MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rhizobium etli CFN 42 chromosome

Total Repeats: 76090

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007761	CGC	2	6	56	61	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_007761	GAG	2	6	228	233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007761	CGA	2	6	312	317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007761	CGC	2	6	420	425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_007761	CAT	2	6	436	441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007761	CCG	2	6	540	545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355670
7	NC_007761	CGA	2	6	706	711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355670
8	NC_007761	CGC	2	6	797	802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355670
9	NC_007761	TGA	2	6	822	827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355670
10	NC_007761	GAC	2	6	878	883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355670
11	NC_007761	GAT	2	6	896	901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355670
12	NC_007761	GTC	2	6	917	922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355670
13	NC_007761	ATC	2	6	923	928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355670
14	NC_007761	CAA	2	6	1044	1049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86355670
15	NC_007761	CCA	2	6	1074	1079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86355670
16	NC_007761	GAC	2	6	1120	1125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355670
17	NC_007761	GGA	2	6	1171	1176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86355670
18	NC_007761	CGC	2	6	1235	1240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355670
19	NC_007761	CGG	2	6	1254	1259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355670
20	NC_007761	TTG	2	6	1266	1271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86355670
21	NC_007761	GAA	2	6	1317	1322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007761	TCG	2	6	1350	1355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355671
23	NC_007761	TCT	2	6	1393	1398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355671
24	NC_007761	CGA	2	6	1421	1426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355671
25	NC_007761	ACC	2	6	1615	1620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86355671
26	NC_007761	ATT	2	6	1849	1854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86355671
27	NC_007761	GAT	2	6	1921	1926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355671
28	NC_007761	CCT	2	6	2226	2231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86355672
29	NC_007761	CCA	2	6	2237	2242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86355672
30	NC_007761	CGG	2	6	2309	2314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355672
31	NC_007761	CGG	2	6	2328	2333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355672
32	NC_007761	CGT	2	6	2388	2393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355672
33	NC_007761	GCG	2	6	2536	2541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355672
34	NC_007761	CGT	2	6	2577	2582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355672
35	NC_007761	TGC	3	9	2669	2677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355672
36	NC_007761	CGT	2	6	2721	2726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355672
37	NC_007761	GCC	2	6	2971	2976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355673
38	NC_007761	CAG	2	6	3066	3071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355673
39	NC_007761	GCT	2	6	3107	3112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355673
40	NC_007761	GTC	3	9	3150	3158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355673
41	NC_007761	ATC	2	6	3333	3338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355673
42	NC_007761	ATC	2	6	3388	3393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355674
43	NC_007761	ACC	2	6	3406	3411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86355674
44	NC_007761	ATC	2	6	3436	3441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355674
45	NC_007761	CGG	2	6	3447	3452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355674
46	NC_007761	CGC	2	6	3588	3593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355674
47	NC_007761	CGA	2	6	3600	3605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355674
48	NC_007761	CTT	2	6	3615	3620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355674
49	NC_007761	GAT	2	6	3873	3878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355674
50	NC_007761	CGG	2	6	3879	3884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355674
51	NC_007761	GGC	2	6	3930	3935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355674
52	NC_007761	TTC	2	6	4190	4195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355675
53	NC_007761	ATC	2	6	4239	4244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355675
54	NC_007761	GCG	2	6	4246	4251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355675
55	NC_007761	GAT	2	6	4280	4285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355675
56	NC_007761	GCA	2	6	4336	4341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355675
57	NC_007761	CGC	2	6	4375	4380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355675
58	NC_007761	TCG	2	6	4504	4509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355675
59	NC_007761	TCG	2	6	4603	4608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355675
60	NC_007761	TGT	2	6	4618	4623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86355675
61	NC_007761	GCC	2	6	4667	4672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_007761	TCC	2	6	4794	4799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86355676
63	NC_007761	ACC	2	6	4812	4817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86355676
64	NC_007761	GAC	3	9	4883	4891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355676
65	NC_007761	CGG	2	6	4931	4936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355676
66	NC_007761	GAT	2	6	4955	4960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355676
67	NC_007761	AGC	2	6	4989	4994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355676
68	NC_007761	CAG	2	6	5021	5026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355676
69	NC_007761	GCA	2	6	5098	5103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355676
70	NC_007761	CGA	3	9	5170	5178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355676
71	NC_007761	GCA	2	6	5203	5208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355676
72	NC_007761	ATC	2	6	5308	5313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_007761	CGG	2	6	5356	5361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_007761	TCA	2	6	5390	5395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355677
75	NC_007761	ATT	2	6	5397	5402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86355677
76	NC_007761	TGG	2	6	5408	5413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86355677
77	NC_007761	CGG	2	6	5414	5419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355677
78	NC_007761	TCT	2	6	5426	5431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355677
79	NC_007761	GCC	2	6	5475	5480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355677
80	NC_007761	CGA	2	6	5571	5576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355677
81	NC_007761	GCG	2	6	5608	5613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355677
82	NC_007761	GGC	2	6	5793	5798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355677
83	NC_007761	TCG	2	6	5843	5848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355677
84	NC_007761	GAT	3	9	6137	6145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007761	ATG	2	6	6164	6169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355678
86	NC_007761	CGG	2	6	6179	6184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355678
87	NC_007761	GGA	2	6	6235	6240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86355678
88	NC_007761	CTT	2	6	6251	6256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355678
89	NC_007761	CGT	2	6	6279	6284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355678
90	NC_007761	GCG	2	6	6293	6298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355678
91	NC_007761	GAC	2	6	6521	6526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355678
92	NC_007761	CGC	2	6	6551	6556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355678
93	NC_007761	TCT	2	6	6624	6629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355678
94	NC_007761	GCC	2	6	6647	6652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355678
95	NC_007761	CTG	2	6	6734	6739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355678
96	NC_007761	TTC	2	6	6854	6859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355678
97	NC_007761	GCG	2	6	6866	6871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355678
98	NC_007761	GCC	2	6	6902	6907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355678
99	NC_007761	CTT	2	6	6917	6922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355678
100	NC_007761	GAT	2	6	7007	7012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355678
101	NC_007761	TCG	2	6	7062	7067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355678
102	NC_007761	GCC	3	9	7169	7177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355678
103	NC_007761	GCA	2	6	7250	7255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_007761	CGC	2	6	7364	7369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355679
105	NC_007761	CAT	2	6	7420	7425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355679
106	NC_007761	GTC	2	6	7522	7527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355679
107	NC_007761	CTC	2	6	7528	7533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86355679
108	NC_007761	GCC	2	6	7690	7695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355679
109	NC_007761	CAT	2	6	7699	7704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355679
110	NC_007761	CGG	2	6	7738	7743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355679
111	NC_007761	CTG	2	6	7899	7904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355680
112	NC_007761	CAT	2	6	7928	7933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355680
113	NC_007761	TCC	2	6	7971	7976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86355680
114	NC_007761	GTC	2	6	7986	7991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355680
115	NC_007761	GCC	2	6	8009	8014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355680
116	NC_007761	CGG	2	6	8046	8051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355680
117	NC_007761	GGC	2	6	8106	8111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355680
118	NC_007761	GAA	2	6	8207	8212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007761	CGC	3	9	8233	8241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_007761	ACA	2	6	8248	8253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_007761	CGA	2	6	8390	8395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355681
122	NC_007761	GTC	2	6	8427	8432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355681
123	NC_007761	CGA	2	6	8444	8449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355681
124	NC_007761	GCG	2	6	8551	8556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355681
125	NC_007761	TCA	2	6	8578	8583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355681
126	NC_007761	GGC	2	6	8601	8606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355681
127	NC_007761	CGG	2	6	8636	8641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355681
128	NC_007761	CGT	2	6	8663	8668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355681
129	NC_007761	CCG	2	6	8702	8707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355681
130	NC_007761	AGC	2	6	8817	8822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355681
131	NC_007761	GAA	2	6	8946	8951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86355681
132	NC_007761	CGG	2	6	8963	8968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355681
133	NC_007761	AAG	2	6	9003	9008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86355681
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257	NC_007761	GGC	2	6	16984	16989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355688
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261	NC_007761	GGC	2	6	17279	17284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355688
262	NC_007761	GCA	2	6	17328	17333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355688
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264	NC_007761	CGG	2	6	17490	17495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355688
265	NC_007761	CGG	2	6	17595	17600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355689
266	NC_007761	CGG	2	6	17766	17771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355689
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269	NC_007761	ATC	2	6	17878	17883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355689
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277	NC_007761	CGA	2	6	18297	18302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355689
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280	NC_007761	CGA	2	6	18354	18359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355689
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282	NC_007761	CAT	2	6	18594	18599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355689
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292	NC_007761	TGA	2	6	19046	19051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355690
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