MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42b

Total Repeats: 514

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007763	CGGC	2	8	156	163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007763	CAAT	2	8	621	628	50 %	25 %	0 %	25 %	86359882
3	NC_007763	TGAT	2	8	939	946	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007763	CTGG	2	8	1116	1123	0 %	25 %	50 %	25 %	86359883
5	NC_007763	TCCG	2	8	2071	2078	0 %	25 %	25 %	50 %	86359883
6	NC_007763	AAAT	2	8	2232	2239	75 %	25 %	0 %	0 %	86359883
7	NC_007763	AAGG	2	8	2452	2459	50 %	0 %	50 %	0 %	86359883
8	NC_007763	GGCG	2	8	2538	2545	0 %	0 %	75 %	25 %	86359883
9	NC_007763	CCAG	2	8	3626	3633	25 %	0 %	25 %	50 %	86359884
10	NC_007763	GATC	2	8	4195	4202	25 %	25 %	25 %	25 %	86359884
11	NC_007763	GGCC	2	8	4537	4544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_007763	TGCC	2	8	5069	5076	0 %	25 %	25 %	50 %	86359885
13	NC_007763	GCCT	2	8	5082	5089	0 %	25 %	25 %	50 %	86359885
14	NC_007763	GGAA	2	8	6209	6216	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007763	GCCG	2	8	6386	6393	0 %	0 %	50 %	50 %	86359887
16	NC_007763	TCGC	2	8	6395	6402	0 %	25 %	25 %	50 %	86359887
17	NC_007763	CGAT	2	8	7643	7650	25 %	25 %	25 %	25 %	86359888
18	NC_007763	AGCG	2	8	7843	7850	25 %	0 %	50 %	25 %	86359888
19	NC_007763	CGGC	2	8	8071	8078	0 %	0 %	50 %	50 %	86359888
20	NC_007763	TCGC	2	8	8385	8392	0 %	25 %	25 %	50 %	86359889
21	NC_007763	TGCT	2	8	8415	8422	0 %	50 %	25 %	25 %	86359889
22	NC_007763	GGCC	2	8	8599	8606	0 %	0 %	50 %	50 %	86359889
23	NC_007763	CTCG	2	8	8707	8714	0 %	25 %	25 %	50 %	86359889
24	NC_007763	CAAG	2	8	8923	8930	50 %	0 %	25 %	25 %	86359889
25	NC_007763	GTCG	2	8	9109	9116	0 %	25 %	50 %	25 %	86359889
26	NC_007763	GCCA	2	8	9183	9190	25 %	0 %	25 %	50 %	86359889
27	NC_007763	TACC	2	8	9208	9215	25 %	25 %	0 %	50 %	86359889
28	NC_007763	GTCC	2	8	9388	9395	0 %	25 %	25 %	50 %	86359889
29	NC_007763	CGTG	2	8	10591	10598	0 %	25 %	50 %	25 %	86359890
30	NC_007763	CTCG	2	8	10729	10736	0 %	25 %	25 %	50 %	86359890
31	NC_007763	CGAC	2	8	11049	11056	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_007763	GAAA	2	8	11076	11083	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007763	GGCC	2	8	11322	11329	0 %	0 %	50 %	50 %	86359891
34	NC_007763	CTGA	2	8	11977	11984	25 %	25 %	25 %	25 %	86359891
35	NC_007763	AGCA	2	8	12572	12579	50 %	0 %	25 %	25 %	86359893
36	NC_007763	GGGC	2	8	12882	12889	0 %	0 %	75 %	25 %	86359893
37	NC_007763	GTCG	2	8	13474	13481	0 %	25 %	50 %	25 %	86359893
38	NC_007763	CCAG	2	8	13492	13499	25 %	0 %	25 %	50 %	86359893
39	NC_007763	CAGG	2	8	13796	13803	25 %	0 %	50 %	25 %	86359893
40	NC_007763	ACCA	2	8	13958	13965	50 %	0 %	0 %	50 %	86359893
41	NC_007763	TGTT	2	8	14028	14035	0 %	75 %	25 %	0 %	86359893
42	NC_007763	CATC	2	8	14098	14105	25 %	25 %	0 %	50 %	86359893
43	NC_007763	GCCG	2	8	14303	14310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_007763	GGGC	2	8	14378	14385	0 %	0 %	75 %	25 %	86359894
45	NC_007763	GGCG	2	8	14639	14646	0 %	0 %	75 %	25 %	86359894
46	NC_007763	GCCT	2	8	14748	14755	0 %	25 %	25 %	50 %	86359894
47	NC_007763	CCGA	2	8	14874	14881	25 %	0 %	25 %	50 %	86359894
48	NC_007763	GCGA	2	8	15275	15282	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_007763	TCGC	2	8	15852	15859	0 %	25 %	25 %	50 %	86359895
50	NC_007763	CGGT	2	8	15892	15899	0 %	25 %	50 %	25 %	86359895
51	NC_007763	CGGC	2	8	15994	16001	0 %	0 %	50 %	50 %	86359895
52	NC_007763	CCGG	2	8	16748	16755	0 %	0 %	50 %	50 %	86359897
53	NC_007763	CGGC	2	8	16810	16817	0 %	0 %	50 %	50 %	86359897
54	NC_007763	GACG	2	8	17244	17251	25 %	0 %	50 %	25 %	86359897
55	NC_007763	CAGC	2	8	17292	17299	25 %	0 %	25 %	50 %	86359897
56	NC_007763	GTGA	2	8	17454	17461	25 %	25 %	50 %	0 %	86359897
57	NC_007763	GCAT	2	8	17600	17607	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_007763	GCAC	2	8	17628	17635	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_007763	CTTC	2	8	17750	17757	0 %	50 %	0 %	50 %	86359898
60	NC_007763	GGCT	2	8	18460	18467	0 %	25 %	50 %	25 %	86359898
61	NC_007763	CTTT	2	8	18626	18633	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_007763	GACC	2	8	18672	18679	25 %	0 %	25 %	50 %	86359899
63	NC_007763	CGTG	2	8	19092	19099	0 %	25 %	50 %	25 %	86359899
64	NC_007763	AACA	2	8	19451	19458	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_007763	CGGC	2	8	19953	19960	0 %	0 %	50 %	50 %	86359900
66	NC_007763	CGCC	2	8	20818	20825	0 %	0 %	25 %	75 %	86359900
67	NC_007763	CCGA	2	8	21169	21176	25 %	0 %	25 %	50 %	86359901
68	NC_007763	CTCG	2	8	21828	21835	0 %	25 %	25 %	50 %	86359901
69	NC_007763	GATC	2	8	22596	22603	25 %	25 %	25 %	25 %	86359902
70	NC_007763	GCCG	2	8	22890	22897	0 %	0 %	50 %	50 %	86359902
71	NC_007763	CGGG	2	8	23088	23095	0 %	0 %	75 %	25 %	86359902
72	NC_007763	CGGC	2	8	23133	23140	0 %	0 %	50 %	50 %	86359902
73	NC_007763	TCCG	2	8	23235	23242	0 %	25 %	25 %	50 %	86359902
74	NC_007763	GCAG	2	8	24192	24199	25 %	0 %	50 %	25 %	86359904
75	NC_007763	CTGG	2	8	24206	24213	0 %	25 %	50 %	25 %	86359904
76	NC_007763	TTCC	2	8	24701	24708	0 %	50 %	0 %	50 %	86359904
77	NC_007763	TTCA	2	8	25188	25195	25 %	50 %	0 %	25 %	86359905
78	NC_007763	TCCA	2	8	26284	26291	25 %	25 %	0 %	50 %	86359906
79	NC_007763	AAGG	2	8	26431	26438	50 %	0 %	50 %	0 %	86359906
80	NC_007763	ACCG	2	8	26695	26702	25 %	0 %	25 %	50 %	86359906
81	NC_007763	CCGG	2	8	27098	27105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_007763	ATCT	2	8	27166	27173	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_007763	GCGA	2	8	27210	27217	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_007763	ACCA	2	8	27475	27482	50 %	0 %	0 %	50 %	86359907
85	NC_007763	GCTG	2	8	27662	27669	0 %	25 %	50 %	25 %	86359907
86	NC_007763	GGCG	2	8	27705	27712	0 %	0 %	75 %	25 %	86359907
87	NC_007763	GATC	2	8	28764	28771	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_007763	GCAG	2	8	29501	29508	25 %	0 %	50 %	25 %	86359908
89	NC_007763	CGAG	2	8	30021	30028	25 %	0 %	50 %	25 %	86359909
90	NC_007763	GGCC	2	8	30309	30316	0 %	0 %	50 %	50 %	86359909
91	NC_007763	ATGG	2	8	30388	30395	25 %	25 %	50 %	0 %	86359909
92	NC_007763	GCGT	2	8	31917	31924	0 %	25 %	50 %	25 %	86359910
93	NC_007763	CGGC	2	8	32282	32289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_007763	CGGC	2	8	32619	32626	0 %	0 %	50 %	50 %	86359911
95	NC_007763	TCGG	2	8	32793	32800	0 %	25 %	50 %	25 %	86359911
96	NC_007763	CGGG	2	8	32803	32810	0 %	0 %	75 %	25 %	86359911
97	NC_007763	CGAA	2	8	33093	33100	50 %	0 %	25 %	25 %	86359911
98	NC_007763	TCCG	2	8	33230	33237	0 %	25 %	25 %	50 %	86359911
99	NC_007763	AGGC	2	8	33530	33537	25 %	0 %	50 %	25 %	86359911
100	NC_007763	GCCG	2	8	33992	33999	0 %	0 %	50 %	50 %	86359912
101	NC_007763	TCGA	2	8	35537	35544	25 %	25 %	25 %	25 %	86359913
102	NC_007763	CCAG	2	8	35667	35674	25 %	0 %	25 %	50 %	86359913
103	NC_007763	CCGT	2	8	36575	36582	0 %	25 %	25 %	50 %	86359914
104	NC_007763	TTCC	2	8	37099	37106	0 %	50 %	0 %	50 %	86359914
105	NC_007763	CCGC	2	8	37179	37186	0 %	0 %	25 %	75 %	86359914
106	NC_007763	CGGC	2	8	37333	37340	0 %	0 %	50 %	50 %	86359914
107	NC_007763	GATG	2	8	37967	37974	25 %	25 %	50 %	0 %	86359915
108	NC_007763	GTCG	2	8	39086	39093	0 %	25 %	50 %	25 %	86359916
109	NC_007763	GCCG	2	8	39310	39317	0 %	0 %	50 %	50 %	86359916
110	NC_007763	TGCC	2	8	39970	39977	0 %	25 %	25 %	50 %	86359917
111	NC_007763	GATG	2	8	40354	40361	25 %	25 %	50 %	0 %	86359917
112	NC_007763	CGGC	2	8	40517	40524	0 %	0 %	50 %	50 %	86359918
113	NC_007763	CGCC	2	8	41001	41008	0 %	0 %	25 %	75 %	86359918
114	NC_007763	GGCA	2	8	41790	41797	25 %	0 %	50 %	25 %	86359919
115	NC_007763	TCGA	2	8	42076	42083	25 %	25 %	25 %	25 %	86359919
116	NC_007763	GCAT	2	8	42110	42117	25 %	25 %	25 %	25 %	86359919
117	NC_007763	GGTC	2	8	42326	42333	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_007763	GCCG	2	8	42686	42693	0 %	0 %	50 %	50 %	86359920
119	NC_007763	TATT	2	8	42802	42809	25 %	75 %	0 %	0 %	86359921
120	NC_007763	TCGC	2	8	43183	43190	0 %	25 %	25 %	50 %	86359921
121	NC_007763	CCGG	2	8	43579	43586	0 %	0 %	50 %	50 %	86359922
122	NC_007763	GCAA	2	8	44046	44053	50 %	0 %	25 %	25 %	86359922
123	NC_007763	GATC	2	8	44297	44304	25 %	25 %	25 %	25 %	86359922
124	NC_007763	CAGC	2	8	44384	44391	25 %	0 %	25 %	50 %	86359922
125	NC_007763	TGTC	2	8	45236	45243	0 %	50 %	25 %	25 %	86359922
126	NC_007763	CGAT	2	8	45250	45257	25 %	25 %	25 %	25 %	86359922
127	NC_007763	CCGA	2	8	45933	45940	25 %	0 %	25 %	50 %	86359923
128	NC_007763	ATGC	2	8	46638	46645	25 %	25 %	25 %	25 %	86359923
129	NC_007763	GTTC	2	8	46702	46709	0 %	50 %	25 %	25 %	86359923
130	NC_007763	GACG	2	8	48024	48031	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_007763	ATGA	2	8	48049	48056	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007763	GCGA	2	8	48067	48074	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_007763	TTGC	2	8	48160	48167	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_007763	GACG	2	8	48300	48307	25 %	0 %	50 %	25 %	86359924
135	NC_007763	CCAT	2	8	48674	48681	25 %	25 %	0 %	50 %	86359925
136	NC_007763	ACCG	2	8	49097	49104	25 %	0 %	25 %	50 %	86359925
137	NC_007763	ATCC	2	8	49254	49261	25 %	25 %	0 %	50 %	86359925
138	NC_007763	TGCT	2	8	49333	49340	0 %	50 %	25 %	25 %	86359925
139	NC_007763	GAAG	2	8	49379	49386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007763	GATT	2	8	49591	49598	25 %	50 %	25 %	0 %	86359926
141	NC_007763	GCGG	2	8	49699	49706	0 %	0 %	75 %	25 %	86359926
142	NC_007763	GCCG	2	8	49877	49884	0 %	0 %	50 %	50 %	86359926
143	NC_007763	TCGC	2	8	51596	51603	0 %	25 %	25 %	50 %	86359928
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145	NC_007763	TCGG	2	8	52155	52162	0 %	25 %	50 %	25 %	86359929
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