MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 chromosome

Total Repeats: 2589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007761	GCCGC	2	10	546	555	0 %	0 %	40 %	60 %	86355670
2	NC_007761	GCGCC	2	10	3266	3275	0 %	0 %	40 %	60 %	86355673
3	NC_007761	GGCGC	2	10	3741	3750	0 %	0 %	60 %	40 %	86355674
4	NC_007761	GCTCC	2	10	5436	5445	0 %	20 %	20 %	60 %	86355677
5	NC_007761	ATCGG	2	10	6397	6406	20 %	20 %	40 %	20 %	86355678
6	NC_007761	CCGAG	2	10	6760	6769	20 %	0 %	40 %	40 %	86355678
7	NC_007761	TGGCG	2	10	8741	8750	0 %	20 %	60 %	20 %	86355681
8	NC_007761	GCCGC	2	10	14254	14263	0 %	0 %	40 %	60 %	86355685
9	NC_007761	CGCGC	2	10	15143	15152	0 %	0 %	40 %	60 %	86355685
10	NC_007761	CATCG	2	10	16328	16337	20 %	20 %	20 %	40 %	86355687
11	NC_007761	CGGCA	2	10	16742	16751	20 %	0 %	40 %	40 %	86355687
12	NC_007761	TCGTT	2	10	17601	17610	0 %	60 %	20 %	20 %	86355689
13	NC_007761	CCATT	2	10	18453	18462	20 %	40 %	0 %	40 %	86355689
14	NC_007761	TCCGA	2	10	18916	18925	20 %	20 %	20 %	40 %	86355690
15	NC_007761	GGCGA	2	10	20050	20059	20 %	0 %	60 %	20 %	86355691
16	NC_007761	ATGGT	2	10	20396	20405	20 %	40 %	40 %	0 %	86355691
17	NC_007761	GGCCG	2	10	21455	21464	0 %	0 %	60 %	40 %	86355692
18	NC_007761	GCCGC	2	10	22782	22791	0 %	0 %	40 %	60 %	86355694
19	NC_007761	GGGGC	2	10	22987	22996	0 %	0 %	80 %	20 %	86355694
20	NC_007761	GCTGC	2	10	24781	24790	0 %	20 %	40 %	40 %	86355694
21	NC_007761	TCCGC	2	10	27406	27415	0 %	20 %	20 %	60 %	86355695
22	NC_007761	CCGTC	2	10	27933	27942	0 %	20 %	20 %	60 %	86355695
23	NC_007761	GAACC	2	10	28381	28390	40 %	0 %	20 %	40 %	86355695
24	NC_007761	TTGCG	2	10	30032	30041	0 %	40 %	40 %	20 %	86355697
25	NC_007761	GCCGA	2	10	31108	31117	20 %	0 %	40 %	40 %	86355697
26	NC_007761	GGCTT	2	10	32347	32356	0 %	40 %	40 %	20 %	86355698
27	NC_007761	GCTGA	2	10	34226	34235	20 %	20 %	40 %	20 %	86355699
28	NC_007761	CTTCT	2	10	38215	38224	0 %	60 %	0 %	40 %	86355703
29	NC_007761	GCGTC	2	10	38632	38641	0 %	20 %	40 %	40 %	86355703
30	NC_007761	TGCCG	2	10	41343	41352	0 %	20 %	40 %	40 %	86355705
31	NC_007761	GAAGA	2	10	43619	43628	60 %	0 %	40 %	0 %	86355708
32	NC_007761	GCGAG	2	10	44976	44985	20 %	0 %	60 %	20 %	162329648
33	NC_007761	GTCCA	2	10	46834	46843	20 %	20 %	20 %	40 %	86355713
34	NC_007761	CCGGT	2	10	47106	47115	0 %	20 %	40 %	40 %	86355714
35	NC_007761	AAGCC	2	10	47394	47403	40 %	0 %	20 %	40 %	86355714
36	NC_007761	TCGTC	2	10	47822	47831	0 %	40 %	20 %	40 %	86355715
37	NC_007761	TGCGC	2	10	49038	49047	0 %	20 %	40 %	40 %	86355717
38	NC_007761	TGCGG	2	10	54678	54687	0 %	20 %	60 %	20 %	86355720
39	NC_007761	CGTGC	2	10	55309	55318	0 %	20 %	40 %	40 %	86355721
40	NC_007761	TTCTG	2	10	57115	57124	0 %	60 %	20 %	20 %	86355723
41	NC_007761	GATAT	2	10	61378	61387	40 %	40 %	20 %	0 %	86355726
42	NC_007761	GCCGT	2	10	61637	61646	0 %	20 %	40 %	40 %	86355726
43	NC_007761	CAGGG	2	10	61915	61924	20 %	0 %	60 %	20 %	86355726
44	NC_007761	TTTTA	2	10	71203	71212	20 %	80 %	0 %	0 %	86355727
45	NC_007761	GGCTG	2	10	72183	72192	0 %	20 %	60 %	20 %	86355728
46	NC_007761	CGACC	2	10	73014	73023	20 %	0 %	20 %	60 %	86355729
47	NC_007761	GCCGG	2	10	73585	73594	0 %	0 %	60 %	40 %	86355729
48	NC_007761	GCGAT	2	10	73776	73785	20 %	20 %	40 %	20 %	86355730
49	NC_007761	CCGGT	2	10	74441	74450	0 %	20 %	40 %	40 %	86355730
50	NC_007761	GCCGC	2	10	75108	75117	0 %	0 %	40 %	60 %	86355731
51	NC_007761	GAAGG	2	10	76002	76011	40 %	0 %	60 %	0 %	86355731
52	NC_007761	CGGGA	2	10	76439	76448	20 %	0 %	60 %	20 %	86355731
53	NC_007761	GGATC	2	10	79901	79910	20 %	20 %	40 %	20 %	86355735
54	NC_007761	CATTC	2	10	81248	81257	20 %	40 %	0 %	40 %	86355736
55	NC_007761	TCAGG	2	10	81774	81783	20 %	20 %	40 %	20 %	86355736
56	NC_007761	TCGAT	2	10	81892	81901	20 %	40 %	20 %	20 %	86355736
57	NC_007761	CGGCC	2	10	82072	82081	0 %	0 %	40 %	60 %	86355736
58	NC_007761	CGAGG	2	10	88149	88158	20 %	0 %	60 %	20 %	86355742
59	NC_007761	ATGCG	2	10	90379	90388	20 %	20 %	40 %	20 %	86355744
60	NC_007761	CGGCC	2	10	91352	91361	0 %	0 %	40 %	60 %	86355745
61	NC_007761	AGGAT	2	10	94525	94534	40 %	20 %	40 %	0 %	86355748
62	NC_007761	TGGCC	2	10	96610	96619	0 %	20 %	40 %	40 %	86355749
63	NC_007761	TCACG	2	10	98612	98621	20 %	20 %	20 %	40 %	86355750
64	NC_007761	CAGGC	2	10	99917	99926	20 %	0 %	40 %	40 %	86355751
65	NC_007761	CGACA	2	10	102329	102338	40 %	0 %	20 %	40 %	86355753
66	NC_007761	CCACG	2	10	105833	105842	20 %	0 %	20 %	60 %	86355756
67	NC_007761	CATGC	2	10	106142	106151	20 %	20 %	20 %	40 %	86355757
68	NC_007761	GCGAA	2	10	107166	107175	40 %	0 %	40 %	20 %	86355757
69	NC_007761	AAGCG	2	10	107787	107796	40 %	0 %	40 %	20 %	86355758
70	NC_007761	CGAAC	2	10	107808	107817	40 %	0 %	20 %	40 %	86355758
71	NC_007761	GCCAT	2	10	108752	108761	20 %	20 %	20 %	40 %	86355758
72	NC_007761	GCGCT	2	10	109955	109964	0 %	20 %	40 %	40 %	86355759
73	NC_007761	CGCGC	2	10	115550	115559	0 %	0 %	40 %	60 %	86355766
74	NC_007761	GAAGT	2	10	116229	116238	40 %	20 %	40 %	0 %	86355767
75	NC_007761	AAGAC	2	10	116398	116407	60 %	0 %	20 %	20 %	86355767
76	NC_007761	GCGCT	2	10	118083	118092	0 %	20 %	40 %	40 %	86355769
77	NC_007761	GGATC	2	10	123262	123271	20 %	20 %	40 %	20 %	86355773
78	NC_007761	CGCGG	2	10	124817	124826	0 %	0 %	60 %	40 %	86355775
79	NC_007761	TGGTC	2	10	124874	124883	0 %	40 %	40 %	20 %	86355775
80	NC_007761	CCTTC	2	10	125242	125251	0 %	40 %	0 %	60 %	86355776
81	NC_007761	CCGCG	2	10	125971	125980	0 %	0 %	40 %	60 %	86355776
82	NC_007761	TGGCG	2	10	126469	126478	0 %	20 %	60 %	20 %	86355776
83	NC_007761	CGGCG	2	10	127333	127342	0 %	0 %	60 %	40 %	86355776
84	NC_007761	TTGGC	2	10	127488	127497	0 %	40 %	40 %	20 %	86355776
85	NC_007761	CCTGC	2	10	127987	127996	0 %	20 %	20 %	60 %	86355777
86	NC_007761	GCGAG	2	10	129180	129189	20 %	0 %	60 %	20 %	86355778
87	NC_007761	CTTCG	2	10	132292	132301	0 %	40 %	20 %	40 %	86355780
88	NC_007761	GAGGG	2	10	134378	134387	20 %	0 %	80 %	0 %	86355782
89	NC_007761	GCCTT	2	10	136216	136225	0 %	40 %	20 %	40 %	86355785
90	NC_007761	GGCAG	2	10	142177	142186	20 %	0 %	60 %	20 %	86355791
91	NC_007761	AGCGC	2	10	142471	142480	20 %	0 %	40 %	40 %	86355792
92	NC_007761	TTGCC	2	10	142751	142760	0 %	40 %	20 %	40 %	86355792
93	NC_007761	GCCCG	2	10	143789	143798	0 %	0 %	40 %	60 %	86355794
94	NC_007761	AGGGG	2	10	144798	144807	20 %	0 %	80 %	0 %	86355794
95	NC_007761	CGCGC	2	10	147127	147136	0 %	0 %	40 %	60 %	86355798
96	NC_007761	CTTGC	2	10	148260	148269	0 %	40 %	20 %	40 %	86355799
97	NC_007761	CGAAG	2	10	148452	148461	40 %	0 %	40 %	20 %	86355799
98	NC_007761	TGGGT	2	10	148763	148772	0 %	40 %	60 %	0 %	86355800
99	NC_007761	GCGCG	2	10	149466	149475	0 %	0 %	60 %	40 %	86355801
100	NC_007761	GCGGT	2	10	153329	153338	0 %	20 %	60 %	20 %	86355805
101	NC_007761	GTGGA	2	10	153383	153392	20 %	20 %	60 %	0 %	86355805
102	NC_007761	ACTTC	2	10	154362	154371	20 %	40 %	0 %	40 %	86355805
103	NC_007761	CCTGC	2	10	164377	164386	0 %	20 %	20 %	60 %	86355811
104	NC_007761	GATGC	2	10	165281	165290	20 %	20 %	40 %	20 %	86355811
105	NC_007761	CATGG	2	10	165611	165620	20 %	20 %	40 %	20 %	86355811
106	NC_007761	CCGAA	2	10	166260	166269	40 %	0 %	20 %	40 %	86355811
107	NC_007761	CCCGA	2	10	169048	169057	20 %	0 %	20 %	60 %	86355812
108	NC_007761	CGTCA	2	10	170189	170198	20 %	20 %	20 %	40 %	86355814
109	NC_007761	TGGTC	2	10	173351	173360	0 %	40 %	40 %	20 %	86355817
110	NC_007761	TCGGC	2	10	181793	181802	0 %	20 %	40 %	40 %	86355826
111	NC_007761	CGCTC	3	15	182224	182238	0 %	20 %	20 %	60 %	86355827
112	NC_007761	CGGCG	2	10	186282	186291	0 %	0 %	60 %	40 %	86355831
113	NC_007761	GATGT	2	10	186948	186957	20 %	40 %	40 %	0 %	86355832
114	NC_007761	TTCGG	2	10	187527	187536	0 %	40 %	40 %	20 %	86355832
115	NC_007761	GGGAA	2	10	187599	187608	40 %	0 %	60 %	0 %	86355832
116	NC_007761	GACCG	2	10	188151	188160	20 %	0 %	40 %	40 %	86355834
117	NC_007761	ATGGC	2	10	189433	189442	20 %	20 %	40 %	20 %	86355835
118	NC_007761	CTTTC	2	10	189771	189780	0 %	60 %	0 %	40 %	86355835
119	NC_007761	TGACA	2	10	193659	193668	40 %	20 %	20 %	20 %	86355838
120	NC_007761	CCTGG	2	10	197247	197256	0 %	20 %	40 %	40 %	86355841
121	NC_007761	CGGCC	2	10	197580	197589	0 %	0 %	40 %	60 %	86355841
122	NC_007761	CACGC	2	10	198420	198429	20 %	0 %	20 %	60 %	86355842
123	NC_007761	TCGAT	2	10	200515	200524	20 %	40 %	20 %	20 %	86355845
124	NC_007761	CGGCG	2	10	205857	205866	0 %	0 %	60 %	40 %	86355850
125	NC_007761	GCCGA	2	10	205939	205948	20 %	0 %	40 %	40 %	86355850
126	NC_007761	GAGCG	2	10	207706	207715	20 %	0 %	60 %	20 %	86355852
127	NC_007761	ATTCC	2	10	208273	208282	20 %	40 %	0 %	40 %	86355853
128	NC_007761	GATCG	2	10	208863	208872	20 %	20 %	40 %	20 %	86355853
129	NC_007761	GCGAA	2	10	210727	210736	40 %	0 %	40 %	20 %	86355856
130	NC_007761	CATCC	2	10	212879	212888	20 %	20 %	0 %	60 %	86355858
131	NC_007761	CGCTG	2	10	216017	216026	0 %	20 %	40 %	40 %	86355862
132	NC_007761	TCTCG	2	10	216295	216304	0 %	40 %	20 %	40 %	86355863
133	NC_007761	TGGCC	2	10	216357	216366	0 %	20 %	40 %	40 %	86355863
134	NC_007761	CCGAC	2	10	217221	217230	20 %	0 %	20 %	60 %	86355864
135	NC_007761	AGCCG	2	10	219725	219734	20 %	0 %	40 %	40 %	86355866
136	NC_007761	GCAGC	2	10	220070	220079	20 %	0 %	40 %	40 %	86355866
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