MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42c

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007764	T	6	6	6001	6006	0 %	100 %	0 %	0 %	86360052
2	NC_007764	T	6	6	10632	10637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007764	A	6	6	33703	33708	100 %	0 %	0 %	0 %	86360083
4	NC_007764	T	7	7	37928	37934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007764	C	6	6	43486	43491	0 %	0 %	0 %	100 %	86360090
6	NC_007764	C	7	7	49031	49037	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7	NC_007764	G	6	6	50001	50006	0 %	0 %	100 %	0 %	86360099
8	NC_007764	G	6	6	50668	50673	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007764	C	6	6	57900	57905	0 %	0 %	0 %	100 %	86360104
10	NC_007764	G	6	6	57936	57941	0 %	0 %	100 %	0 %	86360104
11	NC_007764	A	6	6	74023	74028	100 %	0 %	0 %	0 %	86360118
12	NC_007764	T	6	6	78407	78412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007764	T	6	6	80235	80240	0 %	100 %	0 %	0 %	86360123
14	NC_007764	G	6	6	83754	83759	0 %	0 %	100 %	0 %	86360126
15	NC_007764	G	6	6	84105	84110	0 %	0 %	100 %	0 %	86360126
16	NC_007764	G	6	6	94177	94182	0 %	0 %	100 %	0 %	86360136
17	NC_007764	A	6	6	95193	95198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007764	A	6	6	95401	95406	100 %	0 %	0 %	0 %	86360138
19	NC_007764	T	6	6	101151	101156	0 %	100 %	0 %	0 %	86360139
20	NC_007764	T	6	6	103665	103670	0 %	100 %	0 %	0 %	86360142
21	NC_007764	T	6	6	105702	105707	0 %	100 %	0 %	0 %	86360143
22	NC_007764	T	6	6	106666	106671	0 %	100 %	0 %	0 %	86360145
23	NC_007764	A	7	7	107114	107120	100 %	0 %	0 %	0 %	86360145
24	NC_007764	T	6	6	109856	109861	0 %	100 %	0 %	0 %	86360148
25	NC_007764	A	6	6	111293	111298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007764	G	6	6	115831	115836	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007764	A	6	6	127331	127336	100 %	0 %	0 %	0 %	86360164
28	NC_007764	C	6	6	127467	127472	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29	NC_007764	T	6	6	129190	129195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007764	A	6	6	136678	136683	100 %	0 %	0 %	0 %	86360172
31	NC_007764	G	6	6	137870	137875	0 %	0 %	100 %	0 %	86360174
32	NC_007764	C	6	6	145932	145937	0 %	0 %	0 %	100 %	86360180
33	NC_007764	T	7	7	148472	148478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007764	G	6	6	151127	151132	0 %	0 %	100 %	0 %	86360183
35	NC_007764	T	6	6	162345	162350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007764	A	6	6	163102	163107	100 %	0 %	0 %	0 %	86360195
37	NC_007764	T	6	6	166000	166005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007764	A	6	6	170639	170644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007764	A	6	6	175756	175761	100 %	0 %	0 %	0 %	86360209
40	NC_007764	T	7	7	182555	182561	0 %	100 %	0 %	0 %	86360214
41	NC_007764	G	6	6	189093	189098	0 %	0 %	100 %	0 %	86360219
42	NC_007764	C	6	6	206546	206551	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
43	NC_007764	G	6	6	208684	208689	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007764	A	7	7	209863	209869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007764	A	6	6	216020	216025	100 %	0 %	0 %	0 %	86360246
46	NC_007764	T	6	6	223410	223415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007764	A	6	6	223969	223974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007764	G	6	6	231175	231180	0 %	0 %	100 %	0 %	86360260
49	NC_007764	T	6	6	244151	244156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007764	A	6	6	245468	245473	100 %	0 %	0 %	0 %	86360272
51	NC_007764	A	8	8	245757	245764	100 %	0 %	0 %	0 %	86360272
52	NC_007764	T	6	6	247126	247131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007764	C	6	6	248017	248022	0 %	0 %	0 %	100 %	86360275
54	NC_007764	A	6	6	249499	249504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.