MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Syntrophus aciditrophicus SB chromosome

Total Repeats: 1093

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007759	GTTGCC	2	12	578	589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85857846
2	NC_007759	GATCTG	2	12	1178	1189	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	85857846
3	NC_007759	AGACCA	2	12	3921	3932	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	85857848
4	NC_007759	CCGATG	2	12	4407	4418	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	85857848
5	NC_007759	AAAAGA	2	12	13241	13252	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	85857855
6	NC_007759	CGTGAC	2	12	15229	15240	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	85857858
7	NC_007759	CTTTGT	2	12	16075	16086	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	85857859
8	NC_007759	CTTCCG	2	12	16860	16871	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	85857860
9	NC_007759	CGTGAT	2	12	18376	18387	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	85857862
10	NC_007759	GTGGCG	2	12	26020	26031	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	85857870
11	NC_007759	TTCTCC	2	12	28390	28401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_007759	GATCCG	2	12	28748	28759	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	85857872
13	NC_007759	CCGGGA	2	12	29148	29159	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	85857873
14	NC_007759	AGGTCG	2	12	29853	29864	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	85857873
15	NC_007759	ATCAGG	2	12	33188	33199	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	85857875
16	NC_007759	TCTTTG	2	12	38142	38153	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	85857880
17	NC_007759	TCTTGC	2	12	39520	39531	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	85857882
18	NC_007759	GCCCGT	2	12	40731	40742	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	85857884
19	NC_007759	TGTGCC	2	12	41130	41141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85857884
20	NC_007759	CCGATC	2	12	41577	41588	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	85857884
21	NC_007759	CGCTCC	2	12	42401	42412	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	85857884
22	NC_007759	GCCGTC	2	12	43742	43753	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	85857884
23	NC_007759	CAGAGT	2	12	45559	45570	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	85857887
24	NC_007759	TCGGCG	2	12	45920	45931	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	85857887
25	NC_007759	TCAGGG	2	12	47720	47731	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	85857889
26	NC_007759	CCAGAT	2	12	48601	48612	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	85857890
27	NC_007759	TTTCCG	2	12	48940	48951	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	85857890
28	NC_007759	TGGCGA	2	12	49865	49876	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	85857891
29	NC_007759	TCCCGA	2	12	50196	50207	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	85857891
30	NC_007759	TTGATT	2	12	50383	50394	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	85857892
31	NC_007759	CATCCT	2	12	51239	51250	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	85857892
32	NC_007759	GGCAGG	2	12	57067	57078	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	85857899
33	NC_007759	GAGATC	2	12	58191	58202	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	85857899
34	NC_007759	ATTTAA	2	12	59969	59980	50 %	50 %	0 %	0 %	85857901
35	NC_007759	GCGGAC	2	12	60819	60830	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	85857902
36	NC_007759	TGGCGC	2	12	60839	60850	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	85857902
37	NC_007759	TCCTGG	2	12	63835	63846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85857906
38	NC_007759	GGAAAT	2	12	69388	69399	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	85857911
39	NC_007759	CCGGGT	2	12	73929	73940	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	85857916
40	NC_007759	CGGAAA	2	12	78781	78792	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	85857921
41	NC_007759	GATAAG	2	12	81911	81922	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007759	TCCAGA	2	12	91988	91999	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	85857936
43	NC_007759	GCCCGT	2	12	97559	97570	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	85857941
44	NC_007759	ACCCCC	2	12	103318	103329	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	85857945
45	NC_007759	TTTACT	2	12	104032	104043	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	85857946
46	NC_007759	TGCCGC	2	12	105864	105875	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	85857949
47	NC_007759	GGACCG	2	12	107879	107890	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	85857951
48	NC_007759	TTTGGT	2	12	110886	110897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	85857952
49	NC_007759	AAAGAG	2	12	111121	111132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007759	GCGCCC	2	12	117940	117951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	85857962
51	NC_007759	AGATCC	2	12	122894	122905	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	85857964
52	NC_007759	TAAAAT	2	12	123406	123417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007759	CTTTTT	2	12	124145	124156	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_007759	ACTGGC	2	12	130663	130674	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	85857971
55	NC_007759	ATTTCT	2	12	135500	135511	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_007759	AGCGGC	2	12	138080	138091	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	85857979
57	NC_007759	CCGTCG	2	12	139923	139934	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	85857979
58	NC_007759	ATCGTG	2	12	142035	142046	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	85857982
59	NC_007759	GCCGCA	2	12	142630	142641	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	85857983
60	NC_007759	TTTTCC	2	12	143824	143835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	85857983
61	NC_007759	AATTTG	2	12	146574	146585	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007759	GCATCG	2	12	150498	150509	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	85857987
63	NC_007759	CGCTGG	2	12	154296	154307	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	85857991
64	NC_007759	TAATCT	2	12	155004	155015	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	85857991
65	NC_007759	ATTTAT	2	12	168709	168720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007759	CATCGC	2	12	171235	171246	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	85858008
67	NC_007759	CCGATC	2	12	173448	173459	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	85858012
68	NC_007759	TGGCCA	2	12	175222	175233	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	85858013
69	NC_007759	GGATGA	2	12	176478	176489	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	85858015
70	NC_007759	GAAGGG	2	12	176569	176580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	85858015
71	NC_007759	AGGGAA	2	12	178268	178279	50 %	0 %	50 %	0 %	85858015
72	NC_007759	TCCAGC	2	12	182076	182087	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	85858018
73	NC_007759	CCCATG	2	12	182460	182471	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	85858018
74	NC_007759	TCAAAA	2	12	183792	183803	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	85858019
75	NC_007759	CGGAAT	2	12	192899	192910	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_007759	GTCGCC	2	12	193504	193515	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	85858027
77	NC_007759	TTTCTT	2	12	198492	198503	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	85858033
78	NC_007759	CTGCAC	2	12	200729	200740	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	85858037
79	NC_007759	TCCTGA	2	12	201434	201445	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	85858037
80	NC_007759	GGGCCA	2	12	201475	201486	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	85858037
81	NC_007759	TGATGC	2	12	201545	201556	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	85858037
82	NC_007759	ATGAAT	2	12	202613	202624	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	85858039
83	NC_007759	TGTCGA	2	12	202770	202781	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	85858039
84	NC_007759	AGGGCC	2	12	203364	203375	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_007759	CCAGAT	2	12	203741	203752	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	85858040
86	NC_007759	ATCTCG	2	12	208957	208968	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	85858047
87	NC_007759	GCCGGA	2	12	209228	209239	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	85858047
88	NC_007759	CTTCGG	2	12	209591	209602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85858047
89	NC_007759	ATGAAG	2	12	217169	217180	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	85858056
90	NC_007759	AACGGA	2	12	222558	222569	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	85858061
91	NC_007759	GTCAAT	2	12	231859	231870	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_007759	TCAGCT	2	12	232192	232203	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	85858068
93	NC_007759	CGATGG	2	12	235205	235216	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	85858069
94	NC_007759	CGGTCC	2	12	235630	235641	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	85858069
95	NC_007759	CTTTAA	2	12	240999	241010	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	85858072
96	NC_007759	TGAGGA	2	12	247476	247487	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	85858076
97	NC_007759	GAAAAA	2	12	247841	247852	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	85858077
98	NC_007759	GATGTG	2	12	247909	247920	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	85858077
99	NC_007759	CCTGCC	2	12	250312	250323	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	85858080
100	NC_007759	CCGATG	2	12	253743	253754	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	85858083
101	NC_007759	TCCGTT	2	12	257808	257819	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	85858087
102	NC_007759	TGCCGA	2	12	259441	259452	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	85858088
103	NC_007759	AAGGAA	2	12	262595	262606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85858091
104	NC_007759	GCGGTG	2	12	263178	263189	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	85858092
105	NC_007759	CGGATT	2	12	272079	272090	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	85858099
106	NC_007759	CTGATT	2	12	273611	273622	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_007759	GACCGT	2	12	274980	274991	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	85858103
108	NC_007759	GGAATC	2	12	279755	279766	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	85858108
109	NC_007759	AGGGCG	2	12	285975	285986	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	85858116
110	NC_007759	TGCCGT	2	12	286268	286279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85858116
111	NC_007759	TGGAGA	2	12	288916	288927	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	85858120
112	NC_007759	CGATCA	2	12	292490	292501	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	85858125
113	NC_007759	GAACCC	2	12	294588	294599	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	85858128
114	NC_007759	GGGAAT	2	12	297853	297864	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	85858130
115	NC_007759	AAAGAG	2	12	301051	301062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85858135
116	NC_007759	AAAGAT	2	12	312217	312228	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007759	CTGAGC	2	12	312854	312865	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	85858144
118	NC_007759	AAGGGC	2	12	314227	314238	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	85858146
119	NC_007759	GAAAAG	2	12	317941	317952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85858153
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121	NC_007759	CCTGAC	2	12	323223	323234	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	85858167
122	NC_007759	TAGAAG	2	12	324978	324989	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	85858169
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129	NC_007759	CCAACA	2	12	351280	351291	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_007759	CCCGAG	2	12	352341	352352	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	85858201
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158	NC_007759	AAGCAC	2	12	411158	411169	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	85858251
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197	NC_007759	TGCTGT	2	12	508393	508404	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	85858341
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209	NC_007759	ATTTCG	2	12	541704	541715	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	85858388
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224	NC_007759	TTCAGT	2	12	563181	563192	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	85858412
225	NC_007759	GTCAGA	2	12	566187	566198	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	85858415
226	NC_007759	TTTCTC	2	12	567882	567893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	85858417
227	NC_007759	CCGGAA	2	12	568268	568279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	85858417
228	NC_007759	GCCCTG	2	12	568386	568397	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	85858418
229	NC_007759	GGACGG	2	12	576817	576828	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	85858425
230	NC_007759	GATCAG	2	12	584297	584308	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	85858431
231	NC_007759	AATCGA	2	12	590733	590744	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	85858437
232	NC_007759	TCGGCA	2	12	594916	594927	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	85858439
233	NC_007759	ATATCC	2	12	594933	594944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	85858439
234	NC_007759	CATTAT	2	12	604195	604206	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
235	NC_007759	CATTAT	2	12	604269	604280	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
236	NC_007759	CAAACC	2	12	611736	611747	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
237	NC_007759	ACATGG	2	12	626732	626743	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	85858470
238	NC_007759	AAAGAG	2	12	628239	628250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85858471
239	NC_007759	CCATTA	2	12	633296	633307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	85858477
240	NC_007759	CAGCGG	2	12	640739	640750	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	85858484
241	NC_007759	CTCTGG	2	12	642699	642710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85858487
242	NC_007759	CTCAAT	2	12	644408	644419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	85858488
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248	NC_007759	GGTGTT	2	12	662316	662327	0 %	50 %	50 %	0 %	85858509
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261	NC_007759	ATAGAA	2	12	713621	713632	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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340	NC_007759	TCATCG	2	12	955599	955610	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	85858757
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343	NC_007759	GCATTG	2	12	967768	967779	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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345	NC_007759	GCACAG	2	12	972815	972826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	85858781
346	NC_007759	TTTTCA	2	12	979392	979403	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	85858788
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348	NC_007759	ATCAAT	2	12	979584	979595	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	85858789
349	NC_007759	CATGAC	2	12	980855	980866	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	85858789
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351	NC_007759	CAGGGG	2	12	988261	988272	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	85858798
352	NC_007759	CTGTCA	2	12	990786	990797	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	85858801
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457	NC_007759	CTCACC	2	12	1320118	1320129	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	85859143
458	NC_007759	CAACGG	2	12	1322018	1322029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	85859145
459	NC_007759	ATATCG	2	12	1323275	1323286	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	85859147
460	NC_007759	GCTGGA	2	12	1333761	1333772	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	85859158
461	NC_007759	GGAAAA	2	12	1334040	1334051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85859158
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463	NC_007759	AGGGAG	2	12	1344559	1344570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	85859163
464	NC_007759	CGGCAT	2	12	1344725	1344736	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	85859163
465	NC_007759	TCTTCA	2	12	1347129	1347140	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	85859165
466	NC_007759	TATTTT	2	12	1359525	1359536	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	85859183
467	NC_007759	AGAAAG	2	12	1361978	1361989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85859184
468	NC_007759	CAATTT	2	12	1368891	1368902	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	85859193
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471	NC_007759	TTAGCT	2	12	1380283	1380294	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	85859209
472	NC_007759	CGGCAT	2	12	1381447	1381458	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	85859210
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491	NC_007759	GCCATG	2	12	1474804	1474815	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	85859290
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493	NC_007759	CAGTCC	2	12	1478175	1478186	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	85859294
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500	NC_007759	TACCTC	2	12	1509412	1509423	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	85859318

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