MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42e

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007765	CGGCA	2	10	3493	3502	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_007765	TCAAC	2	10	17291	17300	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_007765	CGATG	2	10	28495	28504	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_007765	CGGGA	2	10	46106	46115	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_007765	TCAGT	2	10	73168	73177	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_007765	ACAGG	2	10	95050	95059	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_007765	GCCCG	2	10	99615	99624	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8	NC_007765	CGGTG	2	10	126924	126933	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_007765	GCGCG	2	10	146273	146282	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10	NC_007765	CATTT	2	10	163169	163178	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_007765	ATTTT	2	10	163345	163354	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007765	GTTCT	2	10	163522	163531	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_007765	CCTTT	2	10	164292	164301	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_007765	CGTTG	2	10	172596	172605	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_007765	CACAG	2	10	172911	172920	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_007765	GGCGG	2	10	173586	173595	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
17	NC_007765	CGCGC	2	10	192563	192572	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18	NC_007765	CGTGT	2	10	200288	200297	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_007765	TCGCC	2	10	217743	217752	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_007765	TATTG	2	10	218826	218835	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007765	CCGAG	2	10	222072	222081	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_007765	ACGAC	2	10	230692	230701	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_007765	ATGTA	2	10	230813	230822	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007765	ATCCT	2	10	251472	251481	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_007765	CGCGA	2	10	255667	255676	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_007765	ATTTC	2	10	272796	272805	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_007765	ACTGG	2	10	285528	285537	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_007765	AGACA	2	10	301912	301921	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_007765	ACGCC	2	10	302500	302509	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_007765	GGCAG	2	10	318688	318697	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_007765	ATTAC	2	10	334249	334258	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_007765	GCTGC	2	10	382967	382976	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_007765	ATGCG	2	10	400746	400755	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_007765	GGCGC	2	10	400813	400822	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
35	NC_007765	TCACA	2	10	404944	404953	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_007765	CCCCT	2	10	411632	411641	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
37	NC_007765	TTTCG	2	10	413592	413601	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_007765	CATAT	2	10	417833	417842	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_007765	ACTTT	2	10	449361	449370	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_007765	TCACT	2	10	454548	454557	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_007765	TCCCT	2	10	468124	468133	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
42	NC_007765	GCCTC	2	10	476967	476976	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
43	NC_007765	GGCGC	2	10	478105	478114	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.