MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Syntrophus aciditrophicus SB chromosome

Total Repeats: 981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007759	GTTGCC	2	12	578	589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85857846
2	NC_007759	GATCTG	2	12	1178	1189	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	85857846
3	NC_007759	AGACCA	2	12	3921	3932	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	85857848
4	NC_007759	CCGATG	2	12	4407	4418	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	85857848
5	NC_007759	AAAAGA	2	12	13241	13252	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	85857855
6	NC_007759	CGTGAC	2	12	15229	15240	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	85857858
7	NC_007759	CTTTGT	2	12	16075	16086	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	85857859
8	NC_007759	CTTCCG	2	12	16860	16871	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	85857860
9	NC_007759	CGTGAT	2	12	18376	18387	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	85857862
10	NC_007759	GTGGCG	2	12	26020	26031	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	85857870
11	NC_007759	GATCCG	2	12	28748	28759	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	85857872
12	NC_007759	CCGGGA	2	12	29148	29159	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	85857873
13	NC_007759	AGGTCG	2	12	29853	29864	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	85857873
14	NC_007759	ATCAGG	2	12	33188	33199	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	85857875
15	NC_007759	TCTTTG	2	12	38142	38153	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	85857880
16	NC_007759	TCTTGC	2	12	39520	39531	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	85857882
17	NC_007759	GCCCGT	2	12	40731	40742	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	85857884
18	NC_007759	TGTGCC	2	12	41130	41141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85857884
19	NC_007759	CCGATC	2	12	41577	41588	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	85857884
20	NC_007759	CGCTCC	2	12	42401	42412	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	85857884
21	NC_007759	GCCGTC	2	12	43742	43753	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	85857884
22	NC_007759	CAGAGT	2	12	45559	45570	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	85857887
23	NC_007759	TCGGCG	2	12	45920	45931	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	85857887
24	NC_007759	TCAGGG	2	12	47720	47731	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	85857889
25	NC_007759	CCAGAT	2	12	48601	48612	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	85857890
26	NC_007759	TTTCCG	2	12	48940	48951	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	85857890
27	NC_007759	TGGCGA	2	12	49865	49876	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	85857891
28	NC_007759	TCCCGA	2	12	50196	50207	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	85857891
29	NC_007759	TTGATT	2	12	50383	50394	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	85857892
30	NC_007759	CATCCT	2	12	51239	51250	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	85857892
31	NC_007759	GGCAGG	2	12	57067	57078	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	85857899
32	NC_007759	GAGATC	2	12	58191	58202	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	85857899
33	NC_007759	ATTTAA	2	12	59969	59980	50 %	50 %	0 %	0 %	85857901
34	NC_007759	GCGGAC	2	12	60819	60830	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	85857902
35	NC_007759	TGGCGC	2	12	60839	60850	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	85857902
36	NC_007759	TCCTGG	2	12	63835	63846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85857906
37	NC_007759	GGAAAT	2	12	69388	69399	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	85857911
38	NC_007759	CCGGGT	2	12	73929	73940	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	85857916
39	NC_007759	CGGAAA	2	12	78781	78792	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	85857921
40	NC_007759	TCCAGA	2	12	91988	91999	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	85857936
41	NC_007759	GCCCGT	2	12	97559	97570	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	85857941
42	NC_007759	ACCCCC	2	12	103318	103329	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	85857945
43	NC_007759	TTTACT	2	12	104032	104043	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	85857946
44	NC_007759	TGCCGC	2	12	105864	105875	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	85857949
45	NC_007759	GGACCG	2	12	107879	107890	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	85857951
46	NC_007759	TTTGGT	2	12	110886	110897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	85857952
47	NC_007759	GCGCCC	2	12	117940	117951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	85857962
48	NC_007759	AGATCC	2	12	122894	122905	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	85857964
49	NC_007759	ACTGGC	2	12	130663	130674	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	85857971
50	NC_007759	AGCGGC	2	12	138080	138091	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	85857979
51	NC_007759	CCGTCG	2	12	139923	139934	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	85857979
52	NC_007759	ATCGTG	2	12	142035	142046	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	85857982
53	NC_007759	GCCGCA	2	12	142630	142641	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	85857983
54	NC_007759	TTTTCC	2	12	143824	143835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	85857983
55	NC_007759	GCATCG	2	12	150498	150509	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	85857987
56	NC_007759	CGCTGG	2	12	154296	154307	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	85857991
57	NC_007759	TAATCT	2	12	155004	155015	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	85857991
58	NC_007759	CATCGC	2	12	171235	171246	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	85858008
59	NC_007759	CCGATC	2	12	173448	173459	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	85858012
60	NC_007759	TGGCCA	2	12	175222	175233	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	85858013
61	NC_007759	GGATGA	2	12	176478	176489	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	85858015
62	NC_007759	GAAGGG	2	12	176569	176580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	85858015
63	NC_007759	AGGGAA	2	12	178268	178279	50 %	0 %	50 %	0 %	85858015
64	NC_007759	TCCAGC	2	12	182076	182087	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	85858018
65	NC_007759	CCCATG	2	12	182460	182471	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	85858018
66	NC_007759	TCAAAA	2	12	183792	183803	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	85858019
67	NC_007759	GTCGCC	2	12	193504	193515	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	85858027
68	NC_007759	TTTCTT	2	12	198492	198503	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	85858033
69	NC_007759	CTGCAC	2	12	200729	200740	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	85858037
70	NC_007759	TCCTGA	2	12	201434	201445	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	85858037
71	NC_007759	GGGCCA	2	12	201475	201486	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	85858037
72	NC_007759	TGATGC	2	12	201545	201556	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	85858037
73	NC_007759	ATGAAT	2	12	202613	202624	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	85858039
74	NC_007759	TGTCGA	2	12	202770	202781	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	85858039
75	NC_007759	CCAGAT	2	12	203741	203752	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	85858040
76	NC_007759	ATCTCG	2	12	208957	208968	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	85858047
77	NC_007759	GCCGGA	2	12	209228	209239	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	85858047
78	NC_007759	CTTCGG	2	12	209591	209602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85858047
79	NC_007759	ATGAAG	2	12	217169	217180	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	85858056
80	NC_007759	AACGGA	2	12	222558	222569	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	85858061
81	NC_007759	TCAGCT	2	12	232192	232203	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	85858068
82	NC_007759	CGATGG	2	12	235205	235216	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	85858069
83	NC_007759	CGGTCC	2	12	235630	235641	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	85858069
84	NC_007759	CTTTAA	2	12	240999	241010	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	85858072
85	NC_007759	TGAGGA	2	12	247476	247487	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	85858076
86	NC_007759	GAAAAA	2	12	247841	247852	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	85858077
87	NC_007759	GATGTG	2	12	247909	247920	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	85858077
88	NC_007759	CCTGCC	2	12	250312	250323	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	85858080
89	NC_007759	CCGATG	2	12	253743	253754	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	85858083
90	NC_007759	TCCGTT	2	12	257808	257819	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	85858087
91	NC_007759	TGCCGA	2	12	259441	259452	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	85858088
92	NC_007759	AAGGAA	2	12	262595	262606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85858091
93	NC_007759	GCGGTG	2	12	263178	263189	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	85858092
94	NC_007759	CGGATT	2	12	272079	272090	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	85858099
95	NC_007759	GACCGT	2	12	274980	274991	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	85858103
96	NC_007759	GGAATC	2	12	279755	279766	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	85858108
97	NC_007759	AGGGCG	2	12	285975	285986	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	85858116
98	NC_007759	TGCCGT	2	12	286268	286279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85858116
99	NC_007759	TGGAGA	2	12	288916	288927	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	85858120
100	NC_007759	CGATCA	2	12	292490	292501	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	85858125
101	NC_007759	GAACCC	2	12	294588	294599	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	85858128
102	NC_007759	GGGAAT	2	12	297853	297864	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	85858130
103	NC_007759	AAAGAG	2	12	301051	301062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85858135
104	NC_007759	CTGAGC	2	12	312854	312865	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	85858144
105	NC_007759	AAGGGC	2	12	314227	314238	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	85858146
106	NC_007759	GAAAAG	2	12	317941	317952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85858153
107	NC_007759	TGTAGG	2	12	320866	320877	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	85858162
108	NC_007759	CCTGAC	2	12	323223	323234	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	85858167
109	NC_007759	TAGAAG	2	12	324978	324989	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	85858169
110	NC_007759	CATTAC	2	12	325911	325922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	85858171
111	NC_007759	ATGAAA	2	12	336859	336870	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	85858183
112	NC_007759	CCCAGG	2	12	340534	340545	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	85858185
113	NC_007759	ATCGGC	2	12	343932	343943	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	85858189
114	NC_007759	GGAACA	2	12	347812	347823	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	85858195
115	NC_007759	CATCGG	2	12	351082	351093	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	85858199
116	NC_007759	CCCGAG	2	12	352341	352352	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	85858201
117	NC_007759	GCGCCG	2	12	355537	355548	0 %	0 %	50 %	50 %	85858204
118	NC_007759	GAGATG	2	12	358058	358069	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	85858205
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222	NC_007759	CAAGGT	2	12	655249	655260	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	85858498
223	NC_007759	AATGCC	2	12	659192	659203	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	85858503
224	NC_007759	GCCGGC	2	12	659753	659764	0 %	0 %	50 %	50 %	85858503
225	NC_007759	GGTGTT	2	12	662316	662327	0 %	50 %	50 %	0 %	85858509
226	NC_007759	GGCGAT	2	12	666296	666307	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	85858513
227	NC_007759	ATTCCA	2	12	674133	674144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	85858521
228	NC_007759	CCTATT	2	12	675810	675821	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	85858523
229	NC_007759	CGAACT	2	12	677159	677170	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	85858524
230	NC_007759	CTTGTT	2	12	678536	678547	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	85858525
231	NC_007759	TCGGCG	2	12	679002	679013	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	85858525
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233	NC_007759	TTTGGT	2	12	704538	704549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	85858543
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333	NC_007759	GGCATG	2	12	1051802	1051813	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	85858865
334	NC_007759	CGATAG	2	12	1060886	1060897	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	85858879
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339	NC_007759	TATGCC	2	12	1089558	1089569	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	85858909
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342	NC_007759	AGATCG	2	12	1095459	1095470	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	85858915
343	NC_007759	GTCAAA	2	12	1099316	1099327	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	85858919
344	NC_007759	GGTTCG	2	12	1103544	1103555	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	85858923
345	NC_007759	TCCTTT	2	12	1112042	1112053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	85858931
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347	NC_007759	CTTCTA	2	12	1122759	1122770	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	85858940
348	NC_007759	AAACAT	2	12	1124924	1124935	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	85858942
349	NC_007759	AAGAGA	2	12	1129318	1129329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85858946
350	NC_007759	CATCGG	2	12	1130794	1130805	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	85858947
351	NC_007759	AATGCC	2	12	1139176	1139187	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	85858958
352	NC_007759	GGGGCT	2	12	1144319	1144330	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	85858961
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354	NC_007759	TAACCG	2	12	1150520	1150531	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	85858967
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442	NC_007759	GCCATG	2	12	1474804	1474815	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	85859290
443	NC_007759	CAGTCC	2	12	1478175	1478186	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	85859294
444	NC_007759	GGGAGC	2	12	1481430	1481441	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	85859296
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448	NC_007759	GCCCTG	2	12	1492661	1492672	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	85859303
449	NC_007759	GGGATC	2	12	1493845	1493856	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	85859304
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451	NC_007759	TTTCGA	2	12	1512833	1512844	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	85859320
452	NC_007759	GCATGA	2	12	1514173	1514184	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	85859321
453	NC_007759	AGGAGA	2	12	1517211	1517222	50 %	0 %	50 %	0 %	85859322
454	NC_007759	CGGAAA	2	12	1519059	1519070	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	85859323
455	NC_007759	CTGCTT	2	12	1523135	1523146	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	85859326
456	NC_007759	CGGAAT	2	12	1524955	1524966	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	85859327
457	NC_007759	CGGTGG	2	12	1526014	1526025	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	85859328
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459	NC_007759	TTTCCG	2	12	1528325	1528336	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	85859330
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