MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42c

Total Repeats: 648

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007764	CCGT	2	8	21	28	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007764	TACC	2	8	1327	1334	25 %	25 %	0 %	50 %	86360048
3	NC_007764	CGAT	2	8	2253	2260	25 %	25 %	25 %	25 %	86360049
4	NC_007764	CGGC	2	8	3225	3232	0 %	0 %	50 %	50 %	86360049
5	NC_007764	GCGA	2	8	3575	3582	25 %	0 %	50 %	25 %	86360050
6	NC_007764	CATG	2	8	3613	3620	25 %	25 %	25 %	25 %	86360050
7	NC_007764	ATCA	2	8	4217	4224	50 %	25 %	0 %	25 %	86360050
8	NC_007764	CACC	2	8	4974	4981	25 %	0 %	0 %	75 %	86360051
9	NC_007764	GTCG	2	8	5922	5929	0 %	25 %	50 %	25 %	86360052
10	NC_007764	ATCA	2	8	6241	6248	50 %	25 %	0 %	25 %	86360052
11	NC_007764	ACCA	2	8	7486	7493	50 %	0 %	0 %	50 %	86360053
12	NC_007764	CCCG	2	8	7860	7867	0 %	0 %	25 %	75 %	86360053
13	NC_007764	GACG	2	8	7900	7907	25 %	0 %	50 %	25 %	86360054
14	NC_007764	TGGC	2	8	8017	8024	0 %	25 %	50 %	25 %	86360054
15	NC_007764	ACCA	2	8	8502	8509	50 %	0 %	0 %	50 %	86360054
16	NC_007764	CGCA	2	8	8644	8651	25 %	0 %	25 %	50 %	86360054
17	NC_007764	GATC	2	8	8721	8728	25 %	25 %	25 %	25 %	86360054
18	NC_007764	GCCG	3	12	9251	9262	0 %	0 %	50 %	50 %	86360055
19	NC_007764	CGGC	2	8	9486	9493	0 %	0 %	50 %	50 %	86360055
20	NC_007764	GCCG	2	8	9497	9504	0 %	0 %	50 %	50 %	86360055
21	NC_007764	CGAC	2	8	10604	10611	25 %	0 %	25 %	50 %	86360056
22	NC_007764	GATC	2	8	11015	11022	25 %	25 %	25 %	25 %	86360057
23	NC_007764	ATGA	2	8	11320	11327	50 %	25 %	25 %	0 %	86360058
24	NC_007764	TTGC	2	8	12539	12546	0 %	50 %	25 %	25 %	86360060
25	NC_007764	TCTG	2	8	13059	13066	0 %	50 %	25 %	25 %	86360061
26	NC_007764	GGCC	2	8	13291	13298	0 %	0 %	50 %	50 %	86360061
27	NC_007764	TTGC	2	8	13567	13574	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_007764	CGAA	2	8	13905	13912	50 %	0 %	25 %	25 %	86360062
29	NC_007764	GATC	2	8	14516	14523	25 %	25 %	25 %	25 %	86360063
30	NC_007764	TCGA	2	8	14637	14644	25 %	25 %	25 %	25 %	86360063
31	NC_007764	GACC	2	8	14854	14861	25 %	0 %	25 %	50 %	86360063
32	NC_007764	GGAA	2	8	15051	15058	50 %	0 %	50 %	0 %	86360063
33	NC_007764	GCAA	2	8	16270	16277	50 %	0 %	25 %	25 %	86360064
34	NC_007764	GTGA	2	8	16450	16457	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007764	GCCG	3	12	16664	16675	0 %	0 %	50 %	50 %	86360065
36	NC_007764	GGTC	2	8	17278	17285	0 %	25 %	50 %	25 %	86360065
37	NC_007764	GGCC	2	8	17317	17324	0 %	0 %	50 %	50 %	86360065
38	NC_007764	CTGG	2	8	17573	17580	0 %	25 %	50 %	25 %	86360065
39	NC_007764	GCGG	2	8	18627	18634	0 %	0 %	75 %	25 %	86360066
40	NC_007764	GGGC	2	8	19096	19103	0 %	0 %	75 %	25 %	86360067
41	NC_007764	CGGT	2	8	19189	19196	0 %	25 %	50 %	25 %	86360067
42	NC_007764	GGGC	2	8	19493	19500	0 %	0 %	75 %	25 %	86360067
43	NC_007764	GATC	2	8	19610	19617	25 %	25 %	25 %	25 %	86360068
44	NC_007764	CGGC	2	8	19775	19782	0 %	0 %	50 %	50 %	86360068
45	NC_007764	CTGC	2	8	19831	19838	0 %	25 %	25 %	50 %	86360068
46	NC_007764	GCAA	2	8	20019	20026	50 %	0 %	25 %	25 %	86360068
47	NC_007764	AAGG	2	8	20077	20084	50 %	0 %	50 %	0 %	86360068
48	NC_007764	GCAA	2	8	20919	20926	50 %	0 %	25 %	25 %	86360069
49	NC_007764	CCGA	2	8	21051	21058	25 %	0 %	25 %	50 %	86360069
50	NC_007764	GCCA	2	8	21407	21414	25 %	0 %	25 %	50 %	86360070
51	NC_007764	GCAT	2	8	21474	21481	25 %	25 %	25 %	25 %	86360070
52	NC_007764	CAGC	2	8	22862	22869	25 %	0 %	25 %	50 %	86360071
53	NC_007764	AGGC	2	8	22984	22991	25 %	0 %	50 %	25 %	86360071
54	NC_007764	TCGA	2	8	23430	23437	25 %	25 %	25 %	25 %	86360071
55	NC_007764	CGAC	2	8	24429	24436	25 %	0 %	25 %	50 %	86360073
56	NC_007764	TGCC	2	8	24774	24781	0 %	25 %	25 %	50 %	86360073
57	NC_007764	GATC	2	8	25816	25823	25 %	25 %	25 %	25 %	86360074
58	NC_007764	CTGG	2	8	26398	26405	0 %	25 %	50 %	25 %	86360075
59	NC_007764	GTTC	2	8	26542	26549	0 %	50 %	25 %	25 %	86360075
60	NC_007764	TCGA	2	8	26748	26755	25 %	25 %	25 %	25 %	86360075
61	NC_007764	GGTG	2	8	27328	27335	0 %	25 %	75 %	0 %	86360076
62	NC_007764	CACG	2	8	27625	27632	25 %	0 %	25 %	50 %	86360076
63	NC_007764	GCCG	2	8	28574	28581	0 %	0 %	50 %	50 %	86360077
64	NC_007764	TCGG	2	8	31450	31457	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_007764	CTCC	2	8	31510	31517	0 %	25 %	0 %	75 %	86360081
66	NC_007764	GCGA	2	8	32163	32170	25 %	0 %	50 %	25 %	86360081
67	NC_007764	GGCA	2	8	34456	34463	25 %	0 %	50 %	25 %	86360084
68	NC_007764	GCTG	2	8	34575	34582	0 %	25 %	50 %	25 %	86360084
69	NC_007764	GGGC	2	8	34599	34606	0 %	0 %	75 %	25 %	86360084
70	NC_007764	GAAC	2	8	34941	34948	50 %	0 %	25 %	25 %	86360084
71	NC_007764	AGCC	2	8	36003	36010	25 %	0 %	25 %	50 %	86360085
72	NC_007764	CGGC	2	8	36238	36245	0 %	0 %	50 %	50 %	86360085
73	NC_007764	TGGA	2	8	36479	36486	25 %	25 %	50 %	0 %	86360085
74	NC_007764	AGGA	2	8	36741	36748	50 %	0 %	50 %	0 %	86360085
75	NC_007764	CAGC	2	8	36761	36768	25 %	0 %	25 %	50 %	86360085
76	NC_007764	AAAT	2	8	37386	37393	75 %	25 %	0 %	0 %	86360085
77	NC_007764	GCGA	2	8	37981	37988	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_007764	TCGA	2	8	38025	38032	25 %	25 %	25 %	25 %	86360086
79	NC_007764	CTTC	2	8	38273	38280	0 %	50 %	0 %	50 %	86360086
80	NC_007764	CGGT	2	8	38482	38489	0 %	25 %	50 %	25 %	86360086
81	NC_007764	TTGC	2	8	38568	38575	0 %	50 %	25 %	25 %	86360086
82	NC_007764	GGCG	2	8	39622	39629	0 %	0 %	75 %	25 %	86360087
83	NC_007764	CGAA	2	8	40155	40162	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_007764	CGAT	2	8	40407	40414	25 %	25 %	25 %	25 %	86360088
85	NC_007764	CGTC	2	8	40813	40820	0 %	25 %	25 %	50 %	86360088
86	NC_007764	CCGG	2	8	40852	40859	0 %	0 %	50 %	50 %	86360088
87	NC_007764	GAGG	2	8	40878	40885	25 %	0 %	75 %	0 %	86360088
88	NC_007764	GACC	2	8	41097	41104	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_007764	CCGC	2	8	41131	41138	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
90	NC_007764	TCGC	2	8	41568	41575	0 %	25 %	25 %	50 %	86360089
91	NC_007764	GGCG	2	8	41715	41722	0 %	0 %	75 %	25 %	86360089
92	NC_007764	TCAT	2	8	42326	42333	25 %	50 %	0 %	25 %	86360089
93	NC_007764	ATCT	2	8	42439	42446	25 %	50 %	0 %	25 %	86360089
94	NC_007764	GGTC	2	8	43378	43385	0 %	25 %	50 %	25 %	86360090
95	NC_007764	GGCC	2	8	43867	43874	0 %	0 %	50 %	50 %	86360090
96	NC_007764	AGAA	2	8	44260	44267	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007764	ACCG	2	8	44461	44468	25 %	0 %	25 %	50 %	86360091
98	NC_007764	CGTC	2	8	44548	44555	0 %	25 %	25 %	50 %	86360091
99	NC_007764	GTCC	2	8	44698	44705	0 %	25 %	25 %	50 %	86360091
100	NC_007764	CTGG	2	8	44786	44793	0 %	25 %	50 %	25 %	86360091
101	NC_007764	CGGT	2	8	44848	44855	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_007764	GACA	2	8	45417	45424	50 %	0 %	25 %	25 %	86360092
103	NC_007764	CTGT	2	8	45649	45656	0 %	50 %	25 %	25 %	86360093
104	NC_007764	GCAT	2	8	45745	45752	25 %	25 %	25 %	25 %	86360093
105	NC_007764	GTCC	2	8	47114	47121	0 %	25 %	25 %	50 %	86360095
106	NC_007764	GCAG	2	8	47613	47620	25 %	0 %	50 %	25 %	86360096
107	NC_007764	CGAT	2	8	47830	47837	25 %	25 %	25 %	25 %	86360096
108	NC_007764	TCTG	2	8	47950	47957	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_007764	TGGA	2	8	48924	48931	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007764	GAAC	2	8	49115	49122	50 %	0 %	25 %	25 %	86360098
111	NC_007764	CGGC	2	8	49139	49146	0 %	0 %	50 %	50 %	86360098
112	NC_007764	AAGC	2	8	49487	49494	50 %	0 %	25 %	25 %	86360098
113	NC_007764	CCGC	2	8	49597	49604	0 %	0 %	25 %	75 %	86360098
114	NC_007764	CGGG	3	12	50216	50227	0 %	0 %	75 %	25 %	86360099
115	NC_007764	CTGC	2	8	50271	50278	0 %	25 %	25 %	50 %	86360099
116	NC_007764	CGGT	2	8	50596	50603	0 %	25 %	50 %	25 %	86360099
117	NC_007764	GGCA	2	8	51468	51475	25 %	0 %	50 %	25 %	86360100
118	NC_007764	CGGC	2	8	51588	51595	0 %	0 %	50 %	50 %	86360100
119	NC_007764	GAAG	2	8	51681	51688	50 %	0 %	50 %	0 %	86360100
120	NC_007764	CGAT	2	8	51960	51967	25 %	25 %	25 %	25 %	86360100
121	NC_007764	TTGC	2	8	52417	52424	0 %	50 %	25 %	25 %	86360100
122	NC_007764	CGAG	2	8	52869	52876	25 %	0 %	50 %	25 %	86360100
123	NC_007764	ATCG	2	8	53029	53036	25 %	25 %	25 %	25 %	86360100
124	NC_007764	GGCG	2	8	53058	53065	0 %	0 %	75 %	25 %	86360100
125	NC_007764	GACA	2	8	53185	53192	50 %	0 %	25 %	25 %	86360100
126	NC_007764	CGAC	2	8	53577	53584	25 %	0 %	25 %	50 %	86360100
127	NC_007764	CGGA	2	8	54561	54568	25 %	0 %	50 %	25 %	86360101
128	NC_007764	CCAC	2	8	55197	55204	25 %	0 %	0 %	75 %	86360101
129	NC_007764	AGGA	2	8	55774	55781	50 %	0 %	50 %	0 %	86360102
130	NC_007764	CGAC	2	8	56086	56093	25 %	0 %	25 %	50 %	86360102
131	NC_007764	GTCC	2	8	56354	56361	0 %	25 %	25 %	50 %	86360102
132	NC_007764	CCGG	2	8	56735	56742	0 %	0 %	50 %	50 %	86360103
133	NC_007764	CCGG	2	8	57186	57193	0 %	0 %	50 %	50 %	86360103
134	NC_007764	CGGG	2	8	57466	57473	0 %	0 %	75 %	25 %	86360103
135	NC_007764	CAGG	2	8	57559	57566	25 %	0 %	50 %	25 %	86360103
136	NC_007764	GACG	2	8	57771	57778	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_007764	AGCC	2	8	58206	58213	25 %	0 %	25 %	50 %	86360104
138	NC_007764	CTCG	2	8	58272	58279	0 %	25 %	25 %	50 %	86360104
139	NC_007764	TCGC	2	8	59041	59048	0 %	25 %	25 %	50 %	86360104
140	NC_007764	TGAT	2	8	59422	59429	25 %	50 %	25 %	0 %	86360105
141	NC_007764	GGAT	2	8	59446	59453	25 %	25 %	50 %	0 %	86360105
142	NC_007764	ATCG	2	8	59541	59548	25 %	25 %	25 %	25 %	86360105
143	NC_007764	GAGC	3	12	59583	59594	25 %	0 %	50 %	25 %	86360105
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