MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42e

Total Repeats: 127

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007765	A	7	7	3502	3508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007765	C	6	6	17226	17231	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3	NC_007765	A	7	7	18828	18834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007765	C	6	6	22668	22673	0 %	0 %	0 %	100 %	86360294
5	NC_007765	A	6	6	24277	24282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007765	T	6	6	30054	30059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007765	T	6	6	30326	30331	0 %	100 %	0 %	0 %	86360301
8	NC_007765	C	6	6	33977	33982	0 %	0 %	0 %	100 %	86360303
9	NC_007765	T	6	6	40313	40318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007765	G	6	6	52024	52029	0 %	0 %	100 %	0 %	86360318
11	NC_007765	T	6	6	57667	57672	0 %	100 %	0 %	0 %	86360322
12	NC_007765	A	6	6	64780	64785	100 %	0 %	0 %	0 %	86360327
13	NC_007765	T	6	6	64935	64940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007765	T	7	7	76872	76878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007765	A	6	6	79567	79572	100 %	0 %	0 %	0 %	86360345
16	NC_007765	T	6	6	81029	81034	0 %	100 %	0 %	0 %	86360347
17	NC_007765	C	6	6	84173	84178	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18	NC_007765	C	6	6	84282	84287	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19	NC_007765	G	6	6	84310	84315	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007765	G	6	6	88527	88532	0 %	0 %	100 %	0 %	86360352
21	NC_007765	C	6	6	110788	110793	0 %	0 %	0 %	100 %	86360373
22	NC_007765	C	6	6	114756	114761	0 %	0 %	0 %	100 %	86360377
23	NC_007765	G	6	6	116973	116978	0 %	0 %	100 %	0 %	86360378
24	NC_007765	C	6	6	117397	117402	0 %	0 %	0 %	100 %	86360379
25	NC_007765	A	6	6	126135	126140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007765	A	6	6	129120	129125	100 %	0 %	0 %	0 %	86360387
27	NC_007765	A	6	6	135246	135251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007765	T	7	7	136347	136353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007765	T	6	6	136371	136376	0 %	100 %	0 %	0 %	86360394
30	NC_007765	C	6	6	136405	136410	0 %	0 %	0 %	100 %	86360394
31	NC_007765	T	6	6	142739	142744	0 %	100 %	0 %	0 %	86360397
32	NC_007765	T	7	7	143134	143140	0 %	100 %	0 %	0 %	86360397
33	NC_007765	T	6	6	146491	146496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007765	T	6	6	149146	149151	0 %	100 %	0 %	0 %	86360401
35	NC_007765	T	6	6	153221	153226	0 %	100 %	0 %	0 %	86360406
36	NC_007765	A	6	6	153943	153948	100 %	0 %	0 %	0 %	86360406
37	NC_007765	A	6	6	156903	156908	100 %	0 %	0 %	0 %	86360408
38	NC_007765	T	6	6	164299	164304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007765	T	6	6	185347	185352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007765	T	7	7	185540	185546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007765	C	6	6	187292	187297	0 %	0 %	0 %	100 %	86360434
42	NC_007765	A	7	7	187773	187779	100 %	0 %	0 %	0 %	86360434
43	NC_007765	C	6	6	188762	188767	0 %	0 %	0 %	100 %	86360435
44	NC_007765	C	6	6	189164	189169	0 %	0 %	0 %	100 %	86360436
45	NC_007765	C	6	6	190683	190688	0 %	0 %	0 %	100 %	86360436
46	NC_007765	G	6	6	191479	191484	0 %	0 %	100 %	0 %	86360436
47	NC_007765	T	6	6	196754	196759	0 %	100 %	0 %	0 %	86360445
48	NC_007765	A	6	6	199251	199256	100 %	0 %	0 %	0 %	86360447
49	NC_007765	A	7	7	203416	203422	100 %	0 %	0 %	0 %	86360451
50	NC_007765	T	6	6	215866	215871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007765	A	7	7	218793	218799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007765	A	6	6	221675	221680	100 %	0 %	0 %	0 %	86360463
53	NC_007765	A	6	6	231080	231085	100 %	0 %	0 %	0 %	86360471
54	NC_007765	T	7	7	231344	231350	0 %	100 %	0 %	0 %	86360471
55	NC_007765	C	6	6	231840	231845	0 %	0 %	0 %	100 %	86360471
56	NC_007765	T	6	6	232321	232326	0 %	100 %	0 %	0 %	86360472
57	NC_007765	A	6	6	238684	238689	100 %	0 %	0 %	0 %	86360478
58	NC_007765	A	6	6	240366	240371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007765	G	6	6	240677	240682	0 %	0 %	100 %	0 %	86360480
60	NC_007765	A	6	6	243454	243459	100 %	0 %	0 %	0 %	86360482
61	NC_007765	T	6	6	254984	254989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007765	C	6	6	264251	264256	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
63	NC_007765	T	6	6	264613	264618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007765	T	6	6	267055	267060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007765	A	6	6	267154	267159	100 %	0 %	0 %	0 %	86360508
66	NC_007765	T	6	6	271437	271442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007765	A	6	6	274761	274766	100 %	0 %	0 %	0 %	86360519
68	NC_007765	T	6	6	276768	276773	0 %	100 %	0 %	0 %	86360520
69	NC_007765	C	6	6	281026	281031	0 %	0 %	0 %	100 %	86360525
70	NC_007765	A	6	6	281877	281882	100 %	0 %	0 %	0 %	86360525
71	NC_007765	T	6	6	288705	288710	0 %	100 %	0 %	0 %	86360530
72	NC_007765	T	7	7	291857	291863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007765	T	6	6	295439	295444	0 %	100 %	0 %	0 %	86360537
74	NC_007765	T	6	6	307500	307505	0 %	100 %	0 %	0 %	86360546
75	NC_007765	C	6	6	308077	308082	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
76	NC_007765	A	6	6	309340	309345	100 %	0 %	0 %	0 %	86360548
77	NC_007765	T	8	8	313895	313902	0 %	100 %	0 %	0 %	86360553
78	NC_007765	T	6	6	322412	322417	0 %	100 %	0 %	0 %	86360561
79	NC_007765	C	7	7	328247	328253	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
80	NC_007765	C	6	6	334393	334398	0 %	0 %	0 %	100 %	86360573
81	NC_007765	A	6	6	334466	334471	100 %	0 %	0 %	0 %	86360573
82	NC_007765	A	7	7	339963	339969	100 %	0 %	0 %	0 %	86360577
83	NC_007765	T	6	6	341448	341453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007765	G	6	6	344813	344818	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007765	A	6	6	348831	348836	100 %	0 %	0 %	0 %	86360586
86	NC_007765	T	6	6	351732	351737	0 %	100 %	0 %	0 %	86360589
87	NC_007765	A	8	8	355249	355256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007765	A	6	6	355290	355295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007765	G	6	6	361163	361168	0 %	0 %	100 %	0 %	86360599
90	NC_007765	T	6	6	369044	369049	0 %	100 %	0 %	0 %	86360606
91	NC_007765	T	6	6	369810	369815	0 %	100 %	0 %	0 %	86360607
92	NC_007765	G	6	6	370525	370530	0 %	0 %	100 %	0 %	86360608
93	NC_007765	T	7	7	373077	373083	0 %	100 %	0 %	0 %	86360612
94	NC_007765	T	7	7	380059	380065	0 %	100 %	0 %	0 %	86360619
95	NC_007765	G	6	6	387961	387966	0 %	0 %	100 %	0 %	86360625
96	NC_007765	A	6	6	390601	390606	100 %	0 %	0 %	0 %	86360628
97	NC_007765	A	6	6	396854	396859	100 %	0 %	0 %	0 %	86360633
98	NC_007765	A	6	6	401490	401495	100 %	0 %	0 %	0 %	86360636
99	NC_007765	A	6	6	409344	409349	100 %	0 %	0 %	0 %	86360642
100	NC_007765	A	6	6	410316	410321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007765	T	6	6	414520	414525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007765	T	6	6	414813	414818	0 %	100 %	0 %	0 %	86360649
103	NC_007765	T	6	6	427586	427591	0 %	100 %	0 %	0 %	86360663
104	NC_007765	C	6	6	428710	428715	0 %	0 %	0 %	100 %	86360663
105	NC_007765	A	6	6	443010	443015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007765	T	6	6	446044	446049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007765	C	6	6	447193	447198	0 %	0 %	0 %	100 %	86360678
108	NC_007765	A	6	6	447354	447359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007765	G	6	6	449610	449615	0 %	0 %	100 %	0 %	86360680
110	NC_007765	T	6	6	457185	457190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007765	A	6	6	466735	466740	100 %	0 %	0 %	0 %	86360696
112	NC_007765	T	6	6	466882	466887	0 %	100 %	0 %	0 %	86360696
113	NC_007765	T	6	6	467053	467058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007765	C	6	6	467851	467856	0 %	0 %	0 %	100 %	86360697
115	NC_007765	A	6	6	468629	468634	100 %	0 %	0 %	0 %	86360698
116	NC_007765	G	6	6	468676	468681	0 %	0 %	100 %	0 %	86360698
117	NC_007765	G	6	6	469984	469989	0 %	0 %	100 %	0 %	86360700
118	NC_007765	A	6	6	473736	473741	100 %	0 %	0 %	0 %	86360702
119	NC_007765	C	6	6	478913	478918	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
120	NC_007765	T	6	6	478939	478944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007765	T	6	6	487433	487438	0 %	100 %	0 %	0 %	86360715
122	NC_007765	T	6	6	489621	489626	0 %	100 %	0 %	0 %	86360717
123	NC_007765	C	7	7	497251	497257	0 %	0 %	0 %	100 %	86360725
124	NC_007765	T	6	6	499749	499754	0 %	100 %	0 %	0 %	86360729
125	NC_007765	A	6	6	503976	503981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007765	A	6	6	504104	504109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007765	A	6	6	504847	504852	100 %	0 %	0 %	0 %	86360733

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.