86360453
106NC_007765CGGTAT21220732720733816.67 %33.33 %33.33 %16.67 %86360454
107NC_007765GGAAGG21220869020870133.33 %0 %66.67 %0 %86360456
108NC_007765TAAAGG21221039321040450 %16.67 %33.33 %0 %86360457
109NC_007765TCCAGC21221133321134416.67 %16.67 %16.67 %50 %86360458
110NC_007765GGAACG21221298021299133.33 %0 %50 %16.67 %86360460
111NC_007765TCGACA21221716021717133.33 %16.67 %16.67 %33.33 %86360462
112NC_007765GCTATT21222148422149516.67 %50 %16.67 %16.67 %86360463
113NC_007765CGATGC21222319522320616.67 %16.67 %33.33 %33.33 %86360465
114NC_007765ATGACG21222398122399233.33 %16.67 %33.33 %16.67 %86360466
115NC_007765TCTTGC2122266482266590 %50 %16.67 %33.33 %86360468
116NC_007765CAAAGA21223094523095666.67 %0 %16.67 %16.67 %86360471
117NC_007765CGCATG21223158423159516.67 %16.67 %33.33 %33.33 %86360471
118NC_007765ATCGCA21223840623841733.33 %16.67 %16.67 %33.33 %86360477
119NC_007765TTGCGT2122471262471370 %50 %33.33 %16.67 %86360486
120NC_007765AGCGGA21224715524716633.33 %0 %50 %16.67 %86360486
121NC_007765GATGGC21225213125214216.67 %16.67 %50 %16.67 %86360493
122NC_007765GCAACG21225231225232333.33 %0 %33.33 %33.33 %86360493
123NC_007765GCGCAG21225369425370516.67 %0 %50 %33.33 %86360495
124NC_007765CGGCGC2122586022586130 %0 %50 %50 %86360500
125NC_007765GGTCTC2122601802601910 %33.33 %33.33 %33.33 %86360502
126NC_007765AGCGGC21226267626268716.67 %0 %50 %33.33 %86360505
127NC_007765CCTTTC2122734352734460 %50 %0 %50 %86360517
128NC_007765CCTATC21227425627426716.67 %33.33 %0 %50 %86360518
129NC_007765ATCGCC21227555327556416.67 %16.67 %16.67 %50 %86360519
130NC_007765CCGATC21227670927672016.67 %16.67 %16.67 %50 %86360520
131NC_007765GCCGCT2122787682787790 %16.67 %33.33 %50 %86360522
132NC_007765AGACGA21228035528036650 %0 %33.33 %16.67 %86360524
133NC_007765GCATTC21228123628124716.67 %33.33 %16.67 %33.33 %86360525
134NC_007765TGCGCA21228430828431916.67 %16.67 %33.33 %33.33 %86360526
135NC_007765CCTCGA21228450928452016.67 %16.67 %16.67 %50 %86360526
136NC_007765TCGAGC21228458928460016.67 %16.67 %33.33 %33.33 %86360526
137NC_007765AGGAAC21228698728699850 %0 %33.33 %16.67 %86360529
138NC_007765TTCGAT21228795228796316.67 %50 %16.67 %16.67 %86360530
139NC_007765GACACC21229267929269033.33 %0 %16.67 %50 %86360534
140NC_007765ACGCGG21229651429652516.67 %0 %50 %33.33 %86360537
141NC_007765CCAGAG21229965429966533.33 %0 %33.33 %33.33 %86360539
142NC_007765TTGCCG2122996912997020 %33.33 %33.33 %33.33 %86360539
143NC_007765AGCGCC21229998729999816.67 %0 %33.33 %50 %86360540
144NC_007765ATGCCG21230016730017816.67 %16.67 %33.33 %33.33 %86360540
145NC_007765ATAGAC21230105730106850 %16.67 %16.67 %16.67 %86360540
146NC_007765GCGATG21230118730119816.67 %16.67 %50 %16.67 %86360540
147NC_007765TCAAGA21230299930301050 %16.67 %16.67 %16.67 %86360542
148NC_007765GTCGGC2123047343047450 %16.67 %50 %33.33 %86360544
149NC_007765GACGGC21230595130596216.67 %0 %50 %33.33 %86360545
150NC_007765TTCTGC2123072833072940 %50 %16.67 %33.33 %86360546
151NC_007765AGGCCG21230840530841616.67 %0 %50 %33.33 %86360547
152NC_007765CCTGAC21231072031073116.67 %16.67 %16.67 %50 %86360549
153NC_007765GCGCGT2123118623118730 %16.67 %50 %33.33 %86360550
154NC_007765GCCTCG2123126953127060 %16.67 %33.33 %50 %86360552
155NC_007765GGCTGG2123148523148630 %16.67 %66.67 %16.67 %86360554
156NC_007765TGCGGC2123198623198730 %16.67 %50 %33.33 %86360558
157NC_007765AGGCCG21232053632054716.67 %0 %50 %33.33 %86360560
158NC_007765TGAAGA21232131132132250 %16.67 %33.33 %0 %86360560
159NC_007765ATCGGC21232288832289916.67 %16.67 %33.33 %33.33 %86360562
160NC_007765AGGCCG21232430732431816.67 %0 %50 %33.33 %86360563
161NC_007765CGTTCG2123258903259010 %33.33 %33.33 %33.33 %86360564
162NC_007765CGAGGA21232640432641533.33 %0 %50 %16.67 %86360565
163NC_007765GCCGAA21232738832739933.33 %0 %33.33 %33.33 %86360565
164NC_007765TCTCGA21233222233223316.67 %33.33 %16.67 %33.33 %86360569
165NC_007765TCGCTG2123361583361690 %33.33 %33.33 %33.33 %86360574
166NC_007765CTTCGA21233716133717216.67 %33.33 %16.67 %33.33 %86360574
167NC_007765ACGCTG21234045334046416.67 %16.67 %33.33 %33.33 %86360577
168NC_007765AGCTGC21234087434088516.67 %16.67 %33.33 %33.33 %86360578
169NC_007765CGAGGA21234104934106033.33 %0 %50 %16.67 %86360578
170NC_007765GACGCT21234312734313816.67 %16.67 %33.33 %33.33 %86360580
171NC_007765TCAACG21234401134402233.33 %16.67 %16.67 %33.33 %86360580
172NC_007765TGCCGC2123454453454560 %16.67 %33.33 %50 %86360582
173NC_007765CCCGGC2123455303455410 %0 %33.33 %66.67 %86360582
174NC_007765CATCAC21234675834676933.33 %16.67 %0 %50 %86360583
175NC_007765CCATCA21234685634686733.33 %16.67 %0 %50 %86360583
176NC_007765ACGACT21234812434813533.33 %16.67 %16.67 %33.33 %86360585
177NC_007765TCGGCC2123485113485220 %16.67 %33.33 %50 %86360585
178NC_007765TGACCC21235069735070816.67 %16.67 %16.67 %50 %86360587
179NC_007765TCGTTC2123525373525480 %50 %16.67 %33.33 %86360589
180NC_007765CCGGCG2123575523575630 %0 %50 %50 %86360596
181NC_007765CGCCGG2123604393604500 %0 %50 %50 %86360598
182NC_007765TCGCCA21236269036270116.67 %16.67 %16.67 %50 %86360600
183NC_007765CGGCGA21236290736291816.67 %0 %50 %33.33 %86360600
184NC_007765ATGCCG21236560136561216.67 %16.67 %33.33 %33.33 %86360604
185NC_007765GCCGAG21236572636573716.67 %0 %50 %33.33 %86360604
186NC_007765CGATGG21236657536658616.67 %16.67 %50 %16.67 %86360605
187NC_007765CGGCGC2123672203672310 %0 %50 %50 %86360605
188NC_007765CGAGGC21236774536775616.67 %0 %50 %33.33 %86360606
189NC_007765GCCGTC2123679613679720 %16.67 %33.33 %50 %86360606
190NC_007765TAGCCG21236812136813216.67 %16.67 %33.33 %33.33 %86360606
191NC_007765AGGTGA21236872236873333.33 %16.67 %50 %0 %86360606
192NC_007765AGGCAT21237025637026733.33 %16.67 %33.33 %16.67 %86360608
193NC_007765GTGCCG2123748143748250 %16.67 %50 %33.33 %86360614
194NC_007765CCAGCG21238079238080316.67 %0 %33.33 %50 %86360619
195NC_007765GGTCGA21238200838201916.67 %16.67 %50 %16.67 %86360620
196NC_007765GAGGCC21238361538362616.67 %0 %50 %33.33 %86360622
197NC_007765GTTCGC2123843483843590 %33.33 %33.33 %33.33 %86360623
198NC_007765GTCCTC2123843673843780 %33.33 %16.67 %50 %86360623
199NC_007765CGGCCT2123867103867210 %16.67 %33.33 %50 %86360625
200NC_007765CGCCAG21238830138831216.67 %0 %33.33 %50 %86360626
201NC_007765GAGGCC21239513739514816.67 %0 %50 %33.33 %86360632
202NC_007765CGAGCG21239722339723416.67 %0 %50 %33.33 %86360633
203NC_007765GCATCG21240296340297416.67 %16.67 %33.33 %33.33 %86360637
204NC_007765GATCAC21240374740375833.33 %16.67 %16.67 %33.33 %86360637
205NC_007765CACGAC21240676240677333.33 %0 %16.67 %50 %86360640
206NC_007765CGACCT21240795340796416.67 %16.67 %16.67 %50 %86360641
207NC_007765CTGGCG2124084584084690 %16.67 %50 %33.33 %86360641
208NC_007765GGGCAT21240978040979116.67 %16.67 %50 %16.67 %86360643
209NC_007765CCAGCG21241209341210416.67 %0 %33.33 %50 %86360645
210NC_007765ATCGAC21241410041411133.33 %16.67 %16.67 %33.33 %86360647
211NC_007765CGCATG21241860441861516.67 %16.67 %33.33 %33.33 %86360654
212NC_007765TGCCGG2124208104208210 %16.67 %50 %33.33 %86360656
213NC_007765GCCTTC2124264094264200 %33.33 %16.67 %50 %86360662
214NC_007765AGGCCG21242781142782216.67 %0 %50 %33.33 %86360663
215NC_007765CGACAG21242784942786033.33 %0 %33.33 %33.33 %86360663
216NC_007765CGGCAG21242962742963816.67 %0 %50 %33.33 %86360664
217NC_007765TTCTGC2124298414298520 %50 %16.67 %33.33 %86360665
218NC_007765GCGGCC2124370204370310 %0 %50 %50 %86360670
219NC_007765CGGCAT21243794843795916.67 %16.67 %33.33 %33.33 %86360670
220NC_007765CGCTCG2124390314390420 %16.67 %33.33 %50 %86360670
221NC_007765TTGTCC2124410444410550 %50 %16.67 %33.33 %86360672
222NC_007765CGTTGA21244141144142216.67 %33.33 %33.33 %16.67 %86360673
223NC_007765TGAAGG21244432344433433.33 %16.67 %50 %0 %86360676
224NC_007765CGGCGC2124447914448020 %0 %50 %50 %86360677
225NC_007765GGCGCC2124476494476600 %0 %50 %50 %86360679
226NC_007765ATCGTC21245648545649616.67 %33.33 %16.67 %33.33 %86360686
227NC_007765GCCGGA21245954845955916.67 %0 %50 %33.33 %86360689
228NC_007765GCTTGA21246194746195816.67 %33.33 %33.33 %16.67 %86360692
229NC_007765AGCGCC21246364946366016.67 %0 %33.33 %50 %86360693
230NC_007765CCGGCT2124653914654020 %16.67 %33.33 %50 %86360695
231NC_007765ACTTCA21246848346849433.33 %33.33 %0 %33.33 %86360698
232NC_007765GCTGGC2124688594688700 %16.67 %50 %33.33 %86360698
233NC_007765CCGCAT21247295447296516.67 %16.67 %16.67 %50 %86360701
234NC_007765AAGGAG21247371647372750 %0 %50 %0 %86360702
235NC_007765TTGCGT2124800104800210 %50 %33.33 %16.67 %86360710
236NC_007765GCAGCC21248101648102716.67 %0 %33.33 %50 %86360711
237NC_007765GCGGAA21248786048787133.33 %0 %50 %16.67 %86360716
238NC_007765GGCGAT21248825548826616.67 %16.67 %50 %16.67 %86360716
239NC_007765CGGTCG2124884734884840 %16.67 %50 %33.33 %86360716
240NC_007765ATCAGC21249162649163733.33 %16.67 %16.67 %33.33 %86360720
241NC_007765TCGCCT2124917144917250 %33.33 %16.67 %50 %86360720
242NC_007765CAGATC21249274149275233.33 %16.67 %16.67 %33.33 %86360721
243NC_007765ACGCTG21249316749317816.67 %16.67 %33.33 %33.33 %86360721
244NC_007765TCCGTT2124942454942560 %50 %16.67 %33.33 %86360722
245NC_007765GCCGCA21249492349493416.67 %0 %33.33 %50 %86360723
246NC_007765GCCGAT21249645349646416.67 %16.67 %33.33 %33.33 %86360724
247NC_007765ATTCCT21249936249937316.67 %50 %0 %33.33 %86360728
248NC_007765GGTCAG21249957049958116.67 %16.67 %50 %16.67 %86360729
249NC_007765TCGCCG2125001745001850 %16.67 %33.33 %50 %86360729