MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 plasmid p42a

Total Repeats: 271

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007762	TA	3	6	650	655	50 %	50 %	0 %	0 %	86359706
2	NC_007762	AT	3	6	3505	3510	50 %	50 %	0 %	0 %	86359708
3	NC_007762	CG	3	6	5100	5105	0 %	0 %	50 %	50 %	86359709
4	NC_007762	CT	3	6	5914	5919	0 %	50 %	0 %	50 %	86359710
5	NC_007762	CG	3	6	6049	6054	0 %	0 %	50 %	50 %	86359710
6	NC_007762	TC	3	6	6857	6862	0 %	50 %	0 %	50 %	86359711
7	NC_007762	GC	3	6	11716	11721	0 %	0 %	50 %	50 %	86359714
8	NC_007762	AG	3	6	12136	12141	50 %	0 %	50 %	0 %	86359714
9	NC_007762	TC	3	6	13515	13520	0 %	50 %	0 %	50 %	86359715
10	NC_007762	GC	3	6	14787	14792	0 %	0 %	50 %	50 %	86359716
11	NC_007762	CA	3	6	15136	15141	50 %	0 %	0 %	50 %	86359716
12	NC_007762	CG	3	6	15420	15425	0 %	0 %	50 %	50 %	86359717
13	NC_007762	GA	3	6	16165	16170	50 %	0 %	50 %	0 %	86359718
14	NC_007762	TA	3	6	16812	16817	50 %	50 %	0 %	0 %	86359719
15	NC_007762	GC	3	6	17266	17271	0 %	0 %	50 %	50 %	86359719
16	NC_007762	AT	3	6	17345	17350	50 %	50 %	0 %	0 %	86359719
17	NC_007762	GC	3	6	17655	17660	0 %	0 %	50 %	50 %	86359719
18	NC_007762	CG	3	6	17808	17813	0 %	0 %	50 %	50 %	86359719
19	NC_007762	GA	3	6	17932	17937	50 %	0 %	50 %	0 %	86359720
20	NC_007762	CG	4	8	18285	18292	0 %	0 %	50 %	50 %	86359720
21	NC_007762	CA	3	6	18762	18767	50 %	0 %	0 %	50 %	86359721
22	NC_007762	GC	3	6	20761	20766	0 %	0 %	50 %	50 %	86359723
23	NC_007762	GC	3	6	20809	20814	0 %	0 %	50 %	50 %	86359723
24	NC_007762	GC	4	8	20971	20978	0 %	0 %	50 %	50 %	86359723
25	NC_007762	GA	3	6	22303	22308	50 %	0 %	50 %	0 %	86359725
26	NC_007762	CG	3	6	22644	22649	0 %	0 %	50 %	50 %	86359725
27	NC_007762	GC	4	8	22696	22703	0 %	0 %	50 %	50 %	86359725
28	NC_007762	CG	3	6	24383	24388	0 %	0 %	50 %	50 %	86359726
29	NC_007762	GC	3	6	24423	24428	0 %	0 %	50 %	50 %	86359726
30	NC_007762	AG	3	6	25245	25250	50 %	0 %	50 %	0 %	86359727
31	NC_007762	CG	3	6	25346	25351	0 %	0 %	50 %	50 %	86359727
32	NC_007762	TC	3	6	25686	25691	0 %	50 %	0 %	50 %	86359727
33	NC_007762	TA	3	6	25963	25968	50 %	50 %	0 %	0 %	86359727
34	NC_007762	GA	3	6	25982	25987	50 %	0 %	50 %	0 %	86359727
35	NC_007762	AG	3	6	26350	26355	50 %	0 %	50 %	0 %	86359727
36	NC_007762	CG	3	6	27991	27996	0 %	0 %	50 %	50 %	86359729
37	NC_007762	AT	3	6	28067	28072	50 %	50 %	0 %	0 %	86359729
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39	NC_007762	CG	3	6	29300	29305	0 %	0 %	50 %	50 %	86359731
40	NC_007762	TC	4	8	29373	29380	0 %	50 %	0 %	50 %	86359731
41	NC_007762	GC	4	8	29584	29591	0 %	0 %	50 %	50 %	86359731
42	NC_007762	CG	3	6	30055	30060	0 %	0 %	50 %	50 %	86359731
43	NC_007762	GC	3	6	30134	30139	0 %	0 %	50 %	50 %	86359731
44	NC_007762	GC	3	6	30494	30499	0 %	0 %	50 %	50 %	86359732
45	NC_007762	CG	3	6	31263	31268	0 %	0 %	50 %	50 %	86359732
46	NC_007762	TC	3	6	31787	31792	0 %	50 %	0 %	50 %	86359732
47	NC_007762	GC	3	6	32103	32108	0 %	0 %	50 %	50 %	86359732
48	NC_007762	GC	4	8	32202	32209	0 %	0 %	50 %	50 %	86359732
49	NC_007762	GT	3	6	33019	33024	0 %	50 %	50 %	0 %	86359733
50	NC_007762	CG	3	6	34180	34185	0 %	0 %	50 %	50 %	86359735
51	NC_007762	GC	3	6	34655	34660	0 %	0 %	50 %	50 %	86359735
52	NC_007762	CG	3	6	36109	36114	0 %	0 %	50 %	50 %	86359738
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54	NC_007762	CG	3	6	39394	39399	0 %	0 %	50 %	50 %	86359740
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60	NC_007762	GC	3	6	45570	45575	0 %	0 %	50 %	50 %	86359747
61	NC_007762	CG	3	6	45614	45619	0 %	0 %	50 %	50 %	86359747
62	NC_007762	TA	3	6	45695	45700	50 %	50 %	0 %	0 %	86359747
63	NC_007762	CG	3	6	45798	45803	0 %	0 %	50 %	50 %	86359747
64	NC_007762	GC	3	6	46176	46181	0 %	0 %	50 %	50 %	86359747
65	NC_007762	CG	3	6	46684	46689	0 %	0 %	50 %	50 %	86359747
66	NC_007762	CG	3	6	47130	47135	0 %	0 %	50 %	50 %	86359747
67	NC_007762	CT	3	6	47961	47966	0 %	50 %	0 %	50 %	86359748
68	NC_007762	CG	3	6	48085	48090	0 %	0 %	50 %	50 %	86359748
69	NC_007762	CG	3	6	49826	49831	0 %	0 %	50 %	50 %	86359750
70	NC_007762	CG	3	6	49911	49916	0 %	0 %	50 %	50 %	86359750
71	NC_007762	AT	3	6	50064	50069	50 %	50 %	0 %	0 %	86359750
72	NC_007762	CG	3	6	50309	50314	0 %	0 %	50 %	50 %	86359750
73	NC_007762	AG	3	6	50639	50644	50 %	0 %	50 %	0 %	86359750
74	NC_007762	AT	3	6	51332	51337	50 %	50 %	0 %	0 %	86359750
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85	NC_007762	CG	3	6	57700	57705	0 %	0 %	50 %	50 %	86359758
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92	NC_007762	GC	3	6	63403	63408	0 %	0 %	50 %	50 %	86359763
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108	NC_007762	CG	3	6	78678	78683	0 %	0 %	50 %	50 %	86359772
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111	NC_007762	CG	3	6	81073	81078	0 %	0 %	50 %	50 %	86359774
112	NC_007762	CA	3	6	81598	81603	50 %	0 %	0 %	50 %	86359775
113	NC_007762	AT	3	6	85361	85366	50 %	50 %	0 %	0 %	86359776
114	NC_007762	GT	3	6	85420	85425	0 %	50 %	50 %	0 %	86359776
115	NC_007762	CG	3	6	86658	86663	0 %	0 %	50 %	50 %	86359777
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125	NC_007762	CT	3	6	92703	92708	0 %	50 %	0 %	50 %	86359784
126	NC_007762	GC	3	6	93184	93189	0 %	0 %	50 %	50 %	86359785
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128	NC_007762	AC	3	6	93422	93427	50 %	0 %	0 %	50 %	86359785
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.