MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42a

Total Repeats: 97

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007762	GC	3	6	1290	1295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007762	GC	3	6	2628	2633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_007762	AG	3	6	3067	3072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007762	CA	3	6	9732	9737	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_007762	CG	3	6	9811	9816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_007762	CG	3	6	9839	9844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_007762	TC	3	6	12326	12331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_007762	GA	3	6	33508	33513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007762	CG	3	6	33557	33562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_007762	CG	4	8	33955	33962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_007762	GA	3	6	38426	38431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007762	CG	3	6	47752	47757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_007762	AT	3	6	48635	48640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007762	CG	3	6	52170	52175	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_007762	GT	3	6	59824	59829	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007762	GC	3	6	60113	60118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_007762	TC	3	6	61012	61017	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_007762	TG	3	6	61153	61158	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007762	GA	3	6	61208	61213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007762	CG	3	6	61457	61462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_007762	GC	3	6	61549	61554	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_007762	CA	4	8	63945	63952	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_007762	AG	3	6	63987	63992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007762	CG	4	8	64053	64060	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_007762	CA	3	6	68267	68272	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_007762	GC	3	6	69609	69614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_007762	CG	4	8	73426	73433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_007762	GC	3	6	73749	73754	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_007762	GC	3	6	73859	73864	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_007762	GC	3	6	74671	74676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_007762	CG	3	6	79148	79153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_007762	GA	3	6	81272	81277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007762	GA	3	6	81285	81290	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007762	AT	3	6	82791	82796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007762	CA	3	6	82988	82993	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_007762	TA	4	8	83060	83067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007762	TC	3	6	83130	83135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_007762	AG	3	6	83240	83245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007762	AT	4	8	83971	83978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007762	GC	3	6	84789	84794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_007762	GA	3	6	84863	84868	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007762	TA	3	6	84955	84960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007762	GC	3	6	85282	85287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_007762	GC	3	6	85686	85691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_007762	AG	3	6	85977	85982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007762	GC	3	6	86098	86103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_007762	TC	3	6	86130	86135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_007762	CG	3	6	88844	88849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_007762	CT	4	8	90535	90542	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_007762	AT	3	6	94414	94419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007762	CA	3	6	94826	94831	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_007762	CA	3	6	95410	95415	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_007762	TG	3	6	95605	95610	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007762	AT	3	6	96131	96136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007762	AT	3	6	99795	99800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007762	TG	3	6	100767	100772	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007762	AT	3	6	102420	102425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007762	GA	3	6	107109	107114	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007762	GC	3	6	109968	109973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_007762	CG	3	6	112588	112593	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_007762	AG	3	6	114861	114866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007762	GC	3	6	114950	114955	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_007762	TC	3	6	115994	115999	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_007762	CT	4	8	120853	120860	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_007762	GC	3	6	120962	120967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_007762	CA	3	6	121036	121041	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_007762	GT	3	6	122271	122276	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007762	GC	4	8	126399	126406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_007762	CG	3	6	127830	127835	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_007762	AG	3	6	127857	127862	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007762	TC	3	6	129921	129926	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_007762	GA	3	6	135843	135848	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007762	CG	3	6	137216	137221	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_007762	GC	3	6	137564	137569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_007762	TC	3	6	139518	139523	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_007762	GA	3	6	141677	141682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007762	CG	3	6	142473	142478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_007762	GC	3	6	143034	143039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_007762	GC	3	6	143126	143131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_007762	CA	3	6	143975	143980	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_007762	GC	3	6	144999	145004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_007762	GC	3	6	145089	145094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_007762	AC	3	6	145197	145202	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_007762	TG	3	6	145556	145561	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007762	GC	3	6	145699	145704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_007762	CT	3	6	146182	146187	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_007762	TC	3	6	149190	149195	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_007762	TC	5	10	149868	149877	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_007762	GC	3	6	150123	150128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_007762	CA	3	6	157291	157296	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_007762	GA	3	6	161733	161738	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007762	CT	4	8	165473	165480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_007762	GA	3	6	170707	170712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007762	AT	3	6	177425	177430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007762	GA	3	6	177734	177739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007762	CG	4	8	177835	177842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_007762	GA	3	6	190492	190497	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.