MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42b

Total Repeats: 341

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007763	GC	3	6	2776	2781	0 %	0 %	50 %	50 %	86359883
2	NC_007763	GC	4	8	2863	2870	0 %	0 %	50 %	50 %	86359883
3	NC_007763	AG	3	6	3137	3142	50 %	0 %	50 %	0 %	86359884
4	NC_007763	GC	3	6	3656	3661	0 %	0 %	50 %	50 %	86359884
5	NC_007763	GC	3	6	4205	4210	0 %	0 %	50 %	50 %	86359884
6	NC_007763	TC	3	6	4516	4521	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_007763	GC	3	6	4616	4621	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_007763	CG	3	6	4971	4976	0 %	0 %	50 %	50 %	86359885
9	NC_007763	AG	3	6	5201	5206	50 %	0 %	50 %	0 %	86359885
10	NC_007763	GC	3	6	6090	6095	0 %	0 %	50 %	50 %	86359886
11	NC_007763	GC	3	6	6708	6713	0 %	0 %	50 %	50 %	86359887
12	NC_007763	GC	3	6	7070	7075	0 %	0 %	50 %	50 %	86359887
13	NC_007763	GC	3	6	7473	7478	0 %	0 %	50 %	50 %	86359888
14	NC_007763	GC	3	6	7565	7570	0 %	0 %	50 %	50 %	86359888
15	NC_007763	GA	3	6	7777	7782	50 %	0 %	50 %	0 %	86359888
16	NC_007763	GA	4	8	8242	8249	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007763	GC	4	8	8741	8748	0 %	0 %	50 %	50 %	86359889
18	NC_007763	CT	3	6	9014	9019	0 %	50 %	0 %	50 %	86359889
19	NC_007763	CG	3	6	9501	9506	0 %	0 %	50 %	50 %	86359890
20	NC_007763	GC	3	6	11154	11159	0 %	0 %	50 %	50 %	86359891
21	NC_007763	GC	3	6	11521	11526	0 %	0 %	50 %	50 %	86359891
22	NC_007763	GA	3	6	11937	11942	50 %	0 %	50 %	0 %	86359891
23	NC_007763	CG	3	6	12075	12080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_007763	CG	3	6	12103	12108	0 %	0 %	50 %	50 %	86359892
25	NC_007763	GC	3	6	13029	13034	0 %	0 %	50 %	50 %	86359893
26	NC_007763	GC	4	8	13388	13395	0 %	0 %	50 %	50 %	86359893
27	NC_007763	GC	3	6	14135	14140	0 %	0 %	50 %	50 %	86359893
28	NC_007763	GA	3	6	15504	15509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007763	CG	3	6	16074	16079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_007763	GC	3	6	16617	16622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_007763	GC	3	6	16871	16876	0 %	0 %	50 %	50 %	86359897
32	NC_007763	CG	3	6	16948	16953	0 %	0 %	50 %	50 %	86359897
33	NC_007763	GC	3	6	17095	17100	0 %	0 %	50 %	50 %	86359897
34	NC_007763	AG	3	6	17236	17241	50 %	0 %	50 %	0 %	86359897
35	NC_007763	CG	3	6	17392	17397	0 %	0 %	50 %	50 %	86359897
36	NC_007763	GC	3	6	18290	18295	0 %	0 %	50 %	50 %	86359898
37	NC_007763	GC	4	8	18403	18410	0 %	0 %	50 %	50 %	86359898
38	NC_007763	GC	3	6	19199	19204	0 %	0 %	50 %	50 %	86359899
39	NC_007763	CG	4	8	19618	19625	0 %	0 %	50 %	50 %	86359900
40	NC_007763	CG	3	6	20568	20573	0 %	0 %	50 %	50 %	86359900
41	NC_007763	CG	3	6	21544	21549	0 %	0 %	50 %	50 %	86359901
42	NC_007763	GC	3	6	21994	21999	0 %	0 %	50 %	50 %	86359901
43	NC_007763	GC	3	6	23151	23156	0 %	0 %	50 %	50 %	86359902
44	NC_007763	GC	3	6	24928	24933	0 %	0 %	50 %	50 %	86359904
45	NC_007763	GC	3	6	26245	26250	0 %	0 %	50 %	50 %	86359906
46	NC_007763	CG	3	6	26701	26706	0 %	0 %	50 %	50 %	86359906
47	NC_007763	CG	3	6	27532	27537	0 %	0 %	50 %	50 %	86359907
48	NC_007763	GC	3	6	28289	28294	0 %	0 %	50 %	50 %	86359907
49	NC_007763	GA	3	6	28861	28866	50 %	0 %	50 %	0 %	86359908
50	NC_007763	AG	3	6	29552	29557	50 %	0 %	50 %	0 %	86359908
51	NC_007763	GC	3	6	29766	29771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_007763	GC	3	6	30722	30727	0 %	0 %	50 %	50 %	86359909
53	NC_007763	GC	4	8	31316	31323	0 %	0 %	50 %	50 %	86359910
54	NC_007763	GC	3	6	31587	31592	0 %	0 %	50 %	50 %	86359910
55	NC_007763	GC	3	6	31885	31890	0 %	0 %	50 %	50 %	86359910
56	NC_007763	GC	3	6	32403	32408	0 %	0 %	50 %	50 %	86359911
57	NC_007763	CG	4	8	32591	32598	0 %	0 %	50 %	50 %	86359911
58	NC_007763	TC	3	6	32647	32652	0 %	50 %	0 %	50 %	86359911
59	NC_007763	AG	3	6	32680	32685	50 %	0 %	50 %	0 %	86359911
60	NC_007763	CG	3	6	32974	32979	0 %	0 %	50 %	50 %	86359911
61	NC_007763	TC	3	6	33351	33356	0 %	50 %	0 %	50 %	86359911
62	NC_007763	CG	4	8	33627	33634	0 %	0 %	50 %	50 %	86359912
63	NC_007763	CG	3	6	33761	33766	0 %	0 %	50 %	50 %	86359912
64	NC_007763	GA	3	6	34690	34695	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007763	GC	3	6	35179	35184	0 %	0 %	50 %	50 %	86359913
66	NC_007763	CG	3	6	35364	35369	0 %	0 %	50 %	50 %	86359913
67	NC_007763	CG	3	6	35696	35701	0 %	0 %	50 %	50 %	86359913
68	NC_007763	GC	3	6	36434	36439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_007763	GC	4	8	36655	36662	0 %	0 %	50 %	50 %	86359914
70	NC_007763	CG	3	6	37461	37466	0 %	0 %	50 %	50 %	86359914
71	NC_007763	CG	3	6	37686	37691	0 %	0 %	50 %	50 %	86359915
72	NC_007763	GC	3	6	37978	37983	0 %	0 %	50 %	50 %	86359915
73	NC_007763	GC	3	6	38091	38096	0 %	0 %	50 %	50 %	86359915
74	NC_007763	GC	3	6	39068	39073	0 %	0 %	50 %	50 %	86359916
75	NC_007763	CG	3	6	39220	39225	0 %	0 %	50 %	50 %	86359916
76	NC_007763	CG	3	6	39533	39538	0 %	0 %	50 %	50 %	86359917
77	NC_007763	CG	4	8	40610	40617	0 %	0 %	50 %	50 %	86359918
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79	NC_007763	GC	3	6	40978	40983	0 %	0 %	50 %	50 %	86359918
80	NC_007763	GC	3	6	41749	41754	0 %	0 %	50 %	50 %	86359919
81	NC_007763	GC	3	6	41807	41812	0 %	0 %	50 %	50 %	86359919
82	NC_007763	CT	3	6	42127	42132	0 %	50 %	0 %	50 %	86359919
83	NC_007763	TG	3	6	43406	43411	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007763	CG	3	6	44570	44575	0 %	0 %	50 %	50 %	86359922
85	NC_007763	CG	3	6	45310	45315	0 %	0 %	50 %	50 %	86359922
86	NC_007763	GC	3	6	45536	45541	0 %	0 %	50 %	50 %	86359923
87	NC_007763	CT	3	6	46417	46422	0 %	50 %	0 %	50 %	86359923
88	NC_007763	GA	3	6	48502	48507	50 %	0 %	50 %	0 %	86359924
89	NC_007763	GC	3	6	48700	48705	0 %	0 %	50 %	50 %	86359925
90	NC_007763	GC	3	6	52202	52207	0 %	0 %	50 %	50 %	86359929
91	NC_007763	GC	3	6	52358	52363	0 %	0 %	50 %	50 %	86359929
92	NC_007763	GC	3	6	52745	52750	0 %	0 %	50 %	50 %	86359930
93	NC_007763	GT	3	6	53986	53991	0 %	50 %	50 %	0 %	86359931
94	NC_007763	CG	3	6	54442	54447	0 %	0 %	50 %	50 %	86359932
95	NC_007763	TC	4	8	54829	54836	0 %	50 %	0 %	50 %	86359932
96	NC_007763	GC	3	6	56527	56532	0 %	0 %	50 %	50 %	86359933
97	NC_007763	CA	3	6	56804	56809	50 %	0 %	0 %	50 %	86359934
98	NC_007763	CG	3	6	57205	57210	0 %	0 %	50 %	50 %	86359934
99	NC_007763	GA	3	6	57307	57312	50 %	0 %	50 %	0 %	86359934
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102	NC_007763	CG	3	6	58296	58301	0 %	0 %	50 %	50 %	86359934
103	NC_007763	GC	3	6	58532	58537	0 %	0 %	50 %	50 %	86359934
104	NC_007763	CG	3	6	58975	58980	0 %	0 %	50 %	50 %	86359935
105	NC_007763	TG	3	6	61431	61436	0 %	50 %	50 %	0 %	86359937
106	NC_007763	CG	3	6	61669	61674	0 %	0 %	50 %	50 %	86359937
107	NC_007763	CG	3	6	61720	61725	0 %	0 %	50 %	50 %	86359937
108	NC_007763	CG	4	8	61856	61863	0 %	0 %	50 %	50 %	86359937
109	NC_007763	GC	3	6	61932	61937	0 %	0 %	50 %	50 %	86359937
110	NC_007763	AC	3	6	61955	61960	50 %	0 %	0 %	50 %	86359937
111	NC_007763	GC	3	6	62011	62016	0 %	0 %	50 %	50 %	86359937
112	NC_007763	GC	4	8	62511	62518	0 %	0 %	50 %	50 %	86359938
113	NC_007763	GC	3	6	62657	62662	0 %	0 %	50 %	50 %	86359938
114	NC_007763	GC	3	6	63619	63624	0 %	0 %	50 %	50 %	86359939
115	NC_007763	CG	3	6	64019	64024	0 %	0 %	50 %	50 %	86359939
116	NC_007763	GA	3	6	64277	64282	50 %	0 %	50 %	0 %	86359940
117	NC_007763	TC	3	6	65315	65320	0 %	50 %	0 %	50 %	86359941
118	NC_007763	GC	4	8	65433	65440	0 %	0 %	50 %	50 %	86359941
119	NC_007763	GA	3	6	66095	66100	50 %	0 %	50 %	0 %	86359942
120	NC_007763	TA	3	6	66411	66416	50 %	50 %	0 %	0 %	86359943
121	NC_007763	GA	3	6	66961	66966	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007763	CG	3	6	67558	67563	0 %	0 %	50 %	50 %	86359944
123	NC_007763	CG	3	6	68089	68094	0 %	0 %	50 %	50 %	86359945
124	NC_007763	GA	3	6	68787	68792	50 %	0 %	50 %	0 %	86359945
125	NC_007763	CG	3	6	71770	71775	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_007763	CG	3	6	71992	71997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_007763	GC	3	6	72201	72206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_007763	GC	3	6	73192	73197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_007763	CT	3	6	73282	73287	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_007763	CG	4	8	74691	74698	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_007763	CG	3	6	74851	74856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_007763	TC	3	6	75046	75051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_007763	CG	3	6	75589	75594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_007763	AG	3	6	75744	75749	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007763	GC	3	6	76284	76289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_007763	GC	3	6	76706	76711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_007763	GC	3	6	77227	77232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_007763	CG	4	8	77241	77248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_007763	CG	3	6	78639	78644	0 %	0 %	50 %	50 %	86359949
140	NC_007763	CG	3	6	79022	79027	0 %	0 %	50 %	50 %	86359949
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143	NC_007763	CG	3	6	81333	81338	0 %	0 %	50 %	50 %	86359951
144	NC_007763	CG	3	6	82355	82360	0 %	0 %	50 %	50 %	86359952
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146	NC_007763	CG	3	6	83598	83603	0 %	0 %	50 %	50 %	86359953
147	NC_007763	AT	3	6	83943	83948	50 %	50 %	0 %	0 %	86359953
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.