MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42a

Total Repeats: 2866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007762	CCG	2	6	1	6	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_007762	TTG	2	6	52	57	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007762	ATA	2	6	86	91	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007762	GCG	2	6	164	169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007762	GGA	2	6	289	294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007762	ACG	2	6	387	392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359706
7	NC_007762	CGA	2	6	459	464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359706
8	NC_007762	TCT	2	6	510	515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359706
9	NC_007762	TCC	2	6	768	773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86359706
10	NC_007762	GAG	2	6	866	871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359706
11	NC_007762	CAA	2	6	978	983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86359706
12	NC_007762	GAT	2	6	1049	1054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359706
13	NC_007762	TCT	2	6	1070	1075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359706
14	NC_007762	CCA	2	6	1077	1082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86359706
15	NC_007762	AAG	2	6	1130	1135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359706
16	NC_007762	GAC	2	6	1214	1219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359706
17	NC_007762	TTC	2	6	1242	1247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359706
18	NC_007762	CAA	2	6	1270	1275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_007762	CGA	2	6	1367	1372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359707
20	NC_007762	TGT	2	6	1380	1385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86359707
21	NC_007762	GCT	2	6	1394	1399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359707
22	NC_007762	CGT	2	6	1761	1766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359707
23	NC_007762	GCT	2	6	1794	1799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359707
24	NC_007762	CGG	2	6	1829	1834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359707
25	NC_007762	CCG	2	6	1835	1840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359707
26	NC_007762	CGC	2	6	1896	1901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359707
27	NC_007762	GCG	3	9	1954	1962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359707
28	NC_007762	GCC	2	6	2070	2075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359707
29	NC_007762	GGA	2	6	2112	2117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359707
30	NC_007762	GAT	2	6	2199	2204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359707
31	NC_007762	CGA	2	6	2208	2213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359707
32	NC_007762	CAG	3	9	2218	2226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359707
33	NC_007762	CGC	2	6	2263	2268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359707
34	NC_007762	GCA	2	6	2412	2417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359707
35	NC_007762	CCG	2	6	2446	2451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359707
36	NC_007762	TGC	2	6	2467	2472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359707
37	NC_007762	GAT	2	6	2485	2490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359707
38	NC_007762	GCG	2	6	2521	2526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359707
39	NC_007762	GAC	2	6	2647	2652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007762	AAC	2	6	2690	2695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007762	GCC	2	6	2829	2834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_007762	GCC	2	6	2862	2867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_007762	AGA	2	6	2921	2926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007762	ACG	2	6	3077	3082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007762	TGC	2	6	3155	3160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007762	CAC	2	6	3240	3245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_007762	TCA	2	6	3298	3303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_007762	GAC	2	6	3374	3379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359708
49	NC_007762	TTC	2	6	3459	3464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359708
50	NC_007762	TTC	2	6	3678	3683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359708
51	NC_007762	GGC	2	6	3731	3736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359708
52	NC_007762	GCG	2	6	3784	3789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359708
53	NC_007762	CAA	2	6	4030	4035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86359708
54	NC_007762	TCC	2	6	4095	4100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86359708
55	NC_007762	CAG	2	6	4215	4220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359708
56	NC_007762	TGC	2	6	4266	4271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359708
57	NC_007762	GCG	2	6	4272	4277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359708
58	NC_007762	ACC	2	6	4284	4289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86359708
59	NC_007762	CGA	2	6	4537	4542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359708
60	NC_007762	GCT	2	6	4630	4635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359708
61	NC_007762	GAT	2	6	4722	4727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359708
62	NC_007762	ATG	2	6	4811	4816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359709
63	NC_007762	TGC	2	6	4955	4960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359709
64	NC_007762	GAA	2	6	5037	5042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359709
65	NC_007762	CGC	2	6	5076	5081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359709
66	NC_007762	GGC	2	6	5119	5124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359709
67	NC_007762	GCT	2	6	5130	5135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359709
68	NC_007762	CGC	2	6	5169	5174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359709
69	NC_007762	GGC	2	6	5388	5393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359709
70	NC_007762	CAG	2	6	5419	5424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359709
71	NC_007762	CAT	2	6	5493	5498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359709
72	NC_007762	CTT	2	6	5620	5625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86359709
73	NC_007762	GAA	2	6	5694	5699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359709
74	NC_007762	GCG	2	6	5717	5722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359709
75	NC_007762	TGG	2	6	5745	5750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86359709
76	NC_007762	GAA	2	6	5804	5809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359709
77	NC_007762	AAG	2	6	5898	5903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359710
78	NC_007762	ACA	3	9	6061	6069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86359710
79	NC_007762	TCA	2	6	6127	6132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86359710
80	NC_007762	CGA	2	6	6142	6147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359710
81	NC_007762	CGA	2	6	6163	6168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359710
82	NC_007762	TCC	2	6	6207	6212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86359710
83	NC_007762	CGG	2	6	6320	6325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359710
84	NC_007762	CGC	2	6	6347	6352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359710
85	NC_007762	TAA	2	6	6368	6373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	86359710
86	NC_007762	CAA	2	6	6445	6450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86359710
87	NC_007762	GCG	2	6	6573	6578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359711
88	NC_007762	AAC	2	6	6579	6584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86359711
89	NC_007762	TTG	2	6	6591	6596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86359711
90	NC_007762	TCG	2	6	6731	6736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359711
91	NC_007762	GCG	2	6	6812	6817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359711
92	NC_007762	CGG	2	6	7051	7056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359711
93	NC_007762	CGA	2	6	7144	7149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359711
94	NC_007762	AAC	2	6	7173	7178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86359711
95	NC_007762	GCA	2	6	7302	7307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359711
96	NC_007762	CGT	2	6	7325	7330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359711
97	NC_007762	TCC	2	6	7374	7379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86359711
98	NC_007762	TGA	2	6	7399	7404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359711
99	NC_007762	ATT	2	6	7488	7493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86359711
100	NC_007762	ACC	2	6	7646	7651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86359712
101	NC_007762	AGC	2	6	7725	7730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359712
102	NC_007762	ACC	2	6	7760	7765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86359712
103	NC_007762	GCT	2	6	7876	7881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359712
104	NC_007762	GGC	2	6	7929	7934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359712
105	NC_007762	CGG	2	6	7960	7965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359712
106	NC_007762	GCC	2	6	7977	7982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359712
107	NC_007762	GGC	2	6	8036	8041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359712
108	NC_007762	CTG	2	6	8065	8070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359712
109	NC_007762	TCG	2	6	8161	8166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359712
110	NC_007762	TGA	2	6	8171	8176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359712
111	NC_007762	GCG	2	6	8313	8318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359712
112	NC_007762	GCC	2	6	8342	8347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86359712
113	NC_007762	ATG	2	6	8349	8354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86359712
114	NC_007762	TGG	2	6	8420	8425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86359712
115	NC_007762	CAA	2	6	8509	8514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86359712
116	NC_007762	TTG	2	6	8649	8654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86359712
117	NC_007762	TGC	2	6	8658	8663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359712
118	NC_007762	CGA	2	6	8674	8679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86359712
119	NC_007762	GCG	2	6	8839	8844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359712
120	NC_007762	AGA	2	6	9058	9063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86359712
121	NC_007762	CGG	2	6	9075	9080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359712
122	NC_007762	GGC	2	6	9147	9152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86359712
123	NC_007762	GAG	2	6	9176	9181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86359712
124	NC_007762	TCG	2	6	9264	9269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86359712
125	NC_007762	CAA	2	6	9275	9280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86359712
126	NC_007762	ATA	2	6	9401	9406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	86359712
127	NC_007762	CCT	2	6	9492	9497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86359712
128	NC_007762	GAA	2	6	9613	9618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007762	GCC	2	6	9658	9663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_007762	GGT	2	6	9771	9776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007762	CGA	2	6	9795	9800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_007762	ACA	3	9	9856	9864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_007762	GCC	2	6	9933	9938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_007762	GAT	2	6	9951	9956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007762	GAT	2	6	9975	9980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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