MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42e

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007765	C	6	6	22668	22673	0 %	0 %	0 %	100 %	86360294
2	NC_007765	T	6	6	30326	30331	0 %	100 %	0 %	0 %	86360301
3	NC_007765	C	6	6	33977	33982	0 %	0 %	0 %	100 %	86360303
4	NC_007765	G	6	6	52024	52029	0 %	0 %	100 %	0 %	86360318
5	NC_007765	T	6	6	57667	57672	0 %	100 %	0 %	0 %	86360322
6	NC_007765	A	6	6	64780	64785	100 %	0 %	0 %	0 %	86360327
7	NC_007765	A	6	6	79567	79572	100 %	0 %	0 %	0 %	86360345
8	NC_007765	T	6	6	81029	81034	0 %	100 %	0 %	0 %	86360347
9	NC_007765	G	6	6	88527	88532	0 %	0 %	100 %	0 %	86360352
10	NC_007765	C	6	6	110788	110793	0 %	0 %	0 %	100 %	86360373
11	NC_007765	C	6	6	114756	114761	0 %	0 %	0 %	100 %	86360377
12	NC_007765	G	6	6	116973	116978	0 %	0 %	100 %	0 %	86360378
13	NC_007765	C	6	6	117397	117402	0 %	0 %	0 %	100 %	86360379
14	NC_007765	A	6	6	129120	129125	100 %	0 %	0 %	0 %	86360387
15	NC_007765	T	6	6	136371	136376	0 %	100 %	0 %	0 %	86360394
16	NC_007765	C	6	6	136405	136410	0 %	0 %	0 %	100 %	86360394
17	NC_007765	T	6	6	142739	142744	0 %	100 %	0 %	0 %	86360397
18	NC_007765	T	7	7	143134	143140	0 %	100 %	0 %	0 %	86360397
19	NC_007765	T	6	6	149146	149151	0 %	100 %	0 %	0 %	86360401
20	NC_007765	T	6	6	153221	153226	0 %	100 %	0 %	0 %	86360406
21	NC_007765	A	6	6	153943	153948	100 %	0 %	0 %	0 %	86360406
22	NC_007765	A	6	6	156903	156908	100 %	0 %	0 %	0 %	86360408
23	NC_007765	C	6	6	187292	187297	0 %	0 %	0 %	100 %	86360434
24	NC_007765	A	7	7	187773	187779	100 %	0 %	0 %	0 %	86360434
25	NC_007765	C	6	6	188762	188767	0 %	0 %	0 %	100 %	86360435
26	NC_007765	C	6	6	189164	189169	0 %	0 %	0 %	100 %	86360436
27	NC_007765	C	6	6	190683	190688	0 %	0 %	0 %	100 %	86360436
28	NC_007765	G	6	6	191479	191484	0 %	0 %	100 %	0 %	86360436
29	NC_007765	T	6	6	196754	196759	0 %	100 %	0 %	0 %	86360445
30	NC_007765	A	6	6	199251	199256	100 %	0 %	0 %	0 %	86360447
31	NC_007765	A	7	7	203416	203422	100 %	0 %	0 %	0 %	86360451
32	NC_007765	A	6	6	221675	221680	100 %	0 %	0 %	0 %	86360463
33	NC_007765	A	6	6	231080	231085	100 %	0 %	0 %	0 %	86360471
34	NC_007765	T	7	7	231344	231350	0 %	100 %	0 %	0 %	86360471
35	NC_007765	C	6	6	231840	231845	0 %	0 %	0 %	100 %	86360471
36	NC_007765	T	6	6	232321	232326	0 %	100 %	0 %	0 %	86360472
37	NC_007765	A	6	6	238684	238689	100 %	0 %	0 %	0 %	86360478
38	NC_007765	G	6	6	240677	240682	0 %	0 %	100 %	0 %	86360480
39	NC_007765	A	6	6	243454	243459	100 %	0 %	0 %	0 %	86360482
40	NC_007765	A	6	6	267154	267159	100 %	0 %	0 %	0 %	86360508
41	NC_007765	A	6	6	274761	274766	100 %	0 %	0 %	0 %	86360519
42	NC_007765	T	6	6	276768	276773	0 %	100 %	0 %	0 %	86360520
43	NC_007765	C	6	6	281026	281031	0 %	0 %	0 %	100 %	86360525
44	NC_007765	A	6	6	281877	281882	100 %	0 %	0 %	0 %	86360525
45	NC_007765	T	6	6	288705	288710	0 %	100 %	0 %	0 %	86360530
46	NC_007765	T	6	6	295439	295444	0 %	100 %	0 %	0 %	86360537
47	NC_007765	T	6	6	307500	307505	0 %	100 %	0 %	0 %	86360546
48	NC_007765	A	6	6	309340	309345	100 %	0 %	0 %	0 %	86360548
49	NC_007765	T	8	8	313895	313902	0 %	100 %	0 %	0 %	86360553
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51	NC_007765	C	6	6	334393	334398	0 %	0 %	0 %	100 %	86360573
52	NC_007765	A	6	6	334466	334471	100 %	0 %	0 %	0 %	86360573
53	NC_007765	A	7	7	339963	339969	100 %	0 %	0 %	0 %	86360577
54	NC_007765	A	6	6	348831	348836	100 %	0 %	0 %	0 %	86360586
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60	NC_007765	T	7	7	373077	373083	0 %	100 %	0 %	0 %	86360612
61	NC_007765	T	7	7	380059	380065	0 %	100 %	0 %	0 %	86360619
62	NC_007765	G	6	6	387961	387966	0 %	0 %	100 %	0 %	86360625
63	NC_007765	A	6	6	390601	390606	100 %	0 %	0 %	0 %	86360628
64	NC_007765	A	6	6	396854	396859	100 %	0 %	0 %	0 %	86360633
65	NC_007765	A	6	6	401490	401495	100 %	0 %	0 %	0 %	86360636
66	NC_007765	A	6	6	409344	409349	100 %	0 %	0 %	0 %	86360642
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77	NC_007765	G	6	6	469984	469989	0 %	0 %	100 %	0 %	86360700
78	NC_007765	A	6	6	473736	473741	100 %	0 %	0 %	0 %	86360702
79	NC_007765	T	6	6	487433	487438	0 %	100 %	0 %	0 %	86360715
80	NC_007765	T	6	6	489621	489626	0 %	100 %	0 %	0 %	86360717
81	NC_007765	C	7	7	497251	497257	0 %	0 %	0 %	100 %	86360725
82	NC_007765	T	6	6	499749	499754	0 %	100 %	0 %	0 %	86360729
83	NC_007765	A	6	6	504847	504852	100 %	0 %	0 %	0 %	86360733

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.