MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Syntrophus aciditrophicus SB chromosome

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007759	TTCTCC	2	12	28390	28401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007759	GATAAG	2	12	81911	81922	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007759	AAAGAG	2	12	111121	111132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007759	TAAAAT	2	12	123406	123417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007759	CTTTTT	2	12	124145	124156	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_007759	ATTTCT	2	12	135500	135511	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_007759	AATTTG	2	12	146574	146585	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007759	ATTTAT	2	12	168709	168720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007759	CGGAAT	2	12	192899	192910	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_007759	AGGGCC	2	12	203364	203375	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_007759	GTCAAT	2	12	231859	231870	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_007759	CTGATT	2	12	273611	273622	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_007759	AAAGAT	2	12	312217	312228	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007759	CCAACA	2	12	351280	351291	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_007759	CGTGAT	2	12	410492	410503	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_007759	TACAGG	2	12	423383	423394	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_007759	CTTATC	2	12	448901	448912	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_007759	CGTCAA	2	12	472435	472446	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_007759	GGTTTT	2	12	503934	503945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007759	CATTAT	2	12	604195	604206	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_007759	CATTAT	2	12	604269	604280	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_007759	CAAACC	2	12	611736	611747	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_007759	TTATTT	2	12	661083	661094	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007759	GGCGCC	2	12	713547	713558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_007759	ATAGAA	2	12	713621	713632	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007759	GCGCGG	2	12	811729	811740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_007759	AGTAAA	2	12	820014	820025	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007759	AGATGA	2	12	844706	844717	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007759	AGGGGG	2	12	848438	848449	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007759	TAAAAA	2	12	900230	900241	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007759	TTTAAT	2	12	932403	932414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007759	GGAATT	2	12	962217	962228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007759	GCATTG	2	12	967768	967779	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_007759	TATAAA	2	12	1015279	1015290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007759	GATACC	2	12	1032784	1032795	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007759	TTATCA	2	12	1044548	1044559	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_007759	CGCTGG	2	12	1060044	1060055	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007759	AAAATA	2	12	1071224	1071235	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007759	AAATTC	2	12	1078630	1078641	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_007759	AGCCGC	2	12	1111218	1111229	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
41	NC_007759	GATCTT	2	12	1134612	1134623	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_007759	CAGAAT	2	12	1174129	1174140	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_007759	TTGAAC	2	12	1256770	1256781	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_007759	GAAAAA	2	12	1279618	1279629	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007759	CGAAGC	2	12	1284392	1284403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007759	GAAATA	2	12	1291814	1291825	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007759	TATAGT	2	12	1297994	1298005	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007759	AAAATT	2	12	1384995	1385006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007759	TACATT	2	12	1388586	1388597	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_007759	GTTTTT	2	12	1477769	1477780	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007759	AAGAAA	2	12	1522376	1522387	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007759	TGCGCC	2	12	1537614	1537625	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_007759	TAATTT	2	12	1550850	1550861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007759	TTAACT	2	12	1610122	1610133	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_007759	AGATAA	2	12	1675521	1675532	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007759	CTGTTT	2	12	1678228	1678239	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_007759	ATAAAG	2	12	1678513	1678524	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007759	GAAAGG	2	12	1788323	1788334	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007759	ATTAAT	2	12	1808562	1808573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007759	TCAATT	2	12	1870571	1870582	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_007759	ATCCTT	2	12	1905886	1905897	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_007759	GTTCCA	2	12	1906974	1906985	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_007759	TTCCAT	2	12	1935904	1935915	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_007759	CGTTTC	2	12	1994705	1994716	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_007759	CGGGAT	2	12	2000768	2000779	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_007759	GCCGGA	2	12	2002116	2002127	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_007759	GCCGGG	3	18	2002146	2002163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_007759	ATGAAC	2	12	2030757	2030768	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_007759	GATTTT	2	12	2045938	2045949	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007759	AGCAAC	2	12	2109273	2109284	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_007759	AAATAC	2	12	2122812	2122823	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_007759	GTTAAA	2	12	2122911	2122922	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007759	TTTTTA	2	12	2139236	2139247	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007759	TCGACC	2	12	2146178	2146189	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
75	NC_007759	ATTAAA	2	12	2171596	2171607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007759	TGTGGA	2	12	2188490	2188501	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007759	CTTTTT	2	12	2198383	2198394	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_007759	CAATCC	2	12	2219871	2219882	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_007759	CGACAT	2	12	2237506	2237517	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_007759	TTGCGC	2	12	2309172	2309183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_007759	CAAAAA	2	12	2332369	2332380	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_007759	AAAATG	2	12	2423515	2423526	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007759	TTGCAC	2	12	2428634	2428645	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_007759	ATCATT	2	12	2431761	2431772	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_007759	ATTGAA	2	12	2460362	2460373	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007759	AAAGGA	2	12	2480393	2480404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007759	CGTCGG	2	12	2484664	2484675	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007759	AAGGAG	2	12	2498398	2498409	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007759	TATAAA	2	12	2516139	2516150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007759	TAGAAA	2	12	2517376	2517387	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007759	TGGAAT	2	12	2535364	2535375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007759	GGGGAA	2	12	2540312	2540323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007759	CAACCC	2	12	2547449	2547460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_007759	ATTCCA	2	12	2562557	2562568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_007759	AGGCAG	2	12	2577515	2577526	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_007759	CTGGAA	2	12	2583096	2583107	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_007759	AAGAAT	2	12	2587505	2587516	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007759	TCGTGT	2	12	2673379	2673390	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_007759	TTCCGT	2	12	2677714	2677725	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_007759	GTTTCG	2	12	2682187	2682198	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_007759	CAGGAG	2	12	2685530	2685541	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_007759	CCCTAT	2	12	2748940	2748951	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_007759	CGCAGG	2	12	2751007	2751018	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_007759	CAATGA	2	12	2764056	2764067	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_007759	ACGCTC	2	12	2818416	2818427	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
106	NC_007759	ATTGAG	2	12	2862738	2862749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007759	TATCTT	2	12	2895672	2895683	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_007759	CCTTTG	2	12	3020501	3020512	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_007759	CCATGT	2	12	3030799	3030810	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_007759	AGCAGT	2	12	3039311	3039322	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_007759	TTTTCA	2	12	3060461	3060472	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_007759	CATACT	2	12	3060577	3060588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.