MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42c

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007764	CCGT	2	8	21	28	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007764	TTGC	2	8	13567	13574	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_007764	GTGA	2	8	16450	16457	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007764	TCGG	2	8	31450	31457	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007764	GCGA	2	8	37981	37988	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_007764	CGAA	2	8	40155	40162	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_007764	GACC	2	8	41097	41104	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_007764	CCGC	2	8	41131	41138	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9	NC_007764	AGAA	2	8	44260	44267	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007764	CGGT	2	8	44848	44855	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_007764	TCTG	2	8	47950	47957	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_007764	TGGA	2	8	48924	48931	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007764	GACG	2	8	57771	57778	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_007764	GGGC	2	8	75817	75824	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15	NC_007764	CGCA	2	8	75863	75870	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_007764	ATCA	2	8	76071	76078	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_007764	ATGT	2	8	78299	78306	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007764	GGAT	2	8	79942	79949	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007764	GCAA	2	8	86815	86822	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_007764	GTGC	2	8	95631	95638	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_007764	GCAT	2	8	95664	95671	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_007764	CGAC	2	8	95815	95822	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_007764	AAAC	2	8	95932	95939	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_007764	GCGG	2	8	96211	96218	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
25	NC_007764	AGCG	2	8	96225	96232	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_007764	GGAC	2	8	103014	103021	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_007764	GGAC	2	8	103075	103082	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_007764	TATC	2	8	104497	104504	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_007764	ACCC	2	8	104527	104534	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
30	NC_007764	CTTT	2	8	106185	106192	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_007764	GCCG	2	8	106202	106209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_007764	TCCC	2	8	113681	113688	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
33	NC_007764	GCCG	2	8	115879	115886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_007764	CGCC	2	8	118567	118574	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
35	NC_007764	CCGC	2	8	118720	118727	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
36	NC_007764	TGAT	2	8	118845	118852	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007764	GGCG	2	8	119044	119051	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
38	NC_007764	CGCC	2	8	121167	121174	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_007764	GATC	2	8	124757	124764	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_007764	GCCT	2	8	126957	126964	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_007764	TCGG	2	8	127385	127392	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_007764	TCTG	2	8	148400	148407	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_007764	CGCC	2	8	149141	149148	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
44	NC_007764	AGGC	2	8	151231	151238	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_007764	AAAT	2	8	151341	151348	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007764	GGAT	2	8	163589	163596	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007764	CGGA	2	8	173738	173745	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_007764	TTCT	2	8	174776	174783	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_007764	CGAA	2	8	188156	188163	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_007764	CCGC	2	8	199164	199171	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
51	NC_007764	CAGA	2	8	204162	204169	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_007764	GGGT	2	8	204289	204296	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007764	TTGC	2	8	209854	209861	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_007764	GAAA	2	8	222184	222191	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007764	GCCG	2	8	222198	222205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_007764	TTGA	2	8	222469	222476	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007764	CGCC	2	8	223387	223394	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
58	NC_007764	AGGC	2	8	223482	223489	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_007764	TCGC	2	8	223712	223719	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_007764	CGTT	2	8	223803	223810	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_007764	TAGT	2	8	225102	225109	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007764	GGAG	2	8	227126	227133	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007764	AGGA	2	8	234552	234559	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007764	GAGC	2	8	235152	235159	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_007764	GCCA	2	8	235202	235209	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_007764	AGGC	2	8	235457	235464	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_007764	GATC	2	8	235569	235576	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_007764	GCAA	2	8	235747	235754	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_007764	CGGG	2	8	238110	238117	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
70	NC_007764	GCTC	2	8	244106	244113	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_007764	CCGA	2	8	245023	245030	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.