MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhizobium etli CFN 42 chromosome

Total Repeats: 11442

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007761	ATCC	2	8	151	158	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007761	GAAC	2	8	483	490	50 %	0 %	25 %	25 %	86355670
3	NC_007761	CGAT	2	8	642	649	25 %	25 %	25 %	25 %	86355670
4	NC_007761	ATCT	2	8	776	783	25 %	50 %	0 %	25 %	86355670
5	NC_007761	ATCT	2	8	962	969	25 %	50 %	0 %	25 %	86355670
6	NC_007761	CGAT	2	8	1912	1919	25 %	25 %	25 %	25 %	86355671
7	NC_007761	CTGG	2	8	2211	2218	0 %	25 %	50 %	25 %	86355672
8	NC_007761	CATG	2	8	2481	2488	25 %	25 %	25 %	25 %	86355672
9	NC_007761	CTCG	2	8	2514	2521	0 %	25 %	25 %	50 %	86355672
10	NC_007761	ATGG	2	8	2524	2531	25 %	25 %	50 %	0 %	86355672
11	NC_007761	GTCG	2	8	2646	2653	0 %	25 %	50 %	25 %	86355672
12	NC_007761	GCCA	2	8	5292	5299	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_007761	TGAA	2	8	5627	5634	50 %	25 %	25 %	0 %	86355677
14	NC_007761	TCCT	2	8	5661	5668	0 %	50 %	0 %	50 %	86355677
15	NC_007761	CAGC	2	8	5919	5926	25 %	0 %	25 %	50 %	86355677
16	NC_007761	TGCC	2	8	6320	6327	0 %	25 %	25 %	50 %	86355678
17	NC_007761	GATC	2	8	6454	6461	25 %	25 %	25 %	25 %	86355678
18	NC_007761	TGGA	2	8	6489	6496	25 %	25 %	50 %	0 %	86355678
19	NC_007761	CGGC	2	8	6508	6515	0 %	0 %	50 %	50 %	86355678
20	NC_007761	GATC	2	8	6559	6566	25 %	25 %	25 %	25 %	86355678
21	NC_007761	GGCC	2	8	6703	6710	0 %	0 %	50 %	50 %	86355678
22	NC_007761	CTGG	2	8	6793	6800	0 %	25 %	50 %	25 %	86355678
23	NC_007761	GCCG	2	8	6923	6930	0 %	0 %	50 %	50 %	86355678
24	NC_007761	CGGC	2	8	7024	7031	0 %	0 %	50 %	50 %	86355678
25	NC_007761	GGAT	2	8	8495	8502	25 %	25 %	50 %	0 %	86355681
26	NC_007761	CGAC	2	8	8536	8543	25 %	0 %	25 %	50 %	86355681
27	NC_007761	CCAG	2	8	9694	9701	25 %	0 %	25 %	50 %	86355681
28	NC_007761	GACG	2	8	9794	9801	25 %	0 %	50 %	25 %	86355681
29	NC_007761	GCGA	2	8	10191	10198	25 %	0 %	50 %	25 %	86355681
30	NC_007761	CGCC	2	8	10349	10356	0 %	0 %	25 %	75 %	86355681
31	NC_007761	GATC	2	8	11329	11336	25 %	25 %	25 %	25 %	86355682
32	NC_007761	CAGG	2	8	11937	11944	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_007761	GCCG	2	8	12019	12026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_007761	CGAT	2	8	12362	12369	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_007761	CGTT	2	8	12887	12894	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_007761	GCCG	2	8	13029	13036	0 %	0 %	50 %	50 %	86355684
37	NC_007761	CCGG	2	8	13088	13095	0 %	0 %	50 %	50 %	86355684
38	NC_007761	CGGA	2	8	15221	15228	25 %	0 %	50 %	25 %	86355685
39	NC_007761	CCGC	2	8	15584	15591	0 %	0 %	25 %	75 %	86355686
40	NC_007761	CTGC	2	8	15968	15975	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_007761	GCCG	2	8	16094	16101	0 %	0 %	50 %	50 %	86355687
42	NC_007761	CGGG	3	12	16164	16175	0 %	0 %	75 %	25 %	86355687
43	NC_007761	GCCT	2	8	16410	16417	0 %	25 %	25 %	50 %	86355687
44	NC_007761	AAGA	2	8	16451	16458	75 %	0 %	25 %	0 %	86355687
45	NC_007761	CGAT	2	8	16899	16906	25 %	25 %	25 %	25 %	86355688
46	NC_007761	TTCC	2	8	17550	17557	0 %	50 %	0 %	50 %	86355689
47	NC_007761	CGGC	2	8	17718	17725	0 %	0 %	50 %	50 %	86355689
48	NC_007761	ACCT	2	8	18412	18419	25 %	25 %	0 %	50 %	86355689
49	NC_007761	AAGG	2	8	18445	18452	50 %	0 %	50 %	0 %	86355689
50	NC_007761	CGCA	2	8	18756	18763	25 %	0 %	25 %	50 %	86355690
51	NC_007761	GTGA	2	8	20587	20594	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007761	CGAC	2	8	20676	20683	25 %	0 %	25 %	50 %	86355692
53	NC_007761	GGCG	2	8	20853	20860	0 %	0 %	75 %	25 %	86355692
54	NC_007761	CCGA	2	8	22025	22032	25 %	0 %	25 %	50 %	86355693
55	NC_007761	CCGG	2	8	22683	22690	0 %	0 %	50 %	50 %	86355694
56	NC_007761	ACAA	2	8	22931	22938	75 %	0 %	0 %	25 %	86355694
57	NC_007761	CGAT	2	8	23069	23076	25 %	25 %	25 %	25 %	86355694
58	NC_007761	AGCG	2	8	23923	23930	25 %	0 %	50 %	25 %	86355694
59	NC_007761	GTCG	2	8	24009	24016	0 %	25 %	50 %	25 %	86355694
60	NC_007761	CCGG	2	8	24582	24589	0 %	0 %	50 %	50 %	86355694
61	NC_007761	GCGA	2	8	24617	24624	25 %	0 %	50 %	25 %	86355694
62	NC_007761	CGGC	2	8	25049	25056	0 %	0 %	50 %	50 %	86355694
63	NC_007761	CCCG	2	8	25534	25541	0 %	0 %	25 %	75 %	86355694
64	NC_007761	GCCA	2	8	26594	26601	25 %	0 %	25 %	50 %	86355695
65	NC_007761	CGAT	2	8	26835	26842	25 %	25 %	25 %	25 %	86355695
66	NC_007761	CAGC	2	8	26927	26934	25 %	0 %	25 %	50 %	86355695
67	NC_007761	CGGT	2	8	26944	26951	0 %	25 %	50 %	25 %	86355695
68	NC_007761	GCCT	2	8	27332	27339	0 %	25 %	25 %	50 %	86355695
69	NC_007761	CGAG	2	8	27391	27398	25 %	0 %	50 %	25 %	86355695
70	NC_007761	CGGT	2	8	27458	27465	0 %	25 %	50 %	25 %	86355695
71	NC_007761	GTCG	2	8	27577	27584	0 %	25 %	50 %	25 %	86355695
72	NC_007761	GCCG	2	8	27833	27840	0 %	0 %	50 %	50 %	86355695
73	NC_007761	GAAT	2	8	28707	28714	50 %	25 %	25 %	0 %	86355695
74	NC_007761	GACG	2	8	28717	28724	25 %	0 %	50 %	25 %	86355695
75	NC_007761	CGAA	2	8	28922	28929	50 %	0 %	25 %	25 %	86355695
76	NC_007761	CACG	2	8	28933	28940	25 %	0 %	25 %	50 %	86355695
77	NC_007761	GCGA	2	8	28974	28981	25 %	0 %	50 %	25 %	86355695
78	NC_007761	GCCG	2	8	29703	29710	0 %	0 %	50 %	50 %	86355696
79	NC_007761	TCGC	2	8	31019	31026	0 %	25 %	25 %	50 %	86355697
80	NC_007761	GCGA	2	8	31232	31239	25 %	0 %	50 %	25 %	86355697
81	NC_007761	TTCA	2	8	31962	31969	25 %	50 %	0 %	25 %	86355698
82	NC_007761	TCCG	2	8	32286	32293	0 %	25 %	25 %	50 %	86355698
83	NC_007761	CTTC	2	8	32645	32652	0 %	50 %	0 %	50 %	86355698
84	NC_007761	ATCG	2	8	32904	32911	25 %	25 %	25 %	25 %	86355698
85	NC_007761	TTCG	2	8	33032	33039	0 %	50 %	25 %	25 %	86355698
86	NC_007761	CGGG	2	8	33473	33480	0 %	0 %	75 %	25 %	86355698
87	NC_007761	CACG	2	8	33795	33802	25 %	0 %	25 %	50 %	86355698
88	NC_007761	GCGG	2	8	33887	33894	0 %	0 %	75 %	25 %	86355698
89	NC_007761	CTGC	2	8	34213	34220	0 %	25 %	25 %	50 %	86355699
90	NC_007761	TGGT	2	8	34362	34369	0 %	50 %	50 %	0 %	86355699
91	NC_007761	GCCG	2	8	35270	35277	0 %	0 %	50 %	50 %	86355699
92	NC_007761	CAGC	2	8	36349	36356	25 %	0 %	25 %	50 %	86355701
93	NC_007761	CCGG	2	8	37152	37159	0 %	0 %	50 %	50 %	86355703
94	NC_007761	CGAT	2	8	37184	37191	25 %	25 %	25 %	25 %	86355703
95	NC_007761	GGCG	2	8	37773	37780	0 %	0 %	75 %	25 %	86355703
96	NC_007761	CGCC	2	8	37968	37975	0 %	0 %	25 %	75 %	86355703
97	NC_007761	GATC	2	8	38373	38380	25 %	25 %	25 %	25 %	86355703
98	NC_007761	GGCC	2	8	38424	38431	0 %	0 %	50 %	50 %	86355703
99	NC_007761	CGAC	2	8	38478	38485	25 %	0 %	25 %	50 %	86355703
100	NC_007761	CCGG	2	8	38810	38817	0 %	0 %	50 %	50 %	86355703
101	NC_007761	CATC	2	8	39001	39008	25 %	25 %	0 %	50 %	86355704
102	NC_007761	AGCG	2	8	39150	39157	25 %	0 %	50 %	25 %	86355704
103	NC_007761	CCGT	2	8	39489	39496	0 %	25 %	25 %	50 %	86355704
104	NC_007761	ATTA	2	8	39811	39818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007761	CAGC	2	8	39989	39996	25 %	0 %	25 %	50 %	86355705
106	NC_007761	CGGA	2	8	40607	40614	25 %	0 %	50 %	25 %	86355705
107	NC_007761	AACG	2	8	40840	40847	50 %	0 %	25 %	25 %	86355705
108	NC_007761	CTGA	2	8	40876	40883	25 %	25 %	25 %	25 %	86355705
109	NC_007761	CCGG	2	8	40934	40941	0 %	0 %	50 %	50 %	86355705
110	NC_007761	GTTC	2	8	41712	41719	0 %	50 %	25 %	25 %	86355706
111	NC_007761	GGCG	2	8	41721	41728	0 %	0 %	75 %	25 %	86355706
112	NC_007761	GCCG	2	8	41839	41846	0 %	0 %	50 %	50 %	86355706
113	NC_007761	GCCT	2	8	42395	42402	0 %	25 %	25 %	50 %	86355707
114	NC_007761	CGGC	2	8	43032	43039	0 %	0 %	50 %	50 %	86355708
115	NC_007761	GATC	2	8	43527	43534	25 %	25 %	25 %	25 %	86355708
116	NC_007761	GTTC	2	8	44029	44036	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_007761	TGCG	2	8	44420	44427	0 %	25 %	50 %	25 %	86355710
118	NC_007761	TCGA	2	8	44441	44448	25 %	25 %	25 %	25 %	86355710
119	NC_007761	GCCG	2	8	44701	44708	0 %	0 %	50 %	50 %	86355710
120	NC_007761	GATC	2	8	45555	45562	25 %	25 %	25 %	25 %	162329648
121	NC_007761	GCAC	2	8	45713	45720	25 %	0 %	25 %	50 %	86355712
122	NC_007761	CGGC	2	8	45947	45954	0 %	0 %	50 %	50 %	86355712
123	NC_007761	CTTT	2	8	46153	46160	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_007761	GAAG	2	8	46251	46258	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007761	CGAA	2	8	46981	46988	50 %	0 %	25 %	25 %	86355713
126	NC_007761	GACC	2	8	47261	47268	25 %	0 %	25 %	50 %	86355714
127	NC_007761	GATC	2	8	47582	47589	25 %	25 %	25 %	25 %	86355715
128	NC_007761	GATC	2	8	47840	47847	25 %	25 %	25 %	25 %	86355715
129	NC_007761	GGCG	2	8	48363	48370	0 %	0 %	75 %	25 %	86355716
130	NC_007761	ACCA	2	8	48802	48809	50 %	0 %	0 %	50 %	86355716
131	NC_007761	CGCC	2	8	49373	49380	0 %	0 %	25 %	75 %	86355717
132	NC_007761	AAGC	2	8	49970	49977	50 %	0 %	25 %	25 %	86355717
133	NC_007761	CGAT	2	8	50042	50049	25 %	25 %	25 %	25 %	86355717
134	NC_007761	CGAT	2	8	50183	50190	25 %	25 %	25 %	25 %	86355717
135	NC_007761	ACGG	2	8	50429	50436	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_007761	CGTC	2	8	50569	50576	0 %	25 %	25 %	50 %	86355718
137	NC_007761	TCGC	2	8	51153	51160	0 %	25 %	25 %	50 %	86355718
138	NC_007761	TGAA	2	8	52885	52892	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007761	CGAT	2	8	53024	53031	25 %	25 %	25 %	25 %	86355720
140	NC_007761	GCTC	2	8	53342	53349	0 %	25 %	25 %	50 %	86355720
141	NC_007761	TTGG	2	8	53718	53725	0 %	50 %	50 %	0 %	86355720
142	NC_007761	TTCG	2	8	53916	53923	0 %	50 %	25 %	25 %	86355720
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