MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42a

Total Repeats: 368

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007762	TA	3	6	650	655	50 %	50 %	0 %	0 %	86359706
2	NC_007762	GC	3	6	1290	1295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_007762	GC	3	6	2628	2633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_007762	AG	3	6	3067	3072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007762	AT	3	6	3505	3510	50 %	50 %	0 %	0 %	86359708
6	NC_007762	CG	3	6	5100	5105	0 %	0 %	50 %	50 %	86359709
7	NC_007762	CT	3	6	5914	5919	0 %	50 %	0 %	50 %	86359710
8	NC_007762	CG	3	6	6049	6054	0 %	0 %	50 %	50 %	86359710
9	NC_007762	TC	3	6	6857	6862	0 %	50 %	0 %	50 %	86359711
10	NC_007762	CA	3	6	9732	9737	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007762	CG	3	6	9811	9816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_007762	CG	3	6	9839	9844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_007762	GC	3	6	11716	11721	0 %	0 %	50 %	50 %	86359714
14	NC_007762	AG	3	6	12136	12141	50 %	0 %	50 %	0 %	86359714
15	NC_007762	TC	3	6	12326	12331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_007762	TC	3	6	13515	13520	0 %	50 %	0 %	50 %	86359715
17	NC_007762	GC	3	6	14787	14792	0 %	0 %	50 %	50 %	86359716
18	NC_007762	CA	3	6	15136	15141	50 %	0 %	0 %	50 %	86359716
19	NC_007762	CG	3	6	15420	15425	0 %	0 %	50 %	50 %	86359717
20	NC_007762	GA	3	6	16165	16170	50 %	0 %	50 %	0 %	86359718
21	NC_007762	TA	3	6	16812	16817	50 %	50 %	0 %	0 %	86359719
22	NC_007762	GC	3	6	17266	17271	0 %	0 %	50 %	50 %	86359719
23	NC_007762	AT	3	6	17345	17350	50 %	50 %	0 %	0 %	86359719
24	NC_007762	GC	3	6	17655	17660	0 %	0 %	50 %	50 %	86359719
25	NC_007762	CG	3	6	17808	17813	0 %	0 %	50 %	50 %	86359719
26	NC_007762	GA	3	6	17932	17937	50 %	0 %	50 %	0 %	86359720
27	NC_007762	CG	4	8	18285	18292	0 %	0 %	50 %	50 %	86359720
28	NC_007762	CA	3	6	18762	18767	50 %	0 %	0 %	50 %	86359721
29	NC_007762	GC	3	6	20761	20766	0 %	0 %	50 %	50 %	86359723
30	NC_007762	GC	3	6	20809	20814	0 %	0 %	50 %	50 %	86359723
31	NC_007762	GC	4	8	20971	20978	0 %	0 %	50 %	50 %	86359723
32	NC_007762	GA	3	6	22303	22308	50 %	0 %	50 %	0 %	86359725
33	NC_007762	CG	3	6	22644	22649	0 %	0 %	50 %	50 %	86359725
34	NC_007762	GC	4	8	22696	22703	0 %	0 %	50 %	50 %	86359725
35	NC_007762	CG	3	6	24383	24388	0 %	0 %	50 %	50 %	86359726
36	NC_007762	GC	3	6	24423	24428	0 %	0 %	50 %	50 %	86359726
37	NC_007762	AG	3	6	25245	25250	50 %	0 %	50 %	0 %	86359727
38	NC_007762	CG	3	6	25346	25351	0 %	0 %	50 %	50 %	86359727
39	NC_007762	TC	3	6	25686	25691	0 %	50 %	0 %	50 %	86359727
40	NC_007762	TA	3	6	25963	25968	50 %	50 %	0 %	0 %	86359727
41	NC_007762	GA	3	6	25982	25987	50 %	0 %	50 %	0 %	86359727
42	NC_007762	AG	3	6	26350	26355	50 %	0 %	50 %	0 %	86359727
43	NC_007762	CG	3	6	27991	27996	0 %	0 %	50 %	50 %	86359729
44	NC_007762	AT	3	6	28067	28072	50 %	50 %	0 %	0 %	86359729
45	NC_007762	GC	3	6	28975	28980	0 %	0 %	50 %	50 %	86359730
46	NC_007762	CG	3	6	29300	29305	0 %	0 %	50 %	50 %	86359731
47	NC_007762	TC	4	8	29373	29380	0 %	50 %	0 %	50 %	86359731
48	NC_007762	GC	4	8	29584	29591	0 %	0 %	50 %	50 %	86359731
49	NC_007762	CG	3	6	30055	30060	0 %	0 %	50 %	50 %	86359731
50	NC_007762	GC	3	6	30134	30139	0 %	0 %	50 %	50 %	86359731
51	NC_007762	GC	3	6	30494	30499	0 %	0 %	50 %	50 %	86359732
52	NC_007762	CG	3	6	31263	31268	0 %	0 %	50 %	50 %	86359732
53	NC_007762	TC	3	6	31787	31792	0 %	50 %	0 %	50 %	86359732
54	NC_007762	GC	3	6	32103	32108	0 %	0 %	50 %	50 %	86359732
55	NC_007762	GC	4	8	32202	32209	0 %	0 %	50 %	50 %	86359732
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57	NC_007762	GA	3	6	33508	33513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007762	CG	3	6	33557	33562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_007762	CG	4	8	33955	33962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_007762	CG	3	6	34180	34185	0 %	0 %	50 %	50 %	86359735
61	NC_007762	GC	3	6	34655	34660	0 %	0 %	50 %	50 %	86359735
62	NC_007762	CG	3	6	36109	36114	0 %	0 %	50 %	50 %	86359738
63	NC_007762	AG	3	6	37478	37483	50 %	0 %	50 %	0 %	86359739
64	NC_007762	GA	3	6	38426	38431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007762	CG	3	6	39394	39399	0 %	0 %	50 %	50 %	86359740
66	NC_007762	GC	3	6	41575	41580	0 %	0 %	50 %	50 %	86359743
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68	NC_007762	GC	3	6	42922	42927	0 %	0 %	50 %	50 %	86359743
69	NC_007762	GC	3	6	43776	43781	0 %	0 %	50 %	50 %	86359744
70	NC_007762	TC	3	6	45504	45509	0 %	50 %	0 %	50 %	86359747
71	NC_007762	GC	3	6	45570	45575	0 %	0 %	50 %	50 %	86359747
72	NC_007762	CG	3	6	45614	45619	0 %	0 %	50 %	50 %	86359747
73	NC_007762	TA	3	6	45695	45700	50 %	50 %	0 %	0 %	86359747
74	NC_007762	CG	3	6	45798	45803	0 %	0 %	50 %	50 %	86359747
75	NC_007762	GC	3	6	46176	46181	0 %	0 %	50 %	50 %	86359747
76	NC_007762	CG	3	6	46684	46689	0 %	0 %	50 %	50 %	86359747
77	NC_007762	CG	3	6	47130	47135	0 %	0 %	50 %	50 %	86359747
78	NC_007762	CG	3	6	47752	47757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_007762	CT	3	6	47961	47966	0 %	50 %	0 %	50 %	86359748
80	NC_007762	CG	3	6	48085	48090	0 %	0 %	50 %	50 %	86359748
81	NC_007762	AT	3	6	48635	48640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007762	CG	3	6	49826	49831	0 %	0 %	50 %	50 %	86359750
83	NC_007762	CG	3	6	49911	49916	0 %	0 %	50 %	50 %	86359750
84	NC_007762	AT	3	6	50064	50069	50 %	50 %	0 %	0 %	86359750
85	NC_007762	CG	3	6	50309	50314	0 %	0 %	50 %	50 %	86359750
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87	NC_007762	AT	3	6	51332	51337	50 %	50 %	0 %	0 %	86359750
88	NC_007762	CG	3	6	52170	52175	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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90	NC_007762	GA	3	6	54781	54786	50 %	0 %	50 %	0 %	86359755
91	NC_007762	TG	3	6	54801	54806	0 %	50 %	50 %	0 %	86359755
92	NC_007762	GA	3	6	54890	54895	50 %	0 %	50 %	0 %	86359755
93	NC_007762	CA	3	6	54960	54965	50 %	0 %	0 %	50 %	86359756
94	NC_007762	AG	3	6	55160	55165	50 %	0 %	50 %	0 %	86359756
95	NC_007762	CG	3	6	55612	55617	0 %	0 %	50 %	50 %	86359756
96	NC_007762	GA	3	6	56769	56774	50 %	0 %	50 %	0 %	86359757
97	NC_007762	GC	3	6	57029	57034	0 %	0 %	50 %	50 %	86359757
98	NC_007762	CG	3	6	57557	57562	0 %	0 %	50 %	50 %	86359758
99	NC_007762	CG	3	6	57700	57705	0 %	0 %	50 %	50 %	86359758
100	NC_007762	CG	4	8	58077	58084	0 %	0 %	50 %	50 %	86359759
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103	NC_007762	AG	3	6	59206	59211	50 %	0 %	50 %	0 %	86359760
104	NC_007762	GT	3	6	59824	59829	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007762	GC	3	6	60113	60118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_007762	GC	3	6	60709	60714	0 %	0 %	50 %	50 %	86359761
107	NC_007762	TC	3	6	61012	61017	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_007762	TG	3	6	61153	61158	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007762	GA	3	6	61208	61213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007762	CG	3	6	61457	61462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_007762	GC	3	6	61549	61554	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_007762	GC	3	6	62597	62602	0 %	0 %	50 %	50 %	86359762
113	NC_007762	GC	3	6	63403	63408	0 %	0 %	50 %	50 %	86359763
114	NC_007762	CA	4	8	63945	63952	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_007762	AG	3	6	63987	63992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007762	CG	4	8	64053	64060	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_007762	CA	3	6	64396	64401	50 %	0 %	0 %	50 %	86359764
118	NC_007762	AT	3	6	65159	65164	50 %	50 %	0 %	0 %	86359765
119	NC_007762	GA	3	6	65531	65536	50 %	0 %	50 %	0 %	86359765
120	NC_007762	AC	3	6	67151	67156	50 %	0 %	0 %	50 %	86359766
121	NC_007762	GC	3	6	67279	67284	0 %	0 %	50 %	50 %	86359766
122	NC_007762	CA	3	6	68267	68272	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_007762	GC	3	6	69609	69614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_007762	TC	3	6	70186	70191	0 %	50 %	0 %	50 %	86359768
125	NC_007762	TC	3	6	70895	70900	0 %	50 %	0 %	50 %	86359768
126	NC_007762	TC	3	6	71146	71151	0 %	50 %	0 %	50 %	86359768
127	NC_007762	GT	3	6	71713	71718	0 %	50 %	50 %	0 %	86359769
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129	NC_007762	TC	3	6	72219	72224	0 %	50 %	0 %	50 %	86359770
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131	NC_007762	GC	3	6	73749	73754	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_007762	GC	3	6	73859	73864	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_007762	GC	3	6	74671	74676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_007762	TC	3	6	76559	76564	0 %	50 %	0 %	50 %	86359771
135	NC_007762	AT	3	6	76664	76669	50 %	50 %	0 %	0 %	86359771
136	NC_007762	GC	3	6	76701	76706	0 %	0 %	50 %	50 %	86359771
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140	NC_007762	CT	3	6	80007	80012	0 %	50 %	0 %	50 %	86359773
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143	NC_007762	GA	3	6	81272	81277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007762	GA	3	6	81285	81290	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007762	CA	3	6	81598	81603	50 %	0 %	0 %	50 %	86359775
146	NC_007762	AT	3	6	82791	82796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007762	CA	3	6	82988	82993	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_007762	TA	4	8	83060	83067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.